范秋平
(山東聊城第二中學,山東 聊城)
在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄以及基因工程等過程的學習中涉及了多種與DNA有關(guān)的酶:解旋酶、DNA聚合酶、RNA聚合酶、限制性核酸內(nèi)切酶、DNA連接酶、DNA酶和Taq酶。由于種類繁多,學生對于每種酶的作用極易混淆。在本文中,我力圖從DNA分子結(jié)構(gòu)的角度對這幾種酶進行比較,希望對此難點的解決有一定的借鑒價值。
DNA分子的基本組成單位是四種脫氧核苷酸,從DNA分子整體的雙螺旋結(jié)構(gòu)來看,包括兩種重要的化學鍵:磷酸二酯鍵和氫鍵。(如下圖)
四種脫氧核苷酸示意圖
DNA分子平面結(jié)構(gòu)示意圖
從化學鍵的種類以及合成與破壞化學鍵的角度出發(fā),我把這七種酶進行了“檢索式”的歸納與總結(jié)。(見下圖)
DNA分子在細胞內(nèi)復(fù)制時首先要用解旋酶將兩條螺旋的雙鏈解開,實質(zhì)上就是破壞DNA分子堿基對中的氫鍵。
小結(jié):這是幾種酶中唯一作用于氫鍵的酶。
在基因工程中②被稱為“分子手術(shù)刀”,它主要是從原核生物中分離純化出來的,一種限制酶只能識別一種特定的核苷酸序列,并且使每一條鏈中特定部位的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵斷開,從而把DNA分子切成小的片段。在獲取目的基因與構(gòu)建基因表達載體時必須用此酶來切割DNA分子。
“艾弗里的肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實驗”中提到,在DNA酶的作用下S型菌的DNA水解為單個核苷酸。DNA酶的作用是破壞掉DNA分子中的每個磷酸二酯鍵,作用的最終結(jié)果是生成單個脫氧核苷酸。
小結(jié):②和③的作用都是破壞DNA分子中的磷酸二酯鍵。不同點是前者“有選擇”地“部分破壞”,而后者是“無選擇”地“全破壞”。
④能催化末端堿基互補配對的不同DNA分子片段連接起來,即“縫合”脫氧核糖和磷酸交替連接而構(gòu)成的DNA骨架上的“缺口”(磷酸二酯鍵)。在基因工程中被稱為“分子縫合針”,構(gòu)建基因表達載體時,目的基因與運載體結(jié)合要通過此酶進行連接。根據(jù)酶的來源不同,可以將DNA連接酶分為E.coliDNA連接酶和T4DNA連接酶。在DNA分子復(fù)制的過程中也會用到DNA連接酶,只是這一點在中學教材中沒有涉及。
⑤通過連接單個脫氧核苷酸而形成DNA分子中的磷酸二酯鍵。DNA分子復(fù)制時,在DNA聚合酶的作用下,利用細胞中游離的四種脫氧核苷酸為原料,以解開的每一段母鏈為模板,按照堿基互補配對原則,各自合成與母鏈互補的一段子鏈,其中子鏈中脫氧核苷酸之間的磷酸二酯鍵就是在DNA聚合酶的作用下形成的。
⑥應(yīng)用在DNA聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)中。此酶是從嗜熱菌Thermus Aquaticus(Taq)中分離出的具有熱穩(wěn)定性的DNA聚合酶,在體外擴增DNA分子時,作用與DNA聚合酶基本上是一樣的,可以說是一種耐熱性的DNA聚合酶。
小結(jié):④⑤⑥三種酶的作用都能合成DNA分子中的磷酸二酯鍵,不同點在于④“粘合”的是“DNA分子片段”,⑤和⑥“粘合”的“單個脫氧核苷酸”。⑤和⑥的不同又在發(fā)揮活性時對溫度的要求不同,所以應(yīng)用場所也不同。
由此可見,②的產(chǎn)物可由④連接,③的產(chǎn)物可由⑤⑥連接成DNA分子。
⑦是在以DNA分子的一條鏈為模板合成RNA(即轉(zhuǎn)錄)過程中用到的一種酶,在RNA聚合酶的作用下,細胞中四種游離的核糖核苷酸與供轉(zhuǎn)錄用的DNA的一條鏈上的堿基互補配對,以磷酸二酯鍵相連接,形成一個mRNA分子。
小結(jié):⑦的作用與RNA的形成有關(guān),實質(zhì)上是合成RNA中的磷酸二酯鍵。
下圖為DNA分子在不同酶的作用下所發(fā)生的變化模式圖,圖中依次表示限制性核酸內(nèi)切酶、DNA聚合酶、DNA連接酶、解旋酶作用的正確順序是 ( )
A.①②③④ B.①②④③ C.①④②③ D.①④③②
【答案】C