(湖南師范大學(xué) 湖南 長沙 410006)
As是一種類金屬,自然界中的As有存在著很多不同的化學(xué)形態(tài),它在環(huán)境中的賦存形態(tài)及其遷移轉(zhuǎn)化過程很大程度上決定了其毒性[1]。環(huán)境中的無機砷的主要存在形式包括+3價的亞砷酸鹽和+5價的砷酸鹽[2],As(III)的毒性和遷移性高于As(V)。As(V)能穩(wěn)定存在于土壤中,它在土壤的各種吸附過程中能與礦物組分共沉淀,與As(V)不同的是As(III)則不易在土壤介質(zhì)中形成沉淀[3]。微生物在砷的形態(tài)轉(zhuǎn)化過程中扮演著重要角色,也在砷的地球化學(xué)過程中起到關(guān)鍵性作用[3-4]。在好氧條件下,34微生物通過細胞內(nèi)As(V)還原酶arsC將As(V)還原為As(III),再由As(III)運載蛋白arsB/acr3將其排出體外[5]。這類通過解毒機制進行砷還原的微生物叫做細胞質(zhì)As(V)還原微生物。這類微生物能將易吸附于鈣、鐵、鋁等礦物質(zhì)上的As(V)還原為移動性和毒性更強的As(III),是好氧環(huán)境中參與砷活化和釋放的重要微生物類群[6-7]。
As和Fe的相互作用對As在環(huán)境中的行為具有重要意義。在自然環(huán)境中,主要有兩類礦物會富集As:一類是硫化物礦物,還有一類是鐵氧化物礦物[8]。由于鐵氧化物礦物具有對As有較高的親和力,F(xiàn)e元素和As素也是相互影響,相互作用,因而吸附了As的鐵氧化物常常被用來用于實驗研究。探討還原菌體、含F(xiàn)e礦物參與的As遷移轉(zhuǎn)化過程有助于理解環(huán)境中As、Fe、微生物三者共同參與下的循環(huán)過程,也能幫助我們更好地理解As和Fe的地球化學(xué)作用[9]。
目前,很多研究主要是關(guān)于厭氧微生物對As(V)遷移轉(zhuǎn)化影響[10-11],而在實際土壤環(huán)境中,土壤表層含氧量較高,存在有很多好氧微生物[12],而關(guān)于這些好氧微生物(如好氧As(V)還原菌)對As(V)的遷移轉(zhuǎn)化研究很少。另一方面,不少的研究采用的是模擬體系,如用石英砂來模擬實際土壤環(huán)境,而對于實際土壤環(huán)境中As在微生物作用下的遷移轉(zhuǎn)化的研究有限,因此,本實驗是探究在好氧條件下As(V)還原菌對鐵氧化物吸附態(tài)As(V)及土壤中結(jié)合態(tài)As(V)的遷移轉(zhuǎn)化的影響[13],研究石門雄黃礦區(qū)高As壤中耐As土著微生物的生長化學(xué)特征、土著微生物對不同價態(tài)As的氧化還原作用,是為了讓我們更好的理解耐As土著微生物在As的遷移轉(zhuǎn)化中所起的作用,也為了讓我們更好的研究高As土壤的As釋放過程,同時對豐富As的遷移轉(zhuǎn)化過程提供了參考價值
供試土壤為取自湖南石門縣雄黃礦區(qū)As污染土,采樣點是礦區(qū)小門衛(wèi)前地塊。土樣采集后經(jīng)風(fēng)干、研磨后4℃冰箱保存?zhèn)溆?土壤基本元素含量用北京海光儀器LC-AFS 6000測定了采樣點的土壤總As含量,其余元素使用原子吸收光譜儀(Agilent 240 AA)測定。
水鐵礦的制備是根據(jù)Schwertmann提出的方法制備[14]。
表1 土壤基本元素含量表
分離菌株采用LB培養(yǎng)基:5g L-1酵母膏,10g L-1胰蛋白胨,10g L-1Na Cl,PH為7.4,培養(yǎng)基中加入固體Na2HAsO4·7H2O使得溶液中As(V)的總濃度為200 mg L-1。
固體培養(yǎng)基需在此基礎(chǔ)上加入20g瓊脂粉即可。
1.好氧As(V)還原菌的分離與鑒定
在富集耐As(V)微生物的土樣中取1g新鮮土壤放置于100m L無菌錐形瓶中(高壓滅菌),加入30ml 200 mg/L無菌As(V)溶液,置于30 ℃,200 r/min搖床中振蕩24 h后,取上清液按10-2-10-5梯度稀釋涂布于LB平板。平板置于30 ℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)2天,挑取單菌落,反復(fù)于平板上劃線純化至獲得耐As(V)純菌。將純菌株放于4 ℃冰箱保存以備后續(xù)實驗使用。將得到的耐As(V)菌接種到200 mg/L As(V)濃度的液體培養(yǎng)基過夜培養(yǎng),培養(yǎng)條件為200r/min,30℃搖床培養(yǎng)。取菌液過0.22 μm微孔濾膜,上級檢測As形態(tài),所用儀器為原子熒光-高效液相色譜聯(lián)用儀(北京海光儀器LC-AFS 6000),將出現(xiàn)一定濃度As(III)的菌株進行標記,篩選出5株具有較強As(V)還原能力的菌株用于后續(xù)實驗。
實驗采用16S r RNA基因序列分析法,鑒定所分離出的As(V)還原菌株。具體方法為:采用FastDNA? Spin Kit for Soil(土壤基因組DNA提取試劑盒)提取分離得到的純菌株的DNA,并以其DNA為模版對菌株的16S r RNA基因進行PCR擴增,PCR擴增后使用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,隨后進行PCR產(chǎn)物的純化與16S r RNA基因測序(湖南擎科)。
2.好氧As(V)還原菌體內(nèi)的As(V)還原酶基因擴增分析
該實驗以分離得到的純菌株經(jīng)過提取后的DNA為模版,以引物P52F和P323R對As(V)還原酶基因arsC進行PCR擴增,擴增引物為P52F和P323R[15]。
3.好氧As(V)還原菌的耐As能力分析
實驗中采用LB培養(yǎng)基,As(V)濃度As(V)為分別為200 mg/L和2 mg/L,研究五株As(V)還原菌SM4,SM9,SM12,SM14,SM15分別在200 mg/L和2 mg/L As(V)溶液中的生長情況。設(shè)置空白對照組(不加微生物),實驗組菌液與培養(yǎng)基比例為1 m L:50 m L,空白組用無菌超純水取代菌液,反應(yīng)條件均為30℃,200 rpm 振蕩培養(yǎng)。設(shè)置時間梯度為4h,6h,14h,16h,18h,20h。在不同時間段測定OD600值(紫外可見分光光度計,上海精科752N)[16]。
(1)好氧As(V)還原菌對液相As(V)的還原轉(zhuǎn)化
實驗中采用LB培養(yǎng)基,As(V)濃度為200 mg/L,設(shè)置空白對照組(不加微生物),實驗組菌液與培養(yǎng)基為1 m L:50 m L,空白組用無菌超純水取代菌液。反應(yīng)條件均為30℃,200 rpm振蕩培養(yǎng)24h。將樣品過0.22μm微孔濾膜,用北京海光儀器LC-AFS6000測定As形態(tài)。
(2)好氧As(V)還原菌對水鐵礦吸附態(tài)As(V)和Fe(Ⅲ)的轉(zhuǎn)化
在前面的液相實驗中,五株菌株都具有較強的As(V)還原能力,從中選取了一株具代表性的菌株,即SM14,進行接下來的水鐵礦吸附態(tài)As(V)的轉(zhuǎn)化實驗。
實驗過程為1ml培養(yǎng)液離心(15000g,10min),得到沉淀用滅菌的0.8%的Na Cl溶液清洗,再溶到1mL Na Cl溶液中得到1ml細胞懸浮液,加到19ml無菌水中,后加入0.05g吸附As(V)后的水鐵礦。實驗設(shè)置兩個對照,一個為不加水Fe(Ⅲ)礦的陰性對照,另一個為不接種As(V)還原菌的空白對照??瞻捉M用無菌超純水取代菌液。反應(yīng)條件均為30℃,200 rpm振蕩培養(yǎng)24h。將樣品過0.22μm濾膜,用北京海光儀器LC-AFS6500測定As形態(tài),用紫外可見分光光度計測定Fe形態(tài)。
(3)好氧As(V)還原菌對As污染土壤中的As(V)和Fe(Ⅲ)轉(zhuǎn)化
將石門取回的新鮮土壤反復(fù)三次高壓滅菌,取1g滅菌土與19ml滅菌水制成土壤懸浮液。1ml培養(yǎng)液離心(15000g,10min),得到沉淀用滅菌的0.8%的Na Cl溶液清洗,再溶到1mlNa Cl溶液中得到1ml細胞懸浮液,加到19 ml的土壤懸浮液中,空白組用無菌超純水取代菌液,30℃,200 rpm振蕩培養(yǎng),培養(yǎng)一定間隔時間取樣測定As形態(tài)和Fe形態(tài)。另取一份相同土壤經(jīng)過同樣處理靜置培養(yǎng)7天。將樣品過0.22μm濾膜,用北京海光儀器LC-AFS6000測定As(V)形態(tài),用紫外可見分光光度計測定Fe形態(tài)。
圖2-2 包含菌株SM4,SM9,SM12,SM14,SM15在內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育樹
1.好氧As(V)還原菌的鑒定結(jié)果
將測序結(jié)果用BLAST數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)進行對比鑒定。經(jīng)比對鑒定,分離出五株As(V)還原菌株,它們都屬于芽孢桿菌屬,與Bacillus序列相似度達99%,分別命名為SM4,SM9,SM12,SM14,SM15。得到的對應(yīng)的NCBI數(shù)據(jù)庫編號分別為1937185,1937190,1937193,1937196,1937199。類似地,陳倩等人用瓊脂平板培養(yǎng)法從湖南石門縣雄黃礦區(qū)土壤中篩選出43株耐As(V)細菌。其中27.91%屬于芽孢桿菌屬Bacillus sp.[17]。
測序結(jié)果經(jīng)過軟件Contig Express拼接之后得到拼接序列,Crustal X軟件align之后,用Mega軟件構(gòu)建出系統(tǒng)發(fā)育樹,采用方法為neighbor-joining方法,步點值(Boot straps)為1000。該發(fā)育樹結(jié)果表明得到的五株好氧As(V)還原菌株SM 4,SM 9,SM 12,SM 14,SM 15與芽孢桿菌屬的關(guān)系最近,但分屬于不同的種。
2.好氧As(V)還原菌體內(nèi)的As(V)還原酶基因的鑒定
將測序結(jié)果用BLAST數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)進行對比鑒定。經(jīng)比對鑒定,五株As(V)還原菌內(nèi)均有As(V)還原酶基因,且該還原酶基因?qū)儆赼rsC基因。很多研究表明和Bacillus sp.具有As(V)操縱子arsC,這一基因編碼了As(V)還原酶,在As(V)到As(III)的生物轉(zhuǎn)化過程中具有重要作用[18]。這與我們的實驗結(jié)果也是一致的,實驗中我們檢測到了arsC編碼基因的存在,片段大小為275bp左右。
3.好氧性As(V)還原菌的耐As能力分析
圖2-3(左)給出了菌株在As(V)濃度為200 mg/L的溶液中菌株的生長情況,CK為無接種微生物對照。由圖可以看出,菌株SM 12,SM 15大致在10 h后開始對數(shù)生長期并在14 h時達到最大生長量,菌株SM 4,SM 9,SM 14大致在14 h后開始對數(shù)生長期SM 14在18 h達到最大生長量,SM 4,SM 9在20 h達到最大生長量。而CK檢測不到菌株的生長。圖2-3(右)給出了菌株在As(V)濃度為2 mg/L的溶液中菌株的生長情況。同樣地CK為無接種微生物對照。由圖可以看出,五株菌株在6 h后開始對數(shù)生長期并在10 h時左右達到最大生長量,說明高As(V)濃度下菌株生長比低As(V)濃度情況下緩慢,但24 h后不同As濃度脅迫下菌株的生長量基本持平,無顯著差異。
圖2-3 200mg/L(左)和2 mg/L(右)As(V)溶液體系中CK以及菌株SM 4,SM 9,SM 12,SM 14,SM 15的生長情況
Figure2-3ThegrowthofCKandstrainSM4,SM9,SM12,SM14,SM15in200mg/Land2mg/LAs(V)solutionsystem
(1)好氧As(V)還原菌對液相As(V)的轉(zhuǎn)化
如圖3-2所示,實驗結(jié)果表明,五株菌株均可以在200 mg/L As(V)溶液中生長,并且都能將As(V)還原成As(III)。隨著培養(yǎng)時間的增加,As(V)濃度慢慢降低,As(III)濃度慢慢升高,并且菌株的生長量是跟其還原量同步的,在菌株大量增長的對數(shù)生長期,其As(V)還原速率也是最快的。五株菌株基本能夠在24h內(nèi)將200 mg/L As(V)完全還原As(III)。其中10-20h是一個快速還原時期,這可能是由于菌株逐漸達到了較大生長量,還原能力不斷增強,此結(jié)果與圖2-2表現(xiàn)出的菌株生長規(guī)律一致。五株菌株SM4,SM9,SM12,SM14,SM15的As(V)還原量相差無幾,都能達到200 mg/L,但是達到最大還原量所需的時間分別是18h,24h,16h,20h,24h,顯然菌株SM12的還原速率最快。As(III)的最大值低于起始的200 mg/L As(V)濃度值可能是因為部分As(III)存在于菌株的細胞液中,暫未釋放到溶液中。
過本章的液相As溶液實驗,可以知道我們所得到的五株好氧型As(V)還原菌能夠在200 mg/L的As(V)溶液中生長并且能夠?qū)s(V)全部還原成為As(III),隨著培養(yǎng)時間的增加,還原效率降低,一方面是因為菌株經(jīng)過了對數(shù)生長期并且逐漸衰亡,其還原能力下降,另一方面,隨著As(III))濃度的升高,溶液中的毒性不斷增強,抑制了菌株的生長,這點與前面提到的As(III)毒性高于As(V)結(jié)論一致。
圖3-2好氧還原菌SM4,SM9,SM12,SM14,SM15以及CK對液相As(V)的還原轉(zhuǎn)化
Fig.3-2TransformationandreductionofarsenicbyaerobicarsenicreducingbacteriaSM4,SM9,SM12,SM14,SM15andCKinliquidAs(V)
(注:每個小圖左上角SM4,SM9,SM12,SM14,SM15,CK為菌株名稱)
(2)好氧As(V)還原菌對水鐵礦吸附態(tài)As(V)的還原轉(zhuǎn)化
在水鐵礦吸附態(tài)As(V)(200 mg/L)的實驗中,收集到的上清液僅為98.46 ug/L,這足以說明水鐵礦對As(V)具有強大的吸附能力,吸附效率高達99.95%。并且吸附所需的時間僅為24 h,這也說明水鐵礦對As(V)具有很強的親和力,這與前面提到的鐵氧化物與As具有密切關(guān)系觀點一致。這也是本文為何選取水鐵礦作為吸附材料的原因。
在0-10h內(nèi),As(V)濃度逐漸下降,As(III)濃度逐漸上升,這意味著在此期間As(V)快速被還原成As(III),10 h即可達到最大As(V)還原量,即As(III)濃度達到了最大值66.72μM(即4.998 mg/L)。并且As(III)濃度達到的最大值遠大于As(V)的最大濃度值。由此可以說明,在此期間,As(V)還原菌株SM14還原了部分吸附在水鐵礦表面的固相As(V)。此時Fe(II)也達到了一個較高值1.168 mM(即65.408 mg/L)。而CK組在0-10 h內(nèi)As(V)濃度由33.16 mg/L下降到26.42 mg/L,這個值遠低于實驗組的As(III)濃度值。并且在CK溶液中檢測不到As(III)的存在,如圖3-3(2)所示。此時溶液中也出現(xiàn)了部分Fe(II)。
如圖3-3(1)所示在10-72h時間段內(nèi),實驗組As(III)濃度有所下降,As(V)濃度有所上升,這可能是因為被還原到液相中的As(III)又被吸附到水鐵礦的表面,因為水鐵礦對As(V)具有強大的吸附能力。Fe(II)濃度則呈現(xiàn)一種緩慢上升的狀態(tài)。而CK組中As(V)濃度雖然有微小的上升階段,最終也恢復(fù)到與起始濃度值持平的狀態(tài),F(xiàn)e(II)濃度則呈現(xiàn)一種相對穩(wěn)定的狀態(tài),溶液中始終沒有檢測到As(III),如圖3-3(2)所示。
圖3-3 好氧還原菌SM14(a)和CK(b)對水鐵礦吸附態(tài)As(V)的還原轉(zhuǎn)化
Fig.3-3ReductionandtransformationofadsorptivearseniconferrihydritebyaerobicarsenicreducingbacteriaSM14(left)andCK(right)
3.好氧As(V)還原菌對土壤As(V)和Fe(Ⅲ)的轉(zhuǎn)化
如圖3-4 B和D所示,在滅菌組中,接種好氧As(V)還原菌株的樣品As(III)濃度和Fe(II)濃度值明顯比未接種樣品As(III)濃度和Fe(II)濃度高,未接種處理中As(III)濃度幾近為零,(As(V)形態(tài)的檢測限為0.05 ug/L),對比之下,接種好氧As(V)還原菌的處理樣品中As(III)濃度最大值達到了82.46 ug/L,F(xiàn)e(II)濃度也達到了74.21 mg/L,SM14對土壤中的As(V)和Fe(III)起到了明顯的還原作用。
如圖3-4 A所示,原始無處理樣品(未接種未滅菌),出現(xiàn)了一定濃度的As(III),As(V),F(xiàn)e(III),F(xiàn)e(II),而滅菌樣品中檢測不到As(III)的出現(xiàn),說明As(III)的出現(xiàn)與土壤中的土著微生物關(guān)系密切。如圖3-4 A和C所示,在未滅菌組中,接種好氧As(V)還原菌株SM14的樣品As(III)濃度值也比未接種樣品As(III)濃度高,F(xiàn)e(II)濃度值也比未接種樣品Fe(II)濃度高。說明好氧As(V)還原菌株SM14促進了As(V)和Fe(Ⅲ)的轉(zhuǎn)化。接種組中As(III)和Fe(II)的濃度隨培養(yǎng)時間的增加慢慢,說明還原過程一直在持續(xù)進行。
圖3-5表明,經(jīng)過七天的培養(yǎng)時間,As(V)還原菌株SM14明顯促進了As(V)的溶出與還原。在滅菌組中,經(jīng)過7天時間的培養(yǎng),最大As(III)還原量達到3524.96 ug/L,而其對照組僅僅為24.19 ug/L,還原量是對照的145.7。說明接種的As(V)還原菌株SM14在As(V)還原到As(III)的過程中起到了十分重要的作用。在未滅菌組中,接種As(V)還原菌株SM14的樣品As(III)濃度為2675.15 ug/L,還原量是對照的3.9倍,對照處理僅為683.45 μg/L。
圖3-4 好氧還原菌SM14對土壤As(V)和Fe(III)的轉(zhuǎn)化
Fig.3-4ReductionandtransformationofAs(V)andFe(III)insoilbyaerobicarsenicreducingbacteriaSM14
(注:A、C土壤未滅菌,其中A未接種菌株SM14,C接種菌株SM 14;B、D土壤進行滅菌,其中C未接種菌株SM14,D接種菌株SM14)
實驗結(jié)果表明,菌株SM14對吸附在水鐵礦表面的吸附態(tài)As(V)具有還原效果。在還原過程中,在無微生物加入的情況下,水鐵礦也會自然溶出部分As(V),這可能由于吸附了As(V)的水鐵礦發(fā)生的化學(xué)性溶解。但加入As(V)還原菌株后,溶出量明顯增加,As(Ⅲ)濃度值明顯大于As(V)濃度值。這說明,As(V)還原菌株促進了As(V)的溶解,并將As(V)還原成As(III),除了液相中的As(V)被還原,還有部分固相As(V)被還原。
圖3-5靜置培養(yǎng)7天后好氧還原菌和CK對滅菌土壤(A)和未滅菌原始土壤(B)中As(V)的還原
Fig.3-5ReductionandtransformationofAs(V)insterilesoil(A)andoriginalsoil(B)byaerobicarsenicreducingbacteriaSM14andCKafterstaticculturefor7days
在土壤實驗中,不同處理都能檢測到少量的Fe(II),說明Fe(III)的還原的出現(xiàn)并不是由于實驗添加的As(V)還原菌所引起的,滅菌處理中Fe(II)的出現(xiàn)可能是Fe(Ⅲ)在還原環(huán)境下發(fā)生的自然過程,也可能是在少數(shù)微生物的作用下發(fā)生的,如Fe(Ⅲ)還原菌。除了滅菌處理中沒有接種As(V)還原菌的對照組沒有檢測到As(III),其他處理都能檢測到微量的As(III),這是由于其他處理中都存在著微生物,這個結(jié)果也印證了As(V)的還原是在微生物參與下進行的這一觀點。不管是滅菌處理還是不滅菌處理中,As(V)還原菌株的加入都使得As(III)和Fe(II)的濃度值有所增加,說明該As(V)還原菌確實能促進土壤As(V)和Fe(III)的還原。
(1)高As濃度下,菌株達到最大生長量所需要的時間比低As濃度長,但是不同的As(V)濃度下,As(V)的最大生長量無顯著性差異。
(2)好氧As(V)還原菌株SM 4,SM 9,SM 12,SM 14,SM 15都對水溶態(tài)表現(xiàn)出一致的還原溶解能力;
(3)相比而言,菌株SM 14對液相As(V)的還原速率較快,對水鐵礦結(jié)合態(tài)和污染土壤結(jié)合態(tài)As(V)的還原速率較低;
(4)菌株SM 14可以同時還原水鐵礦結(jié)合態(tài)Fe(III)成為液相Fe(II),且對Fe(III)的還原量大于對于As(V)的還原量。
(5)靜置七天培養(yǎng),As(III)的還原量有很大的提高,在此過程中,好氧As(V)還原菌株SM 14起到了重要作用。