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分子動力學(xué)模擬在粘土和粘土礦物中的研究思路

2018-10-17 10:59
山西建筑 2018年26期
關(guān)鍵詞:粘土礦光譜動力學(xué)

尚 興

(大同煤礦集團(tuán)馬道頭煤業(yè)有限公司,山西 大同 037003)

1 光譜學(xué)

很早人們就知道,物質(zhì)的含量可以由物質(zhì)的特殊顏色測定,這是比色分析法的基礎(chǔ)。量子力學(xué)誕生后,人們在理解光與物質(zhì)之間相互作用方面有了重大飛躍,光譜技術(shù)不僅在定性和定量分析方面有了很大發(fā)展,而且也逐漸成為人們了解材料結(jié)構(gòu)信息的主要工具之一。

近代化學(xué)和物理學(xué)的發(fā)展,不僅為化合物分子結(jié)構(gòu)鑒定奠定了理論基礎(chǔ),同時也為先進(jìn)的機(jī)械工業(yè)和電子工業(yè)提供了必要的設(shè)計思想,各種光譜儀器得以問世。首先,紫外—可見光譜儀和紅外光譜儀進(jìn)入有機(jī)化學(xué)實(shí)驗(yàn)室,大大加快了分子結(jié)構(gòu)鑒定的步伐。

隨著儀器分析方法不斷發(fā)展和普遍使用,紫外—可見光譜(UV)、紅外光譜(IR)、核磁共振(NMR)、質(zhì)譜(MS)、分子熒光光譜(MFS)、拉曼光譜(R)、X射線衍射(XRD)、電子能譜等各種譜學(xué)相互配合,形成一套新的完善的分析方法,在物質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定中起到重要作用[1]。

各種譜學(xué)法都采用儀器進(jìn)行物質(zhì)結(jié)構(gòu)信息的采集和分析,近年來獲得迅速發(fā)展,得到廣泛應(yīng)用,其特點(diǎn)是:

1)分析速度快,適合批量樣品分析。許多儀器配備了連續(xù)的樣品引入裝置,該裝備使用數(shù)字顯示和電子計算機(jī)技術(shù),可在短時間內(nèi)分析十幾個樣品。

2)靈敏度高,適用于微量組分的測定。

3)用途廣泛,可以適應(yīng)各種分析要求。除了結(jié)構(gòu)分析之外,還可以進(jìn)行定量分析、微區(qū)分析、物相分析、價態(tài)分析和剝層分析等。

4)樣品用量少,僅需毫克級,甚至微克級樣品。

5)分析方法多為非破壞性過程,可直接得到可靠的結(jié)構(gòu)信息。

現(xiàn)在,譜學(xué)法已成為一門重要的學(xué)科,在材料、化學(xué)、化工、醫(yī)藥、生命科學(xué)、環(huán)保、食品及法醫(yī)等諸多科研和生產(chǎn)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。譜學(xué)法主要應(yīng)用于化合物的結(jié)構(gòu)解析和表征、化合物的定性定量分析、反應(yīng)機(jī)理的研究、材料結(jié)構(gòu)與物性的研究、商品的檢驗(yàn)等,在許多領(lǐng)域的應(yīng)用是其他方法無法替代的。其最大應(yīng)用是化合物和材料的結(jié)構(gòu)分析和表征。

2 分子動力學(xué)模擬

自20世紀(jì)50年代開始,在計算物理化學(xué)領(lǐng)域中,微觀尺度上的分子模擬方法一直蓬勃發(fā)展,逐漸形成各種基于量子力學(xué)、分子力學(xué)二階尺度上的計算方法,并已被廣泛用在諸如材料,制藥和生物科學(xué)。分子模擬體系框架如圖1所示[2]。

分子動力學(xué)方法的基本思想是分子間的作用力改變了分子坐標(biāo)和動量,通過求解分子運(yùn)動方程,得到體系的動力學(xué)信息。用于分子動力學(xué)的經(jīng)典動力學(xué)方程是牛頓運(yùn)動方程,進(jìn)行分子動力學(xué)模擬的關(guān)鍵問題是確定原子間的勢能[3]。在分子動力學(xué)模擬中,通常采用合適的經(jīng)驗(yàn)勢(即力場[4,5])來代替不同原子間的實(shí)際勢能,在此基礎(chǔ)上,求解牛頓運(yùn)動方程組,以獲得系統(tǒng)能量。因此,分子動力學(xué)模擬是經(jīng)驗(yàn)的或半經(jīng)驗(yàn)的,利用不同的原子間勢能,可以導(dǎo)出許多不同的分子動力學(xué)分支。其計算的成功或失敗很大程度上取決于力場的適用性、計算速度、計算方法的正確性以及起始結(jié)構(gòu)的合理性。鑒于當(dāng)前計算機(jī)能力的局限性,分子動力學(xué)模擬只能解決10-9s時間范圍和10-9m空間范圍內(nèi)的力學(xué)問題。與連續(xù)介質(zhì)理論相比,分子動力學(xué)模擬無疑更準(zhǔn)確地描述原子尺度系統(tǒng)的物理性質(zhì)。

與實(shí)驗(yàn)相比較,分子模擬的優(yōu)勢有:

1)可以降低試驗(yàn)成本。

2)具有較高的安全性。

3)實(shí)現(xiàn)通常條件下較難或無法進(jìn)行的試驗(yàn),得到較佳的準(zhǔn)確度。

4)研究過快或過慢的反應(yīng)。

5)從微觀角度認(rèn)識材料,增進(jìn)對問題的了解。

3 分子層面的水—粘土礦物相互作用

隨著高效算法和計算機(jī)硬件的快速發(fā)展,以及各國專家學(xué)者對分子動力學(xué)模擬力場的研究開發(fā),粘土礦物與水分子在分子原子水平上相互作用的模擬已成為當(dāng)前土力學(xué)研究的前沿[6]。

近年來,粘土和粘土礦物這個專題使得一大批研究人員積極參與分子模擬,以期了解粘土礦物和粘土礦物過程的電子和分子行為。研究課題的多樣性和最先進(jìn)模擬方法的呈現(xiàn)將有助于粘土讀者認(rèn)識到通過理論方法獲得的分子細(xì)節(jié)的財富。隨著這個專題內(nèi)容的揭示,粘土礦物學(xué)的分子模擬已經(jīng)成熟,也是科學(xué)工具箱不可或缺的一部分。

X射線衍射(XRD)及傅里葉變換紅外光譜等技術(shù)提供了檢驗(yàn)理論模型和分子動力學(xué)模擬結(jié)果的潛力[7]。實(shí)驗(yàn)X射線(或中子)衍射方法和分子模擬是以類似分子長度尺度探測蒙脫石結(jié)構(gòu)組織的關(guān)鍵技術(shù),實(shí)驗(yàn)和數(shù)值這兩種方法的結(jié)合代表了實(shí)驗(yàn)樣品結(jié)構(gòu)異質(zhì)性的互補(bǔ)方法[8]。

另一方面,分子模擬是光譜試驗(yàn)結(jié)果的一個強(qiáng)有力的補(bǔ)充工具。由于天然樣品的實(shí)際化學(xué)成分與模型之間的差異,實(shí)驗(yàn)頻率和計算頻率之間的關(guān)系并不是線性關(guān)系。有些實(shí)驗(yàn)光譜峰位可能會發(fā)生重疊,而基于密度泛函理論計算所得的數(shù)據(jù)十分精確,峰位沒有重疊[9]。

Kremleva和Kruger[10]計算研究Np(Ⅴ)對粘土礦物表面的吸附,并將其與吸附U(Ⅵ)進(jìn)行比較。作為樣本案例研究,模擬了普通粘土礦物蒙脫石的(110)邊緣表面的Np(Ⅴ)吸附。由于目前沒有蒙脫石Np(Ⅴ)吸附的實(shí)驗(yàn)幾何參數(shù),將吸附產(chǎn)生的鍵長Np-Ot和Np-Oeq的計算變化暫時與高嶺石吸附的擴(kuò)展X射線吸收精細(xì)結(jié)構(gòu)(EXAFS)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)對于更優(yōu)選的吸附物質(zhì),這些幾何參數(shù)一致性很好。

4 結(jié)論與展望

況聯(lián)飛[2,11]深部土蒙脫石的高壓力學(xué)響應(yīng)進(jìn)行了一定程度的表象揭露,以理解物質(zhì)的本質(zhì)屬性為出發(fā)點(diǎn),從微觀原子分子水平的底部逐層遞階提出了深部高壓宏觀力學(xué)表征的機(jī)理,這個研究思路突破了過去使用的唯象回歸擬合描述,更加合理。然而,應(yīng)進(jìn)一步研究高嶺石、伊利石和其他粘土礦物的微觀和介觀物理和力學(xué)性質(zhì)。同時,加強(qiáng)對不同尺度間關(guān)聯(lián)策略的研究,實(shí)現(xiàn)粘土礦物—水體系的微觀、細(xì)觀和宏觀多尺度遞階模擬。

分子基礎(chǔ)不僅有助于開發(fā)和測試粘土結(jié)構(gòu)的晶體學(xué)模型,而且為理解控制許多物理和化學(xué)性質(zhì)、熱力學(xué)、動力學(xué)過程和反應(yīng)性的基本機(jī)制提供了重要的見解。分子模擬有助于解釋光譜和顯微鏡,以及與粘土礦物系統(tǒng)行為和動力學(xué)相關(guān)的許多其他關(guān)鍵問題。雖然分子模型和分子模擬顯然不是粘土礦物學(xué)所有技術(shù)挑戰(zhàn)的靈丹妙藥,但分子模型和模擬提供了堅實(shí)的理論背景,使我們能夠深入研究科學(xué)的基本機(jī)制,有廣闊的發(fā)展前景。

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