成 亮,劉 盼,邢恒榮,張 莉
(1.山西藥科職業(yè)學(xué)院,山西 太原 030031;2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西 太谷 030801)
研究表明,植物在逆境環(huán)境中,轉(zhuǎn)錄因子能夠通過(guò)抑制或激活下游基因的表達(dá)從而更好地適應(yīng)環(huán)境的改變[6-7]。植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子能夠與ABA響應(yīng)基因啟動(dòng)子區(qū)域的ABRE(ABA-responsive element)保守位點(diǎn)CACGTG結(jié)合調(diào)控下游基因的表達(dá)。擬南芥ABF/AREB類bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族共有4 個(gè) 基 因 , 包 括 ABF1,ABF2/AREB1,ABF3 和ABF4/AREB2。其中,ABF1在響應(yīng)低溫反應(yīng)中具有非常重要的作用,而ABF2,ABF3和ABF4則響應(yīng)干旱、強(qiáng)酸、高鹽、高溫和氧化等逆境脅迫[8]。
植物在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中受到種種制約,例如病蟲害、干旱、鹽堿、水澇、高溫、冷寒等,這些逆境脅迫促使植物在進(jìn)化過(guò)程中形成了可適應(yīng)環(huán)境變化的調(diào)控機(jī)理,使得植物在受到環(huán)境的刺激后能夠從基因分子水平進(jìn)行調(diào)控,從而抵御外界環(huán)境所帶來(lái)的威脅。因此,探明農(nóng)作物響應(yīng)非生物脅迫的分子機(jī)制并進(jìn)行生產(chǎn)應(yīng)用受到越來(lái)越多的重視。
谷子(Setaria italica)是我國(guó)北方地區(qū)的主要農(nóng)作物之一,是一種抗旱、耐貧瘠、適應(yīng)能力強(qiáng)的作物,是植物抗逆性研究中理想的模型[9-10]。通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)研究谷子響應(yīng)逆境脅迫的分子機(jī)制并對(duì)谷子進(jìn)行改良,是提升谷子農(nóng)業(yè)應(yīng)用能力的一項(xiàng)重要的措施。
為了探索SibZIP8基因在谷子抗逆脅迫中的作用,本研究擬構(gòu)建SibZIP8基因的超量表達(dá)載體,通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)揭示SibZIP8的調(diào)控機(jī)制,旨在為解析bZIP轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的谷子抗旱機(jī)制研究奠定理論基礎(chǔ)。
供試谷子品種為晉谷21,表達(dá)載體為pCAMBIA1302,均由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)提供。
Taq酶來(lái)自上海勁馬實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司;限制性內(nèi)切酶均為北京天恩澤生物有限公司產(chǎn)品;RNA提取試劑盒為上海索萊寶生物科技有限公司生產(chǎn);反轉(zhuǎn)錄酶、DNA凝膠回收試劑盒由上海伯易生物有限公司生產(chǎn);RNA酶抑制劑、質(zhì)粒提取試劑盒和DH5α感受細(xì)胞均為天根生物化學(xué)科技有限公司產(chǎn)品;PCR引物的合成和測(cè)序由北京華大基因研究中心完成。
1.3.1 谷子總RNA的提取 在山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)作站采集谷子嫩葉少許,在液氮中研磨,然后用RNA提取試劑盒提取,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證RNA的完整性,接著以mRNA為模板,用反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA。
1.3.2 PCR擴(kuò)增:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction) 根據(jù)SibZIP8基因的CDS序列設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物。在正向引物的5′端引入Nco1(CCATGG)酶切位點(diǎn),在反向引物的5′端引入BstZ17I(GTATAC)酶切位點(diǎn)。
由圖4和表3可知,雙層干燥模式整體來(lái)說(shuō),各干燥層的水分?jǐn)U散系數(shù)差異較小,平均值最大,約為1.1×10-4m2/s,原因是層數(shù)的變換使得風(fēng)速和溫度的分布相對(duì)均勻,物料中的水分能夠迅速蒸發(fā),從而促進(jìn)了水分?jǐn)U散。lnMR和干燥時(shí)間線性相關(guān)系數(shù)高,各干燥模式不同干燥層的擬合系數(shù)R2均大于0.92。而3層干燥模式的水分有效擴(kuò)散系數(shù)均值最小,約為0.81×10-6m2/s,主要與干燥層數(shù)有關(guān),層數(shù)增加使得風(fēng)速、溫度分布不均勻,影響水分轉(zhuǎn)移。
以反轉(zhuǎn)錄后的cDNA作為擴(kuò)增模板。PCR擴(kuò)增條件為:預(yù)變性條件95℃,5min;變性條件95℃,30 s,復(fù)性條件 56 ℃,30 s,延伸條件 72 ℃,1 min,34次循環(huán);72℃條件下延伸10 min。通過(guò)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,有單一的明亮條帶,用DNA凝膠回收試劑盒進(jìn)行PCR產(chǎn)物回收。
1.3.3 pCAMBIA1302-SibZIP8超表達(dá)載體構(gòu)建取用含有pCAMBIA1302質(zhì)粒的大腸桿菌進(jìn)行搖菌,等菌液濃度達(dá)到OD600值為0.4~0.5后,利用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒。pCAMBIA1302質(zhì)粒和上一步中純化的PCR產(chǎn)物同時(shí)用Nco1和BstZ17I進(jìn)行雙酶切。酶切產(chǎn)物通過(guò)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定,再用DNA凝膠回收試劑盒對(duì)雙酶切后的線性化質(zhì)粒和PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收。雙酶切后的基因片段利用T4連接酶與線性化載體連接,用Ca2+處理DH5α細(xì)胞呈感受態(tài)以吸收重組載體進(jìn)入到受體細(xì)胞,獲得重組質(zhì)粒,即pCAMBIA1302-SibZIP8超表達(dá)載體,最后進(jìn)行藍(lán)白斑篩選,獲得白斑菌落,提取質(zhì)粒DNA,并進(jìn)行測(cè)序。
通過(guò)檢索谷子基因組數(shù)據(jù)庫(kù),獲得SibZIP8 CDS序列(Si017618m),序列如圖1所示。
在正向引物5′端引入Nco1酶切位點(diǎn)和反向引物5′端引入BstZ17I酶切位點(diǎn),得到擴(kuò)增引物序列如下。
下一步以反轉(zhuǎn)錄得到cDNA為模板,以SibZIP8cDNA-F和SibZIP8cDNA-R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果如圖2所示。
采用1.3.3的試驗(yàn)方法,構(gòu)建pCAMBIA1302-SibZIP8重組載體,如圖3-A所示。用Nco1和BstZ17I雙酶切pCAMBIA1302-SibZIP8,然后進(jìn)行電泳檢測(cè),結(jié)果如圖3-B所示,SibZIP8基因已經(jīng)成功與載體進(jìn)行了連接。
為了進(jìn)一步確認(rèn)pCAMBIA1302-SibZIP8是否構(gòu)建成功,本研究選擇酶切成功的2號(hào)克隆進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序引物如下。
測(cè)序比對(duì)結(jié)果如圖4所示,表達(dá)載體中連接的基因片段序列與SibZIP8基因的CDS序列一致,表明目的基因已成功連接到了表達(dá)載體上,超量表達(dá)載體構(gòu)建成功。
bZIP轉(zhuǎn)錄因子能夠參與調(diào)控多種植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程,在植物抵抗逆境脅迫等過(guò)程中也起著非常重要的作用[11]。SiZIP基因作為轉(zhuǎn)錄因子可通過(guò)調(diào)控下游一些靶基因的表達(dá),在植物逆境脅迫的條件下發(fā)揮作用。YING等[12]研究發(fā)現(xiàn),在擬南芥中過(guò)量表達(dá)玉米ZmbZIP72轉(zhuǎn)錄因子,能夠明顯增強(qiáng)擬南芥對(duì)干旱與高鹽脅迫的耐受性。煙草ThpbZIP1和LEA基因的協(xié)同表達(dá),可增強(qiáng)煙草在逆境脅迫下的耐受性。此外,臘梅在脫落酸、高溫、低溫、高鹽和干旱等逆境脅迫下,LEA基因可以誘導(dǎo)表達(dá)[13]。BALOGLU等[14]研究發(fā)現(xiàn),在干旱脅迫條件下,黃瓜的某些bZIP基因會(huì)表現(xiàn)出下調(diào)或者上調(diào)的趨勢(shì)。
劉寶玲等[15]利用生物信息學(xué)的分析方法,系統(tǒng)地分析了谷子SibZIP轉(zhuǎn)錄因子家族,得到較為完整的谷子bZIP基因家族信息。谷子基因組共編碼75個(gè)SibZIP轉(zhuǎn)錄因子基因,可劃分9個(gè)亞家族。其中,SibZIP8基因在谷子各組織中的表達(dá)量變化較大。為了探索該基因的功能,本研究構(gòu)建了SibZIP8基因的超量表達(dá)載體,下一步將轉(zhuǎn)化谷子進(jìn)行基因功能的驗(yàn)證??傊?,本研究結(jié)果將為解析bZIP介導(dǎo)的谷子抗旱機(jī)制研究奠定理論基礎(chǔ),為利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)提高作物抗逆性提供候選基因。