程 珍,趙慧婷,林 飛,雷艷靜
(浙江工業(yè)大學(xué) 計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,杭州 310023)
分子通信作為一種新型的網(wǎng)絡(luò)技術(shù),它使得納米網(wǎng)絡(luò)的實(shí)現(xiàn)成為可能[1].分子通信[2]是納米機(jī)器之間一種新型的通信方式,以生物化學(xué)分子作為信息載體,通過(guò)分子在生物環(huán)境中擴(kuò)散的方式進(jìn)行相互通信[3].分子通信技術(shù)有望在有前景的領(lǐng)域中得到應(yīng)用,例如,藥物傳遞[4]以及納米體域網(wǎng)[5]等.
針對(duì)分子通信的生物兼容性、不可靠性的特點(diǎn)[6],較多的研究者對(duì)不同的分子通信模型的性能進(jìn)行了詳細(xì)的分析.Atakan等人[7]設(shè)計(jì)了可移動(dòng)的ad hoc分子納米網(wǎng)絡(luò)模型并分析該納米網(wǎng)絡(luò)如何達(dá)到較高的吞吐量.Akan等人[8]首次提出基于信息分子的概率密度通信模型,并利用簡(jiǎn)單異或網(wǎng)絡(luò)編碼機(jī)制減少了時(shí)延開銷.在此基礎(chǔ)上,Atakan等人[9]優(yōu)化了該模型的信道容量.Balasubramaniam等人[10]深入分析了基于細(xì)菌分子通信網(wǎng)絡(luò)在網(wǎng)格拓?fù)浜碗S機(jī)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)下的多跳路由機(jī)制.Walsh 等人[11]研究了將病毒粒子作為信息載體的多跳分子通信模型,分析了病毒分子納米網(wǎng)絡(luò)多跳傳輸?shù)目煽啃?,并將病毒粒子的擴(kuò)散、吸收、衰變的過(guò)程作為影響多跳鏈路可靠性的因素進(jìn)行考慮.論文[12]研究了不考慮碼間干擾的、基于概率密度的分子通信模型在多播場(chǎng)景下的可靠性和時(shí)延分析.
擴(kuò)散的分子通信模型中[13],發(fā)送方納米機(jī)器通過(guò)釋放一定數(shù)量的分子到生物環(huán)境中表示信息的傳輸,分子遵循布朗運(yùn)動(dòng)規(guī)則擴(kuò)散,并隨機(jī)到達(dá)接收方納米機(jī)器.到目前為止,還沒有文獻(xiàn)研究擴(kuò)散的分子通信模型在考慮碼間干擾情況下的可靠性和時(shí)延分析,本文填補(bǔ)了此空缺.本文與已有工作[11,12]比較如下:
從分子通信模型上比較,論文[11]考慮了基于病毒的分子通信模型,可以看到可靠性和時(shí)延的計(jì)算主要依賴于分子濃度公式,影響可靠性和時(shí)延的參數(shù)是不同的.論文[12]中的可靠性和時(shí)延研究主要是基于概率密度的分子通信模型,但該論文中的分子通信模型沒有考慮分子在前面時(shí)隙對(duì)當(dāng)前時(shí)隙的碼間干擾.而本文研究了基于概率密度的分子通信模型并考慮了發(fā)送方納米機(jī)器在前面所有時(shí)隙釋放的分子對(duì)當(dāng)前時(shí)隙的碼間干擾情況.
從仿真結(jié)果上比較,分別與基于病毒的分子通信模型[11]和不考慮碼間干擾的分子通信模型[12]相比,在相同的通信場(chǎng)景下,擴(kuò)散的分子通信模型達(dá)到相同的可靠性所花費(fèi)的時(shí)延開銷大大降低.
本節(jié)介紹本文所考慮的二進(jìn)制分時(shí)隙的、擴(kuò)散的分子通信模型.在該模型中,發(fā)送方納米機(jī)器TN(Transmitter Nanomachine)和接收方納米機(jī)器RN(Receiver Nanomachine)分別表示該模型中的發(fā)送方和接收方.假設(shè)TN與RN在時(shí)間上完全同步,同時(shí)假設(shè)所有分子被接收的事件發(fā)生在離散時(shí)間點(diǎn).分子傳輸時(shí)間被劃分為大小相同的時(shí)隙,記為T=NTs.T為信息傳輸?shù)臅r(shí)間,Ts為每個(gè)時(shí)隙持續(xù)時(shí)間,N為所劃分的時(shí)隙的個(gè)數(shù).在二進(jìn)制擴(kuò)散的分子通信模型中,輸入輸出均為二進(jìn)制信息比特1或0,待發(fā)送的二進(jìn)制比特信息被編碼在分子上,這里用兩種不同類型的分子A1和A2分別表示比特1和0的發(fā)送.A1和A2類型的分子均包含要到達(dá)的RN的地址信息.
分子通信模型的基本過(guò)程包括信息的編碼、發(fā)送、傳輸、接收和解碼五個(gè)步驟[14].當(dāng)TN在時(shí)間T內(nèi)發(fā)送信息比特1或0,則TN在每個(gè)時(shí)隙開始時(shí)釋放M個(gè)相應(yīng)A1類型或A2類型分子到傳輸信道中,分子一旦被釋放在生物環(huán)境中,會(huì)進(jìn)行自由擴(kuò)散.這些分子可能在當(dāng)前時(shí)隙到達(dá)RN,也可能會(huì)在之后的時(shí)隙到達(dá)RN.當(dāng)被RN接收后會(huì)立即被吸收,不再存在生物環(huán)境中.圖1展示了分子在TN和RN間的傳輸信道中的傳輸過(guò)程.這里M=8,N=4.
圖1 分子在TN和RN間擴(kuò)散的時(shí)序圖Fig.1 Sequence diagram of molecules diffuse between TN and RN
我們考慮一維環(huán)境中的分子擴(kuò)散情況,在分子傳輸及擴(kuò)散過(guò)程中,描述任一分子從發(fā)送方納米機(jī)器i到達(dá)接收方納米機(jī)器j的時(shí)間t的概率密度函數(shù)[15]為
(1)
其中,dij表示兩個(gè)納米機(jī)器之間的距離,D是生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù).因此,fij(t)的累積分布函數(shù)Fij(t)可以用于描述一個(gè)分子在t時(shí)刻之前到達(dá)接收方納米機(jī)器的概率,表示如下:
(2)
在分子接收過(guò)程中,RN通過(guò)收到的分子類型判定當(dāng)前時(shí)隙收到的比特為1或0.當(dāng)RN成功收到TN發(fā)送的分子,則RN必須發(fā)送M個(gè)確認(rèn)分子給TN.確認(rèn)分子的類型不同于發(fā)送1或0所對(duì)應(yīng)的A1或A2類型,但它們有相同的擴(kuò)散、被吸收等性質(zhì).當(dāng)TN沒有成功收到RN發(fā)送的確認(rèn)分子,TN需要重傳相同數(shù)量的同類型分子給RN.當(dāng)RN在設(shè)置的超時(shí)時(shí)間內(nèi)沒有成功收到TN發(fā)送的分子,TN同樣需要重傳相同數(shù)量的同類型分子給RN.
在本節(jié)中,我們給出了單鏈路和多跳鏈路通信場(chǎng)景下,擴(kuò)散的分子通信模型的可靠性和時(shí)延的數(shù)學(xué)表達(dá)式;此外,研究了當(dāng)鏈路傳輸失敗時(shí),如何利用重傳機(jī)制保證該模型中信息的可靠傳輸.
假設(shè)發(fā)送方納米機(jī)器i在時(shí)隙k發(fā)送一個(gè)比特1或0的概率相同,記為β.令Pij(k,n)表示發(fā)送方納米機(jī)器i第k個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子在第n個(gè)時(shí)隙被接收方納米機(jī)器j收到的概率.則有:
Pij(k,n)=β[Fij((n-k+1)Ts)-Fij((n-k)Ts)],k (3) 特別地,當(dāng)k=n時(shí), Pij(n,n)=βFij(Ts) (4) 因此,發(fā)送方納米機(jī)器i發(fā)送的分子在第n個(gè)時(shí)隙沒有被接收方納米機(jī)器j收到的概率pij(n)為: (5) 單鏈路的可靠性定義為接收方納米機(jī)器j在T時(shí)刻之前即N個(gè)時(shí)隙內(nèi)至少收到一個(gè)分子的概率,用γij表示,即為: (6) 其中,M表示發(fā)送方納米機(jī)器i在每個(gè)時(shí)隙開始時(shí)發(fā)送的分子數(shù).可以看到,發(fā)送方納米機(jī)器i每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)、兩個(gè)納米機(jī)器之間的距離、生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)等參數(shù)對(duì)鏈路的可靠性有著十分重要的影響. 我們關(guān)注接收方納米機(jī)器j首次成功收到分子的情況.用Psuccess,ij(m)表示在前面(m-1)個(gè)時(shí)隙接收方納米機(jī)器j都沒有成功收到一個(gè)分子,并在第m個(gè)時(shí)隙首次成功收到一個(gè)分子的概率.計(jì)算公式如下所示: (7) 鏈路的傳輸時(shí)延τij定義為發(fā)送方納米機(jī)器i發(fā)送的分子首次成功被接收方納米機(jī)器j收到的第m個(gè)時(shí)隙內(nèi),分子被成功收到的概率之和達(dá)到該鏈路可靠性的一半時(shí)所需的最小時(shí)間.表示如下: (8) 根據(jù)[8],我們將鏈路ij間總的時(shí)延τtotal,ij定義為傳輸時(shí)延τij以及為釋放信息分子而消耗的準(zhǔn)備時(shí)延τprepare之和,即: τtotal,ij=τij+τprepare (9) 當(dāng)發(fā)送方納米機(jī)器i發(fā)送一定數(shù)量的分子到生物環(huán)境中,由于分子擴(kuò)散的隨機(jī)性,接收方納米機(jī)器j可能會(huì)產(chǎn)生沒有分子到達(dá)的情況.因此,需要考慮用上節(jié)介紹的重傳機(jī)制來(lái)保證鏈路的可靠傳輸.我們定義:當(dāng)單鏈路傳輸失敗,需要進(jìn)行重傳時(shí)該鏈路的可靠性Pre,ij為第fij次傳輸時(shí)RN至少收到一個(gè)分子的概率為: (10) 其中,fij表示最大重傳次數(shù).鏈路ij間的可靠性γij可以通過(guò)(6)得到.此時(shí)鏈路的總時(shí)延Tre,ij為: Tre,ij=τprepare+τij+τACK,ijfij (11) 其中,τACK,ij為鏈路的超時(shí)時(shí)間,鏈路的傳輸時(shí)延τij可以通過(guò)(8)得到. 多跳鏈路的通信場(chǎng)景如圖2所示.其中,發(fā)送方納米機(jī)器TN、接收方納米機(jī)器RN以及中繼納米機(jī)器A、B等一系列納米機(jī)器組成多跳拓?fù)浣Y(jié)構(gòu).TN發(fā)送分子,通過(guò)納米機(jī)器的轉(zhuǎn)發(fā),最后到達(dá)RN.我們將多跳拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)看成由多個(gè)單鏈路組成,即中繼納米機(jī)器A既是TN的接收方納米機(jī)器,同時(shí)又是下一跳納米機(jī)器的發(fā)送方納米機(jī)器,而分子只能在相鄰的納米機(jī)器間進(jìn)行傳輸.在每個(gè)時(shí)隙的開始,TN會(huì)發(fā)送相應(yīng)類型的分子給中繼納米機(jī)器A.當(dāng)A至少收到一個(gè)從TN釋放的分子后,會(huì)給TN發(fā)送確認(rèn)分子表示已成功收到信息,同時(shí)通過(guò)收到的分子類型進(jìn)行解碼,將解碼后的信息對(duì)應(yīng)到相應(yīng)類型的分子并轉(zhuǎn)發(fā)給下一個(gè)納米機(jī)器.如果在超時(shí)時(shí)間內(nèi)TN沒有收到來(lái)自A的確認(rèn)分子,那么TN重新發(fā)送相同數(shù)量的同類型的分子給A.根據(jù)以上傳輸過(guò)程,我們可以推導(dǎo)出擴(kuò)散的多跳分子通信模型的可靠性和時(shí)延分析情況. 圖2 多跳鏈路的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)Fig.2 Topology of multihop link 假設(shè)s為多跳鏈路上W個(gè)納米機(jī)器的集合,Bs為每條單鏈路的可靠性集合,Ds為每條單鏈路的時(shí)延集合.例如,假設(shè)多跳鏈路由三跳單鏈路構(gòu)成,即W=4,則s=[1,2,3,4]表示多跳鏈路s中存在納米機(jī)器1,2,3,4,分子可通過(guò)納米機(jī)器1經(jīng)由納米機(jī)器2和3傳遞到納米機(jī)器4.此時(shí),該鏈路可靠性的集合記為Bs=[γ12,γ23,γ34],時(shí)延的集合為Ds=[τ12,τ23,τ34].W個(gè)納米機(jī)器構(gòu)成的多跳鏈路的可靠性γs和時(shí)延τs為 (12) (13) 當(dāng)鏈路傳輸失敗時(shí),令fs表示相鄰納米機(jī)器組成的鏈路重傳次數(shù)的集合.則此時(shí)多跳鏈路的可靠性Pre,s和時(shí)延Tre,s分別為 (14) (15) 其中,Bre,s和Dre,s分別表示考慮重傳時(shí)單鏈路可靠性和時(shí)延的集合,Pre,ij和Tre,ij分別通過(guò)公式(10)(11)獲得,其中的數(shù)據(jù)來(lái)源于Bs和Ds,節(jié)點(diǎn)ij間的最大重傳次數(shù)fij取自fs集合. 本節(jié)將通過(guò)Matlab實(shí)驗(yàn)仿真展示擴(kuò)散的分子通信模型中,不同參數(shù),包括納米機(jī)器之間的距離d、生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)D、每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)M對(duì)單鏈路及多跳通信場(chǎng)景下的可靠性和時(shí)延的影響. 本小節(jié)中,我們考慮單鏈路場(chǎng)景包括成功鏈路以及失敗鏈路下的可靠性和時(shí)延分析. 4.1.1 成功單鏈路的可靠性分析 在圖3和圖4中,我們通過(guò)公式(6)分別描繪了生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)D以及TN和RN之間距離d在取不同值的情況下,鏈路可靠性隨著每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)增大的變化趨勢(shì).參數(shù)設(shè)置如下:N=20,Ts=30s.此外,在圖3中,d=200μm;在圖4中,D=7μm2/s. 圖3 D取值不同時(shí)單鏈路可靠性與M的關(guān)系Fig.3 Reliability of single link is varying with M for different values of D 由圖3和圖4可知,在其它參數(shù)保持不變的情況下,單鏈路的可靠性會(huì)隨著每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)增大而提高,但到達(dá)一定數(shù)量后不再增大.這是由于在生物環(huán)境中的分子個(gè)數(shù)變大導(dǎo)致分子到達(dá)接收方納米機(jī)器的概率變大,從而使得單鏈路的可靠性增大.另一方面,在圖3中,當(dāng)生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)增大時(shí),該鏈路的可靠性會(huì)隨之增大.擴(kuò)散系數(shù)越大意味著分子運(yùn)動(dòng)越快,在相同的時(shí)間內(nèi)到接收方納米機(jī)器的概率就越大.而在圖4中,保持其它參數(shù)不變,減小兩個(gè)納米機(jī)器之間的距離會(huì)增大單鏈路的可靠性.兩個(gè)納米機(jī)器之間的距離越小,使得相同數(shù)量的分子在相同時(shí)間內(nèi)更容易到達(dá)接收方納米機(jī)器,從而提高了該鏈路的可靠性. 圖4 d取值不同時(shí)單鏈路可靠性與M的關(guān)系Fig.4 Reliability of single link is varying with M for different values of d 4.1.2 成功單鏈路的時(shí)延分析 在圖5和圖6中,我們通過(guò)公式(9)分別描繪了生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)D以及TN和RN之間距離d在取不同值的情況下,單鏈路的時(shí)延隨著每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子數(shù)量增大的變化趨勢(shì).參數(shù)設(shè)置如下:N=50,Ts=30s.此外,在圖5中,d=200μm,在圖6中,D=7μm2/s.根據(jù)[8],每釋放10個(gè)信息分子需要消耗準(zhǔn)備時(shí)間τprepare為10-3s.當(dāng)每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)增大,時(shí)延會(huì)隨之減少.這是由于生物環(huán)境中的分子個(gè)數(shù)增多導(dǎo)致分子到達(dá)接收方納米機(jī)器的概率增大,從而所需的時(shí)延就會(huì)減少.在圖5中,隨著生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)的增大,分子運(yùn)動(dòng)變快,分子到達(dá)接收方納米機(jī)器的時(shí)延減少.在圖6中,隨著兩個(gè)納米機(jī)器之間距離的增大,分子到達(dá)接收方納米機(jī)器的時(shí)延增大. 圖5 D取值不同時(shí)單鏈路時(shí)延與M的關(guān)系Fig.5 Delay of single link versus M for different values of D 圖6 d取值不同時(shí)單鏈路時(shí)延與M的關(guān)系Fig.6 Delay of single link versus M for different values of d 4.1.3 失敗單鏈路可靠性和時(shí)延分析 圖7和圖8是失敗單鏈路場(chǎng)景下,鏈路可靠性和時(shí)延在重傳機(jī)制下與每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)之間的關(guān)系.參數(shù)設(shè)置如下:d=200μm,D=3.6μm2/s,N=35,Ts=25s.默認(rèn)在納米機(jī)器1和2之間進(jìn)行傳輸,f12表示最大重傳次數(shù),圖中省略下標(biāo),之后相關(guān)圖不另行說(shuō)明.隨著重傳的次數(shù)增加,鏈路的可靠性增加,鏈路的時(shí)延也相應(yīng)地變大.當(dāng)分子個(gè)數(shù)為50時(shí),重傳一次的可靠性增大不到0.2,但時(shí)延差不多是原來(lái)的3倍.雖然重傳一次所花費(fèi)的時(shí)延代價(jià)比較高,但是在分子納米通信中保證通信的可靠性非常重要,因此,在可以容忍的范圍內(nèi)以時(shí)延為代價(jià)提高鏈路的可靠性是值得的. 根據(jù)圖2,我們假設(shè)一維生物環(huán)境中有四個(gè)納米機(jī)器,包括發(fā)送方和接收方納米機(jī)器,以及兩個(gè)中繼納米機(jī)器.同時(shí)假設(shè)每?jī)蓚€(gè)納米機(jī)器之間的距離相等,并假設(shè)每個(gè)納米機(jī)器只能與相鄰的納米機(jī)器通信.圖9和圖10分別展示了多跳鏈路通信場(chǎng)景下的可靠性和時(shí)延與每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)之間的變化關(guān)系.參數(shù)設(shè)置如下:在圖9中,D=3.6μm2/s,N=20,Ts=40s,d=200μm.在圖10中,D=10μm2/s,N=50,Ts=20s,d=200μm.根據(jù)公式(12)、(13)、(14)、(15)可以得到多跳鏈路的可靠性和時(shí)延的仿真結(jié)果. 圖7 f取不同值時(shí)單鏈路可靠性與M的關(guān)系Fig.7 Reliability of single link versus M for different f 圖8 f取不同值時(shí)單鏈路時(shí)延與M的關(guān)系Fig.8 Delay of single link versus M for different f 圖9 f取不同值時(shí),多跳鏈路可靠性與M的關(guān)系Fig.9 Reliability of multihop link versus M for different f 圖10 f取不同值時(shí),多跳鏈路時(shí)延與M的關(guān)系Fig.10 Delay of multihop link versus M for different f 多跳鏈路和單鏈路一樣,當(dāng)每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)增大時(shí),鏈路的可靠性增大,時(shí)延減小.另外,在圖9和圖10中,我們可以看到當(dāng)最大的重傳次數(shù)增大時(shí),鏈路的可靠性和時(shí)延也相應(yīng)地增大. 本節(jié)主要考慮在單鏈路通信場(chǎng)景中,在參數(shù)設(shè)置相同值的條件下,與[11]和[12]的分子通信模型中達(dá)到相同可靠性所需時(shí)延的對(duì)比. 圖11展示的是擴(kuò)散系數(shù)D分別取2μm2/s、3.6μm2/s和7μm2/s的情況下,單鏈路可靠性與時(shí)延間的關(guān)系.這里,參數(shù)設(shè)置如下:M=1500,d=200μm,N=20.由圖11可知,當(dāng)D=3.6μm2/s時(shí),鏈路的可靠性達(dá)到0.9所需要的時(shí)延約為0.15小時(shí).在參數(shù)包括釋放總的分子個(gè)數(shù),D和d設(shè)置相同值的情況下,當(dāng)達(dá)到相同的可靠性0.9時(shí),論文[11]中所需時(shí)延為5小時(shí),論文[12]中所需時(shí)延為2.5小時(shí).因此,與[11]和[12]中的分子通信模型相比,在相同的通信場(chǎng)景下,擴(kuò)散的分子通信模型達(dá)到相同的可靠性所花費(fèi)的時(shí)延開銷大大降低. 圖11 單鏈路時(shí)延與可靠性的關(guān)系Fig.11 Relationship between delay and reliability for single link 在本文中,我們考慮了發(fā)送方納米機(jī)器在前面所有時(shí)隙釋放的分子對(duì)當(dāng)前時(shí)隙的碼間干擾,分析了擴(kuò)散的分子通信模型在單鏈路及多跳鏈路下的可靠性和時(shí)延.特別地,對(duì)于失敗鏈路,我們利用重傳機(jī)制保證信息傳輸?shù)目煽啃?在此情況下,也分析了失敗的單鏈路和多跳鏈路下的可靠性和時(shí)延.隨著每個(gè)時(shí)隙發(fā)送的分子個(gè)數(shù)的增加,生物環(huán)境的擴(kuò)散系數(shù)越大,兩個(gè)納米機(jī)器之間的距離越小,可靠性會(huì)提高,同時(shí),時(shí)延會(huì)減小.此外,重傳可以大大增加鏈路的可靠性,與此同時(shí),傳輸時(shí)延也會(huì)增大.值得一提的是,分別與[11]和[12]相比,對(duì)于相同的通信場(chǎng)景,擴(kuò)散的分子通信模型達(dá)到相同的可靠性所花費(fèi)的時(shí)延開銷大大降低. : [1] Akyildiz I F,Brunetti F,Blázquez C.Nanonetworks:a new communication paradigm[J].Computer Networks(Comput.Netw.),2008,52(12):2260-2279. 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4 仿真結(jié)果
4.1 單鏈路場(chǎng)景下的可靠性和時(shí)延分析
4.2 多跳鏈路的可靠性和時(shí)延分析
4.3 與其它分子通信模型的對(duì)比
5 結(jié)束語(yǔ)