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基于單光子計(jì)數(shù)的水稻真菌病害孢子活性檢測的方法

2018-06-17 07:32:20馮冠潮
科學(xué)與技術(shù) 2018年26期

馮冠潮

摘要:本項(xiàng)目通過單光子計(jì)數(shù)器對水稻真菌病害孢子活性進(jìn)行檢測,通過使用微流控芯片配合單光子計(jì)數(shù)器簡化原有檢測過程,縮短檢測周期,達(dá)到對于水稻病害包子的早期及時(shí)預(yù)測,具有巨大的經(jīng)濟(jì)效益和項(xiàng)目前景

關(guān)鍵詞:水稻真菌病害;單光子計(jì)數(shù);縮短檢測周期

稻作為世界主要糧食作物之一。中國水稻播種面占全國糧食作物的1/3,而稻谷產(chǎn)量則糧食總產(chǎn)量的45%,同時(shí)我國65%以上的人口以大米為主食。水稻的產(chǎn)量又與水稻病害息息相關(guān),稻瘟病、紋枯病和白葉枯病并稱水稻三大病害,每年對水稻生產(chǎn)造成巨大損失,其中稻瘟病、紋枯病都是由真菌引起。據(jù)統(tǒng)計(jì),在現(xiàn)有防治水平下,全國平均每年水稻因水稻病害引起的減產(chǎn)達(dá)400-500萬噸,所以對由真菌引起的水稻病害的孢子檢測與預(yù)防工作刻不容緩。

針對上述水稻病害即稻瘟病、紋枯病,研究表明,這兩種病害都是由真菌引起,同時(shí)孢子傳播途徑都是空氣傳播。因此,對這兩類病害的最佳檢測手段就是對植株周邊空氣中致病孢子的濃度和活性進(jìn)行檢測。現(xiàn)階段,對植物取樣孢子活性的傳統(tǒng)檢測需要先將取得的樣品進(jìn)行殺菌純化后經(jīng)行培養(yǎng),如點(diǎn)植法、稀釋平板計(jì)數(shù)法等,然后通過化學(xué)染色法如亞甲基藍(lán)[8]或通過熒光素二乙酸酯等進(jìn)行染色,再進(jìn)行如直接顯微鏡記數(shù)法、最近似數(shù)測定法等進(jìn)行計(jì)數(shù)測量得到孢子活性。這類方法雖然實(shí)驗(yàn)過程簡單,成本低廉,對設(shè)備要求較低,但是測量周期較長,無法對水稻病害進(jìn)行早期檢測和預(yù)防。隨著現(xiàn)代醫(yī)學(xué)免疫學(xué)和基因技術(shù)的發(fā)展,對孢子活性的檢測也產(chǎn)生了很多多樣化的手段,如多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)、酶聯(lián)免疫法(ELISA)、直接表面熒光濾膜計(jì)數(shù)技術(shù)(DEFT)等[4,8]。由于水稻致病真菌的氣傳孢子具有濃度極低,孢子尺寸極小且樣本中雜菌、雜質(zhì)含量高的特,點(diǎn)現(xiàn)有檢測手段雖然可以準(zhǔn)確測定孢子個體數(shù)量變化,但是由于檢測試劑如底物、輔酶的限制,對被測對象存在檢測的盲目性和滯后性。而且為了提高檢測結(jié)果,避免外界干擾,需要嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境和復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)過程,導(dǎo)致較高的設(shè)備需求和檢測成本。

光子計(jì)數(shù)器(PMT)是一種基于直接探測量子限理論的極微弱光脈沖檢測設(shè)備。它利用光電倍增管的單光子檢測技術(shù),通過對電子計(jì)數(shù)器鑒別并測量單位時(shí)間內(nèi)的光子數(shù),從而檢測離散微弱光脈沖信號功率[6](見圖2)。由于光子計(jì)數(shù)器對微弱光照的敏感性,目前國內(nèi)外單光子計(jì)數(shù)法在微弱熒光生物測量方面有著較為廣泛運(yùn)用,如通過基于時(shí)間相關(guān)單光子計(jì)數(shù)法測量生物組織光學(xué)參數(shù)[5](見圖3)利用時(shí)間相關(guān)單光子計(jì)數(shù)法測量人體癌細(xì)胞的熒光光譜特性[10,11]。但是,目前的國內(nèi)單光子計(jì)數(shù)器對于孢子活性的熒光檢測方面研究尚存較大空白,首先并無可以直接進(jìn)行檢測的針對性裝備,其次亦無對熒光強(qiáng)度與孢子活性間適配的數(shù)學(xué)模型。而且現(xiàn)存對其他對象的檢測方案對待測樣本的要求較高,需要經(jīng)過一定的預(yù)處理過程,對實(shí)驗(yàn)設(shè)備有較高要求;同時(shí)檢測方案多為通過光子的散射和反射來間接測量樣本,后期數(shù)據(jù)處理過程較為復(fù)雜,計(jì)算量大。

本項(xiàng)目擬采用以下技術(shù)思路,技術(shù)路線如圖所示:

光傳孢子的特性以及分布模型選擇合適的微流控材料并設(shè)計(jì)特定的微流控芯片,設(shè)計(jì)并構(gòu)建光學(xué)通路,并創(chuàng)建基于單光子計(jì)數(shù)器的熒光檢測平臺,用熒光檢測平臺對目標(biāo)孢子進(jìn)行熒光檢測。通過實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)結(jié)合已有文獻(xiàn)資料建立數(shù)學(xué)模型,并用該數(shù)學(xué)模型進(jìn)行軟件仿真以求復(fù)現(xiàn)數(shù)據(jù)。

本實(shí)驗(yàn)主要研究內(nèi)容:

(1)、解決微流控芯片芯片對于氣傳孢子的純化、富集問題,尋找合適的對水稻氣傳孢子具有靶向檢測效果的熒光試劑;

(2)、解決單光子計(jì)數(shù)裝置與微流控芯片光學(xué)耦合的問題;

(3)、解決病害種類及程度與熒光光子吸收量間的模型關(guān)系問題;

平臺創(chuàng)建構(gòu)思:

(1)、解決微流控芯片芯片對于氣傳孢子的純化、富集問題,尋找合適的對水稻氣傳孢子具有靶向檢測效果的熒光試劑;

(2)、解決單光子計(jì)數(shù)裝置與微流控芯片光學(xué)耦合的問題;

(3)、解決病害種類及程度與熒光光子吸收量間的模型關(guān)系問題;

3、針對數(shù)學(xué)模型的建立問題:、

(1)、根據(jù)前期建立的孢子生化反應(yīng)模型和物理空間分布特性模型結(jié)合實(shí)驗(yàn)原始數(shù)據(jù)建立先期模型;

(2)、通過實(shí)驗(yàn)結(jié)果與數(shù)學(xué)模型分析結(jié)果進(jìn)行比對,修正數(shù)學(xué)模型。

(作者單位:江蘇大學(xué))

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