保護區(qū)位于青藏高原腹地，青海南部。

是中國面積最大的自然保護區(qū)，也是世界高海拔地區(qū)生物多樣性最集中和生態(tài)最敏感地區(qū)。

2000年8月19日，三江源自然保護區(qū)紀念碑正式落成揭碑，標志著三江源自然保護區(qū)正式成立。

2016年6月，三江源國家公園管理局在西寧掛牌成立，三江源國家公園是我國第一個國家公園，范圍包括青海可可西里國家級自然保護區(qū)，及三江源國家級自然保護區(qū)的扎陵湖、鄂陵湖、星星海等地。

三江源自然保護區(qū)河流密布，湖泊、沼澤眾多，雪山冰川廣布，是世界上海拔最高、面積最大、分布最集中的地區(qū)，濕地總面積占保護區(qū)總面積的24%。

三江源是中國面積最大的自然保護區(qū)，是海拔最高的天然濕地，平均海拔4000多米。它是長江、黃河、瀾滄江三條大河的發(fā)源地，素有中華水塔之美譽。

歷史上，三江源區(qū)曾是野生動物種群繁多的高原草原草甸區(qū)，被稱為生態(tài)“處女地”。然而隨著全球氣候變暖，冰川、雪山逐年萎縮，直接影響高原湖泊和濕地的水源補給，眾多的湖泊、濕地面積縮小甚至干涸，沼澤地

河流：三江源區(qū)有大小河流180多條。外流河主要是通天河、黃河、瀾滄江（上游稱扎曲）三大水系，支流由雅礱江、當曲、卡日曲、孜曲、結(jié)曲等大小河川并列組成。

湖泊：三江源區(qū)是一個多湖泊地區(qū)，大小湖泊1800余個，淡水湖和微咸水湖148個，總面積2623 平方公里。鹽湖共計28個。列入中國重要濕地名錄的有扎陵湖、鄂陵湖、瑪多湖等。其中扎陵湖、鄂陵湖是黃河干流上最大的兩個淡水湖，具有巨大的調(diào)節(jié)水量功能。

沼澤：三江源自然保護區(qū)環(huán)境嚴酷，自然沼澤類型獨特，在黃河源、長江的沱沱河、楚瑪爾河、當曲河三源頭、瀾滄江河源都有大片沼澤發(fā)育，成為中國最大的天然沼澤分布區(qū)，總面積達6.66萬平方公里。

雪山冰川：三江源內(nèi)雪山、冰川約2400平方公里，冰川資源蘊藏量達2000億立方米，現(xiàn)代冰川均屬大陸性山地冰川。以當曲流域冰川覆蓋面積最大，沱沱河流域次之，楚瑪爾河流域最小，冰川總面積1247 平方公里，冰川年消融量約9.89 立方米。

地下水：三江源區(qū)地下水資源也比較豐富，僅玉樹州的地下水貯量就約達115億立方米，補給方式主要為降水的垂直補給和冰雪融水。