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基于成像高光譜數(shù)據(jù)的溫室水稻重金屬脅迫診斷研究

2018-05-14 08:59張雙印王云將歐陽煒費(fèi)騰
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年1期

張雙印 王云將 歐陽煒 費(fèi)騰

摘要 [目的] 通過溫室水稻葉片高光譜影像數(shù)據(jù),從Cd和Pb不同梯度的交叉脅迫中診斷具體的脅迫類別和脅迫梯度。 [方法] 經(jīng)過雙因素方差分析篩選出特征波段,比較SVM和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在診斷能力上的強(qiáng)弱。 [結(jié)果] 在幾種預(yù)處理方法中,對(duì)光譜二階微分預(yù)處理可以對(duì)Cd和Pb脅迫達(dá)到很好的診斷效果,預(yù)處理后挑選出6個(gè)對(duì)Cd脅迫敏感的特征波段以及10個(gè)對(duì)Pb脅迫敏感的特征波段?;赟VM的診斷Cd脅迫的精度達(dá)86%,對(duì)3個(gè)具體梯度的診斷精度達(dá)75%、90%、96%,對(duì)Pb脅迫的診斷精度達(dá)85%,3個(gè)梯度分別為83%、85%、88%;基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的Cd脅迫診斷精度達(dá)88%,3個(gè)梯度為69%、75%、75%;對(duì)Pb脅迫的診斷精度達(dá)88%,3個(gè)梯度為81%、69%、69%。 [結(jié)論] 從植被高光譜影像數(shù)據(jù)診斷重金屬Cd和Pb脅迫是可行的,且SVM的診斷精度整體優(yōu)于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。

關(guān)鍵詞 高光譜;重金屬診斷;SVM;BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

中圖分類號(hào) S-3;TP79文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A文章編號(hào) 0517-6611(2018)01-0005-05

Abstract [Objective] This study aimed to diagnose specific stress categories and stress gradients from the cross-stress of Cd and Pb with high spectral imagery data of greenhouse rice leaves. [Method] After double factor variance analysis, the characteristic bands for diagnosis were selected, and two models of SVM and BP neural network were compared in terms of diagnostic ability. [Result] The results showed that with the pretreatment of 2nd spectral derivative, SVM could achieve very good diagnostic effect for Cd and Pb stress. 6 characteristic bands were identified sensitive to Cd stress, and 10 characteristic bands were identified sensitive to Pb stress. The accuracy of diagnostic Cd stress based on SVM was 86%, and the diagnostic accuracy of three gradients were 75%, 90% and 96%, while the accuracy of diagnostic Pb stress based on SVM was 85%, and the diagnostic accuracy of three gradients were 83%, 85% and 88%. The diagnostic accuracy of Pb stress based BP neutral network was 88%, and the diagnostic accuracy of three gradients were 69%, 75% and 75%, while the diagnostic accuracy of Pb stress was 88%, and the diagnostic accuracy of three gradients were 81%, 69% and 69%. [Conclusion] It is feasible to diagnose heavy metal Cd and Pb stress from hyperspectral spectral imaging data of vegetation, and the accuracy of SVM is satisfied.

Key words Hyperspectral;Heavy metal diagnosis;SVM;BP neural network

水稻是世界上重要的糧食作物之一,產(chǎn)量比重大、種植范圍廣。據(jù)國家統(tǒng)計(jì)局關(guān)于2016年糧食產(chǎn)量的公告顯示,2016年我國稻谷產(chǎn)量達(dá)20 693.4萬t,占全年糧食產(chǎn)量的33.58%。一系列人類活動(dòng),如采礦、施肥、農(nóng)藥應(yīng)用等正日益加劇嚴(yán)重的土壤重金屬污染[1]。在我國1.2億hm2的農(nóng)業(yè)用地中,有8.3%的農(nóng)業(yè)用地受到重金屬污染威脅[2]。2002年,農(nóng)業(yè)部稻米及制品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心曾對(duì)全國市場稻米進(jìn)行安全性抽檢,結(jié)果顯示,稻米中超標(biāo)最嚴(yán)重的重金屬是鉛,超標(biāo)率為28.4%,其次是鎘,超標(biāo)率為10.3%[3]。重金屬在植物組織中累積,一方面妨礙作物生長,另一方面通過食物鏈進(jìn)入人體,危害人類健康[4]。進(jìn)入人體內(nèi)的鎘容易累積,會(huì)使腎臟細(xì)胞內(nèi)溶酶增加,線粒體腫脹變形,形成蛋白尿、糖尿及氨基酸尿,進(jìn)而導(dǎo)致腎小管功能紊亂,特別會(huì)使骨骼代謝受阻,引起負(fù)鈣平衡,從而導(dǎo)致骨質(zhì)疏松[5-6]。鉛進(jìn)入人體后,分布于肝、腎、腦、胰及主要?jiǎng)用}中,會(huì)引起末梢神經(jīng)炎,造成運(yùn)動(dòng)和感覺障礙,損害人體的免疫系統(tǒng),使機(jī)體免疫力明顯下降,常見癥狀有失眠、頭痛、便秘、貧血等,嚴(yán)重者會(huì)發(fā)生休克和死亡[5,7-8]。在糧食作物中,從多種復(fù)雜的重金屬污染中及早診斷出具體的污染類別,可以及時(shí)發(fā)現(xiàn)和制止污染行為[9]。針對(duì)具體污染采取有效措施,為農(nóng)田的污染治理現(xiàn)代化提供輔助決策,保證糧食安全。

傳統(tǒng)的方法以采樣為主,一是基于研究區(qū)域的土壤和植被采樣,利用化學(xué)分析檢測(cè)重金屬含量,依此判斷土壤重金屬污染的程度;二是研究土壤受重金屬污染后,植物污染的生理反應(yīng)和理化參數(shù)變化[10-15]。兩類研究都需要大量的樣本數(shù)據(jù)采集、化學(xué)分析、地理信息解譯,時(shí)間消耗長,植被破壞強(qiáng),研究成本高[16-20]。更重要的是,采樣點(diǎn)的空間代表性和污染的類型和方式、水稻的品種、耕種灌溉的方法等多因素相關(guān),很難進(jìn)行大面積的實(shí)踐推廣。高光譜遙感可以高效快速地獲取大面積實(shí)時(shí)影像,為重金屬污染診斷提供了可能性。是否可能以及如何從高光譜影像上有效地診斷出具體的污染類別,實(shí)現(xiàn)大面積監(jiān)測(cè),近年來成為研究熱點(diǎn)。

目前的研究主要集中在利用土壤的某些代理變量來預(yù)測(cè)土壤重金屬含量方面[17,21-30],但都需要大量的土壤樣本數(shù)據(jù)的采集與處理,周期長、效率低,對(duì)植被破壞性強(qiáng)。一方面,它們僅是探究了在污染造成后植被機(jī)理變化和土地中重金屬含量的關(guān)系,都未能從重金屬污染中診斷出特定的污染類別;另一方面,這些研究大都是地面作業(yè)的基礎(chǔ)研究,無法有效地實(shí)現(xiàn)大面積水稻實(shí)時(shí)檢測(cè),也就很難應(yīng)用到實(shí)際的重金屬污染檢測(cè)中。

筆者主要針對(duì)鎘和鉛2種重金屬脅迫,從高光譜影像數(shù)據(jù)入手,探究了植被高光譜數(shù)據(jù)在診斷水稻葉片重金屬污染方面的可行性,旨在為從植被葉片高光譜數(shù)據(jù)診斷重金屬污染提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

為了有效地控制溫度、濕度等環(huán)境變量,試驗(yàn)全程在溫室內(nèi)完成。為了精確控制重金屬濃度,水稻采用水培方式進(jìn)行種植,水培種植箱外部使用黑漆完全覆蓋;為了后期光譜采集的準(zhǔn)確性,水培漂浮板也使用黑色材質(zhì)。

1.2 方法

1.2.1 重金屬脅迫處理設(shè)置。試驗(yàn)研究對(duì)象是在我國對(duì)水稻污染最嚴(yán)重的2種重金屬鎘(Cd)和鉛(Pb),對(duì)其各設(shè)立3個(gè)梯度,具體脅迫濃度見表1。將2種重金屬脅迫的任意濃度進(jìn)行交叉組合,加上空白對(duì)照組,共16組樣本(表2)。

1.2.2 數(shù)據(jù)采集。

數(shù)據(jù)采集儀器使用德國Cubert公司生產(chǎn)的UHD185,它的采集光譜為450~950 nm,采樣間隔4 nm,光譜分辨率為8 nm,通道數(shù)為125。在水稻的分蘗期到抽穗期,選擇無云或者少云的晴朗天氣,10:00—14:00進(jìn)行光譜采集[29]。共進(jìn)行8次數(shù)據(jù)采集,采集設(shè)備和場地見圖1,采集時(shí)間分別為2月23日、3月20日、4月12日、4月19日、4月28日、5月9日、5月13日和5月17日,從8次數(shù)據(jù)采集中選擇6次(3月20日、4月12日、4月19日、4月28日、5月9日和5月17日)質(zhì)量較好的數(shù)據(jù)作為后續(xù)研究的最終數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)采集過程貫穿水稻的分蘗期和抽穗期。

1.2.3 數(shù)據(jù)預(yù)處理。

數(shù)據(jù)預(yù)處理可以消除采集時(shí)環(huán)境變量的影響,目前使用比較普遍的方法有平滑去噪、基線校正、多元散射校正等[31]。SG平滑可以消除隨機(jī)噪聲[16],多元散射校正和標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換可以消除散射的干擾,微分處理(一、二階微分)能夠很好地消除背景信息的影響;均值歸一化和標(biāo)準(zhǔn)化能夠增加光譜數(shù)據(jù)的差異性,同時(shí)減少信息冗余量[32]。首先使用魯棒主成分分析(ROBPCA)剔除受噪聲干擾嚴(yán)重的異常值,然后對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行平滑去噪、均值歸一化、標(biāo)準(zhǔn)化、微分(包括一階微分和二階微分)以及其他處理和微分的組合處理共11組處理。

1.2.4 特征波段選取。

雙因素方差分析法檢驗(yàn)Cd和Pb 2個(gè)因素的不同水平是否對(duì)水稻生長有顯著影響,以及這2個(gè)因素間是否存在交互效應(yīng)。對(duì)于存在交互效應(yīng)的波段,因?yàn)闊o法判斷是哪一種重金屬造成了相應(yīng)的影響,所以要排除這些波段;在排除交互效應(yīng)的波段后,分別篩選出僅對(duì)Cd、Pb中1種因子敏感的潛在特征波段。

1.2.5 分類診斷。

基于上述得到的潛在敏感的特征波段,通過多次二分類處理,可以驗(yàn)證挑選出來的特征波段在診斷具體(Cd/Pb)重金屬脅迫以及各個(gè)梯度脅迫時(shí)的診斷效果。有無Cd脅迫的二分類,得到特征波段診斷水稻受Cd脅迫的診斷效果;無Cd分別和第一、二、三梯度Cd脅迫做二分類,得到特征波段區(qū)分正常水稻在受到第一(二、三)梯度Cd脅迫時(shí)的診斷效果。Pb亦然。

1.2.5.1 支持向量機(jī)(SVM)分類。

SVM在分類問題上,主要針對(duì)二分類的監(jiān)督分類,旨在解決以下2種問題:對(duì)于線性可分的問題,找到一個(gè)最優(yōu)超平面使得樣本完全分開;對(duì)于線性不可分的情況,通過使用非線性映射算法的核函數(shù),將低維線性不可分的樣本轉(zhuǎn)化為高維特征空間使其線性可分。為了避免隨機(jī)因素影響到試驗(yàn)數(shù)據(jù),該研究采用留一交叉驗(yàn)證,每一回合僅預(yù)留1個(gè)作為驗(yàn)證集,其余都做訓(xùn)練集,最終精度取多次訓(xùn)練精度的平均值,確保訓(xùn)練過程的可靠性。

當(dāng)診斷Cd脅迫時(shí),首先診斷出有無受Cd的脅迫,然后對(duì)于受Cd脅迫的3個(gè)梯度分別進(jìn)行診斷,其中隨梯度數(shù)(第一梯度、第二梯度、第三梯度)遞增受脅迫程度加劇。對(duì)于全部96個(gè)數(shù)據(jù)集,將未受Cd脅迫的4組共24個(gè)數(shù)據(jù)訓(xùn)練標(biāo)簽標(biāo)記為0,其余數(shù)據(jù)集訓(xùn)練標(biāo)簽標(biāo)記為1,運(yùn)行訓(xùn)練模型;對(duì)于其余處理梯度,采取和診斷第一梯度Cd脅迫相同的方法,改變數(shù)據(jù)集,添加訓(xùn)練標(biāo)簽,獲得診斷精度。

同樣,在診斷Pb脅迫以及3個(gè)梯度的脅迫時(shí),采用診斷Cd及Cd 3個(gè)梯度時(shí)相同的方法即可。

1.2.5.2 BP-神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。

BP網(wǎng)絡(luò)是目前應(yīng)用廣泛的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型之一,是一種按誤差逆?zhèn)鞑ニ惴ㄓ?xùn)練的多層前饋網(wǎng)絡(luò),它的學(xué)習(xí)規(guī)則使用梯度下降法,通過反向傳播來不斷調(diào)整網(wǎng)絡(luò)的權(quán)值和閾值,使網(wǎng)絡(luò)的誤差平方和最小。

該研究采用隨機(jī)2/3數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練樣本,剩余1/3作為測(cè)試樣本。通過預(yù)訓(xùn)練,得出隱含層節(jié)點(diǎn)數(shù)13是一個(gè)較合適的參數(shù),輸入層與隱含層采用Tan-sigmoid傳輸函數(shù),輸出層采用Purelin線性傳輸函數(shù)。設(shè)定最小訓(xùn)練速率為0.1,訓(xùn)練標(biāo)準(zhǔn)差為0.001,訓(xùn)練迭代次數(shù)為30,訓(xùn)練函數(shù)使用trainlm,學(xué)習(xí)函數(shù)和性能函數(shù)采用默認(rèn)值learndm和mse。

2 結(jié)果與分析

當(dāng)僅考慮水稻有無受到其中1種重金屬脅迫時(shí),SVM診斷結(jié)果顯示,在對(duì)光譜二階微分預(yù)處理下,對(duì)Cd和Pb脅迫的診斷效果最好,分別達(dá)86%和85%;BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷結(jié)果顯示,在對(duì)光譜一階微分預(yù)處理情況下對(duì)Cd的診斷效果最好,達(dá)87%,平滑和一階微分組合處理情況下,對(duì)Pb脅迫診斷效果最好,達(dá)91%。

當(dāng)綜合考慮特征波段個(gè)數(shù)和整體診斷精度2個(gè)因素時(shí),二階微分預(yù)處理的情況下,Cd脅迫診斷效果最好,共挑選出6個(gè)特征波段,第一、二、三梯度的Cd脅迫的診斷精度分別為75%、90%、96%(圖2);不區(qū)分梯度,僅診斷Cd脅迫的有無時(shí),診斷精度達(dá)86%,4個(gè)診斷參數(shù)整體精度都超過了83%,診斷效果較好;與Cd不同,Pb脅迫診斷最好的情況是二階微分預(yù)處理,該預(yù)處理情況下挑出對(duì)Pb脅迫敏感的10個(gè)特征波段,受Pb脅迫的診斷精度達(dá)85%,3個(gè)梯度的診斷效果分別為83%、85%、88%。具體診斷精度參照表3。

整體診斷水平上,SVM的診斷效果要優(yōu)于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),以二階微分處理診斷Cd脅迫為例,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)Cd脅迫的診斷精度為88%,對(duì)第一、二、三梯度脅迫的診斷精度分別為69%、75%、75%(圖3),而同等處理情況下SVM診斷精度分別達(dá)86%、75%、90%和96%,整體診斷效果明顯優(yōu)于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。

單一的均值歸一化和標(biāo)準(zhǔn)化處理,沒有篩選出可以區(qū)分Cd和Pb脅迫的特征波段,說明單一的均值歸一化和標(biāo)準(zhǔn)化處理不能很好地提取不同脅迫的光譜信息,達(dá)不到有效診斷的效果。平滑處理以及平滑和微分的組合處理很難在診斷Cd和Pb 2種重金屬脅迫上達(dá)到很好的平衡,一種脅迫診斷效果很好時(shí),往往另一種脅迫的診斷效果不是非常理想。當(dāng)其他預(yù)處理與微分處理組合時(shí),可以很好地提取特征波段,說明微分處理可以很好地提取不同脅迫的光譜信息,有效地表征光譜差異。

當(dāng)使用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)1種重金屬脅迫1次訓(xùn)練進(jìn)行多級(jí)脅迫診斷時(shí),不同處理或者處理組合的情況下,僅Cd的診斷效果超過了60%,分別是標(biāo)準(zhǔn)化和一階微分組合處理下的65.63%、二階微分處理下的69%以及平滑和一階微分組合處理下的63%,Pb僅在二階微分處理下達(dá)到了59%。如表4為二階微分處理下對(duì)Cd各梯度脅迫多級(jí)診斷的結(jié)果,表5詳細(xì)給出了各處理情況下的診斷精度。

當(dāng)進(jìn)行各個(gè)梯度的重金屬脅迫診斷時(shí),基于SVM的診斷效果顯示,重金屬脅迫越嚴(yán)重,試驗(yàn)數(shù)據(jù)的診斷精度越高,這可能是因?yàn)殡S著脅迫程度的提高,重金屬在葉片中富集越嚴(yán)重,進(jìn)而葉片的生理狀態(tài)變化越明顯。這種生理狀態(tài)的變化通過葉片的光譜信息反映出來。但是基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)果恰恰相反,這可能和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自身的局限性有關(guān)。

3 結(jié)論與討論

以UHD185獲取水稻葉片高光譜數(shù)據(jù),通過在溫室水培環(huán)境中的系統(tǒng)性試驗(yàn),探究了植被高光譜數(shù)據(jù)在診斷重金屬污染上的可行性,探究了不同預(yù)處理方法對(duì)診斷重金屬污染的診斷水平,同時(shí)比較了SVM和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的診斷性能。通過試驗(yàn)得出以下結(jié)論:

①利用植被高光譜數(shù)據(jù)診斷土壤中的重金屬Cd和Pb脅迫是可行的。

②二階微分處理挑選出來的特征波段數(shù)量合適、診斷效果好。

③以SVM為模型診斷精度整體優(yōu)于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。

④該研究中,光譜數(shù)據(jù)的采集高度應(yīng)固定在1.5 m。若要實(shí)際應(yīng)用,必須增大數(shù)據(jù)采集的尺度,提高效率。

后續(xù)研究可以借助無人機(jī),以實(shí)際大田數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),采集多個(gè)尺度下的光譜數(shù)據(jù),驗(yàn)證植被高光譜數(shù)據(jù)在各個(gè)尺度上診斷重金屬污染的精度變化。另一方面,該研究僅探究了水稻葉片對(duì)重金屬Cd和Pb脅迫的光譜響應(yīng),而在實(shí)際中,Cu、Zn、Ni等都會(huì)影響水稻的生長狀態(tài)和葉片的反射特征。后續(xù)研究也可以嘗試設(shè)置多種重金屬的交叉污染,進(jìn)一步驗(yàn)證葉片高光譜數(shù)據(jù)在葉片存在其他重金屬脅迫的噪音下,診斷Cd和Pb重金屬污染的能力。

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