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Parkin共調(diào)基因調(diào)控功能與疾病研究進(jìn)展

2018-01-23 01:04趙海洲馬延紅劉文華
中國藥理學(xué)通報(bào) 2018年10期
關(guān)鍵詞:微管麻風(fēng)病纖毛

趙海洲,李 軍,馬延紅,劉文華

(肇慶學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,廣東 肇慶 526061)

Parkin共調(diào)基因(Parkin co-regulated gene, PACRG)于2003年被克隆、鑒定[1]。Parkin是與帕金森病(Parkinson’s disease, PD)相關(guān)的一個(gè)基因,其基因缺失或突變呈現(xiàn)常染色體隱性遺傳的青少年型帕金森病(autosomal recessive juvenile parkinsonism, ARJP)。研究顯示,Parkin基因編碼的蛋白是一個(gè)E3泛素連接酶,通過泛素-蛋白酶體系統(tǒng)來降解異常折疊蛋白,參與氧化應(yīng)激及線粒體功能調(diào)控等多種途徑,發(fā)揮保護(hù)功能[2]。PACRG蛋白和α、β-tubulin相結(jié)合,促進(jìn)微管成束,穩(wěn)定微管結(jié)構(gòu)[3];是鞭毛、纖毛和精子尾部軸絲結(jié)構(gòu)的組成部分,在鞭毛、纖毛以及精子的運(yùn)動(dòng)過程中起重要作用[4];與減數(shù)分裂表達(dá)基因1蛋白(meiosis expressed gene 1, MEIG1)相互作用,與精子形成密切相關(guān)[5];與分子伴侶熱休克蛋白90、70(Hsp90、Hsp70)、T-復(fù)合物1(TCP1α、TCP1β、TCP1θ)發(fā)生相互結(jié)合,起到細(xì)胞保護(hù)作用[6];與Parkin蛋白相互結(jié)合,對(duì)Parkin的底物類內(nèi)皮素受體(Parkin associated endothelin receptor-like, Pael-R)引起的細(xì)胞損傷起保護(hù)作用[6]。

PACRG和Parkin在心、腦、骨骼肌等部位都有較高的表達(dá),而在肺、肝等Parkin表達(dá)較低的部位,PACRG也有相對(duì)較高的表達(dá)。PACRG基因全長(zhǎng)600 kb,以頭對(duì)頭的方式位于Parkin基因的反義鏈上,兩個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)之間只有204 bp的長(zhǎng)度,且共用1個(gè)雙向啟動(dòng)子。PACRG的開放讀碼框編碼257個(gè)氨基酸,其蛋白分子量約33 ku。蛋白序列同源性分析顯示,PACRG基因編碼的蛋白在物種之間具有高保守性,整個(gè)PACRG蛋白序列在人、小鼠和果蠅之間的一致性達(dá)到了29%,而蛋白羧基端的序列一致性更是達(dá)到了80%。通過蛋白序列比對(duì)和功能分析,暫還沒有發(fā)現(xiàn)PACRG蛋白序列上存在功能域結(jié)構(gòu),但通過Propsearch分析發(fā)現(xiàn),PACRG和泛素融合降解蛋白1 (ubiquitin fusion degradation protein 1)存在弱的同源性,后者是參與胞內(nèi)蛋白泛素化降解的一個(gè)蛋白[1]。

近期,通過單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)分析對(duì)PACRG的研究結(jié)果顯示,PACRG基因與癌癥、肺結(jié)核、麻風(fēng)病、傷寒副傷寒等疾病的發(fā)生存在相關(guān)性,但其機(jī)制還不清楚。雖然關(guān)于Parkin相關(guān)的研究已有大量文獻(xiàn)報(bào)道,但有關(guān)PACRG的研究文獻(xiàn)還相對(duì)較少,本文對(duì)其調(diào)控功能與相關(guān)疾病方面的研究進(jìn)行綜述。

1 PACRG是鞭毛、纖毛和精子尾部軸絲結(jié)構(gòu)的組成部分

1.1PACRG與鞭毛、纖毛真核生物的鞭毛、纖毛軸絲微管排列是9+2式,即外圈是9組二聯(lián)微管,中央一對(duì)微管。Dawe等[7]于2005年首先發(fā)現(xiàn)PACRG蛋白是布氏錐蟲(Trypanosoma brucei)鞭毛軸絲的組成成分。敲減PACRG表達(dá)后,引起外圈二聯(lián)微管1個(gè)或多個(gè)缺失,從而導(dǎo)致鞭毛不能正常運(yùn)動(dòng),布氏錐蟲生長(zhǎng)減慢[7]。另有研究發(fā)現(xiàn),PACRG蛋白除了位于軸絲的二聯(lián)微管外,在衣藻的胞體、軸絲三聯(lián)微管、細(xì)胞中心粒均有表達(dá)。中心粒在細(xì)胞間期作為基礎(chǔ)體,使纖毛和鞭毛組合成核,這可能是PACRG影響纖毛和鞭毛裝配的機(jī)制之一[8]。近期的研究還揭示了PACRG調(diào)控鞭毛或纖毛運(yùn)動(dòng)的機(jī)制,PACRG蛋白與軸絲內(nèi)中心裝置、徑向輻條及軸絲動(dòng)力蛋白發(fā)生相互作用,通過調(diào)節(jié)軸絲動(dòng)力蛋白的動(dòng)力臂和微管之間的滑行,從而控制鞭毛、纖毛的運(yùn)動(dòng)[4]。

1.2PACRG與精子Quaking (Viable) (qkv)小鼠的基因突變是由于17號(hào)染色體發(fā)生了約1 Mb的自發(fā)隱性缺失,突變鼠表現(xiàn)出中樞神經(jīng)系統(tǒng)髓鞘形成障礙、震顫、雄性不育等病理癥狀。序列研究發(fā)現(xiàn),qkv突變鼠1 Mb的缺失片段包括了qkI基因部分啟動(dòng)子、Parkin基因全部啟動(dòng)子和外顯子1~5及PACRG整個(gè)基因序列,引起突變鼠的qkI蛋白表達(dá)降低,以及Parkin和PACRG表達(dá)缺失。qkv突變鼠表現(xiàn)出雄性不育,其精子數(shù)量少,且不能正常運(yùn)動(dòng),但如果將這些精子的細(xì)胞核通過顯微操作注射到小鼠卵細(xì)胞,受精卵細(xì)胞則能發(fā)育成正常小鼠。Lorenzetti等[9]采用轉(zhuǎn)基因技術(shù),在qkv突變鼠中導(dǎo)入PACRG編碼序列,產(chǎn)生了qkv/qkvTg(Pacrg)轉(zhuǎn)基因鼠,轉(zhuǎn)基因♂小鼠產(chǎn)生能夠正常運(yùn)動(dòng)的精子,并恢復(fù)了生育能力,這項(xiàng)結(jié)果說明PACRG蛋白是精子正常發(fā)育所必需。對(duì)人類男性不育病例的研究顯示,PACRG編碼區(qū)突變與男性不育沒有相關(guān)性,但PACRG/Parkin基因共享啟動(dòng)子區(qū)域的突變與男性不育具相關(guān)性,推測(cè)可能是啟動(dòng)子突變引起了PACRG轉(zhuǎn)錄和表達(dá)水平的降低[10]。

減數(shù)分裂表達(dá)基因1蛋白對(duì)小鼠的精子發(fā)生起重要作用,MEIG1基因敲除小鼠精子尾部軸絲異常,無精子頭和精子領(lǐng)形成,這與PACRG基因敲除小鼠(qkv)的表型相似。酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)證明,PACRG蛋白與MEIG1存在相互作用,MEIG1和PACRG蛋白形成復(fù)合物,MEIG1可以穩(wěn)定PACRG的結(jié)構(gòu)[5]。蛋白結(jié)構(gòu)解析和點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)證明了MEIG1關(guān)鍵蛋白位點(diǎn)W50、K57、F66、Y68對(duì)于穩(wěn)定MEIG1/PACRG復(fù)合物起主要作用。MEIG1/PACRG復(fù)合物對(duì)于精子尾部裝配期間將貨物定向到精子領(lǐng)至關(guān)重要,具體表現(xiàn)為PACRG蛋白招募MEIG1到精子領(lǐng)上,形成MEIG1/PACRG復(fù)合體,該復(fù)合體通過其他配合物或動(dòng)力蛋白與微管相互作用,將貨物(如SPAG16L等)運(yùn)輸至精子領(lǐng),從而裝配精子尾部[5]。

1.3PACRG與腦積水PACRG蛋白是小鼠室管膜細(xì)胞,以及腦室內(nèi)纖毛的組成部分。qkv小鼠由于缺乏PACRG表達(dá),會(huì)發(fā)展為獲得性輕度腦積水(hydrocephalus, HC)。qkv小鼠腦室纖毛結(jié)構(gòu)與野生型對(duì)照的一樣,但室管膜纖毛擺動(dòng)頻率降低,纖毛介導(dǎo)的室管膜流的流速下降到野生型小鼠的32%。PACRG的瞬時(shí)表達(dá)可以使qkv突變體中的獲得性輕度HC缺陷表型恢復(fù)正常[11]。

1.4PACRG與胚胎發(fā)育Thumberger等[12]的研究結(jié)果表明,在胚胎發(fā)育早期,PACRG蛋白特異性地定位表達(dá)于能夠產(chǎn)生左向液流的表皮組織,如非洲爪蟾的原腸腔頂板、斑馬魚的庫氏囊泡以及哺乳動(dòng)物的后脊索。這些胚胎表皮組織帶有纖毛,能產(chǎn)生胞外左向液流,與動(dòng)物的左右不對(duì)稱發(fā)育有關(guān)。非洲爪蟾敲減PACRG表達(dá)后,引起原腸腔頂板輪廓畸形,頂板表面積擴(kuò)大,纖毛長(zhǎng)度和擺動(dòng)頻率減小,左向液流消失,左右不對(duì)稱發(fā)育的起始信號(hào)分子Pitx2c表達(dá)缺失,從而導(dǎo)致左右不對(duì)稱發(fā)育缺陷[12]。

PACRG蛋白還參與了不依賴于纖毛的一些胚胎發(fā)育過程,包括原腸胚發(fā)育和神經(jīng)管的閉合。PACRG高劑量敲低會(huì)導(dǎo)致原腸胚胚孔閉合失敗,其機(jī)制可能是胚孔閉合依賴于瓶狀細(xì)胞的頂端部位收縮,該部位收縮需要有穩(wěn)定微管的支持,而PACRG蛋白可以結(jié)合并促進(jìn)微管成束,穩(wěn)定微管[3]。中劑量敲低PACRG可以引起神經(jīng)管閉合缺陷,補(bǔ)回PACRG可以消除該缺陷。神經(jīng)管閉合依賴神經(jīng)板細(xì)胞的頂端部位收縮,該過程與原腸胚瓶狀細(xì)胞的頂端部位收縮類似,也依賴于PACRG蛋白參與的微管成束和微管穩(wěn)定[12]。

2 PACRG與帕金森病

PACRG和Parkin共用1個(gè)雙向啟動(dòng)子,它們?cè)诠δ苌峡赡艽嬖谙嚓P(guān)性。Imai等[6]研究發(fā)現(xiàn),PACRG蛋白能夠和Parkin,以及Pael-R共同形成包涵體,并抑制Pael-R誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡,提示PACRG蛋白可能通過促進(jìn)路易體的形成,對(duì)多巴胺能神經(jīng)元起到保護(hù)作用。另外的研究也觀察到PACRG是路易體的組成成分,只有當(dāng)泛素-蛋白酶體系統(tǒng)受到抑制時(shí),才能檢測(cè)到內(nèi)源性PACRG的表達(dá),推測(cè)PACRG蛋白受到了該系統(tǒng)的降解[13]。進(jìn)一步的研究顯示,當(dāng)?shù)鞍酌阁w受到抑制后,PACRG蛋白促進(jìn)蛋白聚集體的形成,增強(qiáng)自噬作用,對(duì)BE(2)M17細(xì)胞具有保護(hù)作用[14]。采用免疫組化方法,在PD和多系統(tǒng)萎縮(multiple system atrophy, MSA)患者的路易體和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞胞內(nèi)包涵體中檢測(cè)到PACRG蛋白,表明PACRG可能在PD的發(fā)生中起作用,但其機(jī)制有待深入研究[6,13]。

PACRG基因突變與早發(fā)性帕金森病(early-onset parkinsonism, EOPD)之間是否存在相關(guān)性,已有兩篇文獻(xiàn)報(bào)道。Deng等[15]研究了112例白種人EOPD患者的PACRG基因序列,發(fā)現(xiàn)了3個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸雜合子變體,但這幾個(gè)點(diǎn)突變不影響PACRG的RNA拼接和氨基酸序列,與EOPD之間無致病相關(guān)性。Taylor等[16]分析了76例臺(tái)灣EOPD患者PACRG基因序列,發(fā)現(xiàn)了內(nèi)含子區(qū)3個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸雜合子變體,也不影響PACRG的RNA拼接和氨基酸序列,與EOPD之間不存在致病相關(guān)性。另外,該研究組還發(fā)現(xiàn)了3例EOPD患者出現(xiàn)了外顯子重復(fù)或缺失的雜合子突變,他們認(rèn)為PACRG外顯子重復(fù)或缺失引起的單倍劑量不足可能與EOPD存在相關(guān)性[16]。

3 PACRG與麻風(fēng)病

麻風(fēng)病是由麻風(fēng)分枝桿菌(M.leprae)引起的慢性感染性疾病,每年新增約70萬人。帶菌者中約10%會(huì)發(fā)展成麻風(fēng)病,研究發(fā)現(xiàn),免疫力低下、環(huán)境毒素、遺傳基因等多因素與麻風(fēng)病易感性有關(guān)。正向遺傳學(xué)全基因組篩選發(fā)現(xiàn),麻風(fēng)病易感基因位點(diǎn)主要包括6p21HLA-DRB1和LTA, 6q25-q26Parkin/PACRG等。Mira等[17]對(duì)越南和巴西麻風(fēng)病的單身家庭進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)Parkin/PACRG共享啟動(dòng)子區(qū)域17個(gè)SNP標(biāo)記與麻風(fēng)病存在明顯關(guān)聯(lián),特別是SNP標(biāo)記PARK2_e01(-2599)和rs1040079。使用多變量分析,Alter等[18]重申了Mira等關(guān)于越南人群Parkin和PACRG共享啟動(dòng)子區(qū)域的易感基因座的研究結(jié)果。他們還發(fā)現(xiàn)2個(gè)SNP,rs1333955和rs2023004與印度北部人口的麻風(fēng)病易感性相關(guān)。Bakija-Konsuo等[19]對(duì)歐洲克羅地亞兩個(gè)孤立島人群麻風(fēng)病遺傳易感性研究,也發(fā)現(xiàn)Parkin/PACRG啟動(dòng)子區(qū)域SNP與麻風(fēng)病致病呈相關(guān)性。

關(guān)于麻風(fēng)病的致病機(jī)制并不十分清楚,研究表明,泛素-蛋白酶體途徑參與了麻風(fēng)分枝桿菌的感染過程。Parkin具有抗氧化、抗凋亡等作用,能提高宿主對(duì)麻風(fēng)分枝桿菌的抵抗性。PACRG與Parkin能夠共同對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激引起的細(xì)胞損傷起到保護(hù)作用。而Parkin/PACRG共享啟動(dòng)子區(qū)的突變可能影響到這兩種蛋白的表達(dá),這些因素可能是該共享啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性位點(diǎn)與麻風(fēng)病致病性具有相關(guān)性的原因。

4 PACRG與癌癥

4.1腎透明細(xì)胞癌通過qPCR和組織微陣列免疫組化方法,Toma等[20]發(fā)現(xiàn),腎透明細(xì)胞癌病人中,PACRG和Parkin的mRNA和蛋白表達(dá)水平均明顯下降,mRNA和蛋白表達(dá)水平越低,病人的無病生存期和總生存期越短。其原因可能是PACRG和Parkin蛋白具有抑癌基因功能,通過泛素-蛋白酶體途徑起到細(xì)胞保護(hù)作用,或是通過微管來抑制細(xì)胞增殖和細(xì)胞遷移[3, 20]。

4.2白血病Agirre等[21]檢測(cè)分析了195例急性淋巴細(xì)胞性白血病患者和60例慢性粒細(xì)胞性白血病患者的骨髓樣品,結(jié)果顯示,在兩種疾病中,Parkin/PACRG共享啟動(dòng)子區(qū)出現(xiàn)異常高甲基化的比例分別為26%和20%,異常高甲基化導(dǎo)致了Parkin和PACRG mRNA水平下降。文章作者認(rèn)為,高甲基化引起的Parkin和PACRG蛋白表達(dá)水平下降,與血液腫瘤的發(fā)生具有相關(guān)性[21]。

4.3星形或膠質(zhì)細(xì)胞瘤Ichimura等[22]采用覆蓋6號(hào)染色體98.3%序列的tile path芯片技術(shù),對(duì)104例星形細(xì)胞瘤病人的腫瘤和血液樣品進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)6號(hào)染色體在星形細(xì)胞瘤中發(fā)生高頻率缺失,最頻繁缺失區(qū)域包括PACRG、QKI和ARID1B(AT-rich interactive domain-containing protein 1B)基因。根據(jù)研究結(jié)果,Ichimura等[22]認(rèn)為,缺失區(qū)域內(nèi)的PACRG、QKI、ARID1B等基因可能具有腫瘤抑制基因的功能。

5 PACRG與其他疾病

5.1肺結(jié)核Udina等[23]通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性內(nèi)切酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法,對(duì)俄羅斯圖瓦共和國兩個(gè)地區(qū)的結(jié)核病人Parkin/PACRG共享啟動(dòng)子區(qū)的兩個(gè)SNP位點(diǎn)PARK2-e01(-697)和rs1333955進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,與健康人群相比,結(jié)核病患者的這兩個(gè)SNP位點(diǎn)顯示出較多的雜合子表現(xiàn)型,表明該標(biāo)記對(duì)結(jié)核病的發(fā)病率存在影響。

5.2傷寒副傷寒Ali等[24]對(duì)印度尼西亞雅加達(dá)地區(qū)傷寒和副傷寒患者Parkin/PACRG基因簇內(nèi)PARK_e01(-697)、PARK2_e01(-2599)、rs1333955和rs1040079這4個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其中的PARK2_e01(-2599)位點(diǎn)的多態(tài)性與傷寒副傷寒致病具有相關(guān)性[24]。但該相關(guān)性要比此位點(diǎn)與麻風(fēng)病的相關(guān)性低。

6 PACRG與信號(hào)傳導(dǎo)

Loucks等[25]發(fā)現(xiàn),PACRG蛋白定位在秀麗隱桿線蟲ASE和OLQ神經(jīng)元的非運(yùn)動(dòng)性纖毛,它影響著味覺可塑性的學(xué)習(xí)行為,即在無食物狀態(tài)下,長(zhǎng)時(shí)間暴露于化學(xué)引誘劑NaCl溶液之后,線蟲會(huì)降低對(duì)NaCl的化學(xué)趨向性甚至回避,功能上與G蛋白信號(hào)傳遞相關(guān)。突變或過表達(dá)PACRG,會(huì)破壞秀麗隱桿線蟲的味覺可塑性學(xué)習(xí)行為,這與G蛋白偶聯(lián)受體(G-protein-coupled receptor, GPCR)GPC-1(Gγ)對(duì)味覺可塑性的影響模式相一致。作者通過雙突變實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),PACRG蛋白與GPCR亞基GPC-1(Gγ)、GPA-1(Gα)處在同一信號(hào)通路,影響味覺可塑性,而與GPCR亞基ODR-3(Gα)、GPA-11(Gα)則處在不同信號(hào)通路上,調(diào)控味覺可塑性[25]。

線蟲類存在纖毛感覺靈敏度降低,伴隨壽命變長(zhǎng)的現(xiàn)象。對(duì)秀麗隱桿線蟲的研究發(fā)現(xiàn),PACRG與線蟲的壽命有關(guān)。相比于野生型組,PACRG突變組秀麗隱桿線蟲的壽命變短,而對(duì)PACRG突變組回復(fù)表達(dá)PACRG-GFP蛋白,可以延長(zhǎng)線蟲壽命,但PACRG此功能不依賴于GPCR。另一纖毛蛋白EFHC1和PACRG蛋白共定位于OLQ神經(jīng)元,它也具有延長(zhǎng)壽命的功能。雙突變實(shí)驗(yàn)證明,EFHC1和PACRG處在同一信號(hào)通路,都處在促進(jìn)長(zhǎng)壽的FOXO轉(zhuǎn)錄因子DAF-16的上游,通過正向調(diào)控胰島素/IGF信號(hào)途徑來延長(zhǎng)線蟲壽命[25]。

7 總結(jié)與展望

自2003年P(guān)ACRG基因被克隆、鑒定以來,國外、國內(nèi)共有50多篇相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,這些研究主要集中于PACRG對(duì)微管功能的調(diào)節(jié),與麻風(fēng)病、肺結(jié)核、傷寒副傷寒、癌癥等疾病的相關(guān)性,以及神經(jīng)保護(hù)作用。其中,PACRG對(duì)微管功能的影響,參與鞭毛、纖毛軸絲,以及精子尾部的結(jié)構(gòu)組成,這些方面的研究已較為深入。PACRG缺失后,致使鞭毛、纖毛、以及精子不能正常運(yùn)動(dòng),從而導(dǎo)致胚胎發(fā)育障礙、腦積水、雄性不育等病癥。PACRG和Parkin共同作用,通過增強(qiáng)細(xì)胞自噬等途徑,對(duì)Parkin底物引起的細(xì)胞損傷具有保護(hù)作用,但其機(jī)制有待深入研究。SNP分析結(jié)果表明,PACRG與麻風(fēng)病、肺結(jié)核、傷寒副傷寒等疾病具相關(guān)性,但其機(jī)制還不清楚,需要深入研究闡明。PACRG與幾種癌癥的發(fā)病呈相關(guān)性,PACRG基因缺失、啟動(dòng)子甲基化等引起的蛋白表達(dá)異常,可能是其與癌癥發(fā)生相關(guān)的原因,其抑癌機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。國內(nèi)有關(guān)PACRG的研究較少,Li等SNP研究結(jié)果顯示,其他人種中與麻風(fēng)病相關(guān)的幾個(gè)位點(diǎn),在中國人群中顯示出非相關(guān)性。針對(duì)PACRG蛋白表達(dá)不穩(wěn)定,在胞內(nèi)易降解的特點(diǎn),劉晙玭等運(yùn)用桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng),在昆蟲細(xì)胞系成功表達(dá)了PACRG蛋白。還有其他兩篇文獻(xiàn)報(bào)道了PACRG與精子發(fā)育及與輻射的關(guān)系。PACRG基因被克隆、鑒定以來,已發(fā)現(xiàn)其與胞內(nèi)一些重要功能密切相關(guān)。但從其蛋白結(jié)構(gòu)上也沒有發(fā)現(xiàn)明確的功能域結(jié)構(gòu)。因此,對(duì)PACRG展開深入研究,揭示其胞內(nèi)調(diào)控作用機(jī)制,具有重要意義。

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