李翔
摘 要:介紹了微生物誘變育種的各種方法,對經(jīng)典的誘變技術(shù)、復(fù)合誘變和新型的誘變技術(shù)等處理方法進行了比較。對離子注入法和等離子體誘變育種等新型誘變育種技術(shù)的機理進行了闡述,并對其優(yōu)缺點以及潛在的研究方向進行了論述。
關(guān)鍵詞:微生物誘變;離子注入法;等離子體誘變
中圖分類號:TB 文獻標(biāo)識碼:A doi:10.19311/j.cnki.1672-3198.2017.34.091
微生物誘變育種是一種基因突變技術(shù),通過技術(shù)手段改變微生物的遺傳結(jié)構(gòu)和功能,進而篩選出具有特定性狀的,優(yōu)良突變型微生物。這種育種方式,具有較高的微生物變異率,變異速度快,效率高等優(yōu)點,是食品加工和醫(yī)藥生產(chǎn)等工業(yè)的首選方法。
常用的微生物誘變育種方法包括物理法、化學(xué)法和生物法等,其中物理法誘變包括:紫外誘變、X射線誘變和γ射線誘變等,化學(xué)法誘變包括烷基磺酸鹽和烷基硫酸鹽、亞硝基烷基化合物、次乙胺和環(huán)氧乙烷類和芥子氣類),生物法包括基因轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)座子誘變等。復(fù)合誘變是指采用兩種及以上的誘變方法,對微生物進行誘變,制的目標(biāo)菌株。通常僅采用一種方法進行誘變,會使微生物產(chǎn)生抗性,從而降低突變率,復(fù)合誘變具有補充不同誘變方法之間缺陷的優(yōu)勢。
近些年涌現(xiàn)出一批創(chuàng)新的誘變技術(shù),如離子注入誘變法、大氣壓冷等離子誘變,其中離子注入誘變法具有與復(fù)合誘變相似的特性,日趨成為研究誘變技術(shù)的主流方向。
原生質(zhì)體是包含細胞膜和膜內(nèi)細胞質(zhì)及其他具有生命活性細胞器的生物質(zhì),對于微生物來說即去除細胞壁的細胞。原生質(zhì)體也可以作為誘變的對象,其對外界敏感度很高,因此變異率也很高。
1 經(jīng)典誘變技術(shù)
1.1 物理誘變
1.1.1 紫外誘變
DNA由以嘌呤和嘧啶為堿基的核苷酸組成,紫外線誘變可以使嘧啶形成二聚體,DNA在復(fù)制和轉(zhuǎn)錄時,因存在嘧啶二聚體而不能分離,進而發(fā)生變異。該方法簡單、操作安全且誘變率高,其缺點:誘變原理簡單,引起的突變單一,形成的突變體類型較少,而對于基因損傷及其修復(fù)的研究卻很有意義?,F(xiàn)在,對于細菌、酵母菌或霉菌的紫外誘變往往是對其原生質(zhì)體的誘變,缺少了細胞壁對細胞的保護,紫外線可以更直接的作用于DNA,提高突變率,從而產(chǎn)生更多的突變體和表現(xiàn)型。
1.1.2 激光誘變
該方法是利用了激光輻射的光、電、熱、壓力、磁的綜合效應(yīng)對生物遺傳物質(zhì)引起突變,使細胞中DNA分子吸收、積聚能量并進行能量再分配,導(dǎo)致DNA處于易突變狀態(tài),繼而發(fā)生一系列斷鍵、聚合、交聯(lián)等變化,從而引起DNA的損傷和突變。該方法優(yōu)點包括變異類型較豐富、遺傳較穩(wěn)定,缺點是成本較高。
1.2 化學(xué)誘變
1.2.1 烷化劑
烷化劑類化學(xué)誘變劑是化學(xué)誘變常用方法之一,且種類很多,如硫芥、氮芥、乙撐亞胺類、環(huán)氧衍生物類、硫酸(磺酸)酯類等。哈霞等以甲基磺酸乙酯(EMS)為誘變劑,對大豆疫霉菌進行誘變,建立了包含640個單卵孢子系的突變體庫,50%的誘變菌系在形狀和菌落形態(tài)方面發(fā)生了明顯變化,在卵孢子產(chǎn)量方面,8.13%的菌系有增加,20.41%的菌系減少,27.82%的菌系極少或者沒有卵孢子產(chǎn)生,43.64%的菌系卵孢子產(chǎn)量類似野生型。并估算甲基磺酸乙酯對大豆疫菌霉的誘變頻率至多每115kb發(fā)生一個核苷酸變異。
1.2.2 堿基類似物
堿基類似物主要有嘧啶類似物和嘌呤類似物兩大類。
1.2.3 移碼誘變劑
該類化學(xué)誘變劑能引起DNA分子中遺傳物質(zhì)堿基發(fā)生移位的一類化學(xué)劑。顧真榮等利用吖啶橙誘變枯草芽孢桿菌G3,得到的突變株抗真菌活性提高,合成伊枯草菌素A的能力也增強。
2 復(fù)合誘變
該誘變方法是將上述幾種誘變方法進行結(jié)合,如激光可與紫外結(jié)合做復(fù)合誘變,取得了良好的效果,韓文霞等首次利用15W的He-Ne激光輻照天麻素合成菌華根霉LN-A的原生質(zhì)體20min,再用紫外輻照150s得到的突變株,轉(zhuǎn)化率和天麻素得率都顯著提高,與出發(fā)菌株相比,天麻素得率提高20%以上。祝子坪等利用He-Ne激光與紫外線復(fù)合誘變桑黃菌原生質(zhì)體,篩選出5株變異株S1-S5,且其菌絲發(fā)酵產(chǎn)量比出發(fā)菌株均有不同程度的提高,具有穩(wěn)定遺傳性,估算表明此復(fù)合誘變優(yōu)于單純紫外誘變?;瘜W(xué)誘變之間也可以做復(fù)合誘變,湯衛(wèi)華等為選育高產(chǎn)細菌纖維素的木葡糖酸醋桿菌突變菌株,選用硫酸二乙酯和氯化鋰為誘變劑進行復(fù)合誘變,得到一株產(chǎn)細菌纖維素能力最高的突變菌株 GO2,其細菌纖維素產(chǎn)量為 9.91 g/L,比出發(fā)菌株提高 36.5%。還有物理與化學(xué)誘變相結(jié)合的復(fù)合誘變,Ellaiah 等人通過將紫外險和亞硝基胍進行復(fù)合誘變,得到的頭孢菌素高產(chǎn)突變株 C 產(chǎn)量較原始菌提高2. 4 倍。
實際上,單純的物理誘變或化學(xué)誘變都可能由于產(chǎn)生的變異種類過于單一或只能產(chǎn)生單個堿基的突變,而沒能得到效果好的菌株或得到的突變株不能穩(wěn)定遺傳,而復(fù)合誘變由于誘變種類不同,至少產(chǎn)生兩種不同的變異類型,從一定程度上彌補了單一誘變的缺陷,因此應(yīng)用非常廣泛。
3 誘變創(chuàng)新技術(shù)
3.1 離子注入誘變法
該誘變法本是材料表面改性的一種傳統(tǒng)方法,應(yīng)用時,離子產(chǎn)生器產(chǎn)生的離子在真空環(huán)境中(真空可以減少離子碰撞)經(jīng)適當(dāng)?shù)募铀俸秃Y選,帶有相同能量的離子被導(dǎo)入反應(yīng)室,離子和目標(biāo)物便開始反應(yīng)。根據(jù)反應(yīng)能量,將離子大致分為五個等級:熱離子(<1eV)、過熱離子(1-100eV)、低能離子(0.1-10keV)、中能離子(10-500keV)和高能離子(>500keV)。
3.1.1 離子注入誘變的基本原理
離子注入的對象如果是晶體,離子對其表面的原子作用的宏觀現(xiàn)象以及微觀過程的研究都可以很清楚,而生物體是由固液氣組成的復(fù)雜體系,而且不斷變化,無論是宏觀現(xiàn)象還是微觀過程,都很難作出準(zhǔn)確的判定,但還是有規(guī)律可循的。生物系統(tǒng)中的功能性分子包括DNA、蛋白質(zhì)、多肽、脂類和激素等,離子的注入對細胞產(chǎn)生影響首先要對這些生物小分子產(chǎn)生作用,而離子對它們不僅有物理的作用和化學(xué)的作用,還有生物的效應(yīng),不僅有直接的作用,還有間接的作用即次級效應(yīng)。次級效應(yīng)是注入的離子與生物分子反應(yīng)產(chǎn)生的產(chǎn)物與生物分子的反應(yīng)。當(dāng)活的細胞受到上述產(chǎn)生的粒子或輻射作用時,這種復(fù)雜的效應(yīng)往往會導(dǎo)致多數(shù)細胞死亡,但在少數(shù)未死亡的細胞中如果其DNA的損傷以SOS機制修復(fù),則極有可能會引起基因突變,這些突變?nèi)绻荒軐?dǎo)致細胞死亡,就會被保留下來。生物體就是由于這些物理的、化學(xué)的和生物的作用造成DNA的損傷和再修復(fù)的過程完成變異的。endprint
3.1.2 離子注入對細胞的影響
離子注入對細胞誘變的機理從一定程度上闡述了其對遺傳物質(zhì)的影響,然而它對細胞的其他部分也有相當(dāng)大的影響。離子注入首先導(dǎo)致的是物理損傷,對于植物或微生物的細胞來說,首當(dāng)其沖的就是細胞壁,即細胞壁表面的刻蝕,L.D. Yu等通過離子束對植物和微生物細胞壁的刻蝕,研究基因遷移的機理,進而發(fā)現(xiàn)細胞壁上的類似納米孔洞的結(jié)構(gòu),這些結(jié)構(gòu)可以作為生物大分子轉(zhuǎn)移的通道。為了研究離子注入對細胞通透能力的影響,T.Vilaithong等將低能Ar+離子注入多種植物細胞組織以及大腸桿菌,并測試對臺盼藍(細胞染料,簡稱TB)染料和質(zhì)粒這類外生大分子的轉(zhuǎn)移作用,結(jié)果表明20keV的Ar離子注入能使TB留在細胞壁中,而30keV的Ar離子注入能使TB進入細胞,這說明一個合適的劑量能使細胞壁的通透能力大大加強。
離子對細胞壁的刻蝕可以增加其通透性,能量稍大的離子可以穿透細胞壁和細胞膜進入細胞質(zhì)產(chǎn)生進一步反應(yīng)。如果注入的離子為N+,則N+與水反應(yīng)可生成HCN和氨基酸,這些都是有機體成分的重要前體。將CO2+或CH4+離子注入氨水或N+注入水中所形成的氨基化合物中,就會形成大量的有機物,其中包括胞嘧啶、D-核糖、D-2-脫氧核糖和NH4H2PO4,而且通過HPLC和1H-NMR分析法可以得到5'-CMP和5'-dCMP。因此,可得出離子與胞內(nèi)物質(zhì)發(fā)生的反應(yīng)會很復(fù)雜,形成多種有機物,由于細胞內(nèi)成分非常復(fù)雜,而且多變,對于具體的產(chǎn)物及其產(chǎn)生過程的研究非常有難度,這方面內(nèi)容還鮮有報道。
離子進入細胞后,對細胞影響最大的是與其遺傳物質(zhì)的反應(yīng),這是直接影響到細胞存活與否和后代性狀的根本因素。Yong Zhao等用能量為30ekV,密度為2×1010 - 8.2×1013 ions/cm2的低能N+離子轟擊在鋁片表面涂成的pGEM-3Zf(-)質(zhì)粒膜,質(zhì)粒中DNA鏈(包括單鏈、雙鏈和多鏈)經(jīng)電泳檢測均出現(xiàn)DNA碎片。Chanisorn Ngaojampa等用不同能量和不同速率的N+離子轟擊裸DNA,并用分子模擬來得出DNA分子中的鍵長不同也使離子注入對DNA造成的傷害有一定的特異性。這也驗證了離子注入可以直接作用于遺傳物質(zhì),并對其造成傷害。
3.1.3 離子注入細胞誘變的實際應(yīng)用
離子注入基于以上優(yōu)勢,使其在誘變育種中得到廣泛應(yīng)用。He Song等人采用劑量為7×1015ions/cm2,能量為10keV的N+離子注入Arthrobacter NG-1菌誘變,進而制得cAMP高產(chǎn)菌株,與原始菌株相比,產(chǎn)出的cAMP濃度高出41.7%,高達9.79g/L且性狀較穩(wěn)定。劉國生等以3×1015 ions/cm2劑量的N+離子照射枯草芽孢桿菌,獲得兩株肌苷高產(chǎn)株產(chǎn)量分別為14.83g/L和14.38g/L,與原始菌株相比,分別提高16.3%和12.8%。
雖然該方法具有很多優(yōu)點,但是也存在不足之處:該方法對環(huán)境嚴格要求真空,微生物中由于含有大量的水分,在抽真空時,水分的大量蒸發(fā),不僅破壞離子束真空,也使細胞急劇冷卻或過度失水而導(dǎo)致失活;離子的高速運動會導(dǎo)致高溫,注入時可能因細胞過熱而失活。微生物還未開始誘變,就已經(jīng)大量死亡,這種誘變方法為了適用于微生物的誘變育種,還需要繼續(xù)探索改進。
3.2 等離子體誘變育種
等離子體是物質(zhì)的第四態(tài),由大量相互作用的但仍處于非束縛狀態(tài)下的帶電微粒組成的宏觀體系,它具有特殊的光、熱、聲、電和磁等物理性質(zhì)和化學(xué)性質(zhì),已經(jīng)在臭氧合成、紫外光源設(shè)備、高功率CO2激光器的制造、碳材料的表面改性等許多領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。在前人的許多研究中等離子體作為一種物理滅菌手段,具有快速、低溫、操作簡便、無毒性及殺滅效果好等優(yōu)點。等離子體誘變是在其滅菌原理基礎(chǔ)上,近幾年才起步發(fā)展的一種誘變方法。在誘變育種的應(yīng)用中,由于生物的熱敏性只能采用冷等離子,該方法既避免了化學(xué)方法的變異專一性和高污染性,也解決了傳統(tǒng)物理誘變的變異率低、遺傳不穩(wěn)定等缺點。與近年興起的離子注入誘變技術(shù)相比,此誘變技術(shù)對真空腔的要求不高,不會由于真空產(chǎn)生的低溫而損傷細胞,也不會由于離子束產(chǎn)生高溫而損傷細胞,因此等離子誘變可以很大的提高細胞的存活率,增大誘變效率。因此是很適合于微生物誘變育種的方法。
等離子體誘變的機理解釋并未發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)的研究報道,但等離子體與離子注入的產(chǎn)生源是非常相似的,它們都會產(chǎn)生離子,不同之處在于離子注入可以產(chǎn)生高速離子來刻蝕細胞壁和膜以便離子等進入細胞,而等離子體產(chǎn)生高速電子也可對細胞起到相似的作用。由于目前關(guān)于等離子體誘變的機理未見報道,但其誘變機理與滅菌機理是相通的,可以利用滅菌機理來反映誘變機理。Hongxia Liu等研究了氧等離子體滅菌的影響和機理,分析了電子、離子和氧自由基對大腸桿菌殺菌的影響,首先電子和離子刻蝕細胞膜,然后氧自由基破壞細胞膜上的多元不飽和脂肪酸,這是氧等離子體滅菌的主要原理,其中紫外線對細胞的損傷是微乎其微的。從這里可以知道,等離子體誘變中少了高速離子轟擊對DNA的影響,取而代之的是高速電子與細胞作用,以及作用產(chǎn)生的自由基及其他次級反應(yīng)與DNA的作用成為誘變的主要原理。
等離子體誘變是一種比較新的誘變育種方法,研究尚不成熟,目前應(yīng)用還不多。董曉宇等人用大氣壓冷等離子介質(zhì)阻擋放電法,對產(chǎn)1,3-丙二醇的克雷伯氏菌進行誘變,結(jié)果表明,誘變菌株比出發(fā)菌株1,3-丙二醇的質(zhì)量轉(zhuǎn)化率提高了23%,對數(shù)期比生長速率提高了18%。批式流加發(fā)酵過程中,1,3-PD 濃度在發(fā)酵 36 h 時達到 70.5 g/L,甘油的質(zhì)量轉(zhuǎn)化率為 0.57 g/g,分別比野生菌提高47%和58%。等離子體誘變有變異范圍廣、變異穩(wěn)定,且對條件要求低,必然會成為一種應(yīng)用廣泛的誘變方法。
4 結(jié)論與展望
傳統(tǒng)的誘變方法由于其變異率低、變異范圍窄且遺傳不穩(wěn)定等缺點,復(fù)合誘變成為一種很好的選擇,但操作繁雜。因此克服了以上誘變?nèi)秉c的新型誘變方法成為受人們青睞的方法。但離子注入法又因為要求條件較嚴格,目前不太適用于微生物的誘變育種;而等離子體誘變則克服了這一缺點,因此更有應(yīng)用價值,但由于這種方法的應(yīng)用條件和誘變機理尚未完全研究清楚,應(yīng)用也未廣泛,關(guān)于此誘變方法還需進一步研究。
參考文獻
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