田一雄,趙 偉,*,陳曉嬋,楊瑞金
(江南大學(xué)食品學(xué)院,江蘇無錫 214122)
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二維電泳技術(shù)對脈沖電場處理哈密瓜汁中釀酒酵母的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
田一雄1,趙 偉1,*,陳曉嬋2,楊瑞金2
(江南大學(xué)食品學(xué)院,江蘇無錫 214122)
采用二維電泳(2-dimensional gel electrophoresis,2-DE)技術(shù)對脈沖電場(pulsed electric field,PEF)處理前后哈密瓜汁中釀酒酵母蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測分析,探究處理過程對釀酒酵母蛋白表達(dá)的影響。實(shí)驗(yàn)結(jié)果得知,所有檢測出的酵母蛋白等電點(diǎn)均介于4.00與6.87之間,分子量分布在14.58~109.83 kDa之間;PEF處理后的釀酒酵母為免受環(huán)境變化帶來的氧化損傷,細(xì)胞中硫氧還蛋白過氧化物酶、延長因子2表達(dá)上調(diào);并且因場強(qiáng)影響到了細(xì)胞的遺傳物質(zhì),核染色質(zhì)蛋白和DNA修復(fù)蛋白表達(dá)上調(diào);此外,細(xì)胞中Cu-Zn輔基超氧化物歧化酶和與糖原合成與代謝密切相關(guān)的磷酸丙酮酸水合酶的表達(dá)下調(diào),反映細(xì)胞的活力下降或死亡;與細(xì)胞生存和增殖相關(guān)蛋白的表達(dá)也發(fā)生了明顯的變化,如胱硫醚β-合酶、腺苷5-單磷酰胺酶、非典型蛋白Ynr034w-A亞基等。PEF處理影響到細(xì)胞代謝的相關(guān)酶類和遺傳物質(zhì),可為研究PEF強(qiáng)化殺菌方法提供理論依據(jù)。
高壓脈沖電場技術(shù)(PEF),非熱加工技術(shù),二維電泳技術(shù),釀酒酵母蛋白
脈沖電場(Pulsed electric field,PEF)技術(shù)作為一種新型的食品非熱加工技術(shù),具有能耗低、處理溫度低、食品品質(zhì)保存效果好、設(shè)備穩(wěn)定性好及連續(xù)性處理等優(yōu)點(diǎn),近年來受到國內(nèi)外政府及企業(yè)的高度重視[1]。脈沖電場對液態(tài)食品的滅菌效果不僅取決于微生物本身,同時(shí)還受電導(dǎo)率、離子強(qiáng)度、pH、水分活度、黏度、氣泡等因素的影響[2]。有研究表明,在較高場強(qiáng)(30 kV/cm,400 μs),處理溫度45 ℃時(shí)對啤酒中的釀酒酵母有較好的滅菌效果[3]。
哈密瓜汁為熱敏性果汁,熱處理會產(chǎn)生令消費(fèi)者無法接受的風(fēng)味,然而哈密瓜汁具有低電導(dǎo)率特點(diǎn),通過脈沖電場處理可實(shí)現(xiàn)較好的滅菌效果[4]。本文選擇以低電導(dǎo)率的哈密瓜汁為介質(zhì),用PEF處理果汁中的釀酒酵母,從蛋白質(zhì)組學(xué)的角度解釋PEF處理對釀酒酵母蛋白質(zhì)表達(dá)的影響。
1.1 材料與儀器
釀酒酵母BY4742 Open Biosystem;新疆西州蜜哈密瓜 無錫華潤萬家超市;IPG膠條、CHAPS、礦物油、電極紙片、尿素 美國Bio-Rad公司;N,N-亞甲雙丙烯酰胺、丙烯酰胺、過硫酸銨、TEMED、SDS、β-巰基乙醇 美國Sigma公司;實(shí)驗(yàn)室常用試劑 國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
OSU-4L型PEF連續(xù)處理設(shè)備 美國俄亥俄州立大學(xué);DRP-9082型電熱恒溫培養(yǎng)箱 上海森信實(shí)驗(yàn)儀器有限公司;LDZX-50KB立式壓力蒸汽滅菌器 上海申安醫(yī)療器械廠;QYC2102-C型恒溫培養(yǎng)搖床 上海新苗醫(yī)療器械有限公司;冷凍離心機(jī) 艾本德中國有限公司;IPGhor等電聚焦儀 GE Healthcare公司;DALT-SIX SDS-PAGE電泳儀、ImageScanner 掃描儀 GE Healthcare公司;PDquest 分析軟件 Bio-Rad公司;ABI 5800 MALDI-TOF/TOF串聯(lián)質(zhì)譜儀 美國 AB SCIEX 公司;酸度計(jì) 梅特勒-托利多(上海)儀器有限公司;UV-1100型紫外分光光度計(jì) 上海美譜達(dá)儀器有限公司;DD-11C型電導(dǎo)率儀 上海精密科學(xué)儀器有限公司;其他儀器設(shè)備 均為實(shí)驗(yàn)室常用儀器。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 哈密瓜汁的制備 市售的新鮮哈密瓜進(jìn)行削皮、去籽后用組織搗碎機(jī)搗碎,果漿用離心機(jī)離心(9000 r/min,10 min)取上清液。將離心好的上清液進(jìn)行抽濾,濾液用去離子水調(diào)節(jié)電導(dǎo)率到2000 μs/cm。
1.2.2 微生物的活化培養(yǎng) 從酵母浸出粉胨葡萄糖(YPD)瓊脂斜面培養(yǎng)基中取釀酒酵母接種于YPD液體培養(yǎng)基中在30 ℃、200 r/min 條件下?lián)u床培養(yǎng)14 h至酵母細(xì)胞生長穩(wěn)定期[5]。取菌液進(jìn)行離心(9500 r/min,10 min),將離心好的菌體用無菌水清洗并再次離心(9500 r/min,10 min),將離心好的菌體收集備用。
1.2.3 微生物的接種 按照上述哈密瓜汁制備方法制備哈密瓜汁,將離心好的釀酒酵母加入到適量的哈密瓜汁中,使菌體最終濃度為106~107CFU/mL。
1.2.4 哈密瓜汁的PEF處理 實(shí)驗(yàn)采用實(shí)驗(yàn)室規(guī)模的OSU-4L型連續(xù)處理設(shè)備處理(20 kV/cm,200 μs,脈沖頻率200 Hz,脈寬2 μs),管路依次用4% NaOH、10%的市售84消毒液和無菌水依次清洗使管路保持無菌狀態(tài)。物料從進(jìn)料口泵入,依次通過3對處理腔(電極間距為0.29 cm),處理后流經(jīng)10 ℃的恒溫水浴鍋冷卻,并讀數(shù)。
1.3 測定方法
1.3.1 釀酒酵母蛋白的提取與定量 根據(jù)1.2.1方法將處理好的液體樣品離心取離心好的釀酒酵母用無菌水清洗并離心兩次,離心好的菌體取出并加入液氮,充分研磨;在研磨好的樣品中加入蛋白裂解液在30 ℃下溶解1 h,使蛋白充分溶解;將溶解后的蛋白液離心(9500 r/min,15 min),取上清液,重復(fù)兩次。采用Bradford法[6]測定上清液中蛋白濃度,并儲存于-80 ℃冰箱中備用。
1.3.2 第一向固相pH梯度等電聚焦 取200 μg蛋白樣品,與一定量的樣品水化液(9 mol/L尿素+4% CHAPS+1% IPG buffer(GE Healthcare)+1% DTT+痕量溴酚藍(lán))混合,使得總體積為450 μL。從冰箱中取出低溫保存的IPG膠條(GE Healthcare,24 cm,pH=4~7),在室溫下放置10 min。在聚焦槽中緩慢加入蛋白樣品,將膠條下面緩慢覆蓋在蛋白樣品上。在每根膠條的支持膜面緩慢加上2 mL礦物油,準(zhǔn)備完畢后開始等電聚焦程序。等電聚焦參數(shù):溫度 20 ℃、最大電流為50 μA/膠條。水化在50 V低電壓下進(jìn)行12 h,然后經(jīng)過500 V下1 h、1000 V下1 h,而后1 h內(nèi)梯度升高到10000 V,并保持10 h。
1.3.3 第二向垂直板SDS-PAGE電泳 將聚焦好的IPG膠條取下,在平衡緩沖液1(6 mol/L尿素+50 mmol/L Tris-HCl(pH8.8)+30%甘油+2% SDS+1% DTT+痕量溴酚藍(lán))和平衡緩沖液2(6 mol/L尿素+50 mmol/L Tris-HCl(pH8.8)+30%甘油+2% SDS+2.5%碘乙酰胺+痕量溴酚藍(lán))中各平衡15 min。將膠條放到第二向SDS-PAGE凝膠的上表面,使膠條與SDS-PAGE凝膠的膠面充分接觸,用瓊脂固定,進(jìn)行電泳:水浴循環(huán)儀設(shè)定溫度為15 ℃;電泳設(shè)置為100 V、45 min;至溴酚藍(lán)前沿剛好跑出凝膠。電泳結(jié)束后取出凝膠進(jìn)行染色。
1.3.4 雙向凝膠電泳EMBL銀染方法(質(zhì)譜兼容) 參考Shevchenko等[6]的銀染方法對凝膠進(jìn)行染色?;静僮饕来问?50%甲醇+5%冰乙酸固定20 min;50%甲醇洗脫10 min;500 mL超純水水洗10 min;0.02%硫代硫酸鈉敏化1 min;500 mL超純水水洗1 min;0.1%硝酸銀4 ℃下進(jìn)行銀染20 min;500 mL超純水水洗兩次各1 min;0.04%甲醛+2% Na2CO3進(jìn)行顯色至斑點(diǎn)清晰;5%冰乙酸終止30 min;用30%乙醇+4.6%甘油保存。
1.3.5 凝膠掃描以及圖像分析 用mageScanner掃描儀對染色后的凝膠進(jìn)行掃描,并采用PDquest 8.0軟件對所得的圖像分析。將處理組和對照組的雙向電泳圖片進(jìn)行比較,選取以變化倍數(shù)大于5或小于0.2的蛋白點(diǎn)為差異蛋白,進(jìn)行質(zhì)譜分析。
1.3.6 蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析
1.3.6.1 蛋白質(zhì)酶解 操作步驟依次為:100 μL去離子水清洗膠點(diǎn)兩次;吸出去離子水,每管加入酶解脫色液(15 mmol/L K3Fe9(CN)6+50 mmol/L NaS2O3)50 μL待顏色完全脫去后吸出液體,然后加入200 μL去離子水停止反應(yīng);吸出去離子水,并用200 μL去離子水清洗膠點(diǎn)兩次;加入25 mmol/L NH4HCO3350 μL吸脹5 min后,吸出液體;加50%乙腈100 μL,5 min后吸出液體;加100 %乙腈100 μL脫水,至膠塊完全變白即可,吸出液體;取離心管每管加入2~4 μL酶液(用含10% 乙腈+25 mmol/L NH4HCO3+1 g/L溶于50 mmol/L乙酸中的胰蛋白酶(Promega)溶液配至成終濃度為0.02 μg/μL的酶解工作液),充分吸漲后加20 μL覆蓋液(25 mmol/L NH4HCO3+10%乙腈水溶液);37 ℃恒溫水浴鍋酶解16 h;溶液轉(zhuǎn)移至新離心管中,膠粒采用50 μL萃取液(5%TFA+67%乙腈水溶液)抽提,合并蛋白萃取液和之前的溶液,冷凍干燥,待做質(zhì)譜。
表1 釀酒酵母蛋白點(diǎn)的等電點(diǎn)與分子量分布Table 1 Isoelectric point and molecular weight distribution of Saccharomyces cerevisiae protein spots
1.3.6.2 質(zhì)譜鑒定 將干粉重新溶解于5 μL含0.1% TFA的溶液中,然后按照1∶1的比例與含50% ACN和1% TFA的α-氰基-4-羥基肉桂酸飽和溶液混合;取1 μL樣品進(jìn)行質(zhì)譜點(diǎn)靶鑒定;采用正離子模式和自動獲取數(shù)據(jù)的模式進(jìn)行數(shù)據(jù)采集;將一級和二級質(zhì)譜數(shù)據(jù)整合并使用GPS 3.6(Applied Biosystems)和Mascot2.3(Matrix Science)軟件對質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和蛋白鑒定;并在NCBInr-Fungi 數(shù)據(jù)庫中檢索。
2.1 釀酒酵母蛋白質(zhì)的2-DE分析
圖1所示為釀酒酵母處理前后細(xì)胞蛋白質(zhì)的2-DE圖譜,水平方向?yàn)榈谝幌蚬滔鄍H梯度等電聚焦(IEF),垂直向?yàn)榈诙虼怪卑錝DS-PAGE電泳。其中未處理樣品中共得到926個(gè)蛋白點(diǎn),PEF處理樣品得到851個(gè)蛋白點(diǎn)。
圖1 不同條件下釀酒酵母蛋白雙向電泳圖Fig.1 2-DE of Saccharomyces cerevisiae under different condition
由圖1可知,未處理和PEF處理(20 kV/cm、200 μs)樣品中釀酒酵母蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)均分布在4.00~6.87之間。從分子量分布上來看,所檢測出的酵母蛋白分子量分布在14.58~109.83 kDa之間,分子量分布在處理后不同分子量范圍內(nèi)的樣品的蛋白點(diǎn)數(shù)比未處理樣品均有所減少。具體等電點(diǎn)和分子量分布如表1。
將未處理樣品和PEF處理樣品的2-DE圖進(jìn)行匹配,尋找差異點(diǎn),匹配結(jié)果如圖2所示。
圖2 釀酒酵母蛋白點(diǎn)匹配結(jié)果Fig.2 Protein spots matching in Saccharomyces cerevisiae
圖2a為未處理樣品,圖2b為處理樣品;由于高強(qiáng)度電場處理,釀酒酵母細(xì)胞受到不同程度的影響,細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的表達(dá)發(fā)生了不同程度的變化。以未處理樣品為對照組選取差異倍數(shù)大于5(表達(dá)明顯上調(diào))和小于0.2(表達(dá)明顯下調(diào))的蛋白點(diǎn)。結(jié)果得到明顯下調(diào)的蛋白點(diǎn)42個(gè),明顯上調(diào)的蛋白點(diǎn)35個(gè)。剩余90.95%的蛋白點(diǎn)未發(fā)生明顯變化。通過結(jié)果可以得出,經(jīng)過PEF處理,釀酒酵母蛋白的表達(dá)變化顯著(p<0.05),但蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和分子量分布沒有發(fā)生較大變化。
2.2 PEF處理前后釀酒酵母差異蛋白的分析與鑒定
對表達(dá)差異顯著的釀酒酵母蛋白,利用PDquest分析軟件分析,從中選取35個(gè)差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜和功能鑒定。用胰蛋白酶酶解選取的35種蛋白點(diǎn),對水解后的多肽片段進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,在NCBInr-Fungi數(shù)據(jù)庫中檢索,得到35個(gè)蛋白點(diǎn)的鑒定信息,如表2所示。
表2 釀酒酵母差異蛋白點(diǎn)鑒定結(jié)果Table 2 Identification of differentially expressed proteins in Saccharomyces cerevisiae
在UniProt數(shù)據(jù)庫中搜索上述35個(gè)蛋白點(diǎn)功能信息,結(jié)果如下:
蛋白點(diǎn)1為原肌球蛋白(Tpm2p),原肌球蛋白在肌肉收縮過程中起著重要作用,影響并調(diào)控肌動球蛋白之間相互作用[7]。在釀酒酵母細(xì)胞中主要構(gòu)成細(xì)胞形態(tài)并與細(xì)胞器分布有關(guān)[8-9]。
蛋白點(diǎn)2為翻譯機(jī)制相關(guān)蛋白17(Translation machinery-associated protein 17)。是一種ATP酶伴侶,協(xié)助RPT6-TPT3 ATP酶對形成。用于維持穩(wěn)態(tài)的蛋白酶體水平并在組裝蛋白酶時(shí)起到關(guān)鍵作用,如蛋白酶的伸縮和RPN14功能的重疊。
蛋白點(diǎn)3、5為Egd2p。主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,參與蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)[10]。
蛋白點(diǎn)4為驅(qū)動蛋白相關(guān)蛋白SMY1(Kinesin-related protein SMY1),此種蛋白質(zhì)可能與細(xì)胞微管運(yùn)動有關(guān),可代替肌球蛋白2(myo2)[11-14]。
蛋白點(diǎn)6、7、8為硫氧還蛋白過氧化物酶(Tsa1p),該種蛋白質(zhì)與核糖體結(jié)合,維持細(xì)胞氧化還原穩(wěn)態(tài),保持細(xì)胞對氧化應(yīng)激的反應(yīng),分子伴侶介導(dǎo)的蛋白質(zhì)折疊,DNA損傷檢驗(yàn)和DNA保護(hù)等有關(guān)[15-16]。
蛋白點(diǎn)9為Sba1p,能夠結(jié)合DNA進(jìn)行調(diào)控,與端粒酶對端粒維持的正向調(diào)節(jié)活動,端粒酶活性調(diào)控和蛋白質(zhì)的折疊有關(guān)[17-18]。
蛋白點(diǎn)10、13為熱應(yīng)激蛋白(Hsp12p)。作用可能是對周圍環(huán)境作出應(yīng)激反應(yīng)[19-22]。
蛋白點(diǎn)11、14、25為磷酸丙酮酸水合酶(phosphopyruvate hydratase ENO2),主要和2-磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸與水的縮合反應(yīng),參與糖酵解合成D-甘油醛3-磷酸丙酮酸[23]。
蛋白點(diǎn)12為高遷移率族非組蛋白核染色質(zhì)蛋白(High-mobility group non-histone chromatin protein)。其作用可能與INO80染色質(zhì)相互作用參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控[24-26]。
蛋白點(diǎn)15、16為Hmf1p,可能與異亮氨酸合成相關(guān)[27-28]。
蛋白點(diǎn)17、28、32為磷酸甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase),這種蛋白質(zhì)是參與糖酵解的關(guān)鍵酶,對甘油醛-3-丙酮酸合成起到關(guān)鍵作用[29]。
蛋白點(diǎn)18為延長因子2(Eft2p),與GTP結(jié)合,調(diào)節(jié)GTP酶活性。
蛋白點(diǎn)19為DNA修復(fù)蛋白RAD10(DNA repair protein RAD10),該種蛋白可以切除受紫外線等不良環(huán)境下異常的DNA,特異性的降解單鏈DNA[30-33]。
蛋白點(diǎn)20為熱休克蛋白70(Heat shock protein of HSP70 family)。該蛋白可以和與代謝相關(guān)的酶類結(jié)合,保護(hù)自己不受外界高溫環(huán)境對自身的傷害[34]。
蛋白點(diǎn)21為胱硫醚β-合酶(cystathionine beta-synthase),該酶是細(xì)胞內(nèi)同型半胱氨酸轉(zhuǎn)硫途徑代謝的關(guān)鍵酶。
蛋白點(diǎn)22為含Cu-Zn輔基超過氧化物歧化酶A亞基(Chain A,structure solution and molecular dynamics refinement of the yeast Cu,Zn enzyme superoxide dismutase),該酶能夠清除細(xì)胞內(nèi)的自由基[35]。
蛋白點(diǎn)23為類漿膜蛋白(Reticulon-like protein 1):該種蛋白主要存在于釀酒酵母內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的正常運(yùn)作起到調(diào)節(jié)穩(wěn)定作用[36]。
蛋白點(diǎn)24為應(yīng)激蛋白70(stress-seventy subfamily A protein),該蛋白與ATP結(jié)合,維持能量代謝。
蛋白點(diǎn)26為二氫乳清酸脫氫酶(dihydroorotate dehydrogenase),該酶以延胡索酸為電子受體將二氫乳清酸轉(zhuǎn)化為乳清酸鹽[37]。
蛋白點(diǎn)27、31、33為未命名蛋白。
蛋白點(diǎn)29、30為腺苷5,-單磷酰胺酶,可以水解腺苷5,-單磷酰胺酯類物質(zhì)。釀酒酵母在半乳糖培養(yǎng)基上生長,該酶起到重要作用。
蛋白點(diǎn)34為ETF1p,該蛋白作為電子傳遞的載體,與黃素腺嘌呤二核苷酸結(jié)合。
蛋白點(diǎn)35為非典型蛋白Ynr034w-A亞基,該酶參與細(xì)胞代謝[38-39]。
經(jīng)過PEF處理后,釀酒酵母中硫氧還蛋白過氧化物酶表達(dá)明顯上調(diào),該酶與細(xì)胞的自我防御密切相關(guān),說明PEF處理過程中釀酒酵母細(xì)胞為免受環(huán)境變化造成的損傷而啟動代謝調(diào)控來防止氧化損傷。延長因子2在蛋白質(zhì)合成過程中起到重要作用,其表達(dá)上調(diào),說明經(jīng)PEF處理,釀酒酵母細(xì)胞需要合成更多的蛋白質(zhì)以適應(yīng)外界環(huán)境變化,推斷可能是一些酶類或膜蛋白等。核染色質(zhì)蛋白和DNA修復(fù)蛋白表達(dá)的上調(diào),說明細(xì)胞遺傳物質(zhì)在PEF處理過程中也受到了外界電場的影響,推測這有可能會有助于DNA的合成、復(fù)制及功能。PEF處理后,細(xì)胞Cu-Zn輔基超過氧化物歧化酶表達(dá)下調(diào),該酶在生物體內(nèi)的水平高低是衰老與死亡的直觀指標(biāo),且與糖原的合成與代謝密切相關(guān)的磷酸丙酮酸水合酶表達(dá)也發(fā)生下調(diào),說明經(jīng)過PEF處理,釀酒酵母細(xì)胞活力下降或死亡。此外,表達(dá)發(fā)生明顯變化的還包括一些與細(xì)胞生存和增殖相關(guān)蛋白,如胱硫醚β-合酶、腺苷5,-單磷酰胺酶、非典型蛋白Ynr034w-A亞基等。
哈密瓜汁中釀酒酵母經(jīng)過PEF處理,細(xì)胞內(nèi)代謝相關(guān)的關(guān)鍵蛋白受到較大影響。細(xì)胞需要調(diào)控自身蛋白的合成來應(yīng)對外界惡劣環(huán)境的變化,如延長因子2、硫氧還蛋白過氧化物酶、核染色質(zhì)蛋白和DNA修復(fù)蛋白表達(dá)上調(diào);與細(xì)胞活性相關(guān)的蛋白,如Cu-Zn輔基超過氧化物歧化酶和磷酸丙酮酸水合酶表達(dá)下調(diào);此外,釀酒酵母細(xì)胞蛋白質(zhì)表達(dá)發(fā)生明顯變化的還包括一些與細(xì)胞生存和增殖相關(guān)蛋白,如胱硫醚β-合酶、腺苷5,-單磷酰胺酶、非典型蛋白Ynr034w-A亞基等。目前高壓脈沖電場強(qiáng)化殺菌方法效果較好的有溫和熱協(xié)同和添加天然抑菌物質(zhì)的協(xié)同[40-41]。此外,我們還可以從這些酵母菌細(xì)胞發(fā)生顯著變化的蛋白質(zhì)入手,尋求PEF強(qiáng)化殺菌的方法來達(dá)到較好的滅菌效果。從而有效延長貨架期,在果汁加工行業(yè)具有重大潛力。
[1]馮敘橋,王月華,徐方旭. 高壓脈沖電場技術(shù)在食品質(zhì)量與安全中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào),2013(4):337-346.
[2]曾新安,陳勇.脈沖電場非熱滅菌技術(shù)[M].北京:中國輕工業(yè)出版社,2005:149-165.
[3]劉錚,楊瑞金,趙偉. 高壓脈沖電場破壁法提取廢啤酒酵母中的蛋白質(zhì)與核酸[J]. 食品工業(yè)科技,2007(3):85-88.
[4]尹琳琳,宋麗軍,姜海榮,等. 超高壓處理對哈密瓜汁品質(zhì)的影響[J]. 食品科技,2009(12):56-59.
[5]M M Bradford. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding[J]. Analytical Biochemistry,1976,72(1):248-254.
[6]B Drees,C Brown,B G Barrell,et al. Tropomyosin is essential in yeast,yet the TPM1 and TPM2 products perform distinct functions[J]. The Journal of Cell Biology,1995,128(3):383-392.
[7]楊靜嫻. 原肌球蛋白的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2004(2):144-147.
[8]Drees B,Brown C,Barrell B G,et al. Tropomyosin is essential in yeast,yet the TPM1 and TPM2 products perform distinct functions[J]. The Journal of Cell Biology,1995,1283:383-392.
[9]Huckaba Thomas M,Lipkin Thomas,Pon Liza A. Roles of type II myosin and a tropomyosin isoform in retrograde actin flow in budding yeast[J]. The Journal of Cell Biology,2006,1756:957-969.
[10]Shi X,Parthun M R,Jaehning J A. The yeast EGD2 gene encodes a homologue of the alpha NAC subunit of the human nascent-polypeptide-associated complex[J]. Gene,1995,1652:199-202.
[11]Lillie S H,Brown S S. Smy1p,a kinesin-related protein that does not require microtubules[J]. The Journal of Cell Biology,1998,1404:873-883.
[12]Lwin Kyaw Myo,Li Donghao,Bretscher Anthony. Kinesin-related Smy1 enhances the Rab-dependent association of myosin-V with secretory cargo[J]. Molecular Biology of The Cell,2016,2715:2450-2462.
[13]Lillie S H,Brown S S. Immunofluorescence localization of the unconventional myosin,Myo2p,and the putative kinesin-related protein,Smy1p,to the same regions of polarized growth in Saccharomyces cerevisiae[J]. The Journal of Cell Biology,1994,1254:825-842.
[14]Lillie S H,Brown S S. Smy1p,a kinesin-related protein that does not require microtubules[J]. The Journal of cell biology,1998,1404:873-883.
[15]Wong Chi-Ming,Zhou Yuan,Ng Raymond W M,et al. Cooperation of yeast peroxiredoxins Tsa1p and Tsa2p in the cellular defense against oxidative and nitrosative stress[J]. Journal of Biological Chemistry,2001,2777:5385-5394.
[16]Lim Jung Chae,Choi Hoon-In,Park Yu Sun,et al. Irreversible oxidation of the active-site cysteine of peroxiredoxin to cysteine sulfonic acid for enhanced molecular chaperone activity[J]. Journal of Biological Chemistry,2008,28343:28873-28880.
[17]Fedor Forafonov,Oyetunji A Toogun,et al. Tp23/Sba1p Protects against Hsp90 inhibitors independently of its intrinsic chaperone activity[J]. Molecular and Cellular Biology,2008,28(10):3446-3456.
[18]Shamrock Vanessa J,Duval Jérme F L,Lindsey George G,et al. The role of the heat shock protein Hsp12p in the dynamic response ofSaccharomycescerevisiaeto the addition of Congo red[J]. FEMS Yeast Research,2009,93:391-399.
[19]MS Fu,SL De,FA Mühlschlegel. Functional characterization of the small heat shock protein Hsp12p from Candida albicans[J]. PLoS One,2012,7(8):e42894.
[20]Karreman Robert J,Dague Etienne,Gaboriaud Fabien,et al. The stress response protein Hsp12p increases the flexibility of the yeast Saccharomyces cerevisiae cell wall[J]. Biochimica et Biophysica Acta,2006,17741:131-137.
[21]Witt I,Witz D. Purification and characterization of phosphopyruvate hydratase in erythrocytes of newborn and adults[J]. Hoppe-Seyler’s Zeitschrift für physiologische Chemie,1970,35110:1232-1240.
[22]Goodwin G H,Shooter K V,Johns E W. Interaction of a non-histone chromatin protein(high-mobility group protein with DNA)[J]. European Journal of Biochemistry,1975,542:427-433.
[23]Limas C J. Enhanced myocardial RNA synthesis in spontaneously hypertensive rats possible role of high-mobility group non-histone proteins[J]. Biochimica et Biophysica Acta,1982,6961:37-43.
[24]Mathew C G,Goodwin G H,Gooderham K,et al. A comparison of the high mobility group non-histone chromatin protein HMG 2 in chicken thymus and erythrocytes[J]. Biochemical and Biophysical Research Communications,1979,874:1243-1251.
[25]Pozdniakovaite Natalija,Popendikyte Violeta. Identification of differentially expressed genes in yeastSaccharomycescerevisiaecells with inactivated Mmf1p and Hmf1p,members of proteins family YERO57c/YJGF[J]. Development,Growth and Differentiation,2004,466:545-554.
[26]Rosita Accardi,Ellinor Oxelmark,Nicolas Jauniaux,et al. High levels of the mitochondrial large ribosomal subunit protein 40 prevent loss of mitochondrial DNA in null mmf1Saccharomycescerevisiaecells[J]. Yeast,2004,217:539-548.
[27]Claude Durrieu,Fran?oise Bernier-Valentin,Bernard Rousset. Binding of glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase to microtubules[J]. Molecular and Cellular Biochemistry,1987,741:55-65.
[28]Bardwell L,Cooper A J,Friedberg E C. Stable and specific association between the yeast recombination and DNA repair proteins RAD1 and RAD10invitro[J]. Molecular and Cellular Biology,1992,127:860-862.
[29]Tomkinson A E,Bardwell A J,Bardwell L,et al. Yeast DNA repair and recombination proteins Rad1 and Rad10 constitute a single-stranded-DNA endonuclease[J]. Nature,1993,3626423:860-862.
[30]Bardwell A J,Bardwell L,Johnson D K,et al. Yeast DNA recombination and repair proteins Rad1 and Rad10 constitute a complexinvivomediated by localized hydrophobic domains[J]. Molecular Microbiology,1993,86:1177-1188.
[31]Sung P,Prakash L,Prakash S. Renaturation of DNA catalysed by yeast DNA repair and recombination protein RAD10[J]. Nature,1992,3556362:743-745.
[32]Rafaela M M Paim,Ricardo N Araujo,Miguel Leis,et al. Functional evaluation of Heat Shock Proteins 70(HSP70/HSC70)on Rhodnius prolixus(Hemiptera,Reduviidae)physiological responses associated with feeding and starvation[J]. Insect Biochemistry and Molecular Biology,2016,77:10-20.
[34]Nziengui Hugues,Bouhidel Karim,Pillon David,et al. Reticulon-like proteins in Arabidopsis thaliana:structural organization and ER localization[J]. FEBS Letters,2007,58118:3356-3362.
[35]Williamson R A,Yea C M,Robson P A,et al. Dihydroorotate dehydrogenase is a high affinity binding protein for A77 1726 and mediator of a range of biological effects of the immunomodulatory compound.[J]. The Journal of Biological Chemistry,1995,27038:22467-22472.
[36]Fu-Ping Wen,Yue-Shuai Guo,Yang Hu,et al. Distinct temporal requirements for autophagy and the proteasome in yeast meiosis[J]. Autophagy,2016,124:671-688.
[37]Murphy J Patrick,Stepanova Ekaterina,Everley Robert A,et al. Comprehensive temporal protein dynamics during the diauxicshift in saccharomyces cerevisiae[J]. Molecular & amp Cellular Proteomics,2015,149:2454-2465.
[38]Shen S,M atsubae M,Takao T,et al. A proteomic analysis of leaf sheaths from rice[J]. The Journal of Biochemistry,2002,132(4):613-620.
[39]Tanaka N,Konishi H,Khan M M,et al. Proteome analysis of rice tissues by twodimensional electrophoresis:An approach to the investigation of gibberellin regulated proteins[J]. Mol Gen Genom,2004,270(6):485-496.
[40]趙偉,楊瑞金,張文斌,等. 高壓脈沖電場與溫和熱對液態(tài)蛋協(xié)同殺菌動力學(xué)和工藝研究[J]. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào),2010(16):48-52.
[41]崔曉美,楊瑞金,趙偉,等. 高壓脈沖電場對石榴汁殺菌的研究[J]. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào),2007(3):252-256.
Study on proteomics ofSaccharomycescerevisiaetreated by pulsed electric field in Ha-mi melon juice using two dimensional electrophoresis technology
TIAN Yi-xiong1,ZHAO Wei1,*,CHEN Xiao-chan2,YANG Rui-jin2
(School of Food Science and Technology,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)
:2-dimensional gel electrophoresis(2-DE)technology was used to detect and analyze the protein ofSaccharomycescerevisiaein Ha-mi melon juice before and after PEF treatment. On the basis of the experiment results,the isoelectric point of protein spots was between 4.00 and 6.87,the molecular weight of protein spots was 14.58~109.83 kDa. The expression of proteins was up regulated in order to avoid the damage result in environment change,such as thioredoxin peroxidase and elongation factor 2. Additionally,because of field strength,genetic materials were affected,so the expression of nuclear chromatin protein and DNA repair protein was up regulated. The proteins like Cu-Zn cofactor superoxide dismutase and pyruvate phosphatese were down expressed. It revealed that cells viability decreased or cells were dead. The expression of cell survival and proliferation related proteins also changed significantly such as cystathionineβ-synthase,adenosine 5- single phosphate amide,atypical protein Ynr034w-A subunit and so on. The treatment of PEF affected the enzyme relevant to metabolize and genetic material in cells. It can provide the theoretical basis for the study of intensified sterilization of PEF.
pulsed electric field(PEF);non thermal processing technology;2-dimensional gel electrophoresis(2-DE);Saccharomycescerevisiaeprotein
2016-12-02
田一雄(1992-),男,碩士研究生,研究方向:食品加工與配料,E-mail:372767129@qq.com。
*通訊作者:趙偉(1982-),男,博士,教授,研究方向:食品加工與配料,E-mail:zhaow@jiangnan.edu.cn。
國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0400300);國家自然基金科學(xué)基金項(xiàng)目:(31522044);教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃(NCET-13-0834);中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金項(xiàng)目(JUSRP51406A)。
TS201.3
A
1002-0306(2017)11-0128-06
10.13386/j.issn1002-0306.2017.11.016