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EBP:最宏偉的科學(xué)計(jì)劃

2017-05-12 14:19
關(guān)鍵詞:真核基因組物種

“人類(lèi)基因組計(jì)劃”與“曼哈頓原子彈計(jì)劃”“阿波羅登月計(jì)劃”并稱(chēng)為自然科學(xué)史上的“三大計(jì)劃”。繼人類(lèi)基因組計(jì)劃之后,生命科學(xué)領(lǐng)域又迎來(lái)一件大事——地球生物基因組計(jì)劃(Earth BioGenome Project,EBP)即將啟動(dòng),目標(biāo)是破譯地球上所有生命的基因組。這一具有歷史意義的項(xiàng)目吸引了全球科學(xué)家的關(guān)注。

據(jù)EBP項(xiàng)目組成員介紹,整個(gè)項(xiàng)目大約需要40億美元的投入,相當(dāng)于兩架轟炸機(jī)的價(jià)格,1萬(wàn)個(gè)美國(guó)總統(tǒng)的年薪,也與人類(lèi)基因組計(jì)劃的投入相當(dāng)(人類(lèi)基因組計(jì)劃耗時(shí)13年,測(cè)序一個(gè)人的基因組花費(fèi)約30億美元)。項(xiàng)目組的科學(xué)家們表示,如果獲得資金支持,該計(jì)劃有望在10年內(nèi)完成。

從兩年前提出“測(cè)序所有地球生命”的愿景,到BioGenomics2017大會(huì)上提出EBP的綱要,這一項(xiàng)目已徹底點(diǎn)燃生物學(xué)家們的熱情,將極大推動(dòng)所有真核生物的研究——包括所有植物、動(dòng)物、真菌以及如阿米巴蟲(chóng)之類(lèi)的單細(xì)胞生物。

EBP項(xiàng)目將首先集中完成約9 330個(gè)真核生物科級(jí)別代表性物種的基因組,從而獲得與人類(lèi)參考基因組相當(dāng)或比人類(lèi)參考基因組更好的參考基因組。接著,在14萬(wàn)至20萬(wàn)個(gè)真核生物屬中,對(duì)來(lái)自每個(gè)屬的一個(gè)物種進(jìn)行基因組草圖繪制。最后,對(duì)剩下的150萬(wàn)個(gè)已知的真核生物物種的基因組進(jìn)行低覆蓋測(cè)序。這些精細(xì)度不同的基因組之間還能通過(guò)比較分析或進(jìn)一步測(cè)序,幫助科學(xué)家獲知更多的信息。

EBP計(jì)劃的意義重大。據(jù)工作組成員介紹,這是第一個(gè)真正意義上的全球大型基因組測(cè)序項(xiàng)目,能讓世界上數(shù)千名科學(xué)家和數(shù)百萬(wàn)民眾參與,所產(chǎn)出的數(shù)據(jù)超過(guò)1EB(相當(dāng)于1億部高清電影播放2.3萬(wàn)年),將推動(dòng)全新計(jì)算算法、分析方法和模型的創(chuàng)立,革新人們對(duì)生物學(xué)的理解,并有望極大改善物種保護(hù)工作,為農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥和生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)創(chuàng)造新的基因資源。

雖然EBP項(xiàng)目的落地還存在一些尚待解決的問(wèn)題,但類(lèi)似的國(guó)際合作項(xiàng)目已有成功的先例。隨著基因科技的飛速發(fā)展,科學(xué)家們已經(jīng)破譯了許多地球物種,并組建國(guó)際級(jí)合作小組,發(fā)起覆蓋海、陸、空物種的多項(xiàng)計(jì)劃。如同樣致力于生物多樣性保護(hù)的華大基因與史密森學(xué)會(huì)已經(jīng)共同維護(hù)和推動(dòng)了多項(xiàng)國(guó)際合作項(xiàng)目——旨在構(gòu)建約10 500種現(xiàn)存鳥(niǎo)類(lèi)的基因組圖譜,實(shí)現(xiàn)對(duì)鳥(niǎo)類(lèi)生命之樹(shù)的數(shù)字化重建,并解碼遺傳變異和表型差異之間聯(lián)系的B10K項(xiàng)目;旨在完成10 000個(gè)脊椎動(dòng)物的基因組,并通過(guò)這些脊椎動(dòng)物的遺傳多態(tài)性,為生命科學(xué)以及全球生物保護(hù)提供強(qiáng)有力幫助的G10K項(xiàng)目;旨在對(duì)1 000種昆蟲(chóng)的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行研究,揭開(kāi)昆蟲(chóng)演化之謎的1KITE項(xiàng)目等。

EBP項(xiàng)目的提出將有助于整合世界各地的地球生物基因組研究,使之形成更有價(jià)值的科研體系,促進(jìn)物種研究工作有序而高效地進(jìn)行,進(jìn)而幫助人們?nèi)媪私獾厍蛏莼膴W秘。(據(jù)新浪網(wǎng))

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