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馬炯的雙面人生

2016-10-12 15:59武光磊
科學(xué)中國人 2016年6期
關(guān)鍵詞:復(fù)合物細胞核顯微鏡

武光磊

吾生也有涯。而知也無涯。學(xué)海漫漫,很多人窮其一生都難在一個領(lǐng)域里有所建樹,終碌碌無為,草莽而終。而復(fù)旦大學(xué)信息與工程學(xué)院光科學(xué)與工程系的青年研究員馬炯用他一半技術(shù)、一半生物的雙向科研成就,為我們展示了一個科研工作者如何在兩個領(lǐng)域都有所成就。

初見馬炯,并沒有想象中那么嚴(yán)肅。他坦誠、開朗、愛笑,直言不諱,又分寸有佳。他聊星座,說自己能在兩個領(lǐng)域里吃香大概是“托了這個雙子座的?!保贿€笑言自己是追星族,并拿出與諾獎得主的照片和記者一同分享。而談及他的科研工作,馬炯并沒有太多地說起科研工作的辛苦,而是更多地分享他的步步歷程。

一半是技術(shù),一半是生物

馬炯1999年進入復(fù)旦大學(xué)物理系,2008年取得物理系光學(xué)專業(yè)博士學(xué)位。博士階段開始,馬炯就致力于發(fā)展光學(xué)技術(shù)與生物課題相結(jié)合的研究工作。期間他曾作為訪問學(xué)者前往南非羅德斯大學(xué)化學(xué)系和挪威奧斯陸大學(xué)生理系進行學(xué)術(shù)交流。

在南非期間,他確認水溶性CdTe量子點的光催滅機理,首次測定其單態(tài)氧產(chǎn)量,并開創(chuàng)出一種應(yīng)用于其實現(xiàn)光動力治療癌癥的方法。2008年赴美從事博士后工作后,他一直致力于發(fā)展新型的單分子超分辨熒光顯微鏡,用于細胞核孔復(fù)合物的研究工作。在美國,馬炯與Yang教授共同開發(fā)了SPEED顯微技術(shù),并在10nm空間精度和400μs時間精度下,研究了各類分子穿越細胞核孔的選擇機制。他首次觀測到細胞核孔內(nèi)非折疊蛋白的三維結(jié)構(gòu),并首次獲得生物小分子穿越細胞核孔三維路徑,確定了其間的選擇性機制,并于2010年及2012年在Proceedings of the National Academy of Sciences上發(fā)表了兩篇高質(zhì)量論文。

馬炯還與Walter教授合作,開發(fā)應(yīng)用于超分辨顯微鏡的mRNA熒光標(biāo)記系統(tǒng),結(jié)合單分子顯微追蹤技術(shù),完成了mRNA穿越核孔的選擇機制的初步研究,確認了mRNA核孔輸出三維路徑,糾正了一維路徑數(shù)據(jù)所造成的認知誤解,并發(fā)表在Nature Communication上。

而談到技術(shù)和生物研究,馬炯說他從來沒有糾結(jié)兩者之間的取舍,而是始終游走在兩者的平衡之中。曾經(jīng)在南非和挪威做訪問學(xué)者的時候,他感到技術(shù)上偏重太多時,就在前去美國的時候有意識地加重了生物研究的選擇。技術(shù)是他的“技”,而生物就是他的“巧”。有技方成巧,通過超分辨率光學(xué)顯微鏡的技術(shù)不斷提高,他在細胞核孔復(fù)合物領(lǐng)域的研究也不斷加深;以巧推動技,通過細胞核孔復(fù)合物實驗研究的需求,他又不斷革新超分辨光學(xué)顯微鏡的技術(shù)。雙子的多面性,他展現(xiàn)在了科研領(lǐng)域中,并且大獲成功。

2015年6月,馬炯歸國。他坦言,歸國的一部分原因是因為故鄉(xiāng)的父母,另一部分則是國家現(xiàn)在對于青年學(xué)者的重視,能夠讓他在最有精力的時刻投入到科研中去?!澳軌驗閲易鲆稽c事情,國家也重視我做的事情,這當(dāng)然是再好不過了?!瘪R炯笑言。

超分辨光學(xué)顯微鏡下看世界

顯微鏡的發(fā)展?jié)M足了人們對觀察微觀世界的需求,讓人們可以看得越來越“小”。但由于衍射極限的存在,幾十年來光學(xué)顯微鏡的分辨率停滯在了200nm左右。2014年諾貝爾化學(xué)獎頒發(fā)給了美國及德國三位科學(xué)家Eric Betzig、Stefan W. Hell和William E. Moerner,獲獎理由是“研制出超分辨率熒光顯微鏡”。幾位獲獎?wù)咔擅钤O(shè)計了避開衍射極限的方法,其研究突破性地將光學(xué)顯微鏡帶入了納米維度。在納米顯微鏡下,科學(xué)家實現(xiàn)了活體細胞中單個分子通路的可視化,能夠觀察到分子是如何在大腦神經(jīng)細胞之間生成神經(jīng)突觸;可以追蹤帕金森病、阿爾茲海默癥和亨廷頓癥患者體內(nèi)相關(guān)蛋白的累積情況;還能跟蹤受精卵在分裂形成胚胎時蛋白質(zhì)的變化過程?,F(xiàn)在已經(jīng)進入了“光學(xué)顯微鏡2.0”的時代,超分辨熒光顯微鏡推動著新一輪生物醫(yī)學(xué)的飛速發(fā)展。

現(xiàn)今,已具有多種不同超分辨成像技術(shù)實際應(yīng)用于生物系統(tǒng)的范例,也已出現(xiàn)了商業(yè)化的超分辨顯微鏡系統(tǒng),但仍然沒有達到完美狀態(tài)。在許多生物研究中,各類超分辨系統(tǒng)有著各自的局限性,如對于特殊熒光標(biāo)記的發(fā)光特性依賴,或是高空間精度測量制約了探測時間進一步縮短。因此,研究和發(fā)展合適新的原理和方法,研制出適合專項生物課題研究的顯微鏡將是今后發(fā)展的一大方向。

談起二維到三維的超分辨退卷積計算開發(fā)的時候,馬炯說起了一個有意思的故事:他做出這個開發(fā)之后,花了整整一個星期的時間說服他的老師來相信他的成果,因為他的老師根本無法想象有人可以做出從二維分布中獲取系統(tǒng)的三維分布的開發(fā)。而當(dāng)他的老師認可了他的成果,他和他的老師又開始一起說服領(lǐng)域里的其他研究者一起應(yīng)用這項成果的相關(guān)研究人員。“這告訴我們,固化思維的可怕??萍家M步,科研人員要創(chuàng)新研究,首先就要從打破自己的固有傳統(tǒng)認知開始?!瘪R炯嚴(yán)肅地說。

歸國后的馬炯將開始著手建立顯微鏡第二平臺熒光返還探測技術(shù),實現(xiàn)兼具超高的時間和空間分辨率的三維分子熒光追蹤系統(tǒng)。他將把研究中所獲得的信息將與跟蹤RNA輸出細胞核孔的研究互相印證,通過分析RNA在細胞核孔各位置的高時空精度動態(tài)過程,進一步研究細胞核孔蛋白調(diào)控基因的機理。此外,研究中所發(fā)展的原理和方法還將能夠被廣泛用于毫秒量級甚至更快的纖毛內(nèi)分子運輸、細胞間分子交換及跨膜通道開關(guān)等生物問題的研究。

在研究中,馬炯將采用創(chuàng)新技術(shù),促使實驗系統(tǒng)同時具有很高的時間和三維空間分辨率,在不影響平面二維光學(xué)分辨精度的前提下,不通過擬合點擴散函數(shù),而在亞毫秒級時間分辨量級和10nm三維空間分辨量級,實現(xiàn)對三維單分子熒光信息的實時探測和分析,滿足高速動態(tài)生物學(xué)研究的特點和條件。在新型光學(xué)系統(tǒng)中,他還將利用凹面鏡返還光程無色差的光學(xué)原理,創(chuàng)新設(shè)計凹面鏡熒光返還光路系統(tǒng),能夠?qū)方向信息轉(zhuǎn)換成x-y水平方向的信息,從而獲取單分子z方向的位置信息。

細胞核孔復(fù)合物探尋

在細胞核孔復(fù)合物的研究中,馬炯將利用SPEED顯微鏡技術(shù),完成各類FG屏障與各類主要的傳輸分子間反應(yīng)區(qū)域的三維分布測量。細胞核孔復(fù)合物是真核細胞中連接細胞質(zhì)和細胞核之間的選擇性雙向通道,控制著絕大部分細胞核所需的蛋白輸入,以及核內(nèi)基因物質(zhì)的輸出??梢哉f,核孔是細胞內(nèi)基因調(diào)控中非常重要的一個環(huán)節(jié)。核孔的缺陷會導(dǎo)致核孔相關(guān)的白血病及阿爾茲海默癥等疾病。其本身更是各類病毒侵入細胞的重要關(guān)口之一,各類病毒會通過不同的方式通過核孔,最終侵入細胞的基因表達系統(tǒng)導(dǎo)致疾病發(fā)生。核孔的結(jié)構(gòu)與功能的研究將為各類基因調(diào)控機制的研究提供一環(huán)重要的依據(jù),對核孔蛋白缺失相關(guān)的白血病、阿爾茲海默癥的致病機制,以及各種類病毒的侵入機制等核孔相關(guān)病理機制或基因治療提供關(guān)鍵信息。endprint

一個NPC是由30種多不同的核孔蛋白構(gòu)成,長約200nm、直徑為120nm、中心內(nèi)徑為50nm的大分子復(fù)合物。其中有三分之一的核孔蛋白富含苯丙氨酸-甘氨酸(FG)氨基酸片段,且在自然狀態(tài)下呈現(xiàn)出非固定形態(tài),我們稱之為FG-Nups。這些FG-Nups組成了具有選擇性機制的FG屏障。FG屏障選擇性地調(diào)控基因相關(guān)物質(zhì)按照被動運輸或者主動介入運輸?shù)姆绞竭M出細胞核:只有小于60kDa的分子才能通過被動運輸?shù)姆绞?,自由擴散通過NPC;另一種方式是主動運輸,如含有入核信號或者核孔輸出信號的蛋白或復(fù)合物分子,在核孔運輸?shù)鞍讕椭?,形成?fù)合物,通過TRs與FG片段相互作用,從而通過FG屏障。TRs與需要傳輸?shù)牡鞍仔纬傻膹?fù)合物的結(jié)合與解離,通過細胞核內(nèi)外的RanGDP和RanGTP的濃度梯度來調(diào)節(jié)。通過電子顯微鏡可以觀察到細胞核孔結(jié)構(gòu)蛋白,但卻無法獲得這些高度自由的非折疊蛋白的結(jié)構(gòu),所以至今在生理狀態(tài)下FG屏障及其相關(guān)的核孔物質(zhì)傳輸?shù)臋C理仍不清楚。

馬炯將利用SPEED顯微鏡技術(shù),完成各類FG屏障與各類主要的傳輸分子間反應(yīng)區(qū)域的三維分布測量。他將確認活細胞內(nèi)FG-Nup相互反應(yīng)的存在及相應(yīng)的水凝膠分布。綜合各反應(yīng)分布,完成接近完善的FG屏障的完整分布。他還將利用基因敲除,獲取缺失核孔蛋白的分布,理解其對白血病的致病機理及對腺相關(guān)病毒(AAV)基因療法的調(diào)控機制。從傳輸?shù)鞍组g的競爭情況,了解細胞核孔在大通量物質(zhì)運輸下對應(yīng)的優(yōu)先選擇機制。

達成這項研究的基礎(chǔ),是SPEED顯微技術(shù)能在超短的時間內(nèi)獲得高精度的空間位置信息,調(diào)控光學(xué)設(shè)置的穩(wěn)定和準(zhǔn)確,以及對各不同分子不同擴散速率下,在確保單分子熒光定位精度的同時,優(yōu)化實驗條件獲取最多的數(shù)據(jù)量,是實驗成功的關(guān)鍵。擁有豐富的超分辨光學(xué)經(jīng)驗,這讓馬炯能夠滿足數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性及穩(wěn)定地產(chǎn)出量。據(jù)此,他將創(chuàng)新領(lǐng)先技術(shù),努力實現(xiàn)分子競爭通過核孔的實驗設(shè)計創(chuàng)新。

未來故事

回國后的馬炯選擇了他的母校復(fù)旦大學(xué)作為科研工作的新起點。這里熟悉的環(huán)境讓他很快就進入到了工作當(dāng)中并規(guī)劃新的征程。

首先,馬炯將繼續(xù)提升SPEED顯微技術(shù)的性能及推廣其應(yīng)用范圍。所有的對稱體系研究中,馬炯的SPEED顯微技術(shù)都可以推廣應(yīng)用。而在快速跟蹤領(lǐng)域中,這項技術(shù)也具有明顯優(yōu)勢。其次,他將繼續(xù)完善超快速的實時單分子三維追蹤。再次,馬炯將提高靜態(tài)單分子熒光定位下的超分辨圖像精度?,F(xiàn)在的主流超分辨顯微鏡是用了一種光開關(guān)蛋白來實現(xiàn),這將會造成單位時間內(nèi)的信號光的損失。馬炯換了其他方式,利用分子運動進特定區(qū)域時將這個分子可能發(fā)出的所有熒光進行收集,從而提高靜態(tài)單分子熒光定位下的超分辨圖像精度。

此外,馬炯還將利用單分子熒光圖像獲取除未知外的其他信息。他認為這部分是相當(dāng)有意思的內(nèi)容。利用這些單分子圖像可以看到,隨著探測時間的加長,隨著分子運動速度越來越快,這個分子的單分子影像所占區(qū)域會越來越大,馬炯可以通過這些分子的大小探測到運動速率的快慢,確定這個區(qū)域的黏滯性有多大,從而找到這個分子所在納米位置的環(huán)境信息。

最后擴展到生物學(xué)的研究領(lǐng)域,比如基因治療方面。現(xiàn)在病毒如何進入到細胞、感染到細胞并最終復(fù)制出來的完整機制還有很多未知之處。如果徹底研究清楚,就能標(biāo)記這個病毒,知道它什么時候進入到什么位置,如何從細胞吞噬體逃出,并且穿過細胞核孔到達細胞核,把基因嵌入其中。馬炯將通過光學(xué)手段解析所有步驟,為治療絕癥提供重要依據(jù)。

采訪中,馬炯并沒有過多涉及家庭,卻在言語中流露出對父母、對妻子的柔情。而科研事業(yè)于他,更是一種信仰與幸福,讓他收獲前所未有的樂趣。作為2015年歸國的青年研究員,馬炯在國內(nèi)的事業(yè)剛剛起步,也必將乘風(fēng)破浪,揚帆遠航。endprint

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