曾穎
【摘 要】本文針對(duì)用于DNA擴(kuò)增的PCR儀其試樣環(huán)境溫度的測(cè)量裝置及測(cè)溫位置進(jìn)行研究,提出使用薄膜鉑電阻對(duì)PCR儀進(jìn)行快速準(zhǔn)確測(cè)溫,并在實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的對(duì)比分析后證明將測(cè)溫敏感點(diǎn)放置在試管的液體中的位置最滿足DNA實(shí)驗(yàn)需要。
【關(guān)鍵詞】PCR儀;溫度;測(cè)溫位置;薄膜鉑電阻
0 引言
PCR技術(shù)是一項(xiàng)在短時(shí)間內(nèi)體外大量擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)[1],PCR儀的工作原理在于為DNA實(shí)驗(yàn)制造不同的溫度環(huán)境,使DNA變性、退火、引物鏈延伸,其實(shí)質(zhì)為一臺(tái)精密溫度控制儀。其溫度的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性、波動(dòng)性直接影響DNA反應(yīng)3個(gè)階段過程中基因片段的擴(kuò)增質(zhì)量。但是目前國(guó)內(nèi)PCR儀器的校準(zhǔn)規(guī)程里并未對(duì)溫度校準(zhǔn)裝置的響應(yīng)速度及溫度測(cè)量位置進(jìn)行詳細(xì)闡述,為此本文針對(duì)PCR儀試樣環(huán)境溫度的測(cè)量裝置及測(cè)溫位置進(jìn)行探討。
1 PCR儀簡(jiǎn)介
1.1 PCR儀簡(jiǎn)介
目前市面上PCR儀的主流方向?yàn)榘雽?dǎo)體式PCR,其內(nèi)部結(jié)構(gòu)示意圖如圖1所示:在快速導(dǎo)熱金屬質(zhì)地的基座上設(shè)有多個(gè)試管孔,并由下方的半導(dǎo)體片進(jìn)行加熱制冷控溫。
圖1 半導(dǎo)體式PCR儀內(nèi)部結(jié)構(gòu)示意圖
1.2 PCR儀校準(zhǔn)用溫度傳感器
PCR儀使用的基座按孔數(shù)分有48孔、60孔、96孔,按孔的大小也分為0.2ml、0.5ml等。根據(jù)PCR儀的特殊結(jié)構(gòu),若采用一般鉑電阻的形狀及大小無法與基座完全接觸,且粗大的鉑電阻數(shù)據(jù)線使得在校準(zhǔn)過程中帶閉蓋結(jié)構(gòu)的PCR儀頂蓋無法閉合,加強(qiáng)了空氣對(duì)流,破壞了基座溫度場(chǎng)分布,影響校準(zhǔn)結(jié)果。
目前市面上主流的國(guó)外PCR溫度檢測(cè)裝置其測(cè)量傳感器使用固定測(cè)點(diǎn)間距及探頭大小的檢測(cè)系統(tǒng),其普適性低,不適用于檢測(cè)對(duì)象具有多樣性的計(jì)量檢測(cè)機(jī)構(gòu)。此外,以DRIFTCON的PCR實(shí)時(shí)檢測(cè)系統(tǒng)為例,其溫度探頭(如圖2所示)雖能和基座試管孔完美貼合,但尺寸較大直接影響其熱容值,導(dǎo)致熱響應(yīng)速度減慢,不能滿足快速檢測(cè)的需求,在校準(zhǔn)PCR儀升降溫速率時(shí)偏差較大。
(1) (2)
圖2 BIOplastics的溫度傳感器圖
2 溫度測(cè)量
2.1 標(biāo)準(zhǔn)器裝置
1)溫度采集
利用本院自主研發(fā)的Vtest-1101溫濕度試驗(yàn)設(shè)備自動(dòng)檢定系統(tǒng)的18CH溫度數(shù)據(jù)采集器(如圖3所示),對(duì)溫度數(shù)據(jù)進(jìn)行自動(dòng)快速采集。
圖3 溫度數(shù)據(jù)采集器圖
2)薄膜鉑電阻
為了滿足溫度測(cè)量快速響應(yīng)且準(zhǔn)確可靠的測(cè)量需求,本文采用厚1mm、熱觸點(diǎn)面積1mm2的薄膜鉑電阻Pt100,其具有熱容小、熱反應(yīng)時(shí)間短、在(-40~200)℃范圍內(nèi)線性準(zhǔn)確測(cè)溫的特點(diǎn),并能較好伸入PCR儀試管孔中,而不影響其基座的溫度場(chǎng)。為了防止薄膜鉑電阻遇水靜電等一系列干擾,將其表面及引線涂上有較高的機(jī)械強(qiáng)度且防水耐油的漆包線漆,進(jìn)而提高和穩(wěn)定鉑電阻引線的性能,其實(shí)物圖如圖4所示。
圖4 薄膜鉑電阻實(shí)物圖
2.2 溫度測(cè)量方法
1)溫度測(cè)量方法1
為了讓薄膜鉑電阻更好的與試管孔壁面貼合,在試管孔內(nèi)壁涂上一層具有高導(dǎo)熱率的導(dǎo)熱硅脂,并將薄膜鉑電阻深入試管與基座之間,利用試管往下的力使薄膜鉑電阻熱觸點(diǎn)面貼緊孔壁,最后連接采集器及上位機(jī)進(jìn)行孔壁溫度的測(cè)量。薄膜鉑電阻測(cè)點(diǎn)放置位置如圖5所示。
圖5 方法1鉑電阻測(cè)溫位置示意圖
2)溫度測(cè)量方法2
為了防止液體在試驗(yàn)溫度內(nèi)沸騰時(shí)產(chǎn)生氣泡,并附著溫度傳感器進(jìn)而帶來測(cè)量誤差。在試管內(nèi)加入2/3試管容積高傳熱效率、高沸點(diǎn)的導(dǎo)熱油,然后將薄膜鉑電阻伸入1/2液體深度,最后將其連接采集器及上位機(jī)進(jìn)行試管中液體溫度的測(cè)量。薄膜鉑電阻測(cè)點(diǎn)放置位置如圖6所示。
圖6 方法2鉑電阻測(cè)溫位置示意圖
PCR儀的溫度偏差、均勻度、波動(dòng)度分別表征試管孔的實(shí)際溫度的差值、各試管實(shí)驗(yàn)結(jié)果的一致性及實(shí)驗(yàn)成功率。為了對(duì)比兩種測(cè)量方法,分別對(duì)Applied Biosysterms 9700型號(hào)的一臺(tái)PCR儀進(jìn)行試驗(yàn)測(cè)試,設(shè)定儀器溫度95.0℃恒溫。并取圖7中5個(gè)位置的試管孔進(jìn)行測(cè)溫,待溫度示值穩(wěn)定后進(jìn)行溫度數(shù)值采樣,并對(duì)其溫度偏差、均勻度、波動(dòng)度進(jìn)行分析,兩種測(cè)量方法試驗(yàn)數(shù)據(jù)如下:
圖7 96試管孔測(cè)溫點(diǎn)
a)溫度測(cè)量方法1(表1):(℃)
表1
從以上數(shù)據(jù)分析可以看出基板整個(gè)空間自左而右側(cè)溫度呈現(xiàn)由高到低的梯度,溫度偏差△Td:+0.20℃,溫度均勻度△Tu:0.47℃,溫度波動(dòng)度△Tv:±0.15℃。
b)溫度測(cè)量方法2(表2):(℃)
表2
同樣從以上數(shù)據(jù)分析可以看出,溫度偏差△Td:-0.76℃,溫度均勻度△Tu:0.54℃,溫度波動(dòng)度△Tv:±0.02℃。
對(duì)比兩種PCR儀測(cè)溫的方法,兩種方法所測(cè)結(jié)果中方法2的溫度偏差較小,并略小于顯示溫度;方法2的波動(dòng)度也小于方法1,均勻性兩種方法相差不多。方法1實(shí)測(cè)溫度實(shí)質(zhì)為儀器基板孔壁溫度,而方法2實(shí)測(cè)溫度為試管內(nèi)DNA實(shí)驗(yàn)時(shí)的液體環(huán)境溫度。在進(jìn)行PCR試驗(yàn)時(shí),基座溫度通過試管壁傳遞到其試管內(nèi)液體,在穩(wěn)定散熱情況下自基座底部到試管形成一定梯度的溫度場(chǎng),因此方法1所測(cè)溫度略高于方法2所測(cè)溫度,且方法2的所測(cè)位置的溫度波動(dòng)更小,其所測(cè)位置實(shí)際溫度的測(cè)量也更滿足DNA實(shí)驗(yàn)需要。
3 總結(jié)
根據(jù)PCR溫度計(jì)量檢測(cè)準(zhǔn)確性和升溫速率檢測(cè)快速響應(yīng)的需要,本文提出使用薄膜鉑電阻對(duì)PCR進(jìn)行溫度檢測(cè);并通過提出兩種測(cè)溫傳感器放置的位置進(jìn)行溫度檢測(cè)試驗(yàn),通過試驗(yàn)數(shù)據(jù)分析比較其溫度偏差、波動(dòng)度、均勻度說明將測(cè)溫敏感點(diǎn)放置在試管的液體中的位置最滿足DNA實(shí)驗(yàn)需要。
【參考文獻(xiàn)】
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[責(zé)任編輯:楊玉潔]