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茶樹根際促生菌的篩選與促生特性的研究

2016-05-26 06:59:23韓麗珍鄧兆輝朱春艷梁彩嬌韋德萍
關(guān)鍵詞:茶樹

韓麗珍,鄧兆輝,朱春艷,梁彩嬌,韋德萍

(貴州大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,貴州 貴陽 550025)

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茶樹根際促生菌的篩選與促生特性的研究

韓麗珍*,鄧兆輝,朱春艷,梁彩嬌,韋德萍

(貴州大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,貴州 貴陽 550025)

摘要:從貴州地區(qū)的茶樹根際土壤中分離篩選出6株根際促生菌,經(jīng)16S rRNA基因分子鑒定,它們分屬于假單胞菌屬(Pseudomonas sp.)、芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)、束村氏菌屬(Tsukamurella sp.)、伯克霍爾德氏菌屬(Burkholderia sp.)和根瘤菌屬(Rhizobium sp.)中。促生特性的研究結(jié)果顯示,溶磷解鉀性能最優(yōu)的菌株為GD-3菌株,固氮效能最高的KKS-6-N1菌株,此外6個菌株具有溶磷解鉀固氮、產(chǎn)IAA、產(chǎn)NH3、產(chǎn)HCN能力、可分泌嗜鐵素及具有ACC脫氨酶活性等多種促生性能,可作為研制微生物肥料的優(yōu)良菌株資源。

關(guān)鍵詞:茶樹;根際促生菌;促生特性

植物根際促生菌(plant growth-promoting rhizobacteria, PGPR)是指定植于植物根部系統(tǒng)并能促進(jìn)植物生長的細(xì)菌。其促生機(jī)制主要包括:(1)細(xì)菌通過固氮酶的作用固定空氣中的氮氣,為植物提供氮素營養(yǎng);(2)分泌有機(jī)酸,加速土壤中無效磷及難溶性鉀的釋放,從而增加土壤中游離P、K離子的含量,為植物提供營養(yǎng);(3)分泌植物激素,如吲哚乙酸(IAA)、細(xì)胞分裂素、赤霉素等,以促進(jìn)植物生長發(fā)育;(4)分泌嗜鐵素,不僅可與植物根際病原菌爭奪有限的鐵,抑制病原微生物生長繁殖而起生物防治作用;而且能與土壤中的Fe3+螯合形成復(fù)合體后被植物吸收,改善植物的鐵營養(yǎng)[1-2]; (5)具有ACC(1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸)脫氨酶活性,通過將植物乙烯的合成前體ACC分解成丁酮酸和氨來降低乙烯水平,從而增加植物抗逆能力[3-5];(6)通過競爭生態(tài)位,產(chǎn)生抗生素、氫氰酸(HCN)等物質(zhì),對植物病原菌具有抑制作用;(7)誘導(dǎo)系統(tǒng)抗性(ISR)等[6]。多年來,研究者在水稻、甘蔗、玉米、小麥、高粱等作物和一些牧草上分離獲得很多PGPR菌株,對其固氮、溶磷、產(chǎn)生植物激素和抑病機(jī)理、菌肥研制等方面進(jìn)行了有益的探索[7],而在茶樹等經(jīng)濟(jì)林木中的研究鮮有報道[8]。

貴州作為茶葉大省之一,迄止2011年茶種植面積為24.5萬hm2,位居全國第二位[9]。到2014年底,全省茶園面積已達(dá)44.1萬hm2,連續(xù)兩年排名全國第一[10]。近年來,貴州茶園氮磷流失及土壤酸化、土壤普遍缺磷缺鉀狀況明顯,有效磷和有效鉀的含量處于缺乏或很缺乏的均占到40%以上[11-15]。土壤中氮磷鉀含量對茶樹生長及茶葉的產(chǎn)量品質(zhì)均有較大影響。因此,本文擬從貴州茶園根際土壤中分離、篩選出具有促生性能的菌株進(jìn)行研究,研究結(jié)果不僅可豐富植物促生菌資源,且可為茶樹微生物菌肥的研制及提高茶葉品質(zhì)產(chǎn)量奠定基礎(chǔ)。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1土樣采集

3份土壤樣本來源于貴州省遵義市寬闊水自然保護(hù)區(qū)茶園(107°9′E,28°13′N),分別標(biāo)為KKS-6、KKS-7及HSD6,該茶園種植茶樹約20-30年茶齡;1份土壤樣本采集自貴州大學(xué)茶園(106°32′E,26°17′N),標(biāo)為GD,茶樹茶齡約10年。分別取茶樹根際土壤裝入標(biāo)本袋中、置于4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.1.2培養(yǎng)基

解鉀菌篩選及活性測定選用亞歷山大硅酸鹽培養(yǎng)基[16],固氮菌篩選及活性測定用Ashby無氮培養(yǎng)基[17],解磷菌篩選培養(yǎng)基參考趙小蓉等的方法配制[18],CAS培養(yǎng)基按照榮良燕等的方法配制[19],DF培養(yǎng)基和ADF培養(yǎng)基參考陳倩等的方法配制[20]。

1.1.3主要試劑及儀器

化學(xué)藥品均為國產(chǎn)分析純,Premix rTaq購自TaKaRa,細(xì)菌DNA提取試劑盒購自O(shè)mega,16S rRNA基因擴(kuò)增引物由TaKaRa合成,主要儀器為THZ-82A氣浴恒溫振蕩器(江蘇普天,中國)、GelDoc XRS+凝膠成像儀(Bio-Rad,USA)、S1000快速梯度PCR儀(Bio-Rad,USA)、759紫外分光光度計(上海菁華,中國)等。

1.2方法

1.2.1菌株的分離與篩選

準(zhǔn)確稱取土壤10.0 g,加入帶玻璃珠并裝有90 mL無菌水的250 mL三角瓶中振蕩10 min后靜置,取上清液1 mL依次通過10倍倍比稀釋、分別獲得終濃度為10-2、10-3、10-4、10-5、10-6的土壤懸液。利用涂布法將以上各濃度的土壤懸液分別涂布于解鉀固體培養(yǎng)基、解磷固體培養(yǎng)基和Ashby無氮固體培養(yǎng)基上,挑出有透明圈的菌落及具不同菌落形態(tài)的菌落進(jìn)行純化并保存。將純化的初篩菌株接種到相應(yīng)的篩選培養(yǎng)基上培養(yǎng)后,分別測定水解圈(D)和菌落直徑(d)。

1.2.2菌株的16S rRNA基因擴(kuò)增及分子鑒定

采用細(xì)菌DNA抽提試劑盒提取菌株總DNA。以細(xì)菌總DNA為模板,利用原核生物16S rRNA基因通用引物27f(5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’)和1492r(5’-TACGGYTACCTTGTTACGACTT-3’)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。25 μL反應(yīng)體系包括DNA模板1 μL,PCR Premix rTaq 12.5 μL,上下游引物各1 μL,ddH2O 9.5 μL。擴(kuò)增程序為:94℃ 5 min預(yù)變性;94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸90 s,共30個循環(huán);72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送上海英駿生物工程有限公司測序。所得的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫和EzTaxon數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST分析對比,選擇同源性較高模式菌株的16S rRNA基因序列,采用MEGA6.0軟件,用鄰接法(Neighbor-Joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹、置信度經(jīng)Bootstrap法1000次重復(fù)檢驗。

1.2.3菌株促生特性的研究

1.2.3.1解鉀活性的測定

將待測菌液按5%接種量接入50 mL解鉀液體培養(yǎng)基中、以加入等量無菌水的解鉀培養(yǎng)液為對照組,30℃ 100 rpm搖床振蕩培養(yǎng)5 d,設(shè)置3個重復(fù)。培養(yǎng)液的處理采用過氧化氫灰化法,用原子吸收法測定對照組及處理組中的水溶性鉀含量[21]。

1.2.3.2解磷活性的測定

將待測菌株的活化菌懸液1 mL接種入解磷液體培養(yǎng)基中,對照接入1mL無菌解磷培養(yǎng)液,置于28℃ 150 rpm搖床振蕩培養(yǎng)7 d;培養(yǎng)液經(jīng)10000 rpm離心10 min,取上清液用鉬銻抗分光光度法測定水溶性磷含量[22]。

1.2.3.3固氮效能的測定

在含1%葡萄糖的Ashby無氮培養(yǎng)基中加入待測菌懸液(OD6001.0)1 mL,以加入1 mL無菌水的為對照,置于30℃ 150 rpm搖床振蕩培養(yǎng)8 d后取出測氮定糖,設(shè)置3個重復(fù);定糖采用蒽酮光電比色法,定氮采用柰氏比色法,固氮效能的測定參考成澤艷的方法[23]。

1.2.3.4產(chǎn)IAA能力的測定

以Salkowski法測定產(chǎn)吲哚乙酸的能力。將待測菌株接種于含有100 mg/L色氧酸(過濾除菌)的LB液體培養(yǎng)基中, 30℃ 180 rpm搖床培養(yǎng)1 d。取50 μL菌懸液滴于白色陶瓷板上,加入等量 Salkowski比色液;以加入50 mg/L吲哚乙酸的比色液作為陽性對照。白色陶瓷板于室溫下避光放置30 min后觀察,顏色變紅者表明菌株可分泌IAA[24]。

1.2.3.5產(chǎn)NH3能力的測定

將菌株接到含10 mL蛋白胨水(10 g/L)試管中、28°C培養(yǎng)3 d后,每管加入0.5 mL Nessler's試劑,顏色由褐色轉(zhuǎn)為黃色則表明有NH3產(chǎn)生[25]。

1.2.3.6產(chǎn)HCN能力的測定

在NB培養(yǎng)基中添加4.4 g/L甘氨酸,將細(xì)菌劃線接種于該平板上,另將浸過2%碳酸鈉、0.5% 2,4,6-三硝基苯酚的Whatman 1號濾紙置于培養(yǎng)基上,28°C培養(yǎng)4 d,濾紙顏色由橘黃色轉(zhuǎn)為紅色則表明有HCN產(chǎn)生[25]。

1.2.3.7產(chǎn)嗜鐵素能力的定性測定

利用CAS法測定產(chǎn)嗜鐵素能力。將CAS培養(yǎng)基劃分成若干等分,接種待測菌株(10 μL 106CFU/mL),28°C培養(yǎng)2 - 3 d,如菌株周邊有黃綠色暈圈產(chǎn)生,即表明該菌株具產(chǎn)嗜鐵素能力[19,26]。

1.2.3.8ACC脫氨酶活性的定性測定

將待測菌株接入5 mL無氮液體培養(yǎng)基中,30℃ 200 rpm 振蕩培養(yǎng)1 d;吸取0.1 mL培養(yǎng)液接種至5 mL DF培養(yǎng)基振蕩培養(yǎng)1 d;按2%接種量轉(zhuǎn)接入5 mL ADF培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)2 d。能以ACC為唯一氮源生長的菌株為 ACC 脫氨酶陽性菌株[17]。

1.3數(shù)據(jù)處理

試驗數(shù)據(jù)處理采用Excel 2010 和SPSS 軟件,多重比較采用LSD法。

2結(jié)果與分析

2.1菌株的分離篩選

4份茶園根際土樣經(jīng)選擇性培養(yǎng)基篩選后,在Ashby無氮培養(yǎng)基上獲得菌落形態(tài)明顯不同的2個菌株KKS-6-N1和KKS-7-N7。在解鉀培養(yǎng)基上獲得12個菌株(表1),水解圈直徑/菌落直徑之比值2.0的為菌株GD-3和GD-12。在解磷培養(yǎng)基上獲得7個菌株(表2),水解圈直徑/菌落直徑比值接近2.0的有KKS-6-P9和KKS-7-P10。將初篩獲得的6個菌株分別置于其余兩種選擇培養(yǎng)基上,發(fā)現(xiàn)菌株GD-3及KKS-7-N7還可以在解磷培養(yǎng)基上生長,且D/d比值為2.86和4.57;菌株GD-12、KKS-6-P9和KKS-7-P10還可在無氮培養(yǎng)基上生長。因而,確定GD-3、GD-12、KKS-6-N1、KKS-7-N7、KKS-6-P9和KKS-7-P10共6個菌株進(jìn)行促生特性的研究。

表1 茶樹根際土壤解鉀菌的初篩特性

表2 茶樹根際土壤解磷菌的初篩特性

2.2菌株的分子鑒定

根據(jù)擴(kuò)增的1.5 Kb片段長度的菌株16S rRNA基因核苷酸序列,與相近屬種模式菌株的16S rRNA基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1),可初步鑒定KKS-6-N1為根瘤菌屬(Rhizobiumsp.),菌株KKS-7-N7及GD-3為假單胞菌屬(Pseudomonassp.),GD-12為芽孢桿菌屬(Bacillussp.),KKS-6-P9為束村氏屬(Tsukamurellasp.),KKS-7-P10為伯克霍爾德氏菌屬(Burkholderiasp.)。

圖1 茶樹根際促生菌的16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 1 Phylogenetic tree based on the 16S rRNA sequences

2.3菌株促生特性的研究

2.3.1菌株的解鉀解磷活性及固氮效能

待測的6株菌株中,僅有GD-3和GD-12具有解鉀性能,接種GD-3與GD-12菌株的處理組中,水溶性鉀含量分別為3.970.52 mg/L、3.900.10 mg/L,而對照組僅為1.270.22 mg/L, 處理組水溶性鉀含量超過對照組的3倍以上。

除GD-12和KKS-6-N1菌株不能在解磷培養(yǎng)基上生長外,將其余4個菌株置于解磷液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),測定發(fā)酵液中的有效磷含量(表3),結(jié)果表明,處理組的水溶性磷含量均顯著高于對照組,且4個菌株之間并無顯著差異。

以往研究多采用乙炔還原法測定固氮酶活性來間接反映固氮菌的固氮作用,但其受環(huán)境因子、反應(yīng)容器體積及溫育時間、采樣方法、儀器及操作誤差等因素的影響[27]。固氮效能是指固氮菌每消耗1 g糖從空氣中固定氮素的毫克數(shù)[16]。本研究對6株待測固氮菌株進(jìn)行了固氮效能測定(圖2),結(jié)果顯示KKS-6-N1固氮效能最高,高達(dá)12.51±0.34毫克氮/克糖;其余4株菌固氮效能均接近或高于5毫克氮/克糖。

圖2 6株茶樹根際促生菌的固氮效能

菌株GD-3KKS-7-N7KKS-6-P9KKS-7-P10對照組有效磷含量(mg/L)99.67±13.15b97.47±4.21b79.67±5.99b84.88±12.84b17.89±9.15a

注:表中數(shù)據(jù)為平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)誤。小寫拉丁字母表示顯著水平α=0.05時多重比較(LSD法)結(jié)果。

2.3.2其他促生性能的定性測定

篩選獲得的6個菌株進(jìn)行了產(chǎn)IAA、產(chǎn)HCN、產(chǎn)NH3及分泌嗜鐵素的能力,是否具有ACC脫氨酶活性等涉及促生機(jī)理的定性研究。結(jié)果表明,僅KKS-7-N7具有產(chǎn)IAA能力;GD-12、KKS-6-P9和KKS-6-N1具有產(chǎn)HCN能力,而菌株KKS-7-N7由于培養(yǎng)過程中產(chǎn)生綠色色素而無法準(zhǔn)確判定。6株菌都具有產(chǎn)NH3的能力。除了GD-12外,GD-3、KKS-6-N1、KKS-7-N7、KKS-6-P9和KKS-7-P10等5個菌株具有分泌嗜鐵素的能力。除了KKS-6-N1和KKS-7-N7菌株外,其余4個菌株均具有ACC脫氨酶活性。

3結(jié)論與討論

本文從4份貴州地區(qū)茶園根際土壤中分離篩選到6個菌株,其中除菌株KKS-6-P9屬于放線菌門(Actinobacteria)、束村氏菌科(Tsukamurellaceae)、束村氏菌屬外,其余5個菌株均為細(xì)菌菌株,它們分屬于假單胞菌屬、芽孢桿菌屬、伯克霍爾德氏菌屬和根瘤菌屬中,體現(xiàn)出根際促生菌的多樣性。

孫建光等[17]報道,類芽孢桿菌和芽孢桿菌為小麥、水稻、玉米、白菜及芹菜等作物根際及土壤中的固氮菌優(yōu)勢種群,部分菌株具有ACC脫氨酶活性,少數(shù)菌株具有抗病潛能。除GD-3外,本文篩選到的5個菌株均具有一定的固氮能力,且大多有ACC脫氨酶活性和產(chǎn)NH3能力;固氮效能最高的是根瘤菌屬KKS-6-N1菌株。已有研究表明,根瘤菌也可不形成根瘤而作為非豆科植物根際有益菌,促進(jìn)植物生長[28]。

近年來,國內(nèi)外學(xué)者分離的解鉀菌呈現(xiàn)多樣性,包括芽孢桿菌屬[29]、固氮菌屬(Azotobactersp.)、微桿菌屬(Microbacteriumsp.)、中華根瘤菌屬(Sinorhizobiumsp.)、根瘤菌屬(Rhizobiumsp.)、慢生根瘤菌屬(Mesorhizobiumsp.)、屈撓桿菌屬(Flexibactersp.)和假單胞菌屬等[30]。羅華元等人[31]篩選獲得34株具有解鉀能力的菌株,發(fā)酵液的水溶性鉀含量在0.4-10.6 mg/L之間。本研究中,解鉀菌GD-3與GD-12分屬于假單胞菌屬和芽孢桿菌屬,培養(yǎng)液中的水溶性鉀含量約4 mg/L,居于中等水平;2個菌株還具有ACC脫氨酶活性及其他促生潛能。

目前已報道的解磷菌包括細(xì)菌、真菌和放線菌,其中細(xì)菌最多,約20個屬,真菌約5個屬,放線菌中以鏈霉菌(Streptomycesspp.)居多[32-33]。本研究篩選到一株解磷菌株KKS-6-P9,屬于放線菌門、束村氏菌屬,該菌還具有產(chǎn)HCN、產(chǎn)NH3、產(chǎn)嗜鐵素及具ACC脫氨酶活性,這是首次發(fā)現(xiàn)該屬的菌株具有促生潛能。楊艷華等人[34]從茶樹根際篩選獲得23株解無機(jī)磷細(xì)菌,集中在Burkholderiasp.,Paenibacilluspolymyxa,Enterobactersp.和Bacillussp.,最大的解磷活性高達(dá)100 μg/mL。本文篩選的6株茶樹根際細(xì)菌中,有4株具有解磷特性,它們分屬于假單胞菌屬、伯克霍爾德氏菌屬和束村氏菌屬,這也與Bruto等[35]報道的大多數(shù)根際促生菌具解磷特性相符。

綜上所述,本研究從茶樹根際篩選到5株細(xì)菌菌株及1株放線菌,溶磷解鉀性能最優(yōu)的菌株為GD-3(Pseudomonassp.),固氮性能最優(yōu)的菌株是KKS-6-N1(Rhizobiumsp.),具有解鉀固氮性能的菌株為GD-12(Bacillussp.),具有解磷固氮性能的菌株為KKS-6-P9(Tsukamurellasp.)、KKS-7-P10(Burkholderiasp.)和KKS-7-N7(Pseudomonassp.);且多個菌株具有產(chǎn)NH3、產(chǎn)HCN、產(chǎn)IAA、產(chǎn)嗜鐵素及ACC脫氨酶的能力。以上篩選菌株均有多種促生特性,應(yīng)該具有一定的田間應(yīng)用潛力,促生機(jī)理的進(jìn)一步深入研究將為微生物菌肥的研制提供參考依據(jù)。

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Identification and Characterization of Plant Growth-promoting Rhizobacteria Isolated from Rhizosphere soils of Tea Trees

HANLi-zhen*,DENGZhao-hui,ZHUChun-yan,LIANGCai-jiao,WEIDe-ping

(CollegeofLifeSciences,GuizhouUniversity,Guiyang,Guizhou550025,China)

Abstract:Based on sequence conservation of 16S rRNA, six strains of plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR), which isolated from rhizosphere soils of Guizhou tea trees, were identified as Pseudomonas sp., Bacillus sp., Tsukamurella sp., Burkholderia sp. and Rhizobium sp. GD-3 showed the most efficiency in phosphatesolubilization and potassium decomposition, and KKS-6-N1 had the most efficiency in nitrogen fixing. In addition, other growth-promoting characteristics, e.g. nitrogen fixation,IAA, NH3, HCNproduction,siderophore secretion and 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC) deaminase activity, were also investigated in these six strains, justifying their potentials for development ofbiological fertilizer as microbial resources in the future.

Keywords:Tea trees; Plant growth-promoting rhizobacteria; Growth-promoting characteristics

文章編號:1008-0457(2016)01-0051-06國際DOI編碼:15958/j.cnki.sdnyswxb.2016.01.011

中圖分類號:Q938.1

文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

*通訊作者:韓麗珍,女,博士,教授,碩士生導(dǎo)師,主要研究方向:環(huán)境微生物及微生物生態(tài)學(xué);E-mail:hanlizhen11@163.com。

基金項目:貴州省大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計劃項目“貴州省茶樹根際促生菌的促生機(jī)理研究”(201510657041)。

收稿日期:2016-1-30;修回日期:2015-2-2

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