田翠霞 魏強 李憲彬
摘要:為探究擬南芥和水稻BRI1基因差異表達的原因,本研究克隆了OsBRI1啟動子,并將其構建在植物表達載體pCambia2300-GUS上,為進一步轉化擬南芥或其他植物并研究其表達模式奠定了基礎。
關鍵詞:水稻;油菜素內酯;OsBRI1
中圖分類號:S511+Q78文獻標識號:A文章編號:1001-4942(2016)08-0001-05
AbstractIn order to explore the reasons for expression difference of BRI1 in rice and Arabidopsis thaliana, we cloned the OsBRI1 promoter and connected it on the plant expression vector pCambia2300-GUS. These results laid foundations for further transformation into Arabidopsis or other plants and study on its expression patterns.
KeywordsRice; Brassinosteroids; OsBRI1
植物激素(plant hormone)是植物體內產(chǎn)生的一類在很低濃度時即可對植物的生長發(fā)育、代謝、環(huán)境應答等生理過程產(chǎn)生重要調控作用的代謝產(chǎn)物,在植物生長過程中扮演著極其重要的角色。植物中最早發(fā)現(xiàn)的一類甾醇類激素是蕓苔甾內酯(brassinolide, BL)[1]。到目前為止,已發(fā)現(xiàn)60多種具BL結構的類似物,廣泛存在于植物的不同組織和器官中,由于它們的功能與BL相似,統(tǒng)稱為油菜素甾醇類物質(brassinosteroid, BR)[2-4],BL是油菜素甾醇類成員中生物活性最強的一種分子。隨著BR結構鑒定和人工合成BR的出現(xiàn),科學家們進行了大量的生理學研究,不僅確定了BR在多種植物中的促生長作用,還揭示了BR的多種其它功能,包括種子萌發(fā)、氣孔形成、維管分化、株型、開花、雄性可育性和抑制衰老等[5]。外施具生物活性的BR能增強植物對各種脅迫的抗性,包括生物和非生物脅迫[6-8]。自20世紀80年代起,BR已被廣泛用于增加農(nóng)作物和蔬菜的產(chǎn)量。在水稻中,BR影響許多農(nóng)藝性狀如糧食產(chǎn)量、株高、葉角、籽粒大小和分蘗數(shù)等[9,10]。
BR的感知和信號傳遞過程需要眾多基因參與,首先通過一個定位于細胞膜上的富含亮氨酸重復序列(leucine-rich repeats, LRRs)的跨膜類受體蛋白激酶BRI1 (brassinosteroid insensitive 1) 感知傳遞信號[11,12],然后才能激活一系列的信號級聯(lián)傳遞[13,14]。利用AtBRI1啟動子在野生型擬南芥中驅動GUS表達,顯示AtBRI1在根、莖、葉柄及葉中廣泛表達[15]。采用RT-PCR技術,檢測水稻各組織器官中OsBRI1的表達模式,其主要在芽中表達,在根部表達不明顯[16]。本文構建了OsBRI1啟動子(pOsBRI1)的表達載體,為利用pOsBRI1在野生型擬南芥中驅動GUS報告基因的表達,在同一水平觀察水稻和擬南芥BRI1的表達位置及表達量的差異,以及揭示OsBRI1基因的表達特征奠定基礎。
1材料與方法
1.1材料與試劑
1.1.1試驗材料水稻日本晴基因組DNA。
1.1.2菌株和載體大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞、pCambia2300-GUS載體質粒由陜西師范大學生命科學學院進化發(fā)育實驗室保存。克隆載體pMD19-Simple購自寶生物工程(大連)有限公司。
1.1.3酶、試劑盒及其他耗材LA Taq酶、Sal Ⅰ、BamHⅠ、T4 DNA Ligase、6×DNA Loading Buffer、DNA Marker、dNTP Mixture 購自寶生物工程(大連)有限公司;KOD FX(附有dNTPs,KOD Buffer) 購自KOD公司;NheⅠ、RNA溶解酶溶液購于NEB公司;EasyPure Quick Gel Extraction Kit、EasyPure Plasmid MiniPrep Kit購自Omiga;其他藥品試劑均為進口或國產(chǎn)分析純。
1.1.4引物和測序PCR引物合成及DNA測序工作由南京金斯瑞生物工程股份有限公司完成。
1.2試驗方法
1.2.1引物設計根據(jù)TAIR (The Arabidopsis Information Resource)網(wǎng)站上AtBRI1的基因序列,在網(wǎng)站Phytozm中查找水稻日本晴BRI1基因,定義起始密碼子ATG上游2 000 bp為啟動子序列。根據(jù)表達載體pCambia2300-GUS插入位點的酶切位點設計PCR引物,pOsBRI1-F: 5′-GCGTCGACCCCAATGCATGGATAGTTTAGGTTG3′ (下劃線為限制性內切酶SalⅠ的酶切位點),pOsBRI1-R: 5′-CGGGATCCGAAGTGATGAGGAGGAGATGGAGAGAG-3′ (下劃線為限制性內切酶BamHⅠ的酶切位點)。
1.2.2啟動子克隆以水稻日本晴基因組DNA為模板,用設計的引物進行PCR擴增。PCR反應體系50 μL:2×PCR Buffer for KOD FX 25 μL,2 mmol/L dNTPs 10 μL,10 pmol/μL上下游引物各1.5 μL,Template DNA 1 μL,1.0 U/μL KOD FX 1 μL,最后加ddH2O將反應體系調至50 μL。PCR反應程序: 95℃預變性5 min;98℃變性15 s, 58℃退火30 s, 68℃延伸2 min 20 s,循環(huán)25次;68℃延伸10 min,16℃恒溫保存。PCR產(chǎn)物經(jīng)0.8%的瓊脂糖凝膠電泳分離,用凝膠成像系統(tǒng)檢測并記錄結果。將PCR回收產(chǎn)物加A,純化,與載體pMD19-Simple連接,轉化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,挑選陽性克隆抽提質粒進行酶切檢測,將檢測的陽性質粒送去測序。
1.2.3表達載體構建將測序正確的質粒及pCambia2300-GUS載體質粒進行SalⅠ、BamHⅠ雙酶切。酶切體系為:pOsBRI1質粒5 μL,SalⅠ、BamHⅠ各0.5 μL,1.5×T Buffer 2 μL加ddH2O平衡反應體系終體積到20 μL;同時在另一小EP管中加入pCambia2300-GUS載體質粒5 μL,SalⅠ、BamHⅠ各0.5 μL,1.5×T Buffer 2 μL加ddH2O平衡反應體系終體積到20 μL。將以上兩個酶切體系同時置于37℃保溫箱中反應3 h。酶切結束后用2%的瓊脂糖凝膠電泳純化反應產(chǎn)物,并回收目的片段及載體片段。用T4連接酶將目的片段連接到pCambia2300-GUS載體上。連接體系10 μL:pCambia2300-GUS載體1.5 μL、目的片段7 μL、T4 DNA連接酶0.5 μL、10×T4 DNA ligase Buffer 1 μL,16℃反應12 h。載體構建示意圖見圖1。將連接產(chǎn)物轉入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中,挑選陽性抗性菌落進行PCR檢測,將陽性菌落擴大培養(yǎng),提質粒,進行雙酶切再檢測。
2結果與分析
2.1OsBRI1啟動子的克隆
以水稻日本晴基因組DNA為模板,用pOsBRI1-F和pOsBRI1-R為引物,進行PCR擴增。電泳檢測結果(圖2)顯示,擴增出2 000 bp左右的條帶,與預期目的片段大小相符。
將回收的PCR產(chǎn)物加尾純化后連接到pMD19-Simple 載體上,轉化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,挑選白色單菌落,使用菌落PCR方法進行初步篩選,將菌落PCR檢測得到的陽性菌抽提質粒,進行雙酶切(SalⅠ和BamHⅠ、NheⅠ和BamHⅠ)及單酶切(NheⅠ)檢測,由圖3可知,酶切片段與預期相符,說明目的片段已連接到載體上。將檢測陽性的質粒進行測序,測序結果與Phytozm網(wǎng)站提供的水稻日本晴序列對比結果見圖4,說明基因未發(fā)生突變。
2.2表達載體構建
將OsBRI1啟動子經(jīng)酶切連接到pCambiaM:DNA Marker;1:SalⅠ與BamHⅠ雙酶切片段;2:NheⅠ單酶切片段;3:NheⅠ和BamHⅠ雙酶切片段;SalⅠ與BamHⅠ雙酶切片段分別長2 065、2 692 bp;NheⅠ單酶切片段長4 757 bp;NheⅠ和BamHⅠ雙酶切片段分別長1 224、3 533 bp。
2300-GUS表達載體上,轉化大腸桿菌DH5α,對陽性菌抽提質粒進行雙酶切(SalⅠ和BamHⅠ)鑒定(圖5),結果顯示pOsBRI1成功連接到pCambia2300-GUS表達載體上。
3討論與結論
BR是一種廣泛存在于植物中的類固醇激素,通過位于細胞膜上的跨膜類受體蛋白激酶BRI1感知和傳遞信號。已有的研究表明,擬南芥BRI1在整個植株內廣泛表達,但水稻BRI1在根部表達不明顯。BRI1在水稻和擬南芥中的表達差異是基因本身造成的還是由于啟動子區(qū)的差異所致,為了探究其原因,我們對十字花科和禾本科BRI1基因序列進行比對,發(fā)現(xiàn)BRI1的編碼序列保守,但其啟動子區(qū)存在多樣性,由此推測,啟動子區(qū)的多態(tài)性可能導致BRI1蛋白在水稻和擬南芥中的表達差異。因此,我們根據(jù)已經(jīng)公布的水稻日本晴基因序列,結合表達載體pCambia2300-GUS上的酶切位點,設計引物克隆得到OsBRI1啟動子,并成功連接到pCambia2300-GUS載體上。該研究為進一步研究十字花科與禾本科BRI1表達差異奠定了基礎,以期為深入探究水稻的BR信號轉導機制做出貢獻。
參考文獻:
[1]Thompson M J, Meudt W J, Mandava N B, et al. Synthesis of brassinosteroids and relationship of structure to plant growth-promoting effects[J]. Steroids, 1982, 39(1): 89-105.
[2]Clouse S D. Brassinosteroids[J]. The Arabidopsis Book, 2011,9:123-151.
[3]Zullo M A T, Adam G. Brassinosteroid phytohormones-structure, bioactivity and applications[J]. Braz. J. Plant Physiol., 2002, 14(3): 143-181.
[4]Saleh A, Lumbreras V, Lopez C, et al. Maize DBF1-interactor protein 1 containing an R3H domain is a potential regulator of DBF1 activity in stress responses[J]. Plant J., 2006, 46(5): 747-757.
[5]Clouse S D, Sasse J M. Brassinosteroids: essential regulators of plant growth and development[J]. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 1998, 49:427-451.
[6]Li L, Ye H X, Guo H Q, et al. Arabidopsis IWS1 interacts with transcription factor BES1 and is involved in plant steroid hormone brassinosteroid regulated gene expression[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2010, 107(8): 3918-3923.
[7]Sakamoto T, Morinaka Y, Ohrishi T, et al. Erect leaves caused by brassinosteroid deficiency increase biomass production and grain yield in rice[J]. Nat. Biotechnol., 2006, 24(1): 105-109.
[8]Tong H, Chu C. Brassinosteroid signaling and application in rice[J]. J. Genet. Genomics, 2012, 39(1): 3-9.
[9]Ikekawa N, ZhaoY. Application of 24-epibrassinolide in agriculture[J]. ACS Symp. Ser., 1991, 474: 280-291.
[10]Khripach V, Zhabinskii V, Groot A D. Twenty years of brassinosteroids: steroidal plant hormones warrant better crops for the XXI century[J]. Annals of Botany, 2000, 86(3): 441-447.
[11]Li J, Chory J. A putative leucine-rich repeat receptor kinase involved in brassinosteroid signal transduction[J]. Cell, 1997, 90(5): 929-938.
[12]Hothorn M, Belkhadir Y, Dreux M, et al. Structural basis of steroid hormone perception by the receptor kinase BRI1[J]. Nature, 2011, 474(7352): 467-471.
[13]Clouse S D. Brassinosteroid signal transduction: from receptor kinase activation to transcriptional networks regulating plant development[J]. The Plant Cell, 2011, 23(4): 1219-1230.
[14]Kim T W, Wang Z Y. Brassinosteroid signal transduction from receptor kinases to transcription factors[J]. Annu. Rev. Plant Biol., 2010, 61:681-704.
[15]Cano-Delgado A, Yin Y, Yu C, et al. BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis[J]. Development, 2004, 131(21): 5341-5351.
[16]Nakamura A, Fujioka S, Sunohara H, et al. The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice[J]. Plant Physiol., 2006, 140(2): 580-590.