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鹽溶蛋白電泳和SSR標記鑒定蘇玉20種子純度的比較研究

2016-05-03 20:36王波彭宏羅緒標郭玲
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年3期
關(guān)鍵詞:玉米種子

王波+彭宏+羅緒標+郭玲

摘要: 為建立一套經(jīng)濟、快速、準確鑒定蘇玉20純度的方法,利用鹽溶蛋白電泳和SSR標記同時對該品種進行了純度鑒定,并對2種方法及結(jié)果進行了比較分析。研究發(fā)現(xiàn),同一批次種子,2種方法純度結(jié)果基本一致,但鹽溶蛋白電泳法純度結(jié)果比SSR分析結(jié)果平均高0.78百分點。經(jīng)綜合分析,在實際操作中,建議用SSR標記,利用1~2對引物即可完成蘇玉20 的純度鑒定,其結(jié)果更真實準確。

關(guān)鍵詞: 玉米種子;蘇玉20;鹽溶蛋白;SSR標記;純度鑒定

中圖分類號: S513.037 文獻標志碼: A

文章編號:1002-1302(2016)03-0072-02

鹽溶蛋白電泳一直是種子企業(yè)鑒定玉米種子純度的主要方法之一。該方法簡單、便于操作,對技術(shù)人員和檢驗設(shè)備要求不高,一般的種子企業(yè)檢驗室都可開展該項工作,因此在實際檢驗工作中被廣泛應(yīng)用。包和平等利用玉米鹽溶蛋白PAGE法和田間小區(qū)種植鑒定法對吉林省生產(chǎn)商應(yīng)用的16個雜交玉米種子純度進行測定,試驗表明,同一樣品種子純度田間小區(qū)鑒定普遍高于蛋白PAGE法鑒定純度值,純度越高2種方法所測值偏差越小[1]。郭景倫等將玉米雜交種子純度室內(nèi)鑒定結(jié)果與田間種植鑒定結(jié)果進行了對比研究,結(jié)果表明,2種方法鑒定結(jié)果較吻合,一般相差在5.0%以內(nèi),并且玉米種子純度越高,室內(nèi)鑒定結(jié)果和田間鑒定結(jié)果相差越??;純度越低,2個結(jié)果差異越大[2]。

但鹽溶蛋白PAGE法有一定的局限性,有些品種雙親蛋白質(zhì)水平上的差異較小,難以鑒定;鑒定大批量玉米種子純度時,藥品配制量大且步驟繁瑣,有些試劑容易失效;另外鹽溶蛋白的電泳譜帶分辨率低,有時會出現(xiàn)誤讀或譜帶難以辨別,因此對結(jié)果判定有一定的影響。近幾年來隨著SSR分子標記的發(fā)展和應(yīng)用,表現(xiàn)其獨特的優(yōu)越性。孟慶長等以蘇玉20雜交種及其親本為材料,篩選出在蘇玉20雙親之間多態(tài)性明顯、重復(fù)性較好的4對引物bnlg1306、phi065、bnlg2291和umc1590用于蘇玉20鑒定[3]。此標記特異性好,田間鑒定與利用SSR標記鑒定結(jié)果高度一致。本試驗利用孟慶長等篩選的4對引物,結(jié)合鹽溶蛋白電泳法對蘇玉20種子純度進行鑒定,并比較分析,驗證2種試驗結(jié)果的相關(guān)性,以便建立一套適應(yīng)蘇玉20品種純度準確、快速鑒定的試驗方法。

1 材料與方法

1.1 材料

蘇玉20雜交種及其親本蘇951和蘇651種子均由江蘇明天種業(yè)科技有限公司提供。

1.2 方法

1.2.1 鹽溶蛋白電泳法 參照NY/T 449—2001《玉米種子純度鹽溶蛋白電泳鑒定方法》。

1.2.2 SSR分子標記 切取少量胚乳,利用堿煮法[4]提取玉米基因組DNA。利用文獻[3]中提供的4對引物(表1)用于蘇玉20純度鑒定,所用引物由上海英俊生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系:DNA模板1.0 μL,Super Taq Mix 5.0 μL(上海浦迪生物科技有限公司),ddH2O 3.0 μL,上下游引物(2.0 μmol/L)各0.5 μL。PCR擴增程序為:95 ℃預(yù)變性 5 min;95 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR反應(yīng)在BIO-RAD 5808R型PCR儀上進行。

PCR反應(yīng)產(chǎn)物在30%的聚丙烯酰胺凝膠電泳(N,N-亞甲基二丙烯酰胺 ∶丙烯酰胺=1 ∶29)分離1.5 h后,經(jīng)0.2% AgNO3銀染后顯色,拍照觀察并記錄。

2 結(jié)果與分析

2.1 鹽溶蛋白及SSR分子標記電泳結(jié)果參照農(nóng)業(yè)行業(yè)標準NY/T 449—2001《玉米種子純度鹽溶蛋白電泳鑒定方法》,將待檢批次的蘇玉20及其父、母本蛋白質(zhì)上樣,電泳并分析(圖1)。結(jié)果表明:蘇玉20及其親本自交系間存在差異,且雜交種F1代和雙親譜帶互補。圖1中,有1個泳道的譜帶呈偏母本型,可能是母本接受外來花粉造成的混雜,可以確定為非雜交種。這表明鹽溶蛋白電泳可用于蘇玉20品種純度鑒定。

利用孟慶長等篩選出的4對引物[3]對蘇玉20雜交種及親本進行擴增,其中引物umc1590經(jīng)PCR擴增后,F(xiàn)1代圖譜出現(xiàn)3條互補帶,因此不建議作為區(qū)分此品種的首選引物。而引物bnlg1306、phi065、bnlg2291經(jīng)PCR擴增后父母本各為1條帶,雜交種為雙親的2條互補帶,可很好地區(qū)分(圖2)。

2.2 2種方法的結(jié)果比較

對10個不同批次種子同時用2種方法進行對比(表2),研究發(fā)現(xiàn),同一批次種子,蛋白電泳純度數(shù)值比SSR分子標記數(shù)值高平均0.78百分點,差異范圍在-0.8~3.1百分點。2種方法數(shù)值有一定的相關(guān)性,種子純度越高,2種方法數(shù)值越接近,如果純度越低,SSR分子標記數(shù)值相對越低。

為進一步驗證篩選出的3對引物能否很好地鑒定品種純度,每一粒種子經(jīng)玉米單粒磨碎儀研磨后,取少許胚乳做DNA模板,對應(yīng)的種胚做鹽溶蛋白電泳。經(jīng)比較,2種方法的純度結(jié)果基本吻合(表3)。另外研究發(fā)現(xiàn),152個檢測樣品,4個母本自交系種子在不同引物標記及蛋白電泳檢測中表現(xiàn)均一致,而經(jīng)phi065檢測顯示為父本的個體在其他方法中顯示為F1代,經(jīng)bnlg1306和蛋白電泳檢測顯示為雜株的個體在其他檢測方法中顯示為F1代。這種現(xiàn)象可能和玉米種子在不同發(fā)育時期蛋白表達不同有關(guān)。同時也說明在實際工作中,應(yīng)結(jié)合該批種子是自交苗、回交苗、其他類型雜株還是遺傳不穩(wěn)定因素,根據(jù)實際情況,選擇合適的引物對,對各單株檢測結(jié)果進行綜合判定,確定待測雜交種的純度。

3 討論與結(jié)論

劉宏魁等利用鹽溶蛋白PAGE法和SSR分子標記對先玉335和澤玉11指紋圖譜進行了分析,研究發(fā)現(xiàn),鹽溶蛋白法可大批量用于純度檢測,對于難以鑒定的品種可用SSR分子標記法作為輔助手段進行鑒定[5]。本試驗以同一玉米種子為材料,提取不同取樣部位的基因組DNA,利用SSR分子標記法和鹽溶蛋白電泳法對蘇玉20純度進行了鑒定,結(jié)果表明2種方法均可區(qū)分親本自交系和雜交種。這說明堿煮法適于蘇玉20的提取,鹽溶蛋白電泳法也可以用于此品種的純度鑒定。

試驗中利用3對SSR引物和蛋白電泳進行比較(表3),研究發(fā)現(xiàn)2種方法結(jié)果比較吻合。但各個引物的SSR標記圖譜和蛋白電泳圖譜個別個體表現(xiàn)并非一一對應(yīng),這正解釋了SSR標記作為一種隨機DNA標記,個體在不同引物間存在一定差異,而SSR 標記和鹽溶蛋白法個體的差異表現(xiàn)正說明蛋白質(zhì)電泳圖譜易受種子(或幼苗)發(fā)育階段及表達器官的影響,不夠穩(wěn)定從而影響了鑒定結(jié)果的準確性。這和趙久然的研究結(jié)果[6]是一致的。

參考文獻:

[1]包和平,曹麗娟,楊 光. 用鹽溶蛋白PAGE法檢測雜交玉米種子純度[J]. 中國種業(yè),2006(6):36-37.

[2]郭景倫,趙久然,王風(fēng)格,等. 玉米雜交種純度室內(nèi)與田間鑒定結(jié)果比較研究[J]. 種子世界,2004(7):22-24.

[3]孟慶長,陳艷萍,楊興華,等. 利用SSR技術(shù)鑒定蘇玉20的純度[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報,2009,25(3):508-512.

[4]王建華,田寶華,楊麗維,等. 玉米單粒播種子質(zhì)量評價與檢測技術(shù)手冊[M]. 北京:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)種子科學(xué)與技術(shù)研究中心,46-52.

[5]劉宏魁,閆洪朗,原亞萍. 應(yīng)用鹽溶蛋白電泳和SSR分子標記鑒定玉米種子純度的研究[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2011,39(19):11396-11398.

[6]趙久然. 玉米種子真實性和品種純度鑒定新方法[J]. 北京農(nóng)業(yè)科學(xué),1999(3):25-40.

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