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雞IGF1、IGF2基因的遺傳互作效應(yīng)

2016-01-27 15:42:32金崇富王金玉張跟喜等
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年11期
關(guān)鍵詞:黃雞揚(yáng)州生長(zhǎng)因子

金崇富 王金玉 張跟喜等

摘要:以IGF1、IGF2基因作為影響雞生產(chǎn)性能的候選基因,采用DNA測(cè)序和PCR-SSCP技術(shù)分析2個(gè)基因的單核苷酸多態(tài)性及互作效應(yīng)。結(jié)果表明,IGF1基因P1位點(diǎn)與IGF2基因P2位點(diǎn)對(duì)12、16周齡雞的質(zhì)量存在互作效應(yīng)。

關(guān)鍵詞:雞;遺傳多樣性;IGF1R基因;IGFBP-3基因;互作效應(yīng)

中圖分類號(hào):S831.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2015)11-0285-02

收稿日期:2014-11-27

基金項(xiàng)目:江蘇省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題(編號(hào):K13032);江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金[編號(hào):CX(13)3044]。

作者簡(jiǎn)介:金崇富(1985—),男,江蘇建湖人,碩士研究生,助理研究員,主要從事動(dòng)物遺傳育種與繁殖研究。Email:jincf001@sina.com。

通信作者:陳應(yīng)江,副研究員,主要從事畜牧業(yè)研究。胰島素樣生長(zhǎng)因子(IGFs)是人體最重要的生長(zhǎng)因子之一。IGF家族由2個(gè)多肽類生長(zhǎng)因子(IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ)、2類受體(IGF-ⅠR、IGF-ⅡR)、7種結(jié)合蛋白(IGFBP1-7)組成,它們是動(dòng)物生長(zhǎng)軸上的重要因子,具有強(qiáng)烈的促生長(zhǎng)和分化作用[1]。類胰島素樣生長(zhǎng)因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)是介導(dǎo)生長(zhǎng)素作用的物質(zhì),在研究生長(zhǎng)素的促生長(zhǎng)作用時(shí)被發(fā)現(xiàn)并深入研究。類胰島素樣生長(zhǎng)因子-Ⅱ(insulin-like growth factor-Ⅱ,IGF2)是調(diào)節(jié)動(dòng)物生命活動(dòng)最重要的多肽生長(zhǎng)因子之一[2],是生長(zhǎng)激素發(fā)揮作用的中間信使,進(jìn)而發(fā)揮促進(jìn)生長(zhǎng)發(fā)育的作用[3]。

王慧華研究發(fā)現(xiàn),IGF1基因G49754A/G49778A位點(diǎn)對(duì)京海黃雞的初生質(zhì)量有顯著影響[2]。Amills等在IGF-Ⅰ基因的5′-UTR發(fā)現(xiàn),HinfI-RFLP與107 d雞的日增質(zhì)量存在相關(guān)性[4]。楊鳳萍等在京海黃雞IGF2基因中檢測(cè)到外顯子2發(fā)生G→C突變,并與其生產(chǎn)性狀具有顯著相關(guān)性[5]。李源等研究發(fā)現(xiàn),IGF2基因C2C2型個(gè)體的12、16周齡質(zhì)量極顯著大于C1C2型個(gè)體(P<0.01)[3]。

在分析多基因調(diào)控的數(shù)量性狀時(shí),須同時(shí)分析多個(gè)位點(diǎn),以便得到基因與性狀之間的真實(shí)相關(guān)性,從而在利用DNA標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇時(shí)獲得更大的遺傳進(jìn)展[6]。以江蘇省鹽城市地方草雞為研究對(duì)象,分析IGF1、IGF2基因的互作效應(yīng),以期為鹽城市地方草雞生產(chǎn)性狀的分子遺傳機(jī)制研究提供依據(jù)。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)材料

在江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所生態(tài)養(yǎng)殖基地的母雞群中,翅靜脈采集138份血樣,每份1.5 mL,以ACD抗凝并于 -20 ℃ 保存?zhèn)溆?。用DNA提取試劑盒抽提基因組DNA。

1.2引物設(shè)計(jì)

1.3PCR-SSCP分析

將2.5 μL PCR產(chǎn)物添加至7.5 μL變性緩沖液中,98 ℃變性10 min,隨后迅速冰浴5 min。將變性的PCR產(chǎn)物點(diǎn)樣添加至10%聚丙烯酰胺凝膠中,于140 V電壓電泳12 h。電泳結(jié)束后進(jìn)行銀染顯色并拍照記錄結(jié)果。

1.4IGF1、IGF2基因綜合標(biāo)記

采用SPSS軟件的廣義線性模型(GLM)綜合分析IGF1、IGF2基因的互作效應(yīng),選取互作效應(yīng)顯著的雞,對(duì)其生產(chǎn)性狀進(jìn)行基因型組合,并對(duì)不同基因型組合間的差異進(jìn)行最小二乘(LSD)分析。

2結(jié)果與分析

2.1PCR-SSCP分析結(jié)果

采用PCR-SSCP分析P1、P2引物擴(kuò)增片段。P1擴(kuò)增片段有3種帶型,定義為AA、AB、BB(圖1);P2擴(kuò)增片段有3種帶型,定義為CC、CD、DD(圖2)。

2.2序列分析結(jié)果

由引物P1的PCR產(chǎn)物片段測(cè)序結(jié)果(圖3)可知,BB型與AA型相比在160 bp處發(fā)生了G→A突變。由引物P2的PCR產(chǎn)物片段測(cè)序結(jié)果(圖4)可知,DD型與CC型相比在1 087 bp處發(fā)生了G→A突變。

2.3IGF1、IGF2基因?qū)ιa(chǎn)性狀的互作效應(yīng)

由IGF1、IGF2基因?qū)ιa(chǎn)性狀的互作效應(yīng)(表1)可知,IGF1、IGF2基因?qū)}城市地方草雞的12、16周齡質(zhì)量存在互作效應(yīng)。

3結(jié)論與討論

培育具有綜合性能的優(yōu)良家禽品種已成為現(xiàn)代家禽育種的重要目標(biāo)。由于家禽的很多經(jīng)濟(jì)性狀是由多基因控制的數(shù)量性狀,可通過(guò)分子標(biāo)記選擇世代中含有多個(gè)目標(biāo)基因的個(gè)體,再?gòu)闹羞x出優(yōu)良個(gè)體,實(shí)現(xiàn)有利基因的聚合,使品種具有更優(yōu)良的生產(chǎn)性能。

通過(guò)分子標(biāo)記將多個(gè)影響家禽生產(chǎn)性狀的基因聚合,此方面的研究尚不多見。侯啟瑞在京海黃雞群體中對(duì)IGF1與IGF2、LYZ與gag-env分別進(jìn)行聚合分析,發(fā)現(xiàn)其存在互作效應(yīng)[7]。趙秀華在京海黃雞群體中對(duì)IGFBP-1、IGFBP-2、STAT5基因進(jìn)行3基因互作效應(yīng)分析,結(jié)果表明,3基因合并效應(yīng)>2基因合并效應(yīng)>單基因效應(yīng),且組合基因型效應(yīng)不是單基因型效應(yīng)的簡(jiǎn)單相加,其效果優(yōu)于單基因型效應(yīng)[8]。李國(guó)輝等以白耳雞為試驗(yàn)對(duì)象,檢測(cè)GH、POU1F1、PRL基因的單核苷酸多態(tài)性,分析3個(gè)基因的單基因效應(yīng)與聚合基因型效應(yīng)[9]。本研究中鹽城市地方草雞IGF1、IGF2基因?qū)ζ?2、16周齡質(zhì)量具有互作效應(yīng);在生產(chǎn)中,可通過(guò)選擇這2個(gè)基因的SNPs進(jìn)行分子標(biāo)記輔助育種,其風(fēng)險(xiǎn)低于單基因選擇。

參考文獻(xiàn):

[1]張力,李樹濃. 胰島素樣生長(zhǎng)因子-1[J]. 國(guó)外醫(yī)學(xué)生理:病理科學(xué)與臨床分冊(cè),1997,17(2):174-176.

[2]王慧華. 京海黃雞IGF-I基因多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)系及其遺傳規(guī)律的研究[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2010.

[3]李源. IGF2基因,IGF2R基因多態(tài)性及其與京海黃雞生產(chǎn)性能的相關(guān)性研究[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2010.

[4]Amills M,Jiménez N,Villalba D,et al. Identification of three single nucleotide polymorphisms in the chicken insulin-like growth factor 1 and 2 genes and their associations with growth and feeding traits[J]. Poultry Science,2003,82(10):1485-1493.

[5]楊鳳萍,李其松,戴國(guó)俊,等. 京海黃雞IGF-Ⅱ基因SNPs及其與生產(chǎn)性能關(guān)系研究[J]. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào),2008,39(11):1470-1475.

[6]王金玉,陳國(guó)宏. 數(shù)量遺傳與動(dòng)物育種[M]. 南京:東南大學(xué)出版社,2004.

[7]侯啟瑞. IGFs、LYZ基因和EAV-HP DNA序列SNPs與京海黃雞經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2010.

[8]趙秀華. 京海黃雞IGFBP-1、IGFBP-2和STAT5基因遺傳效應(yīng)及表達(dá)規(guī)律的研究[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2012.

[9]李國(guó)輝,張學(xué)余,蘇一軍,等. 3個(gè)基因SNPs及基因聚合對(duì)白耳雞產(chǎn)蛋數(shù)的遺傳效應(yīng)[J]. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2010,32(4):661-667.趙莎莎,周澤偉,鄭玲敏,等. 飼用L-色氨酸添加劑的Ames試驗(yàn)[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,43(11:287-289.

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