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(南華大學公共衛(wèi)生學院,湖南 衡陽 421001)
·文獻綜述·
基于功能核酸的金屬離子生物傳感技術進展
朱玉鳳,王小鳳,王永生*
(南華大學公共衛(wèi)生學院,湖南 衡陽 421001)
基于功能核酸的生物傳感技術近年取得了顯著的進步。本文對綜述了功能核酸在金屬離子傳感技術中的應用進展,重點介紹了熒光、比色和共振光散射三類傳感技術的新進展、新原理及其應用。
功能核酸; 金屬離子; 熒光傳感; 比色傳感; 共振光散射
功能核酸是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術 (Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX) 篩選得到的寡聚核苷酸片段,包括脫氧核酶(DNAzyme),核酸適配體(aptamer)和適體酶(aptazyme)等[1-3]。功能核酸具有易于合成、穩(wěn)定性好、特異性強、便于修飾等特點,因而成為近年來的研究熱點。本文對近年來發(fā)展的金屬離子生物傳感技術進行了總結和評述。
1.1標記型熒光傳感器熒光傳感技術具有靈敏度高、動態(tài)線性范圍寬和重現(xiàn)性好等優(yōu)點。熒光傳感器大多采用熒光標記技術,即在核酸適配體5′端和3′端分別標記熒光基團(F)和猝滅基團(Q),或?qū)和Q分別標記到DNAzyme的酶鏈和底物鏈上,當靶分子引入后,核酸適配體或脫氧核酶的構象發(fā)生改變,導致體系的熒光強度發(fā)生改變,據(jù)此進行定量分析[4-5]。Magdalena S等[6]設計了一個分子信標檢測Hg2+,分子信標5′端和3′端分別標記熒光基團(FAM)和猝滅基團(DABCYL),莖部由4對G-C堿基和1對T堿基組成,且T-T在莖干中間部分,只有體系中存在Hg2+時,分子信標才能形成穩(wěn)定的發(fā)夾結構,F(xiàn)AM靠近DABCYL,熒光值降低,據(jù)此建立靈敏的檢測Hg2+的方法。該方法操作簡便,但成本較高。由于傳統(tǒng)的熒光猝滅基團猝滅效率低,且標記猝滅基團也增加了實驗成本。因此,量子點、金納米和氧化石墨烯等新型高效猝滅劑受到了人們的青睞[7-9]。本課題組發(fā)現(xiàn)[10],設計的富T序列寡核苷酸與Hg2+特異性識別后,形成的端基T-Hg2+-T結構,能猝滅5′端標記FAM的熒光,從而實現(xiàn)了對Hg2+的特異性檢測,不需標記猝滅基團,降低了實驗成本,方法新穎,快速,檢出限達到4.28 nM。
1.2非標記型熒光傳感器非標記熒光傳感技術是近年來又一研究熱點。這類傳感器主要是基于熒光染料與不同構象的功能核酸結合后,呈現(xiàn)不同的熒光強度[11-14]。應用較多的染料有N-methyl-mesoporphyrin IX (NMM),SYBR Green I (SG),Picogreen (PG) 和 GeneFinder (GF) 等。Zhang等[11]基于Hg2+(或Ag+)能與胸腺嘧啶T(或胞嘧啶C)形成T-Hg2+-T (或C-Ag+-C) 結構,導致功能核酸的構象改變,生成的雙鏈體能與SG特異性結合,引起熒光強度的變化,從而建立了分別測定Hg2+和Ag+的生物傳感方法,并將此技術應用于“邏輯門”設計。本課題組[12]基于UO2+特異性脫氧核酶在缺乏UO2+時,能與SG特異結合,體系熒光強度迅速增強;加入UO2+后,引起底物鏈在rA堿基處斷裂,斷裂片段游離,SG被釋放出來,體系熒光強度急速降低,據(jù)此定量測定UO2+,檢出限達到0.52 nM,此方法靈敏度高,選擇性好。含有富G序列的寡核苷酸探針在適當條件下能夠形成G-四聚體,它能與NMM特異性結合導致熒光顯著增強。本作者發(fā)現(xiàn)[13],在酸性環(huán)境下,UO22+能夠猝滅NMM的熒光,并抑制NMM與G-四聚體的作用,據(jù)此用來定量UO22+濃度,此法選擇性好,精密度高,但也存在檢出限較高的缺陷。隨后,應用氧化石墨烯來降低背景信號,同時,設計了RNA裂解型嵌合DNA酶(RCDzyme),通過酶鏈循環(huán)來進一步放大信號,建立了酶鏈循環(huán)和氧化石墨烯雙重信號放大超靈敏檢測UO22+的生物傳感方法[14],方法檢出限達到皮摩爾水平,遠低于其它已報道的生物傳感器。與標記熒光技術相比,這類熒光傳感技術無需標記,成本相對低廉,操作簡便,靈敏度高。
功能核酸的出現(xiàn),使比色傳感技術取得了突破性的進展,方法的靈敏度從傳統(tǒng)方法的毫摩爾、微摩爾水平提高到納摩爾,甚至皮摩爾水平。由于比色傳感技術能夠快速、現(xiàn)場、實時監(jiān)測,無需昂貴的儀器,因而備受研究者關注。目前基于功能核酸檢測金屬離子的比色傳感器主要有兩大類。
2.1基于金屬納米粒子和功能核酸的比色生物傳感器金屬納米粒子,尤其是金納米粒子,其粒徑小、比表面積大、消光系數(shù)大、易于修飾,這一特點被廣泛用來發(fā)展比色傳感技術。Wu等[15]基于陽離子聚合物PDDA能夠結合Cd2+特異性核酸適配體(Cd-4),加入Cd2+后,Cd-4變構為發(fā)夾結構,釋放出的PDDA與金納米作用,使金納米發(fā)生聚集,溶液顏色和吸光度值相應發(fā)生變化,以此定量測定Cd2+。該方法靈敏,快速,但穩(wěn)定性較差,易造成假陽性。相比之下,核酸適配體修飾的金納米因其更穩(wěn)定,特異性更好深受研究者歡迎。Li等[16]設計了金納米表面修飾Pb2+特異性DNAzyme復合物,結合氧化石墨烯(GO)對單雙鏈不同的吸附作用,建立了超靈敏檢測Pb2+的比色傳感器:當體系中沒有Pb2+時,金納米修飾Pb2+特異性DNAzyme能夠吸附到GO表面,金納米保持均勻分散狀態(tài);當有Pb2+存在時,該復合物裂解成三個單鏈片段被GO吸附,此時金納米聚集,依據(jù)溶液顏色的變化來定量測定Pb2+。
2.2基于G-四聚體-hemin的類過氧化物酶活性建立的比色生物傳感器氯化血紅素 (hemin)與富含G堿基的核酸適配體結合,可形成具有類似過氧化物酶活性的DNA酶[17],能快速催化過氧化氫介導的氧化作用。Sun等[17]以Pb2+穩(wěn)定的G-四聚體為探針,建立了測定血清中K+的傳感器,其原理是Pb2+誘導形成的更緊湊的G-四聚體不能結合hemin,而K+取代Pb2+形成的G-四聚體能夠結合hemin,具有較強的催化H2O2氧化ABTS(2′-聯(lián)氨-雙-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)顯色的能力。該方法特異性好。本課題組[18]設計了富含G(鳥嘌呤)和T(胸腺嘧啶)的功能化嵌合核酸適體(functional chimera aptamer,FCA),在沒有Hg2+離子存在時,F(xiàn)CA以G-四聚體結構形式存在,能夠與hemin結合形成具有過氧化物酶活性的DNAzyme;當加入Hg2+后,T-Hg-T發(fā)夾結構阻止了G-四聚體的形成,不能形成DNAzyme,根據(jù)溶液顏色深淺或吸光度大小定量測定Hg2+,方法線性范圍寬,靈敏度高,檢出限達到2.65 nM。
共振光散射技術具有靈敏度高、分析速度快、所需儀器設備簡單等優(yōu)點,已廣泛應用于環(huán)境、食品、藥物分析和生物醫(yī)學等領域。近年來,功能核酸與納米技術結合,促進了共振光散射技術在金屬離子檢測中的廣泛應用。Cai等[19]將富含G堿基的單鏈核酸適配體(ssDNA)與納米銀結合,建立了共振光散射測定K+的傳感方法:在高濃度的NaCl溶液中,納米銀被ssDNA保護而處于分散狀態(tài),K+能誘導核酸適配體形成穩(wěn)定的G-四聚體結構,此時納米銀失去了保護而發(fā)生聚集,體系的共振光散射增強。該方法應用于實際尿樣中K+離子測定,取得了滿意的效果。本課題組基于鈾特異性DNA酶通過金硫鍵組裝在金納米粒子上,形成金納米粒子復合物,在pH 4.5的MES緩沖溶液中,加入一定濃度的鈾酰離子,導致復合物在高鹽濃度下聚集,使體系的共振光散射強度增加,據(jù)此,建立了一種標記DNA酶-金納米粒子系統(tǒng)共振光散射法檢測鈾酰離子的新方法[20]。該方法可檢出納摩爾級的鈾酰離子,檢出限低,穩(wěn)定性好。UO22+特異性DNA酶的底物鏈含有核糖核苷酸堿基rA,它容易被核酸酶水解,因此實驗過程中需對所有的試劑、器械進行去核酸酶的處理,這加大了分析檢測的工作量和實驗成本。為了克服這一缺點,應用UO22+特異性核酸適配體(底物鏈不含rA堿基),建立了測定環(huán)境水樣中痕量UO22+的共振光散射傳感方法[21]。該方法檢出限低,試劑和器械無需進行去核酸酶處理,操作簡便,快速。功能核酸技術和共振光散射技術的結合,在金屬離子檢測方面具有重要的發(fā)展前景。
除了上述傳感技術外,不少研究者應用功能核酸建立了多種測定金屬離子的傳感方法,如化學發(fā)光、電化學、表面等離子體共振和無線傳感法等[22-26],本文不一一贅述。
基于功能核酸測定金屬離子的傳感技術簡便快速,靈敏度高,特異性好,但仍存在一些不足,主要表現(xiàn)在:①已開展的工作主要集中在理論研究及實驗室階段,推廣應用于實際樣品檢測還需作進一步的工作;②研究主要集中在Hg2+,Pb2+,Cu2+,K+,UO22+,Ag+和Cd2+等,對其它金屬離子的研究相對較少;③研究方法多限于比色法、熒光法和共振光散射光譜法等。因此,今后的研究工作可望在以下方面進一步深入和發(fā)展:①進一步完善和發(fā)展SELEX篩選技術,篩選出更多金屬離子特異性的功能核酸,應用于金屬離子傳感器的構建;②進一步開發(fā)金屬離子傳感新材料,深入研究金屬離子傳感新原理、新技術和新方法,推廣應用于實際工作中,擴大應用領域;③開發(fā)簡便、易攜帶、靈敏度高、檢測范圍寬且穩(wěn)定性和重現(xiàn)性好的生物傳感器,滿足經(jīng)濟、社會發(fā)展的需要,這仍然是今后金屬離子檢測研究領域應著重解決的一個問題。
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10.15972/j.cnki.43-1509/r.2016.02.026
2015-12-30;
2016-03-01
國家自然科學基金資助項目(No.21177052).
*通訊作者,E-mail:yongsheng.w@tom.com.
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