王欣欣, 盧 萍, 李鴻雁, 黃 帆, 李 俊
(1.內(nèi)蒙古師范大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院, 呼和浩特010022;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所, 內(nèi)蒙古 呼和浩特010010)
老芒麥(Elymus sibiricus L.)別名西伯利亞披堿草,是禾本科(Gramineae)小麥族(Triticeae)披堿草屬(Elymus)優(yōu)質(zhì)牧草[1]。主要分布在北半球溫帶地區(qū),集中在東歐、西伯利亞、俄羅斯、中亞、西亞、蒙古、朝鮮、日本及印度,在我國(guó)野生老芒麥資源主要分布于東北、內(nèi)蒙古、甘肅、寧夏、青海、新疆、四川、西藏、河北、山西、陜西、等省區(qū)[2]。老芒麥等野生披堿草屬植物適應(yīng)性強(qiáng),具有耐鹽、抗寒和抗旱等特性[3]。老芒麥植株葉量豐富,其粗蛋白含量高,適口性好,利于消化,可以青飼和放牧,也可制成干草,為牲畜所喜食[4]。
目前世界上已收集610萬(wàn)份植物種質(zhì)資源,約90%以種子形式保存在低溫種質(zhì)庫(kù)中[5-6]。種質(zhì)庫(kù)中種子的安全保存要確保種質(zhì)在更新及貯存過(guò)程中維持其遺傳完整性,開(kāi)展種質(zhì)遺傳完整性的變化研究非常重要。
近年來(lái),醇溶蛋白電泳技術(shù)廣泛應(yīng)用于牧草種質(zhì)資源遺傳完整性的研究分析,該技術(shù)簡(jiǎn)單易行、花費(fèi)少,不需精密儀器,多態(tài)性較好,適合大規(guī)模檢測(cè)老芒麥種質(zhì)遺傳完整性[7]。王芳等[8]采用醇溶蛋白電泳技術(shù)對(duì)20份大麥種質(zhì)進(jìn)行遺傳完整性分析,發(fā)現(xiàn)某些大麥異質(zhì)性種質(zhì)的遺傳完整性在繁殖更新過(guò)程中發(fā)生了變化。任守杰等[9]用醇溶蛋白電泳技術(shù)對(duì)20份小麥種質(zhì)遺傳完整性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)小麥更新時(shí),較高發(fā)芽率是維持異質(zhì)性種質(zhì)遺傳完整性的關(guān)鍵因素。目前有關(guān)利用醇溶蛋白標(biāo)記技術(shù)檢測(cè)老芒麥種質(zhì)資源遺傳完整性方面的研究少有報(bào)道。本研究用A-PAGE酸性聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù),對(duì)3種老化處理?xiàng)l件下、4份老芒麥材料的16份種子醇溶蛋白進(jìn)行分析,旨在從蛋白水平上探討其遺傳完整性變化,以期為牧草種質(zhì)資源的安全保存和種子的繁殖更新標(biāo)準(zhǔn)提供參考。
供試材料由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所國(guó)家牧草種質(zhì)中期庫(kù)提供,種質(zhì)材料在2012年7月收獲,保存于中期庫(kù),貯存溫度(4±2)℃。
表1 試驗(yàn)材料及來(lái)源
采用Delouche等提出的高溫(40℃)高濕(100%RH)老化法[10]對(duì)種子進(jìn)行處理,具體如下:濾紙置于干燥器中間白瓷板上,干燥器底部盛無(wú)菌水,將待處理種子以單層鋪于濾紙上,保證處理?xiàng)l件一致,蓋嚴(yán)干燥器,置40℃老化箱內(nèi)進(jìn)行高溫高濕老化處理,使其發(fā)芽率分別達(dá)到80%、50%和30%左右。
參照牧草種子檢驗(yàn)規(guī)程[11]中老芒麥的標(biāo)準(zhǔn)發(fā)芽條件對(duì)材料進(jìn)行發(fā)芽實(shí)驗(yàn),發(fā)芽床鋪2層濾紙,每天光照8h、黑暗16h,溫度設(shè)為25℃和15℃,第5天統(tǒng)計(jì)發(fā)芽勢(shì),第12天統(tǒng)計(jì)發(fā)芽率,取平均值(見(jiàn)表2)。
1.4.1 樣品提取
每份材料各取30粒種子,采用半粒種子法,方法如下:將種子橫切,帶胚端發(fā)芽,若發(fā)芽則提取另外半粒種子進(jìn)行貯藏蛋白分析;不發(fā)芽者剔除。取與發(fā)芽相對(duì)半粒種子0.2g,將樣品磨碎,放入1.5mL離心管中,按1mg加入6μL的比例加入樣品提取液(提前配好:25mL乙二醇+0.05g甲基綠,用無(wú)離子水定容至100mL,-4℃低溫保存),在振蕩器振蕩混勻,于室溫下浸提過(guò)夜,使用前10 000r/min離心10min,取上清液點(diǎn)樣。
1.4.2 A-PAGE分析
參照國(guó)際種子檢查協(xié)會(huì)ISTA標(biāo)準(zhǔn)程序(1986年)進(jìn)行種子醇溶蛋白提?。?2]。取適量凝膠溶液,按凝膠溶液1mL加入1μL 10%過(guò)硫酸銨,1μL TEMED,迅速搖勻。灌膠,插好樣品梳,讓其在5~10 min內(nèi)聚合。醇溶蛋白的進(jìn)樣量為10~15μL,將電壓調(diào)至200V,電泳20min,電泳在4℃冰箱中進(jìn)行,將電壓調(diào)至500V,待甲基綠沿指示劑遷移至底板2cm處,再將電壓調(diào)為400V,指示劑遷移至凝膠前沿時(shí),結(jié)束電泳。凝膠加1%考馬斯亮藍(lán)5mL,加10%三氯乙酸200mL染色過(guò)夜。在7%醋酸中保存,拍照。
按條帶有無(wú)分別賦值,有記為1,無(wú)記為0,計(jì)算相似系數(shù)S=2Nab/(Na+Nb)×100%(Na,Nb,Nab分別代表a、b和ab的酶帶數(shù)),再應(yīng)用POP-GENE 32軟件進(jìn)行醇溶蛋白電泳譜帶差異和遺傳多樣性指數(shù)的統(tǒng)計(jì)分析[13-14]。采用 NTSYSpc 2.1軟件進(jìn)行聚類 分析[15-16]。
表2 人工老化處理對(duì)老芒麥種子相對(duì)發(fā)芽率的影響
表3 16份老芒麥種質(zhì)醇溶蛋白相似性系數(shù)
16份種質(zhì)材料共檢測(cè)出18條醇溶蛋白條帶,均為多態(tài)性條帶(見(jiàn)圖1)。每1份材料具有其特有的醇溶蛋白指紋圖譜,其中E 1條帶最多,為9條,老化后發(fā)芽率降至30%的E 4條帶最少,為4條,平均每份種質(zhì)檢測(cè)到7.3條。依照蛋白質(zhì)的分子量由小到大,遷移率由快到慢將醇溶蛋白電泳圖譜分為4個(gè)區(qū),即α、β、γ和ω區(qū)。隨高溫高濕老化時(shí)間延長(zhǎng),種子生活力不斷下降。4個(gè)種質(zhì)以3種老化條件處理后,各分區(qū)中譜帶數(shù)目有的不同。
圖1 老芒麥種子醇溶蛋白電泳圖譜
當(dāng)老化處理使發(fā)芽率降至50%左右時(shí),醇溶蛋白圖譜顏色逐漸變淺,隨著老化時(shí)間進(jìn)一步延長(zhǎng),發(fā)芽率降到30%左右,α、β區(qū)的醇溶蛋白有的譜帶表現(xiàn)為消失。
老芒麥醇溶蛋白條帶相似性系數(shù)見(jiàn)表3,老化處理后E 1的4個(gè)材料的種質(zhì)相似性系數(shù)在0.94和1.00間;E 2的4個(gè)材料的相似性系數(shù)在0.85和1.00間;E 3的相似性系數(shù)在0.85與1.00間;E 4的相似性系數(shù)在0.72和1.00間,其中 E 1-0和 E 1-1,E 1-2和E 1-3,E 2-0 和 E 2-1,E 2-0和 E 3-1,E 2-1和 E 3-1,E 2-3和 E 3-2,E 2-0和 E 3-3,E 2-1和 E 3-3,E 3-1和E 3-3,E 4-0和E 4-1材料間的相似系數(shù)為1.00,說(shuō)明親緣關(guān)系最近;E 2-0和E 4-3,E 2-1和E 4-3,E 3-1和E 4-3,E 3-3和E 4-3材料間的相似系數(shù)最小,為0.50,說(shuō)明親緣關(guān)系相對(duì)遠(yuǎn)些;老化后發(fā)芽率降至50%左右后,相似系數(shù)較未老化的種質(zhì)發(fā)生很大變化,種質(zhì)間存在較大的遺傳差異,遺傳組成上發(fā)生了變化。
表4 老芒麥材料間的等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、多樣性指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)
從表4可以看出,4份老芒麥種質(zhì)4個(gè)不同發(fā)芽率群體的等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、Nei’s基因多樣性、Shannon多樣性指數(shù)、多態(tài)性位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)這5個(gè)指標(biāo)均隨著發(fā)芽率的下降而呈現(xiàn)下降的趨勢(shì),這初步說(shuō)明隨老化程度的加大,低發(fā)芽率的老芒麥種質(zhì)對(duì)其遺傳完整性產(chǎn)生不利的影響。
老芒麥醇溶蛋白聚類分析結(jié)果見(jiàn)圖2,將材料劃分為三大類,其中第1類包括 E 4-2和 E 4-3號(hào)材料,來(lái)自E 4發(fā)芽率為54%和30%的2個(gè)梯度種質(zhì);第2類包括 E 4-0和E 4-1號(hào)材料,來(lái)自E 4發(fā)芽率91%和81%的2個(gè)梯度種質(zhì);第3類包括E 1-0、E 1-1、E 1-2、E 1-3、E 2-0、E 2-1、E 3-1、E 3-3、E 2-2、E 2-3、E 3-2和E 3-0號(hào)材料,其中E 1-0、E 1-1、E 1-2、E 1-3號(hào)材料為E 1種質(zhì),E 2-0、E 2-1、E 2-2、E 2-3號(hào)材料為E 2種質(zhì),E 3-0、E 3-1、E 3-2、E 3-3為E 3種質(zhì)。由此看出,來(lái)源相同的種質(zhì)材料部分聚在一起,呈現(xiàn)出規(guī)律性,即同一種質(zhì)不同的老化處理材料先聚一起,如來(lái)自E 1和E 4的材料各自聚為一類。但E 2和E 3的材料出現(xiàn)交叉,原因可能與老化后的種質(zhì)遺傳完整性改變有關(guān)。
圖2 基于醇溶蛋白圖譜的老芒麥種質(zhì)材料聚類圖
E 4的4個(gè)材料間聚類分析見(jiàn)圖3,劃分為兩大類,發(fā)芽率為91%的群體(對(duì)照)和81%的群體為一類;發(fā)芽率54%的群體和30%的群體聚為一大類。說(shuō)明老化后群體內(nèi)的某些醇溶蛋白基因序列可能改變或消失,同時(shí)表明低發(fā)芽率種質(zhì)資源不利于遺傳完整性的保持。
圖3 03658老芒麥基于種子醇溶蛋白的聚類圖
譚富娟等對(duì)燕麥種子貯存后遺傳完整性的研究分析發(fā)現(xiàn),不同貯存年代種子的酯酶、淀粉酶、過(guò)氧化物酶、同工酶和醇溶蛋白圖譜中陳舊材料的條帶數(shù)明顯減少、顏色變淺[17]。張晗等對(duì)大麥地方品種普乃干木進(jìn)行醇溶蛋白譜帶分析,發(fā)現(xiàn)發(fā)芽率降到34%時(shí),白帶型Ⅲ生物型隨之消失[18]。本研究發(fā)現(xiàn),經(jīng)高溫高濕老化處理后,老芒麥種子發(fā)芽率降至50%左右時(shí)種子醇溶蛋白圖譜有條帶顏色變淺,有的消失,同一種質(zhì)不同老化處理、不同發(fā)芽率材料間的相似系數(shù)出現(xiàn)變化,與上述研究的結(jié)論相同。
人工老化處理的低發(fā)芽率種質(zhì)群體的等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、Nei’s基因多樣性、Shannon多樣性指數(shù)、多態(tài)性位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)的參數(shù)值,較對(duì)照種質(zhì)的數(shù)值有所下降,說(shuō)明老化后種子活力降低,某些醇溶蛋白基因的DNA序列改變或丟失,對(duì)其遺傳完整性維持產(chǎn)生不利影響。這與任守杰[9]、張晗[19]和王小麗[20]等對(duì)20份小麥種質(zhì)、不同發(fā)芽率水平玉米和扁蓿豆的研究結(jié)果相似。
聚類分析發(fā)現(xiàn),低發(fā)芽率E 4種質(zhì)(54%的群體和30%群體)聚為一類,發(fā)芽率為91%的群體(對(duì)照)和81%的群體為一類,種質(zhì)老化后群體內(nèi)出現(xiàn)遺傳變異,某些序列可能改變或丟失,老化后無(wú)法聚在一起;同一種質(zhì)E 1和E 4不同的老化處理的材料,先聚一起,也有部分材料有分支,可能受到老化處理的影響使其發(fā)生了突變。另外,老芒麥?zhǔn)浅.惢ㄊ诜壑参铮s交使基因型發(fā)生了改變。
醇溶蛋白標(biāo)記是檢測(cè)植物多態(tài)性較好的技術(shù)手段,只能反映基因編碼區(qū)的部分變異,今后可以結(jié)合其它標(biāo)記技術(shù),如形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記及DNA分子標(biāo)記(AFLP、SNP、SSR、ISSR)等進(jìn)行全面分析,以求準(zhǔn)確反映種子老化對(duì)其遺傳完整性的影響。
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