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水稻抗稻瘟病基因研究進(jìn)展

2015-11-20 19:58王丹曹志肖應(yīng)輝
南方農(nóng)業(yè)·下旬 2015年10期
關(guān)鍵詞:稻瘟病水稻

王丹 曹志 肖應(yīng)輝

摘 要 水稻(Oryza sativa)作為世界上主要的糧食作物之一,它的生產(chǎn)關(guān)系糧食安全。稻瘟病是由真菌病原物Magnaporthe oryzae引起的,是水稻最嚴(yán)重的病害之一,嚴(yán)重威脅著世界的糧食生產(chǎn)。簡述國內(nèi)外水稻抗稻瘟病基因的研究進(jìn)展,

關(guān)鍵詞 水稻;稻瘟?。豢剐曰?/p>

中圖分類號(hào):S511 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:B 文章編號(hào):1673-890X(2015)30-0-03

水稻(Oryza sativa)作為世界上主要的糧食作物之一,它的生產(chǎn)關(guān)系糧食安全。稻瘟病是由真菌病原物Magnaporthe oryzae引起的,是水稻最嚴(yán)重的病害之一,嚴(yán)重威脅著世界的糧食生產(chǎn)[1]。據(jù)統(tǒng)計(jì),從1975-1990 年間,全世界由稻瘟病導(dǎo)致的水稻產(chǎn)量損失高達(dá)1.57億t[2]。自20世紀(jì)末以來,我國稻瘟病每年發(fā)生面積均超過380萬hm2,所造成的產(chǎn)量損失達(dá)數(shù)億公斤每年[3]。實(shí)踐證明,控制此病害最經(jīng)濟(jì)、有效和環(huán)保的方法是利用寄主的抗性培育和種植抗病品種[1,4],而應(yīng)用分子標(biāo)記輔助選擇(Marker-assisted Selection,MAS)技術(shù)將多個(gè)具有不同抗譜的稻瘟病抗性基因聚合到同一個(gè)品種中,是培育具有持久抗瘟性品種的有效措施之一[5]。

1 稻瘟病的抗性遺傳

稻瘟病抗性可分為兩種類型:完全抗性和部分抗性。完全抗性是指寄主與病原菌之間以一種不親和的方式互作,病原菌不能在寄主上完成生長世代;這種抗性一般是由單個(gè)主效抗病基因控制的,這種抗性對(duì)病原菌具有小種專一性,在特定的品種中抗性的壽命有限,原因是它對(duì)病原菌進(jìn)化的選擇壓很大。而部分抗性是指寄主與病原菌以一種親和方式互作,但其能減輕病原菌的侵染程度;一般認(rèn)為,部分抗性是由多個(gè)基因控制的[6],每一個(gè)微效基因又稱為數(shù)量性狀基因座QTL。

2 稻瘟病抗性基因定位與克隆

20世紀(jì)60年代中期,日本率先開展了水稻抗稻瘟病基因的遺傳研究,并取得了一系列的研究成果。隨著分子生物學(xué)的不斷發(fā)展,各種類型分子標(biāo)記的開發(fā)和應(yīng)用,推動(dòng)了水稻稻瘟病抗性基因定位與克隆研究迅速發(fā)展。截至目前,已至少報(bào)道了69個(gè)抗稻瘟病位點(diǎn)和83個(gè)主效基因,這些抗性基因或主效QTL大多被精細(xì)定位。其中,Pib、Pita、Pi9、Pi2、Piz-t、Pid2、Pi36、Pi37、Pik-m、Pid3、Pi-t、Pi5、Pish、Pi54、Pik、Pik-p、Pia、Pi25、Pi1、 Pi56、Pi63、PiCO39、Pi64、Pi50、pi21和Pb1等26個(gè)基因被成功克隆,這些基因分布于除第3 染色體外的其余11條染色體上,其中第6、11和12染色體分布最多。稻瘟病抗性基因在染色體上往往成簇分布,如Pi2、Pi9和Piz-t同為Piz位點(diǎn)上的復(fù)等位基因,Pi1、Pik-h/Pi54、Pik-m和Pik-p同為Pik位點(diǎn)上的復(fù)等位基因,Pid3與Pi25等位,Pia與PiCO39等位。

第6染色體Pi9/2位點(diǎn)是稻瘟病抗性基因密集區(qū)域,到目前為止至少有10個(gè)以上的基因被定位,分別是Pigm、Pi2、Piz–t、Pi2–2、Pi9、Pi26、Pi40、Pi50、Piz和qBR6。廣譜抗稻瘟病基因Pi9首先由Amante Bordeos等[7]從小粒野生稻導(dǎo)入栽培稻中并命名,并獲得了與之緊密連鎖的RFLP標(biāo)記RG64和R2132,遺傳距離分別2.8cM和2.7cM;后被精細(xì)定位于水稻第6染色體短臂的NIP基因和PK基因之間。在抗譜表現(xiàn)方面,Pi9抗譜相當(dāng)廣,對(duì)來自13個(gè)國家的43個(gè)稻瘟病菌株均表現(xiàn)出很高的抗性。Qu等利用圖位克隆方法最終克隆了Pi9[8]。Pi2為Pi9同一位點(diǎn)上的抗瘟基因,Mew[9]、Yu[10]和吳金紅[11]等的研究將抗性基因Pi2(t)最終定位在標(biāo)記RG64和AP22之間,遺傳距離分別是0.9cM和1.2cM。Zhou等利用圖位克隆方法克隆了Pi2,Pi2和Pi9同源性很高,只存在幾個(gè)氨基酸的差異,抗譜也只有幾個(gè)稻瘟菌生理小種差異[12]。吳建利等在谷梅2號(hào)第6號(hào)染色體定位了2個(gè)抗稻瘟病基因Pi-25和Pi-26。Pi-25對(duì)中國稻瘟菌菌系92-183(小種ZC15)有較強(qiáng)的葉瘟和穗瘟抗性,定位于水稻第6染色體標(biāo)記A7和RG456之間,圖距分別是1.7cM和1.5cM;Pi-26對(duì)菲律賓稻瘟菌菌系Ca89有較強(qiáng)的葉瘟抗性,定位于水稻第6染色體上標(biāo)記B10和R674之間,圖距分別是5.7cM和25.8cM[13]。此外,江南等研究發(fā)現(xiàn),分子標(biāo)記AP4007、AP4791、AP5659-5和AP5930與谷梅2號(hào)中的主效抗病基因共分離[14]。Deng[15]等通過開發(fā)新的標(biāo)記,定位了谷梅4號(hào)中的廣譜抗性基因Pigm,將其定位在水稻第6染色體上CAPS標(biāo)記C5483與C0428之間的70kb區(qū)間內(nèi),與廣譜抗性基因Pi2/Pi9緊密連鎖或等位。此外,他還發(fā)現(xiàn)Pi26基因可能也在同一位點(diǎn)。王悅[16]等對(duì)天津野生稻中的主效抗稻瘟病基因Pi2–1進(jìn)行了定位,將其定位在第6號(hào)染色體上Pi9/2位點(diǎn),位于SSR標(biāo)記AP5659–5和RM7213之間,與兩標(biāo)記的遺傳距離分別為0.9cM和1.4cM。

此外,黃紅梅[17]將湘資3150中的抗稻瘟病基因Pi47定位在第11染色體上,位于標(biāo)記RM224和RM206之間。而后史學(xué)濤[18]對(duì)湘資3150中的抗稻瘟病基因Pi47進(jìn)行了精細(xì)定位,將Pi47定位在水稻第11染色體長臂端,位于SSR標(biāo)記RM224和STS標(biāo)記K134之間;而后又通過開發(fā)新的分子標(biāo)記,最終將Pi47定位在CAPS標(biāo)記S32和K33之間,與兩標(biāo)記的遺傳距離分別為0.21 cM和0.03 cM,分子標(biāo)記S10與其共分離。

Rybka等利用RFLP標(biāo)記和RAPD標(biāo)記定位了位于第十二號(hào)染色體中部的兩個(gè)抗稻瘟病基因Pi-ta2和Pi-ta,它們是緊密連鎖的,后來對(duì)兩個(gè)基因進(jìn)行深入研究發(fā)現(xiàn)含有Pi-ta2基因的水稻品種都具有Pi-ta基因,Tetep等通過接種實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Pi-ta2 比Pi-ta抗譜更廣。Wu等從1440個(gè)RAPD引物產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)了3個(gè)標(biāo)記與目的基因Pi-ta的遺傳距離小于0.5cm,為Bryan等最終克隆該基因奠定了良好的基礎(chǔ)[19]。此外,王悅等又將天津野生稻中另一個(gè)主效抗稻瘟病基因Pi51(t)定位在第12染色體上位于標(biāo)記RM5364和RM27990之間,與兩標(biāo)記的遺傳距離分別為0.4 cM和0.8cM[20]。此外,黃紅梅將湘資3150中的另一主效抗稻瘟病基因Pi48定位在第12染色體上,位于標(biāo)記RM5364和RM7102之間4.2cM的區(qū)間內(nèi)[21]。劉楊對(duì)Pi48基因進(jìn)行了精細(xì)定位,將Pi48定位于第12號(hào)染色體著絲粒附近,標(biāo)記LY-2與Pi48之間的遺傳距離只有0.025cM左右,并且該標(biāo)記與Pi48共分離[22]。

隨著對(duì)稻瘟病抗病基因和致病機(jī)理以及抗病基因在寄主和病原菌之間相作深入研究,對(duì)水稻抗稻瘟病侵染全過程的詳細(xì)了解以及新生物技術(shù)手段發(fā)展和應(yīng)用,一定能夠?qū)⒌疚敛〉奈:χ饾u減小的。

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(責(zé)任編輯:趙中正)

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