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巢式一實時熒光定量PCR法檢測慢性乙型肝炎患者PBMC中HBVcccDNA的實用性評估

2015-10-21 19:58:27楊慧慧
醫(yī)學美學美容·中旬刊 2015年2期
關(guān)鍵詞:乙型環(huán)狀單核細胞

楊慧慧

【摘要】 目的 評估巢式-實時熒光定量PCR法檢測慢性乙型肝炎患者PBMC中HVB cccDNA的實用性。方法 利用巢式-實時熒光定量PCR法檢測慢性乙型肝炎患者肝組織和PBMC中HVB cccDNA水平。結(jié)果 20例血清HBV DNA均為陽性的慢性乙型肝炎患者肝組織和外周血PBMC中ccDNA陽性率分別為55%(11/20)和45%(9/20),兩者的符合率為90%。結(jié)論 利用巢式-實時熒光定量PCR法檢測慢性乙型肝炎患者PBMC中HBV cccDNA能較真實地反映HBV的復制。該方法可能是一種評價抗病毒藥物的療效,觀察乙型肝炎患者病情的變化的有效手段,具有很強的實用性。

【關(guān)鍵詞】 肝炎病毒,乙型;DNA,環(huán)狀;聚合酶鏈式反應;單核細胞

【中圖分類號】R51216 【文獻標識碼】B【文章編號】1004-4949(2015)02-0048-02

乙型肝炎病毒(HBV)復制有其獨特的地方,首先形成共價閉合環(huán)DNA(covlently closed circular DNA,cccDNA),然后轉(zhuǎn)錄成前基因組RNA,最后在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下合成病毒基因組DNA,故cccDNA是HBV復制的突出標志[1]。cccDNA主要存在宿主的細胞核,既往均采用肝組織檢測DNA,但取材困難,限制了臨床應用。研究發(fā)現(xiàn)外周血淋巴細胞同樣存在HBV感染復制現(xiàn)象[2,3],故檢測外周血HBV cccDNA同樣能反映HBV復制狀況及評價藥物療效,且比肝組織更方便,只是外周血cccDNA濃度較低,易出現(xiàn)假陰性。為了評估巢式-實時熒光定量PCR法在檢測慢性乙型肝炎患者PBMC中HVB cccDNA的實用性,筆者擬利用巢式-實時熒光定量PCR法同時檢測慢性乙肝患者肝組織和PBMC中HVB cccDNA的含量,以期為臨床檢測HCV復制狀況及評價藥物療效提供簡便有效的方法。

1 材料與方法

1.1 標本 選取長沙市第一醫(yī)院傳染科確診的慢性乙型肝炎患者20例,男13例,女7例,平均年齡46.8歲(28~65歲),所有患者均未進行任何治療。每例病例分別采取全血10ml和行肝穿刺獲取肝組織;全血采用密度梯度離心法分離PBMC,洗滌5次后檢測上清液中HBV DNA,確認HBV DNA PCR結(jié)果為陰性后,計數(shù)細胞,取1×106細胞備用。肝組織用生理鹽水清洗4次,入液氮保存?zhèn)溆?。aywHBV全序列的pcp10質(zhì)粒,采用p-GEM-T-Easy載體構(gòu)建,用作檢測HBV cccDNA的陽性參照定量標準品,提取陽性標準質(zhì)粒,測定核酸濃度,倍比稀釋為5.0×102~5.0×109拷貝/ml,作為陽性標準品對照。

1.2 引物與探針的設(shè)計及合成 根據(jù)HBV cccDNA與松弛結(jié)構(gòu)DNA(rcDNA)結(jié)構(gòu)上的差異,跨HBV DNA雙鏈缺口兩側(cè)選擇區(qū)域設(shè)計2對內(nèi)外引物,并在負鏈缺口下游設(shè)計TaqMan熒光探針。所有設(shè)計的引物能選擇性地擴增HBV cccDNA,而不能擴增rcDNA。P1引物:5-CGC TTT CGG GTC CCT CAT GCG ACG TGC-3,P2引物:5-TCG CTT TCG GGT CCC T-3,P3引物:5-GCA CCT CTC TTT ACG CGG TC-3,P4引物:5-AAC TGA AAG CCA AAC AGT G-3,TaqMan熒光探針:5-FAM-CTC TGC C-TAA TCA TCT CAT GTT CAT-TAMRA-3,外引物擴增片段為385bp,內(nèi)引物擴增片段為105bp。

1.3 主要試劑 基因組提取試劑盒、HBV DNA熒光定量PCR檢測試劑盒、質(zhì)粒抽提試劑盒均購自北京索奧生物技術(shù)公司,CR Master Mix試劑購自日本東洋坊公司。

1.4 DNA抽提 利用質(zhì)粒抽提試劑盒按說明書操作提取PBMC及肝組織中病毒DNA。

1.5 巢式-實時熒光定量PCR擴增 取純化模板2μl,用外引物進行第一輪常規(guī)PCR擴增。外引物P1和P2濃度為10μmol/L,各1μl,10mmoldNTP 0.5μl,Taq酶0.5μl,10×buffer 2μl,ddH2O 13μl;循環(huán)條件:94℃ 5min;94℃ 30s,50℃ 30s,72℃ 30s,40個循環(huán);72℃ 5min。第二輪反應用內(nèi)引物和熒光探針對第一輪PCR產(chǎn)物中的目的片段進行實時熒光定量擴增。反應體系為:第一輪PCR產(chǎn)物2μl,2×Taq PCR Master Mix 12μl,P3、P4引物各1μl,10μmol/L熒光探針0.5μl,反應總體積20μl;循環(huán)條件:94℃ 5min;94℃ 30s,50℃ 30s,72℃ 30s,40個循環(huán);72℃ 5min。設(shè)陽性標準品對照為aywHBV全序列的pcp10質(zhì)粒,陰性對照為3例健康獻血員。

2 結(jié) 果

2.1 肝組織和外周血中PBMC中cccDNA檢測結(jié)果 第一輪PCR產(chǎn)物電泳在385bp處見陽性條帶,第4,6,7,8,10,12,13泳道呈陽性(圖1)。20例血清HBV DNA均為陽性的慢性乙型肝炎患者肝組織中ccDNA陽性者10例,陽性率為50%(10/20)。cccDNA定量值為4.214×104~5.211×105拷貝/ml。外周血PBMC中cccDNA陽性者9例,陽性率45%(9/20)。cccDNA定量值為3.521×103~3.452×104拷貝/ml。3例健康獻血員PBMC中cccDNA均陰性。

2.2 外周血PBMC和肝組織中cccDNA陽性的符合率 9例外周血PBMC中cccDNA陽性患者的肝組織中cccDNA均陽性,但有1例肝組織中cccDNA陽性患者其外周血PBMC中cccDNA陰性,外周血PBMC和肝組織中cccDNA陽性的符合率高達90%(9/10)。

2.3 方法的敏感性 檢測pcp10陽性參照定量標準品,得到該方法的靈敏度為2log10拷貝/ml范圍,隨著模板量減少,對應CT值增大,呈線性相關(guān),獲得標準曲線(圖2)。

3 討 論

臨床上一般以HBV DNA載量作為抗病毒治療依據(jù)及判斷乙肝病毒復制活力,HBV DNA包括rcDNA和ceeDNA。有學者認為單純依靠血清HBV DNA檢測是不夠的,應結(jié)合HBV cccDNA的檢測和臨床來進行綜合分析,才能更真實地反應患者體內(nèi)乙肝病毒的復制,為臨床治療提供更為可靠的依據(jù)[4]。cccDNA的清除預示著HBV在宿主體內(nèi)生命周期的終結(jié),因此不少學者認為這是最佳的抗病毒參考指標之一[4]。HBV cccDNA的檢測能夠評價抗病毒藥物的療效,連續(xù)觀察更能反映乙型肝炎患者病情的變化,所以準確、方便、快速檢測cccDNA的量是目前乙肝治療的迫切要求。乙型肝炎病毒HBV cccDNA研究以肝組織為多,但肝組織取材困難,臨床應用受到了極大的限制。HBV可以感染白細胞,而這種免疫細胞的感染有利于病毒免疫逃逸,不被免疫細胞攻擊,從而導致機體清楚HBV能力下降,故外周血PBMC中存在HBV感染和復制,檢測外周血PBMC中cccDNA應該亦能反映HCV的復制,但血液中cccDNA的水平遠遠低于肝組織,檢測亦較為困難。

巢式-實時熒光定量PCR技術(shù)具有高靈敏性和高特異性,能夠檢測極其微量的DNA。cccDNA有共價、閉合、超螺旋雙鏈DNA結(jié)構(gòu),在堿變性后可再復性,而rcDNA是有缺口的雙鏈DNA,堿變性后不可復性 所以本實驗方法應用質(zhì)粒提取試劑盒抽提肝組織和PBMC中的病毒DNA可以祛除rcDNA、單鏈DNA和RNA,對cccDNA進行純化,可進一步提高cccDNA檢測的靈敏性和特異性[5]。

本研究結(jié)果顯示,利用巢式-實時熒光定量PCR技術(shù)對20例血清HBV DNA陽性的慢性乙型肝炎患者的肝組織和PBMC中的cccDNA進行檢測,發(fā)現(xiàn)肝組織和PBMC中cccDNA的陽性率分別為50%和45%,且兩者的符合率高達90%,表明利用巢式-實時熒光定量PCR技術(shù)檢測外周血PBMC中的cccDNA亦能較真實的反映HBV的復制,可以避免由于肝組織取材帶來的限制,且準確、方便、快捷,是一種評價抗病毒藥物的療效,觀察乙型肝炎患者病情的變化的有效手段,具有很強的實用性。

參考文獻

[1]陳延平. 檢測HBVcccDNA的巢式-實時熒光定量PCR方法的建立及初步應用[D].第四軍醫(yī)大學,2007.

[2]陳勇. 實時熒光定量PCR檢測HBV cccDNA體系建立及臨床應用初步研究[D].重慶醫(yī)科大學,2008.

[3]陳延平,孟存英,徐光華,馮繼紅,王平忠,白雪帆. 應用巢式-實時定量PCR方法檢測慢性乙型肝炎患者PBMC中HBV cccDNA[J]. 肝臟,2011,05:401-404.

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