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桃兒七地下莖內(nèi)生真菌的分離和鑒定△

2015-09-25 12:59祝英王治業(yè)楊暉周劍平
中國現(xiàn)代中藥 2015年6期
關(guān)鍵詞:榆中縣內(nèi)生菌落

祝英,王治業(yè),楊暉*,周劍平*

(1.甘肅省科學(xué)院生物研究所,甘肅 蘭州 730000;2.蘭州大學(xué) 草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)國家重點實驗室 生命科學(xué)學(xué)院,甘肅 蘭州 730000)

·中藥農(nóng)業(yè)·

桃兒七地下莖內(nèi)生真菌的分離和鑒定△

祝英1,2,王治業(yè)1,楊暉1*,周劍平1*

(1.甘肅省科學(xué)院生物研究所,甘肅 蘭州 730000;2.蘭州大學(xué) 草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)國家重點實驗室 生命科學(xué)學(xué)院,甘肅 蘭州 730000)

目的:探索甘肅興隆山桃兒七內(nèi)生真菌的多樣性和豐度,為鬼臼毒素的獲取方式提供新途徑,保護(hù)瀕危藥用植物桃兒七資源。方法:采用組織塊培養(yǎng)法從一株桃兒七地下莖中分離純化內(nèi)生真菌,利用分子鑒定和常規(guī)的形態(tài)學(xué)方法對重復(fù)出現(xiàn)的4株內(nèi)生真菌進(jìn)行分類鑒定。結(jié)果:本研究采用組織塊內(nèi)生菌分離方法分離純化了20株內(nèi)生真菌,鑒定的4株菌分別是赭曲霉Aspergillusochraceus,Eucasphaeriacapensis,布氏白僵菌Beauvetiabrongniaritii和鐮孢菌Fusariumsp.。結(jié)論:內(nèi)生真菌的多樣性和豐度與桃兒七的生境有關(guān),甘肅興隆山桃兒七內(nèi)生真菌優(yōu)勢屬為Aspergillus,Eucasphaeria,Beauvetia和Fusarium。

桃兒七;組織塊培養(yǎng)法;內(nèi)生真菌;分子鑒定;形態(tài)學(xué)鑒定

植物內(nèi)生真菌是自然界普遍存在的。有些內(nèi)生真菌菌株不但能促進(jìn)宿主植物生長、增強(qiáng)宿主抗旱、抗鹽和抗病蟲害的能力[1],還能產(chǎn)生與宿主植物相同或類似的生物活性物質(zhì)[2],引起人們對植物內(nèi)生真菌研究的興趣。

近年來,國內(nèi)外已經(jīng)陸續(xù)報道了從多種藥用植物中分離獲得產(chǎn)生藥理活性的內(nèi)生真菌。Kusari[3]和王玉美等[4]分別從喜樹植物中分離到產(chǎn)生喜樹堿及其結(jié)構(gòu)類似物的內(nèi)生真菌。殷紅等[5]從秦艽中分離到產(chǎn)生龍膽苦苷的內(nèi)生真菌。李海燕等[6]從云南中縣桃兒七地下莖的韌皮部分離到一株能產(chǎn)生鬼臼毒素的內(nèi)生真菌。王曉鵬等[7]從小檗科鬼臼亞科兩種重要植物桃兒七和南山荷葉中共分離92種內(nèi)生真菌,發(fā)現(xiàn)桃兒七內(nèi)生真菌抗真菌活性較強(qiáng),但未報道這些真菌是否產(chǎn)生鬼臼毒素或其結(jié)構(gòu)類似物。張琨等[8]從桃兒七植株中分離得到產(chǎn)鬼臼毒素類物質(zhì)的真菌4株和產(chǎn)鬼臼毒素單糖甙的真菌2株,均屬于毛霉屬M(fèi)ucor;而楊顯志等[9]從桃兒七植物中篩選出產(chǎn)鬼臼毒素的菌株分別屬于交鏈孢屬Alternaria、青霉屬Penicillium和叢梗孢屬M(fèi)onilia。曲霉屬Aspergillus真菌也是植物常見的內(nèi)生菌,也能產(chǎn)生有價值的生物活性物質(zhì)[6,10-11]。Debbab等[12]從唇萼薄荷中分離到能產(chǎn)生活性物質(zhì)的匍柄霉屬Stemphylium內(nèi)生真菌。同一宿主植物分離到產(chǎn)生物活性物質(zhì)的內(nèi)生真菌種類不同,這與植物的生境和生長年限有關(guān)。張琨等[8]研究的桃兒七植株來源陜西太白山;而李海燕等[6]從云南省中甸縣的桃兒七地下莖分離28株內(nèi)生真菌,從陜西太白山自然保護(hù)區(qū)的桃兒七地下莖分離到21株內(nèi)生真菌[13];王曉鵬等[7]的桃兒七采自云南省香格里拉仙人洞,分離到20株內(nèi)生真菌。他們的研究結(jié)果顯示不同生境來源的桃兒七分離到的內(nèi)生菌數(shù)量和種屬存在一定的差異。因此,桃兒七內(nèi)生真菌可能和植株的生境有關(guān)。

桃兒七主要分布在我國的云南、青海、西藏、四川、陜西和甘肅等省,生長在海拔2000~3000 m的林下或山地草叢中。云南和陜西境內(nèi)桃兒七內(nèi)生真菌的研究均有報道,而甘肅是野生桃兒七主要分布區(qū)之一。甘肅境內(nèi)桃兒七內(nèi)生真菌的研究還未見報道。本研究桃兒七植物來源于甘肅省榆中縣興隆山,對該生境下桃兒七地下莖內(nèi)生真菌分離、鑒定,闡述植物內(nèi)生真菌分離鑒定的系統(tǒng)方法,以期為植物內(nèi)生真菌的研究和開發(fā)利用提供參考。

1 材料與方法

1.1 樣品來源

實驗樣品為多年生桃兒七Sinopodophyllumhexandrum采自甘肅省蘭州市榆中縣興隆山國家自然保護(hù)區(qū),海拔2400 m。采樣時間為2009年8月,選擇結(jié)果實的桃兒七植株,完整的將地下莖挖出,將根圍泥土和根系一起放入取樣袋中,帶回實驗室。以興隆山桃兒七根圍泥土為培養(yǎng)基質(zhì),將桃兒七地下莖栽種于實驗室溫室內(nèi)備用。

1.2 培養(yǎng)基

內(nèi)生真菌分離培養(yǎng)基:馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA)培養(yǎng)基。

1.3 內(nèi)生真菌的分離、純化和保藏

內(nèi)生真菌分離時,直接從溫室栽培基質(zhì)中挖取桃兒七地下莖,將地下莖用自來水沖洗干凈,選取直徑小于5 mm的地下莖按照下列程序表面消毒:75%酒精浸泡3~5 min,拿到無菌操作臺用無菌水沖洗4次,用0.1%的升汞浸泡1~3 min,再用蒸餾水洗滌4次后,留做接種備用。

為了驗證表面消毒效果,進(jìn)行對照試驗:將上述處理好的桃兒七地下莖切成小段,兩端在酒精燈上燒一下后,種植在培養(yǎng)基上;實驗組:將上述處理好的桃兒七地下莖兩端燒一下,用滅菌手術(shù)刀切掉兩端,再將中間莖段切成3 mm小片,分別種植到PDA培養(yǎng)基上,于25 ℃培養(yǎng)3~7d,地下莖切口處長出內(nèi)生真菌菌落。挑取菌絲轉(zhuǎn)接到PDA培養(yǎng)基上純化,3次轉(zhuǎn)接純化后,轉(zhuǎn)接到PDA斜面上保藏備用。

1.4 內(nèi)生真菌的菌種鑒定

1.4.1 分子鑒定 將純化好的菌種用真菌試劑盒提取總DNA。以提取的總DNA為模板,用真菌ITS rDNA通用引物(引物1序列:5’-TCCGTAGGTGAA CCTGCGG-3’;引物2序列:5’-TCCTCCGCTTATTG ATATGC-3’)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。瓊脂糖凝膠電泳檢測到目的條帶,送樣測序。得到測序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫中BLAST比對,得到相似度較高的菌株。本研究選取了在分離純化過程中重復(fù)出現(xiàn)次數(shù)較高的4株內(nèi)生真菌進(jìn)行分子鑒定。

1.4.2 形態(tài)鑒定 參照分子鑒定結(jié)果,查閱《中國真菌志》[14]和《真菌的形態(tài)和分類》[15],根據(jù)分類鑒定要求,對分子鑒定結(jié)果進(jìn)一步驗證和細(xì)分。

2 結(jié)果與分析

2.1 內(nèi)生真菌分離

在PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)5天后觀察,對照實驗沒有微生物生長,表明本實驗消毒方法可靠。以地下莖表皮接觸培養(yǎng)基的方式培養(yǎng)時(圖1A、B和C),每個培養(yǎng)皿中接種6個根段,其中約3~6個地下莖段均有微生物菌落出現(xiàn):多數(shù)是以絲狀真菌和膠質(zhì)狀菌落共存,此情況的絲狀真菌較難純化。只有少數(shù)地下莖段出現(xiàn)單一菌落(圖1B和C),但只要橫切面一端長出絲狀真菌菌落,另一端也有相同菌落生長(圖1C)。以地下莖段橫切面接觸培養(yǎng)基的方式培養(yǎng)時(圖1D、E和F),每個培養(yǎng)皿中接種10個根段,約6~8個根段均能見到絲狀真菌生長,此培養(yǎng)方式膠質(zhì)狀菌落出現(xiàn)較少,多數(shù)以單菌落的形式在上橫切面生長(圖1F和G),在下橫切面也有菌落生長(圖1E)。由圖1D、E和F實驗結(jié)果可知,絲狀真菌菌落多數(shù)從皮層組織長出,此結(jié)果與桃兒七地下莖真菌分布顯微觀察結(jié)果一致[16]。另外,實驗結(jié)果還表明:從同一條地下莖分離到內(nèi)生菌相似度較高;同一株不同地下莖內(nèi)生菌的差異較大。

A:對照組;B~F:實驗組圖1 桃兒七地下莖內(nèi)生真菌在PDA培養(yǎng)基上的生長情況

2.2 內(nèi)生真菌純化

將PDA平板上地下莖段長出的菌絲分別挑去到PDA培養(yǎng)基上純化,直到純化PDA平板上長出單一菌落(見圖2),一般純化2~3次即可得到單一菌落。本實驗從興隆山一株桃兒七地下莖用PDA培養(yǎng)基共分離到20株內(nèi)生真菌。

圖2 桃兒七地下莖內(nèi)生真菌純化的部分單菌落菌株

2.3 內(nèi)生真菌鑒定

2.3.1 分子鑒定 鑒定結(jié)果表明它們分別是:赭曲霉Aspergillusochraceus;Eucasphaeriacapensis;白僵菌屬真菌Beauveriasp.和鐮孢菌屬真菌Fusariumsp.

2.3.2 形態(tài)學(xué)鑒定 4株內(nèi)生真菌的分類地位、形態(tài)特征和基物見表1。通過形態(tài)鑒定[14-15]進(jìn)一步將白僵菌鑒定到種,確定為布氏白僵菌Beauvetiabrongniaritii。

表1 4株桃兒七內(nèi)生真菌的分類地位、形態(tài)和基物

3 討論

3.1 內(nèi)生菌分離方法可行性和局限性

賈粟等[2]采用桃兒七地下莖表面消毒后,用無菌刀片除去外部組織,再將內(nèi)部組織切成0.5 cm×0.5 cm小片種植于PDA培養(yǎng)基上等方法來分內(nèi)生菌。黃杰超等[16]對桃兒七地下莖連續(xù)切片觀察,發(fā)現(xiàn)較粗的地下莖菌絲分布幾率較少,而且內(nèi)生真菌僅存在于皮層細(xì)胞的一至二層處。本研究也曾嘗試用此方法分離桃兒七地下莖內(nèi)生真菌,但發(fā)現(xiàn)除去根外部組織的步驟不僅操作復(fù)雜、容易交叉污染的同時,還容易破壞皮層細(xì)胞,不易觀察到內(nèi)生真菌的著生位點和較純的菌落。利用本研究提供的內(nèi)生真菌分離方法,能可靠的分離純化到根部內(nèi)生真菌。該方法簡單、易于操作。張昆等[8]、楊顯志[9]和李海燕等[6,12]利用該方法成功的分離到多株桃兒七內(nèi)生真菌,但他們沒有提供內(nèi)生菌分離的試驗圖片。本研究提供了內(nèi)生菌的分離圖片,能清晰看到內(nèi)生真菌的著生部位,菌絲、孢子和菌落的生長情況,驗證了該方法對植物根或地下莖內(nèi)生真菌分離的可行性和可靠性。

大量的顯微觀察研究發(fā)現(xiàn)植物根部內(nèi)生真菌菌絲的侵染部位主要集中在皮層細(xì)胞的某些區(qū)域,并不侵染內(nèi)皮層和維管束[16-18]。圖1D、E和F的研究結(jié)果從可培養(yǎng)微生物的角度進(jìn)一步驗證了內(nèi)生真菌只集中在皮層細(xì)胞的某些區(qū)域。因此,在對植物根部內(nèi)生真菌分離時,選擇根的合適部位和可靠的分離方法是十分必要的。

3.2 分子鑒定和形態(tài)鑒定相結(jié)合的鑒定方法

對分離純化的內(nèi)生真菌先進(jìn)行分子鑒定。分子鑒定一般能鑒定到屬,在分子鑒定的基礎(chǔ)上,再有目的地開展形態(tài)鑒定,核對真菌鑒定手冊或真菌志上菌株的形態(tài)特征和培養(yǎng)特征,對分子鑒定結(jié)果進(jìn)行核對和驗證,并可以在分子鑒定結(jié)果的基礎(chǔ)上進(jìn)一步細(xì)分。例如在本研究中分子方法對白僵菌菌株只鑒定到屬,結(jié)合形態(tài)學(xué)分類將該菌株鑒定到種,為布氏白僵菌。先分子鑒定再形態(tài)鑒定,不但能減少從海量資料中查找、搜索未知菌株形態(tài)特征的時間,而且還能對分子鑒定結(jié)果進(jìn)行核實、驗證,提高鑒定結(jié)果的可靠性。

3.3 內(nèi)生真菌與宿主植物生境有關(guān)

本研究從甘肅省蘭州市榆中縣興隆山桃兒七地下莖分離到20株內(nèi)生真菌,其中有4株菌在分離過程中重復(fù)出現(xiàn),經(jīng)鑒定這4株菌分別是赭曲霉Aspergillusochraceus,Eucasphaeriacapensis,布氏白僵菌Beauvetiabrongniaritii和鐮孢菌Fusariumsp.,因此榆中縣興隆山桃兒七地下莖的優(yōu)勢屬為Aspergillus,Eucasphaeria,Beauvetia和Fusarium。李海燕等[6]從采自云南省中甸縣桃兒七地下莖中分離到28株內(nèi)生真菌,并篩選出產(chǎn)活性物質(zhì)的內(nèi)生真菌。楊顯志等[9]也從云南省中甸縣桃兒七地下莖中分離到28株內(nèi)生真菌并對其分類鑒定,其中叢梗孢屬M(fèi)onilia和青霉屬Penixillium是優(yōu)勢屬,木霉屬Trichoderma、毛霉屬M(fèi)ucor和毛殼菌屬Chaetomium是常見屬,無孢菌群Myceliasterilia、交鏈孢屬Alternaria、曲霉屬Aspergillus和莖點霉屬Phoma為偶見。李海燕等[13]桃兒七植株采自陜西太白山自然保護(hù)區(qū),從桃兒七根、莖中共分離21株內(nèi)生真菌,其中有一株菌的菌絲和發(fā)酵液均能檢測到桃兒七生物活性物質(zhì),但未對內(nèi)生真菌鑒定。后來張昆等[8]從陜西太白山桃兒七也分離到20株內(nèi)生真菌,其中絲核菌屬Rhizoctonia2株,交鏈孢屬Alternaria1株,毛霉屬M(fèi)ucor17株。王曉鵬等[7]從云南省香格里拉仙人洞桃兒七分離到35株內(nèi)生真菌,其中鐮孢屬Fusarium、柱孢屬Cylindrocarpon和色串孢屬Torula為活性物質(zhì)生產(chǎn)菌??梢姡坏貐^(qū)分離到內(nèi)生真菌數(shù)量差別很小,而不同來源的桃兒七地下莖內(nèi)生真菌的種類和豐度存在顯著差異。

曲霉屬Aspergillus內(nèi)生真菌在云南省中緬縣的桃兒七地下莖中是偶見屬,卻是甘肅省榆中縣興隆山桃兒七地下莖的優(yōu)勢屬;而在陜西省太白山自然保護(hù)區(qū)和云南省香格里拉仙人洞生長的桃兒七地下莖中未見報道。Eucasphaeriacapensis是2007年Crous等[19]從澳大利亞和南非桉樹葉中發(fā)現(xiàn)的新種;有報道表明E.capensis是傘形科阿魏屬植物常見的內(nèi)生真菌[20];金輝等[21]從甘肅省榆中縣萃英山采集的瑞香狼毒植物中也分離到該菌,本研究從榆中縣興隆山的桃兒七地下莖也分離到該菌,而且是桃兒七地下莖的優(yōu)勢屬之一。興隆山和萃英山均在榆中縣境內(nèi),但兩山植被和地質(zhì)結(jié)構(gòu)差異巨大,興隆山是祁連山山系東延部分,是石質(zhì)山地;而萃英山為黃土高原典型的土梁山,在不同植物中均能分離到E.capensis內(nèi)生真菌,而陜西省太白山自然保護(hù)區(qū)、云南省香格里拉仙人洞和中緬縣的桃兒七地下莖中均未分離到該菌,表明內(nèi)生真菌與宿主植物生長的地理位置有一定的關(guān)系。冬蟲夏草屬Cordyceps也是榆中縣興隆山桃兒七地下莖內(nèi)生真菌的優(yōu)勢屬之一,在其它地方的桃兒七地下莖中還未見報道。鐮孢屬Fusarium也是榆中縣興隆山桃兒七地下莖內(nèi)生真菌的優(yōu)勢屬之一,王曉鵬等[7]從云南省香格里拉仙人洞桃兒七也分離到產(chǎn)活性物質(zhì)的鐮孢屬Fusarium內(nèi)生真菌??梢?,桃兒七內(nèi)生真菌種類和數(shù)量與生境密切相關(guān)。因此,不同產(chǎn)地桃兒七地下莖鬼臼脂素的含量也存在差異,甘肅桃兒七地下莖鬼臼脂素的含量最高為4.2%,陜西次之為3.4%,西藏為3.1%,青海鬼臼脂素的含量最少為2.7%,這些差異可能與內(nèi)生菌的優(yōu)勢菌群和宿主植物生境密切相關(guān)。

3.4 存在問題及下一步研究計劃

本研究僅對重復(fù)分離到的4株菌株進(jìn)行了分類學(xué)鑒定,剩余的16株內(nèi)生真菌還需要進(jìn)一步分離鑒定。另外,還需從20株內(nèi)生真菌中篩選出產(chǎn)鬼臼毒素及其結(jié)構(gòu)類似物等藥用活性成分的優(yōu)良菌株。

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IsolationandIdentificationofEndophyticFungiObtainedfromUndergroundStemsofSinopodophyllumhexandrum

ZHUYing1,2,WANGZhiYe1,YANGHui1*,ZHOUJianping1*

(1.InstituteofBiology,GansuAcademyofSciences,Lanzhou730000,China) (2.StateKeyLaboratoryofGrasslandAgro-ecosystems,SchoolofLifeSciences,LanzhouUniversity,Lanzhou730000,China)

Objective:This study investigated the diversity and abundance of endophytic fungi ofSinopodophyllumhexandrumin Xinglong Mountain,Gansu Province,in order to provide a new way for obtaining podophyllotoxin from endophytic fungi,and protect endangered medicinal plants.Methods:TheS.hexandrumendophytic fungi were isolated by tissue culture method,and identified with molecular and morphological data.Results:Twenty endophytic fungi were obtained fromS.hexandrumunderground stems,and four recurring endophytic fungi were identified asAspergillusochraceus,Eucasphaeriacapensis,BeauvetiabrongniaritiiandFusariumsp.Conclusion:Endophytic fungi diversity and abundance were related with host plants and environments,and the dominant endophytic genera inS.hexandrumin Xinglong Mountain areAspergillus,Eucasphaeria,BeauvetiaandFusarium.

Sinopodophyllumhexandrum;tissue culture;endophytic fungi;molecular identification;morphological identification

10.13313/j.issn.1673-4890.2015.6.013

2014-11-05)

國家科技支撐計劃(2012BAD14B10);科技部國際合作項目(2013DFA30950);國家星火計劃項目(2010GA860003);甘肅省民生計劃項目(1209FCMA003);甘肅省青年科技基金計劃(1208RJYA058);甘肅省科學(xué)院開發(fā)與應(yīng)用基金項目(2012JK-03);甘肅省科學(xué)院青年基金項目(QN-2014-03)

*

楊暉,研究員,研究方向:藥用植物生態(tài)學(xué);Tel:(0931)8613554;E-mail:yanghui43@126.com 周劍平,研究員,研究方向:資源微生物應(yīng)用;Tel:(0931)8613554;E-mail:zhjp8818@163.com

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基于高光譜技術(shù)的菌落圖像分割與計數(shù)
植物內(nèi)生菌在植物病害中的生物防治
內(nèi)生微生物和其在作物管理中的潛在應(yīng)用
“黨建+”激活鄉(xiāng)村發(fā)展內(nèi)生動力
授人以漁 激活脫貧內(nèi)生動力
榆中縣中、小學(xué)校園足球開展現(xiàn)狀與對策研究
榆中縣精準(zhǔn)扶貧過程中農(nóng)民參與度調(diào)查研究
“菌落總數(shù)”詳解