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那些可以“扔掉”的人類基因

2015-07-08 00:55胡德良
關(guān)鍵詞:冰島人解碼基因組

胡德良

2015年3月25日,研究人員公布了規(guī)模最大的一套完整基因組信息,這些基因組來自單一的人類群體——冰島人。

這項浩大的工程由冰島一家私營公司——基因解碼公司實施,該公司找到了具有致病風(fēng)險的新基因,對人類進化提出了深刻的見解,還列出了人類可以“扔掉”的一千多個基因。

這項研究的主持人、基因解碼公司執(zhí)行總裁卡里·斯特凡松說:“對于那些為研究個性化醫(yī)療而努力為本國人進行DNA測序的國家,該工程也樹立了一個榜樣。例如,美國正計劃在接下來的幾年對100萬本國人的基因組進行測序,然后利用這些數(shù)據(jù)來制訂個性化治療方案?!?/p>

供職于馬薩諸塞州波士頓市麻省總醫(yī)院和劍橋市布羅德研究所的人類遺傳學(xué)家丹尼爾·麥克阿瑟說:“基因解碼公司這項研究是一項了不起的工程,這樣的工程在五年之前是不可能做到的?!?/p>

基因解碼公司是冰島首都雷克雅未克一家富有爭議的公司。19年前,該公司著手通過采集冰島人致病基因的遺傳和醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)來進行藥物開發(fā)。雖然當(dāng)時沒有獲得全國健康檔案,但所招募的志愿者代表了目前冰島人口的40%以上。該公司最終倒閉,后來于2012年末被安進公司收購并改制。

自始至終,基因解碼公司發(fā)表了大量有關(guān)遺傳變異的論文,通常涉及精神分裂癥、糖尿病、癌癥和其他疾病,公司通過對比分散在健康人基因組和病人基因組中的標(biāo)記物來進行研究。

多虧現(xiàn)在廉價的基因組測序技術(shù),基因解碼公司得以對2636位冰島人的全部基因組進行測序,并梳理了測序結(jié)果,以便尋找更罕見的突變現(xiàn)象。

利用該國的系譜記錄和已采集的標(biāo)記物數(shù)據(jù),基因解碼公司還計算出10多萬其他人中哪些人攜帶著這些變異體。不久前,《自然·遺傳學(xué)》雜志在線發(fā)表的一篇綜述論文和三篇相關(guān)論文中,基因解碼公司提供了一份樣本資料,說明了這些數(shù)據(jù)所揭示的情況。

該公司發(fā)現(xiàn)了幾種新的致病基因,其中包括基因ABCA7的突變體;這種突變體能使具有歐洲血統(tǒng)的人罹患阿爾茨海默氏癥的風(fēng)險加倍。以前的遺傳標(biāo)記物研究曾經(jīng)指向這一基因,但當(dāng)時無法確定到底是由哪些特定的高風(fēng)險變體致病的。

另外一篇論文對Y染色體變異的速度進行了評估分析,結(jié)果表明:通過父系而追溯到的距離現(xiàn)在最近的人類共同祖先,他們大約生活在23.9萬年前,比以前認(rèn)為的時間幾乎推后了10萬年?;蚪獯a公司的安格納·赫爾加松說,新發(fā)現(xiàn)的Y染色體變異速度將有助于精確界定人類進化過程中主要事件發(fā)生的年代。

冰島人的基因組中還有大量所謂的人類淘汰基因。大約有兩萬人,他們攜帶著某種基因的無功能復(fù)制本,意味著他們的細(xì)胞不會制造出該基因的蛋白質(zhì)。如果說這種淘汰基因在某種程度上能對人們起到抗病保護的作用,那么攜帶這種基因的人可能有助于揭示許多基因的功能,或許也會指向新的藥物靶點。

基因解碼公司發(fā)現(xiàn),8000多名冰島人攜帶著1171個淘汰基因,其中許多很可能是多余和不必要的,或者說是去除后不影響健康的。在這些淘汰基因中有3%參與氣味辨別,它們對于古人類來說可能很重要,但對于現(xiàn)代人類來說就不重要了。

然而,有些淘汰基因可能仍有利用價值,比如一對可能跟聽覺有關(guān)的基因?,F(xiàn)在,基因解碼公司計劃對缺少某種功能性基因的人進行臨床試驗,以便使研究人員明白那些淘汰基因起什么作用。

斯特凡松說:“這只不過剛剛觸及到問題的表面?!丙溈税⑸Q,他們的研究肯定還有其他發(fā)現(xiàn),只是目前安進公司對外保密?!昂苊黠@,他們在這些論文中沒有透露所有的情況?!?/p>

遺傳學(xué)家們認(rèn)為,要想確定哪一部分人可能攜帶引發(fā)疾病的有害突變基因,以及這些不良影響能否通過其他基因得到緩解,建立大量人口的基因數(shù)據(jù)庫必不可少。

這種數(shù)據(jù)庫也是美國總統(tǒng)奧巴馬提出的“精準(zhǔn)醫(yī)療計劃”中的目標(biāo)之一,而“精準(zhǔn)醫(yī)療計劃”的中心環(huán)節(jié)就是針對100萬美國人的基因組進行研究。這項計劃帶來的益處將是極大的。(譯據(jù)美國《科學(xué)》)

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