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全文檢索引擎技術(shù)在電子病歷中的應(yīng)用

2015-05-04 17:54趙景越徐松青蔡連忠
關(guān)鍵詞:電子病歷全文檢索

趙景越++徐松青++蔡連忠

摘要:針對醫(yī)院臨床電子病歷數(shù)據(jù)大量積累無法快速、高效地服務(wù)于臨床醫(yī)療、醫(yī)學科研、以及病例管理的現(xiàn)象,提出研究更高效的電子病歷檢索方法,采用全文索引搜索引擎技術(shù),以關(guān)鍵字為索引,把電子病歷統(tǒng)一轉(zhuǎn)換成XML形式,最后生成病歷檢索索引文件方式,建立電子病歷全文檢索系統(tǒng)。系統(tǒng)通過實際數(shù)據(jù)測試表明,該檢索方法準確率較高、檢索速度快。

關(guān)鍵詞:電子病歷 全文檢索 XML

中圖分類號:R197.324 文獻標識碼:A 文章編號:1007-9416(2014)12-0089-02

1 引言

隨著信息化技術(shù)的飛速發(fā)展,計算機技術(shù)越來越多地應(yīng)用到了醫(yī)療領(lǐng)域。近年來醫(yī)療行業(yè)大力加強信息化建設(shè),建立和完善以電子病歷為核心的醫(yī)院信息系統(tǒng)。電子病歷作為臨床信息的載體以及醫(yī)院信息系統(tǒng)的核心構(gòu)成了醫(yī)療衛(wèi)生決策等系統(tǒng)的基礎(chǔ)。目前很多醫(yī)院患者電子病歷內(nèi)容存儲比較分散,例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲在HIS里、檢驗結(jié)果存儲在LIS系統(tǒng),手麻等檢查報告存儲在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中,如果要獲取患者全部病歷信息只能通過患者ID號來查詢,然后通過病歷的存儲規(guī)則來找到相應(yīng)的病歷,再通過顯示規(guī)則加以排列顯示。每次得到的信息都是分散的,而且存儲方式各不相同,存在于病歷文本中的大量非結(jié)構(gòu)化的信息也不能作為檢索條件,因而很多醫(yī)療數(shù)據(jù)不能為醫(yī)療工作者充分利用,大大降低臨床數(shù)據(jù)利用效率。因此,為了滿足醫(yī)生臨床診療需求、科研輔助需要,醫(yī)院電子病歷管理系統(tǒng)的現(xiàn)行檢索查詢處理方式問題亟待解決。為此,我們提出了,將所有病歷文件統(tǒng)一轉(zhuǎn)換,統(tǒng)一識別,再采用以基于關(guān)鍵字的全文檢索引擎技術(shù),建立電子病歷全文檢索系統(tǒng),實現(xiàn)方便、快捷地為臨床醫(yī)療、醫(yī)學科研及病歷管理等方面工作提供服務(wù)。

2 全文檢索引擎簡介

全文檢索是指計算機索引程序通過掃描文章中的每一個詞,并收集文章內(nèi)容到本地,對文章內(nèi)容及分詞建立索引,經(jīng)過加工處理建立信息數(shù)據(jù)庫和索引數(shù)據(jù)庫,指明該詞在文章中出現(xiàn)文章和次數(shù),當用戶查詢時,檢索程序就根據(jù)事先建立的索引進行查找,并將查詢結(jié)果反饋給用戶的檢索方式,從而對用戶提出的各種檢索作出響應(yīng),提供用戶所需的信息或相關(guān)指針。

3 電子病歷數(shù)據(jù)處理

目前由于醫(yī)院意識到電子病歷在醫(yī)院信息系統(tǒng)建設(shè)中的核心重要性,紛紛加強電子病歷信息化建設(shè),實現(xiàn)病歷記錄貫穿于患者在醫(yī)院就診的各個環(huán)節(jié)中,實現(xiàn)以統(tǒng)一視圖方式展現(xiàn)患者臨床病歷信息。但由于國內(nèi)醫(yī)療信息化建設(shè)歷史原因,很多醫(yī)院病人電子病歷內(nèi)容存儲比較分散,例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲在HIS里、檢驗結(jié)果存儲在LIS系統(tǒng),手麻等檢查報告存儲在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中;為此有必要進行統(tǒng)一整合,將分散在院內(nèi)各系統(tǒng)的電子病歷信息轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一形式的文件存儲于電子病歷庫中。

可擴展標記語言(eXtensible Markup Language,簡稱XML)就是建立并實現(xiàn)該統(tǒng)一轉(zhuǎn)換模型的一個有效手段。XML是一種置標語言,置標指計算機所能理解的信息符號,通過此種標記,計算機之間可以處理包含各種信息的文章等。它與HTML一樣,都是SGML(標準通用標記語言)。XML是互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境中跨平臺的,依賴于內(nèi)容的技術(shù),是當前處理結(jié)構(gòu)化文檔信息的有力工具。XML同時也是一種簡單的數(shù)據(jù)存儲語言,使用一系列簡單的標記描述數(shù)據(jù),而這些標記可以用方便的方式建立。

為此將要先定義、規(guī)范病歷內(nèi)容的結(jié)構(gòu),然后將臨床各系統(tǒng)中關(guān)于患者的病歷數(shù)據(jù)進行抽取、整合、轉(zhuǎn)換成電子病歷架構(gòu)的符合格式,生成描述患者病歷的XML文件,作為患者病歷存儲檢索管理的基本單位。

4 系統(tǒng)設(shè)計( 圖1)

系統(tǒng)將來自各系統(tǒng)(HIS、電子病歷、LIS等)的臨床科研數(shù)據(jù)進行采集,并生成對應(yīng)的XML格式,再根據(jù)XML格式數(shù)據(jù)建立全文索引,形成全文索引庫;完成臨床科研數(shù)據(jù)積累;完成數(shù)據(jù)收集后,系統(tǒng)提供全文索引查詢功能,根據(jù)查詢結(jié)果,系統(tǒng)可以直接顯示該病歷文件詳細信息,還可以關(guān)聯(lián)顯示該患者對應(yīng)的病案,方便科研人員隨時調(diào)閱分析。

5 系統(tǒng)測試

5.1 服務(wù)器端軟件環(huán)境

服務(wù)器采用Sun公司的JDK 1.5.0版本,應(yīng)用容器采用開源免費JBOSS4.0.4版本。

服務(wù)器操作系統(tǒng)采用微軟的Windows Server 2008企業(yè)版。

服務(wù)器數(shù)據(jù)庫采用SQL Server 2008企業(yè)版及SQL JDBC驅(qū)動。

客戶端支持通用瀏覽器,本案例測試中采用了IE8。

5.2 服務(wù)器端硬件環(huán)境

服務(wù)器采用的CPU為Inter Core2 Quad CPU Q8200 2.33GHz,內(nèi)存4GB,硬盤1TGB

5.3 測試結(jié)果

針對醫(yī)院測試庫中2萬名患者,約120萬份電子病歷文件,轉(zhuǎn)換生成XML文件,建立索引,形成全文索引庫,輸入條件“男”、“骨折”、“髖部”,如圖2:

系統(tǒng)在2秒左右時間搜索到滿足條件的文檔78761份,并按檢索條件關(guān)聯(lián)度進行排序,以患者姓名、性別、年齡、病歷類別作為標題,同時簡略顯示關(guān)鍵詞在文件中位置并加以警示;單擊標題便可以瀏覽病歷詳細信息。通過上述查詢測試可以看出,本系統(tǒng)實現(xiàn)了電子病歷一體化,檢索定位準確率高,達到了系統(tǒng)應(yīng)用的性能要求。

6 結(jié)語

根據(jù)以上測試結(jié)果可以看出系統(tǒng)性能出眾,滿足當前設(shè)計要求;不僅能基于關(guān)鍵字快速檢索,大大提高病歷檢索速度,同時實現(xiàn)查詢結(jié)果與電子病歷無縫對接,直接通過滿足條件的查詢結(jié)果可以打開病歷文件,瀏覽該患者病案內(nèi)容(護理文書、醫(yī)師病歷、檢查結(jié)果、檢驗結(jié)果、醫(yī)囑等),大大提高臨床科研效率。

參考文獻

[1]基于語義的電子病歷智能全文檢索[J].醫(yī)療衛(wèi)生裝備,2008.

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