鄭 躍,裴慶慧,葛喜珍,田平芳,*
(1.北京化工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,北京100029;2.北京聯(lián)合大學(xué)生物化學(xué)工程學(xué)院,北京100023)
超表達(dá)葡萄糖脫氫酶促進(jìn)大腸桿菌生長
鄭 躍1,裴慶慧2,葛喜珍2,田平芳1,*
(1.北京化工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,北京100029;2.北京聯(lián)合大學(xué)生物化學(xué)工程學(xué)院,北京100023)
通過PCR擴(kuò)增了肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)和大腸桿菌(Escherichia coli)各自的葡萄糖脫氫酶基因KPgdh和ECgdh,構(gòu)建了表達(dá)載體pET-28a-KPgdh和pET-28a-ECgdh,轉(zhuǎn)化大腸桿菌E.coli BL21,獲得了重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)。經(jīng)IPTG誘導(dǎo),聚丙烯酰胺凝膠電泳顯示重組菌實(shí)現(xiàn)了葡萄糖脫氫酶的高效表達(dá),且葡萄糖脫氫酶活性分別是空質(zhì)粒對照菌E.coli BL21(pET-28a)的8.5倍和12倍。重組菌的生長速度快于空質(zhì)粒對照菌E.coli BL21(pET-28a),并與原代菌E.coli BL21持平。如果扣除質(zhì)粒復(fù)制造成的代謝負(fù)荷,過表達(dá)葡萄糖脫氫酶促進(jìn)了大腸桿菌的生長。
大腸桿菌,肺炎克雷伯氏菌,葡萄糖脫氫酶,超表達(dá),細(xì)胞生長
葡萄糖脫氫酶(Glucose dehydrogenase)廣泛存在于生物體,如牛心臟、大腸桿菌、洋蔥伯克霍爾德菌(Burkholderiacepacia)、弱氧化葡糖桿菌(Gluconobacter suboxydans)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)等[1-4]。葡萄糖脫氫酶在食品領(lǐng)域有重要的作用,它參與磷酸戊糖途徑,以NAD+(NADP+)為輔基,特異催化β-D-葡萄糖生成葡萄糖酸[5-6],進(jìn)而與鈣鹽反應(yīng)生成可促進(jìn)人體補(bǔ)鈣吸收的葡萄糖酸鈣[7]。D-核糖是一種核苷酸衍生物,可用于生產(chǎn)調(diào)味品、香精等食品添加劑,還具有保健的功效[8]。葡萄糖脫氫酶是合成D-核糖的限速酶,其活力與D-核糖的產(chǎn)量密切相關(guān)[9]。此外葡萄糖脫氫酶和果糖轉(zhuǎn)移酶組成的系統(tǒng)能夠有效降低葡萄糖的含量,從而大大提高低聚果糖的純度[10]。肺炎克雷伯氏菌雖有一定致病性,但能高產(chǎn)3-羥基丙酸、1,3-丙二醇、2,3-丁二醇等高值化合物,是有潛力的工業(yè)微生物[11];肺炎克雷伯氏菌能利用甘油、葡萄糖等多種碳源快速生長,較大腸桿菌而言,其生長更旺盛,碳源代謝能力更強(qiáng)。研究其葡萄糖脫氫酶有望獲得生長迅速的工程菌。
本研究以大腸桿菌E.coli BL21為宿主,以pET-28a為載體,由IPTG誘導(dǎo)T7啟動(dòng)子來表達(dá)不同來源的GDH基因,測定催化活性及生長速度,旨在探索超表達(dá)葡萄糖脫氫酶對菌體生長的促進(jìn)作用,且研究了葡萄糖脫氫酶異源表達(dá)對其活性是否存在影響,為葡萄糖脫氫酶的開發(fā)及其在食品領(lǐng)域的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。
1.1 材料與儀器
大腸桿菌E.coli DH5α、肺炎克雷伯氏菌K.pneumoniae MGH78578//大腸桿菌E.coli BL 21、質(zhì)粒pET-28a 由本實(shí)驗(yàn)室保存;限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、SacⅠ和HindⅢ TaKaRa公司;T4 DNA連接酶 NEB公司;Taq DNA聚合酶、蛋白質(zhì)分子質(zhì)量標(biāo)記、DNA分子量Marker、硫酸卡那霉素 北京全新拓達(dá)公司;質(zhì)粒提取試劑盒、DNA產(chǎn)物回收試劑盒以及切膠回收試劑盒 北京博邁德生物公司。
JA1003B型電子天平 上海越平科學(xué)儀器有限公司;TGL-16B型高速離心機(jī) 上海安亭科學(xué)儀器廠;LRH70型培養(yǎng)箱 上海一恒科技有限公司;GT9612型PCR儀 BIOGENER;H2O3-PRO金屬浴 金銀杏生物科技有限公司;THZ-C型恒溫振蕩器 太倉市儀器設(shè)備廠;10011624型分光光度計(jì) 上海奧普勒儀器有限公司;FluorChemTM5500凝膠成像儀 安萊(美國);DYY-8C型電泳儀 北京市六一儀器廠;SCL-10A型高效液相色譜 島津(日本);TY-80A/S型脫色搖床 江蘇榮華儀器制造有限公司。
1.2 培養(yǎng)基的配制
LB液體培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,氯化鈉10 g/L,pH7.0;LB固體培養(yǎng)基需加入瓊脂15 g/L;M9發(fā)酵培養(yǎng)基:5×M9鹽溶液 200 mL,1 mol/L MgSO4·7H2O 2 mL,20%葡萄糖20 mL,1 mol/L CaCl20.1 mL,添加去離子水至1000 mL;5×M9鹽溶液(200 mL):Na2HPO4·12H2O 17.1 g,KH2PO43 g,NaCl 0.5 g,NH4Cl 1 g。
1.3 基因克隆與表達(dá)
1.3.1 葡萄糖脫氫酶基因的克隆 根據(jù)GenBank公布的肺炎克雷伯氏菌和大腸桿菌的gdh基因序列設(shè)計(jì)引物。分別在肺炎克雷伯氏菌gdh基因上下游引入EcoRⅠ和SacⅠ酶切位點(diǎn),大腸桿菌gdh基因上下游分別引入EcoRⅠ和HindⅢ酶切位點(diǎn)。分別以肺炎克雷伯氏菌和大腸桿菌基因組DNA為模板擴(kuò)增其各自的gdh基因。設(shè)計(jì)引物如表1所示。
表1 引物序列Table 1 Primer sequences
1.3.2 表達(dá)載體的構(gòu)建 PCR產(chǎn)物回收后酶切,與載體pET-28a連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至E.coli DH5α,涂布含有硫酸卡那霉素的抗性平板,37℃靜置培養(yǎng)18 h,挑取陽性克隆,進(jìn)行菌落PCR及質(zhì)粒雙酶切鑒定。
1.3.3 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主 制備大腸桿菌E.coli BL 21感受態(tài),分別將鑒定正確的兩個(gè)重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coli BL21,得到重組菌BL21(pET28a-KPgdh)和BL21(pET28a-ECgdh)。
1.3.4 重組菌的表達(dá) 分別接種空白菌E.coli BL21(pET-28a)、重組菌BL21(pET28a-KPgdh)和BL21(pET28a-ECgdh)于M9發(fā)酵培養(yǎng)基,pET-28a質(zhì)粒因采用T7啟動(dòng)子,需用IPTG誘導(dǎo)來表達(dá)葡萄糖脫氫酶。由于IPTG對菌體生長有一定影響,故本實(shí)驗(yàn)在37℃,200 r/min培養(yǎng)至OD600=0.6時(shí),加入IPTG至終濃度1 mmol/L,37℃低溫誘導(dǎo)6 h,收集菌體進(jìn)行SDSPAGE分析,5%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))濃縮膠,10%分離膠。
1.4 分析方法
以未轉(zhuǎn)化重組質(zhì)粒的原代大腸桿菌E.coli BL21及攜帶空質(zhì)粒的大腸桿菌E.coli BL21(pET-28a)作為空白對照,每隔3 h測一次菌體濃度和葡萄糖含量,生物量測定采用比濁法[12],葡萄糖含量測定采用3,5-二硝基水楊酸法[13]。取發(fā)酵液稀釋至合適倍數(shù),生長曲線和葡萄糖含量分別用分光光度計(jì)測定吸光度OD600和OD520。
1.5 酶活性的測定
本研究采用超聲破碎細(xì)胞,取發(fā)酵液離心8000 r/min,收集菌體,在4℃條件下用pH7.4的PBS緩沖液重懸,超聲破碎,破碎條件為100 W,工作3 s,間隔2 s,循環(huán)50次,12000 r/min離心5 min,取上清作為粗酶液。
酶活測定體系為2 mL,即200 μmol/L D-葡萄糖,4 μmol/L NAD,1.2 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),20 nmol/L MnSO4,200 μL粗酶液。
酶活測定反應(yīng)在37℃進(jìn)行,通過檢測340 nm處吸光度的增量來確定反應(yīng)體系中NADH的生成量,酶單位定義:37℃下,每分鐘催化生成1 μmol NADH的酶量即為一個(gè)酶活力單位。
圖1 K.pneumoniae和E.coli中g(shù)dh基因的PCR擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of KPgdh and ECgdh genes from K.pneumoniae and E.coli
2.1 gdh基因的克隆
2.1.1 gdh基因的克隆 分別以肺炎克雷伯氏菌和大腸桿菌基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增葡萄糖脫氫酶基因gdh,結(jié)果如圖1所示。
2.1.2 表達(dá)載體的構(gòu)建及轉(zhuǎn)化E.coli BL21 提取表達(dá)載體質(zhì)粒并進(jìn)行雙酶切鑒定,結(jié)果如圖2所示。酶切結(jié)果與理論預(yù)期相符,表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。將重組質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中,陽性克隆分別命名為BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh),用于蛋白表達(dá)及發(fā)酵實(shí)驗(yàn)。
圖2 pET-28a-gdh的雙酶切鑒定Fig.2 Identification of pET-28a-gdh by restriction digestion
2.2 重組菌中葡萄糖脫氫酶基因的表達(dá)
將重組質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化E.coli BL 21,重組菌和對照菌搖瓶培養(yǎng),進(jìn)行總蛋白的SDS-PAGE分析。由圖3可知,重組菌中的葡萄糖脫氫酶均高效表達(dá),分子量大小約為87000 u,符合預(yù)期。
圖3 兩種重組大腸桿菌的蛋白電泳Fig.3 SDS-PAGE analysis of two recombinant E.coli strains
2.3 重組菌的發(fā)酵
用M9培養(yǎng)基發(fā)酵,以空質(zhì)粒E.coli BL21(pET-28a)和原代菌E.coli BL21為對照組,以重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)為實(shí)驗(yàn)組,發(fā)酵24 h,每3 h用分光光度計(jì)測量其600 nm處的吸光值,繪制生長曲線,結(jié)果如圖4。由圖4可知,原代菌E.coli BL21在培養(yǎng)9~12 h后達(dá)到平穩(wěn)期,而攜帶空質(zhì)粒的對照菌E.coli BL21(pET-28a)因質(zhì)粒負(fù)荷而生長滯后。無論重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)還是BL21(pET-28a-ECgdh),其生物量均高于攜帶空質(zhì)粒的對照菌E.coli BL21(pET-28a),而與原代菌基本持平。重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)攜帶的質(zhì)粒大于空質(zhì)粒,其中的葡萄糖脫氫酶過表達(dá)必然消耗轉(zhuǎn)錄和翻譯資源,盡管如此,這兩菌的生物量均高于空質(zhì)粒重組菌,表明過表達(dá)葡萄糖脫氫酶促進(jìn)了菌體生長。Zhu等在研究枯草芽孢桿菌的核黃素生成時(shí),發(fā)現(xiàn)過表達(dá)葡萄糖脫氫酶能促進(jìn)菌體生長,重組菌的生長速率和生物量均高于對照菌[14]。Duan等的報(bào)道也與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果相符[15]。這些結(jié)果表明葡萄糖脫氫酶的表達(dá)與細(xì)胞生長有關(guān)。
圖4 重組大腸桿菌的生長曲線Fig.4 Growth curve of two recombinant E.coli strains
2.4 葡萄糖剩余量的測定
用M9培養(yǎng)基發(fā)酵,以空質(zhì)粒E.coli BL21(pET-28a)和原代菌E.coli BL21為對照組,以重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)為實(shí)驗(yàn)組,發(fā)酵24 h。由圖5可知,無論重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)還是BL21(pET-28a-ECgdh),其葡萄糖消耗均與原代菌E.coli BL21基本持平,而空質(zhì)粒重組菌E.coli BL21(pET-28a)的葡萄糖消耗最慢。該結(jié)果表明重組菌BL21(pET-28a-ECgdh)和BL21(pET-28a-KPgdh)中葡萄糖脫氫酶超表達(dá)促進(jìn)葡萄糖消耗,也從而促進(jìn)了菌體生長。
葡萄糖脫氫酶參與磷酸戊糖途徑,該途徑是葡萄糖消耗的重要途徑,結(jié)果表明構(gòu)建的重組菌株在0~9 h的葡萄糖消耗速度大于空質(zhì)粒菌株,且隨著葡萄糖脫氫酶活性的提高,重組菌的生長速度也快于攜帶空質(zhì)粒的菌株,基本與原代菌持平。如果扣除質(zhì)粒復(fù)制和轉(zhuǎn)錄等造成的代謝負(fù)荷,葡萄糖脫氫酶超表達(dá)明顯促進(jìn)了菌體生長。
2.5 葡萄糖脫氫酶酶活性的測定
酶活測定反應(yīng)體系為2 mL,在37℃進(jìn)行酶催化反應(yīng),通過檢測340 nm下的吸光度變化來確定反應(yīng)體系中NADH的生成量,并用考馬斯亮藍(lán)R250標(biāo)定其總蛋白含量,計(jì)算比活力。酶活定義為37℃下每分鐘催化生成1 μmol NADH的酶量,酶活測定結(jié)果如圖6所示。由圖6可知,重組大腸桿菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)的葡萄糖脫氫酶活性分別是空質(zhì)粒對照菌E.coli BL21(pET-28a)的8.5倍和12倍。換言之,KPgdh的活性低于ECgdh,推斷與異源表達(dá)有關(guān)。由于大腸桿菌對密碼子有偏好性,而肺炎克雷伯氏菌葡萄糖脫氫酶基因KPgdh(GenBank accession No.YP_001335612)與大腸桿菌葡萄糖脫氫酶基因ECgdh(GenBank accession No.YP_003052795)的序列同源性僅為53%,KPgdh作為外源基因在大腸桿菌中表達(dá)其酶活性會(huì)降低。葡萄糖脫氫酶活性也取決于底物、輔因子、能荷水平乃至信號等多種因素。
圖6 葡萄糖脫氫酶活性Fig.6 Enzymatic activities of GDH
本文為研究超表達(dá)不同來源葡萄糖脫氫酶對菌體生長的促進(jìn)作用,分別以肺炎克雷伯氏菌和大腸桿菌基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增了各自的葡萄糖脫氫酶基因KPgdh和ECgdh,與pET-28a載體連接后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21,獲得了重組菌BL21(pET-28a-KPgdh)和BL21(pET-28a-ECgdh)。經(jīng)IPTG誘導(dǎo),重組菌可實(shí)現(xiàn)gdh的高表達(dá),且證實(shí)異源表達(dá)的葡萄糖脫氫酶活力明顯降低。重組菌以葡萄糖作為碳源在遲緩期和對數(shù)生長期生長迅速,在此時(shí)期葡萄糖消耗速率與野生菌持平,生物量較空質(zhì)粒對照菌有所提高。該研究具有雙重意義:a.葡萄糖脫氫酶是糖代謝的關(guān)鍵酶,本研究發(fā)現(xiàn)重組菌中該酶的活性很高且菌體生長加快,因此為葡萄糖的高效利用及促進(jìn)細(xì)菌生長提供了思路;b.葡萄糖脫氫酶在醫(yī)藥和食品工業(yè)有著重要作用,但目前價(jià)格昂貴,該研究為其發(fā)酵生產(chǎn)及在食品領(lǐng)域應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。
[1]Sakamoto K,Miyoshi H,Matsushita K,et al.Comparison of the structural features of ubiquinone reduction sites between glucose dehydrogenase in Escherichia coli and bovine heart mitochondrial complex I[J].Eur J Biochem,1996,237(1):128-135.
[2]Tsuya T,F(xiàn)erri S,F(xiàn)ujikawa M,et al.Cloning and functional expression of glucose dehydrogenase complex of Burkholderia cepacia in Escherichia coli[J].J Biotechnol,2006,123(2):127-136.
[3]Navanietha Krishnaraj R,Chandran S,Pal P,et al.Molecular modeling and assessing the catalytic activity ofglucose dehydrogenase of Gluconobacter suboxydans with a new approach forpowergeneration in a microbialfuelcell[J].Current Bioinformatics,2014,9(3):327-330.
[4]Park HJ,Jung J,Choi H,et al.Enantioselective bioconversion using Escherichia coli cells expressing Saccharomyces cerevisiae reductase and Bacillus subtilis glucose dehydrogenase[J].J Microbiol Biotechnol,2010,20(9):1300-1306.
[5]Siddappaji MH,Scholes DR,Bohn M,et al.Overcompensation in response to herbivory in Arabidopsis thaliana:The role of glucose-6-phosphate dehydrogenase and the oxidative pentosephosphate pathway[J].Genetics,2013,195(2):589-598.
[6]Stover NA,Dixon TA,Cavalcanti AR.Multiple independent fusions of glucose-6-phosphate dehydrogenase with enzymes in the pentose phosphate pathway[J].PLoS One,2011,6(8):e22269.
[7]Sangeetha PT,Ramesh MN,Prapulla S G.Recent trends in the microbial production,analysis and application of Fructooligosaccharides[J].Trends in Food Science&Technology,2005,16(10):442-457.
[8]周玨,魏轉(zhuǎn),孫文敬,等.D-核糖的生產(chǎn)及應(yīng)用[J].食品科技,2014,39(14):273-278.
[9]張錦芳,籍小濤,杜連祥,等.D-葡萄糖脫氫酶活力測定方法的研究-短小芽孢桿菌在D-核糖生產(chǎn)中的應(yīng)用[J].天津輕工業(yè)學(xué)院學(xué)報(bào),2001,38(3):37-40.
[10]唐江濤,覃益民,楊梅,等.利用重組葡萄糖脫氫酶提高低聚果糖純度[J].食品研究與開發(fā),2007,28(12):63-67.
[11]Ashok S,Raj S M,Rathnasingh C,et al.Development of recombinant Klebsiella pneumoniae△dhaT strain for the coproduction of 3-hydroxypropionic acid and 1,3-propanediol from glycerol[J].Applied microbiology and biotechnology,2011,90(4):1253-1265.
[12]Spiller E,Sch?ll A,Alexy R,et al.A microsystem for growth inhibition test of Enterococcus faecalis based on impedance measurement[J].Sensors and Actuators B:Chemical,2006,118(1):182-191.
[13]趙凱,許鵬舉,谷廣燁.3,5-二硝基水楊酸比色法測定還原糖含量的研究[J].食品科學(xué),2008,29(8):534-536.
[14]Zhu YB,Chen X,Chen T,Shi S B,Zhao XM Over-expression of glucose dehydrogenase improves cell growth and riboflavin production in Bacilla subtilis[J].Biotechnol Lett,2006,28(20):1667-1672.
[15]Duan YX,Chen T,Chen X,et al.Overexpression of glucose-6-phosphate dehydrogenase enhances riboflavin production in Bacillus subtilis[J].Appl Microbiol Biotechnol,2010,85(6):1907-1914.
Overexpression glucose dehydrogenase can promote the growth of recombinant Escherichia coli
ZHENG Yue1,PEI Qing-hui2,GE Xi-zhen2,TIAN Ping-fang1,*
(1.College of Life Science and Technology,Beijing University of Chemical Technology,Beijing 100029,China;2.College of Biochemical Engineering,Beijing Union University,Beijing 100023,China)
The genes encoding glucose dehydrogenase(gdh)from Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli were amplified by polymerase chain reaction(PCR).Subsequently,the corresponding expression vectors pET-28a-KPgdh and pET-28a-ECgdh were constructed and cloned into E.coli BL21,resulting in two recombinant strains E.coli(pET-28a-KPgdh)and E.coli(pET-28a-ECgdh).SDS-PAGE analysis showed the high level expression of both KPgdh and ECgdh upon IPTG induction.Compared with the control strain E.coli(pET-28a)which harbored an empty vector,the recombinant strains E.coli(pET-28a-KPgdh)and E.coli(pET-28a-ECgdh)consumed more glucose,and the gdh activity toward glucose increased by 8.5-and 12-fold,respectively.If plasmid burden was not counted,overall these results indicated that gdh overexpression facilitated cell growth.
Escherichia coli;Klebsiella pneumoniae;glucose dehydrogenase;overexpression;cell growth
TS201.3
A
1002-0306(2015)22-0189-05
10.13386/j.issn1002-0306.2015.22.031
2015-02-02
鄭躍(1989-),女,碩士,研究方向:微生物與分子生物學(xué),E-mail:yueyue_0307@126.com。
*通訊作者:田平芳(1965-),男,博士,教授,研究方向:合成生物學(xué),E-mail:tianpf@mail.buct.edu.cn。
國家自然科學(xué)基金(21076013,21276014)。