王明慧 毛鈺霞 許雅香
摘要:絲氨酸蛋白酶抑制劑超基因蛋白質(zhì)家族,參與調(diào)節(jié)昆蟲體內(nèi)多種生理反應(yīng)。本研究在體外原核表達(dá) 6His-Bmserpin-3,以此作為餌蛋白,采用His-pull down技術(shù)及SDS-PAGE分析,從家蠶血液中篩選出了能與 Bmserpin-3 結(jié)合的2個蛋白質(zhì),分子量分別為83.04、83.57 ku。對家蠶幼蟲sp-2、sp-3在不同組織的表達(dá)變化分析可知,sp-2 在脂肪體、血淋巴中表達(dá)量比較高,sp-3在精巢、脂肪體、血淋巴里表達(dá)量比較高。
關(guān)鍵詞:家蠶;pull-down;蛋白相互作用
中圖分類號: S881.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2015)01-0037-03
收稿日期:2014-03-03
基金項目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(編號:CARS-22);江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程項目。
作者簡介:王明慧(1986—),女,山東濱州人,碩士,主要從事家蠶資源與功能基因組學(xué)研究。E-mail:wangminghui.219@163.com。
通信作者:許雅香,副教授,主要從事家蠶資源與功能基因組學(xué)研究。Tel:(0512)65880260;E-mail:xuyaxiang@suda.edu.cn。Serpin全稱為serine protease inhibitor,是一類能夠抑制絲氨酸蛋白酶活性的超家族蛋白質(zhì),參與調(diào)節(jié)生物體內(nèi)多種生理反應(yīng),包括血液凝集、纖維蛋白溶解、補(bǔ)體激活、免疫黑化、生長發(fā)育過程中組織構(gòu)建等[1-5]。Serpin在昆蟲各組織中均有分布,對昆蟲的生命活動起到重要作用,目前關(guān)于家蠶Serpin的研究很多,但是幾乎沒有關(guān)于家蠶Serpin相互作用蛋白方面的研究,生物的生命活動主要體現(xiàn)在蛋白質(zhì)水平,許多蛋白是通過與其他蛋白相互作用來發(fā)揮作用的,因此,研究蛋白質(zhì)相互作用能更好地理解生物的生命活動。本研究原核表達(dá)并純化了Bmserpin-3蛋白,應(yīng)用pull-down及質(zhì)譜技術(shù)篩選到Bmserpin-3的相互作用蛋白,并通過熒光定量PCR技術(shù)初步探索了這2個基因的組織分布,旨在為深入探討 Bmserpin-3 的功能機(jī)制提供依據(jù)。
1材料與方法
1.1材料
家蠶品種為筆者所在研究室保存的大造,正常桑葉育,取5齡4 d幼蟲的脂肪體,-70 ℃保存?zhèn)溆?。Trizol RNA提取及M-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑等化學(xué)常規(guī)試劑均購自寶生物工程(大連)有限公司。引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
1.2重組表達(dá)載體的構(gòu)建和鑒定
采用反轉(zhuǎn)錄的家蠶5齡4 d幼蟲脂肪體的cDNA模板,PCR擴(kuò)增serpin-3基因。引物為F:5′-CTAGCTAGCAACATAGATCCGAACACCCTAAG-3′(下劃線為NheⅠ酶切位點(diǎn))和R:5′-ACGCGTCGACCTATAGTACTTTATAATCCCCATCG-3′(下劃線為SalⅠ酶切位點(diǎn))。擴(kuò)增條件是:95 ℃ 預(yù)變性 3 min;95 ℃變性30 s,60.4 ℃退火35 s,72 ℃延伸3 min,33個循環(huán);最后72 ℃終延伸10 min。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物與pET-28a(+)進(jìn)行雙酶切,然后再將其目的片段與 pET-28a(+) 連接,轉(zhuǎn)化至E.coli Top10中,挑選陽性克隆進(jìn)行酶切鑒定及測序檢驗(yàn)。
1.3重組表達(dá)載體的誘導(dǎo)表達(dá)
含家蠶serpin-3全長cDNA的陽性菌株在含30 mg/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中加入誘導(dǎo)劑異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)至終濃度為0.5 mmol/L,37 ℃誘導(dǎo)表達(dá)6 h后,4 ℃ 5 000 r/min離心10 min收集菌體,用PBS重懸,在冰浴中超聲破碎,直到溶液變澄清。4 ℃ 5 000 r/min離心 10 min,收集沉淀即得包涵體形式的6His-Bmserpin-3。
1.4重組蛋白的純化、鑒定
4 ℃ 5 000 r/min離心20 min收集細(xì)胞,以1 ∶20比例添加0.01 mol/L PBS (pH值為 8.0),在PBS中懸浮細(xì)胞,冰上超聲后添加等量的蛋白loading buffer,蛋白樣品煮沸5 min,5 000 r/min 離心20 min。上清通過SDS-PAGE(沒有梳子)來純化,鋅染后,將膠條切成1 cm的條帶,裝到透析袋里,4 ℃ 透析過夜。用Brandford法檢測蛋白含量后,-20 ℃保存?zhèn)溆?,將純化好的蛋白用SDS-PAGE來鑒定。
1.5pull-down篩選與Bmserpin-3重組蛋白相互作用蛋白
按照每100 mg組織加入1 mL裂解液的比例加入RIPA裂解液(使用前數(shù)分鐘加入PMSF使PMSF終濃度為1 mmol/L),通過強(qiáng)烈的渦旋使樣品裂解充分,5 000 r/min離心5 min,取上清,儲存于-20 ℃冰箱中備用。用10 mL binding buffer 平衡250 μL樹脂,將純化后的Bmserpin-3蛋白與樹脂在4 ℃下緩慢搖晃結(jié)合5 h,使Bmserpin-3蛋白與樹脂充分結(jié)合,讓蛋白液流出,用含50 mmol/L咪唑的Tris洗脫Ni2+柱,祛除未結(jié)合的Bmserpin-3蛋白,將1 mL血液總蛋白加入Ni2+柱中,與Bmserpin-3蛋白復(fù)合物共同4 ℃孵育過夜,使血液內(nèi)靶蛋白與Bmserpin-3蛋白結(jié)合,從而形成樹脂-Bmserpin3-血液總蛋白的復(fù)合物,用含50 mmol/L咪唑的Tris洗脫Ni2+柱,祛除未結(jié)合的血液總蛋白,用含 200 mmol/L 咪唑的 elution buffer洗脫液,將Bmserpin3-血液總蛋白復(fù)合物與樹脂分離,收集洗脫液,12% SDS-PAGE分析收集的洗脫液。
1.6靶標(biāo)蛋白基因的分布
采用Primer 5.0軟件,引物如表1所示。采用SYBR PrimeScriptTM RT-PCR試劑盒測定,具體步驟按照說明書進(jìn)行,反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性1 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火 30 s,循環(huán)45次。反應(yīng)體系為:SYBRPremix Ex TaqTM(2×) 10 μL,上游引物0.4 μL,下游引物0.4 μL,ROX Reference Dye Ⅱ(50×) 0.4 μL,DNA模板 2 μL,ddH2O 6.8 μL。反應(yīng)過程由ABI7300熒光定量PCR儀(Applied Biosystems公司)軟件自動設(shè)定,每個樣品重復(fù)3次。表1實(shí)時熒光定量PCR的檢測基因、內(nèi)參照基因的引物
基因名稱引物序列Tm(℃)Actin3F:5′-CGGCTACTCGTTCACTACC-3′;R:5′-CCGTCGGGAAGTTCGTAAG-3′59.27Bmsp-2F:5′-TTAATTCTGGCTGGGCTTGT-3′;R:5′-TTAGTTGGCTCACATCTTGG-3′ 55.80Bmsp-3F:5′-GATTTTAGCGGGGCTTATTG-3′;R:5′-AGTCCTGGGCGACTTTGTAG-3′ 55.80
2結(jié)果與分析
2.1重組表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定
含有酶切位點(diǎn)NheⅠ、SalⅠ的引物擴(kuò)增serpin-3基因的ORF,得到1 300 bp左右的條帶,PCR純化的目的片段與 pET-28a(+)連接后,轉(zhuǎn)化至E.coli Top10中,挑選陽性克隆進(jìn)行酶切鑒定(圖1),條帶約1 300 bp,表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,命名為pET-28a-Bmserpin-3。
2.2重組蛋白的純化與鑒定
重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coli BL21,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)重組 Bmserpin-3 蛋白,表達(dá)的蛋白多是以包涵體方式存在,用鋅染、透析的方式進(jìn)行純化,結(jié)果如圖2所示,SDS檢測到1條單一的約49 ku的蛋白條帶。
2.3重組蛋白相互作用蛋白的鑒定
樣品組內(nèi)形成樹脂-Bmserpin-3-血液總蛋白的復(fù)合物后,先用含50 mmol/L咪唑的Tris洗脫,祛除非特異性結(jié)合,然后用含200 mmol/L咪唑的elution buffer洗脫液使 Bmserpin-3-血液總蛋白復(fù)合物與樹脂分離,收集樣品,后期用SDS-PAGE分析(圖3)。可見與Bmserpin-3相互作用的3條蛋白條帶。從SDS-PAGE膠上將3條蛋白條帶切下,放入EP管中,加入胰蛋白酶進(jìn)行膠內(nèi)酶切,然后用LC-MS/MS技術(shù)對獲得的3條蛋白條帶進(jìn)行分析(圖4)。鑒定出的蛋白是家蠶儲存蛋白、性別特異儲存蛋白2,相關(guān)蛋白信息見表2。
2.4家蠶幼蟲Bmsp-2,3在不同組織的表達(dá)變化
由圖5可以看出,sp-2、sp-3在各個組織都有分布,且sp-2在脂肪體、血淋巴中表達(dá)量比較高;sp-3在精巢、脂肪體、血淋巴中表達(dá)量比較高。
4結(jié)論與討論
蛋白質(zhì)是生物生命活動的重要體現(xiàn)者之一,幾乎參與生物所有的生命過程、細(xì)胞活動。它在體內(nèi)主要通過與自身或其他蛋白質(zhì)及核酸形成復(fù)合體來進(jìn)行基因調(diào)節(jié)、免疫應(yīng)答、信
表2相互作用蛋白相關(guān)信息
蛋白質(zhì)名稱基因登錄號得分等電點(diǎn)分子量
(ku)性別特異儲存蛋白2gi|1244307251015.7083.57家蠶儲存蛋白gi|3793278111785.9083.04
號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞組裝等生物學(xué)功能[6-7]。通過研究蛋白質(zhì)之間的相互作用可獲得更多的細(xì)胞功能信息。目前蛋白質(zhì)相互作用的主要研究方法有酵母雙雜交技術(shù)、免疫共沉淀法、噬菌體展示技術(shù)、pull-down技術(shù)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)技術(shù)及生物信息學(xué)分析法等。已有學(xué)者利用pull-down 方法鑒定已知的2種蛋白質(zhì)間的相互作用,或采用少量Ni2+-NTA agarose beads 在Eppendorf 管中進(jìn)行小體積的pull-down[8-9]。筆者采用Ni2+-NTA agarose beads 柱使整個體系放大,更利于蛋白質(zhì)的結(jié)合、洗脫,并結(jié)合質(zhì)譜分析來篩選與Bmserpin-3相互作用的蛋白質(zhì)。絲氨酸蛋白酶抑制劑在生物體內(nèi)分布廣泛,參與調(diào)節(jié)生物體內(nèi)多種生理反應(yīng)。研究發(fā)現(xiàn),云杉卷葉蛾serpin-1在表皮中高表達(dá),且在蛻皮期間的轉(zhuǎn)錄水平高于蛻皮期。煙草天蛾serpin-1mRNA在5齡幼蟲脂肪體中含量豐富,但在蛻皮、化蛹時mRNA水平驟然降低[10]。岡比亞按蚊serpin-2與絲氨酸蛋白酶CLIPB9結(jié)合調(diào)節(jié)黑化反應(yīng),此外CLIPB9與serpin2的相互作用還影響雌性成蟲壽命[11]。果蠅serpin27A與serpin28D都參與了先天性免疫反應(yīng),但果蠅serpin28D只參與由創(chuàng)傷引起的酚氧化酶激活產(chǎn)生的黑化,serpin27A在酚氧化酶激活路徑中調(diào)節(jié)病毒或病原菌引起的黑化[12-13]。果蠅中serpin43AC參與了toll途徑調(diào)節(jié)的先天性免疫反應(yīng)[14-15]。研究發(fā)現(xiàn),岡比亞按蚊中serpin10在中腸上皮細(xì)胞聚集與瘧疾病原體的傳播有關(guān)[16]。Serpin家族在昆蟲的表皮、頭部、血淋巴、脂肪體、絲腺、中腸、精巢、卵巢中均有分布,對家蠶的各種生理活動起到調(diào)節(jié)作用[17]。董照明等認(rèn)為,serpin-16在維持絲腺穩(wěn)定的泌絲環(huán)境中發(fā)揮重要作用[18]。查宏賢研究表明,家蠶serpin-4參與了先天性免疫反應(yīng)[19]。王彥云等證實(shí)serpin-6與家蠶表皮黑化、蛻皮變態(tài)、先天性免疫等生理過程有關(guān)[20]。李國勝等推測serpin-5與家蠶的生殖生理有關(guān),可能參加了家蠶的先天免疫反應(yīng)[21]。serpin-3是以單體的形式發(fā)揮作用還是與伴侶分子一起作用或是與其他蛋白質(zhì)形成復(fù)合物來發(fā)揮作用還不得而知。本研究選擇適宜大分子量蛋白質(zhì)的六聚組氨酸作為標(biāo)簽,構(gòu)建了家蠶serpin-3六聚組氨酸蛋白,并以此為餌蛋白,采用His-pull down技術(shù),從家蠶血液中調(diào)取了2個與該蛋白相互作用的蛋白。它們均是血液儲存蛋白,同源性很高,與β-芳基儲存蛋白亞基(煙草天蛾)、芳基儲存蛋白(棉鈴蟲)、血清儲存蛋白2(印度蠶)具有很高的同源性,功能也相似,主要是參與免疫、信號傳導(dǎo)。對家蠶幼蟲sp-2、sp-3在不同組織的表達(dá)變化分析可知,sp-2在脂肪體、血淋巴中表達(dá)量比較高,sp-3在精巢、脂肪體、血淋巴里表達(dá)量比較高。
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