林源,闕庭志,趙珍敏
(上海市法醫(yī)學重點實驗室司法部司法鑒定科學技術(shù)研究所,上海 200063)
X染色體STR和InDel在親緣鑒定中的應(yīng)用1例
林源,闕庭志,趙珍敏
(上海市法醫(yī)學重點實驗室司法部司法鑒定科學技術(shù)研究所,上海 200063)
法醫(yī)遺傳學;X染色體;短串聯(lián)重復序列;插入/缺失;親緣鑒定;半同胞
兩位女性因懷疑彼此為同父異母姐妹,委托本中心進行DNA檢驗,判斷她們是否符合同一父親的遺傳條件。經(jīng)了解,她們的父母均已過世。接受委托后,本中心采集當事人指尖血備檢。采用Chelex-100法提取血樣基因組DNA,采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)20A試劑盒和Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒[基點認知技術(shù)(北京)有限公司]對39個常染色體STR進行復合擴增。采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)17X試劑盒[基點認知技術(shù)(北京)有限公司]對X染色體上的16個STR基因座進行PCR復合擴增,參考文獻[1]對18個X-InDel位點進行PCR復合擴增。以上擴增均在9700型基因擴增儀(美國AB公司)上完成,擴增產(chǎn)物在3130XL遺傳分析儀(美國AB公司)上進行毛細管電泳,用GeneMapper ID v3.2軟件進行基因分型。
經(jīng)對常染色體39個STR基因座的檢驗,參考文獻[2]計算半同胞指數(shù)(half sibling index,HSI)為218。對16個X-STR基因座進行分型檢驗,發(fā)現(xiàn)兩女性除DXS10134基因座外,其余15個X-STR基因座上均具有一個相同的等位基因。經(jīng)X-InDel位點檢驗,兩女性在18個X-InDel位點上均具有相同的等位基因。綜上檢驗,初步認為兩女性符合同一父親的可能性更大,DXS10134基因座可能存在突變的可能。
涉及半同胞關(guān)系鑒定的案例,部分學者嘗試依托常染色體STR結(jié)果,采用ITO法進行探索研究[2-4]。本案例的常染色體STR結(jié)果表明,他們具備半同胞關(guān)系的可能較大,但是X-STR檢驗卻發(fā)現(xiàn)在DXS10134基因座有不符合同一父親的現(xiàn)象,這給本案的判斷帶來了困擾??紤]到STR基因座的突變率較高,故采用了自行研制的X-InDel復合擴增體系,結(jié)果表明,所檢驗的18個X-InDel位點上均檢見相同的等位基因,從而為本案的判斷起到了支撐作用。
插入缺失(InDel)多態(tài)性是一種特殊類型的二等位基因遺傳標記,是由單個或多個堿基的插入或缺失造成的,這種遺傳標記具有較低的自發(fā)突變率和較小的擴增產(chǎn)物片段。同時,作為長度擴增多態(tài)性遺傳標記,大多數(shù)法醫(yī)學實驗室已具備PCR擴增儀和毛細管電泳平臺足以用來對其進行分型分析,無需增加額外的儀器設(shè)備。本案的檢驗也再次證明這一遺傳標記在類似親緣關(guān)系鑒定中有較好的應(yīng)用價值。
[1]孫寬,趙書民,張素華,等.X染色體上18個InDel多重PCR系統(tǒng)的建立[J].法醫(yī)學雜志,2014,30(2):101-109.
[2]陸惠玲,周科偉,呂德堅,等.ITO法和判別函數(shù)法在同胞關(guān)系鑒定中的應(yīng)用[J].法醫(yī)學雜志,2009,25(2):118-122.
[3]陸惠玲,楊慶恩.用ITO法計算兩個體間的血緣關(guān)系機會[J].中國法醫(yī)學雜志,2002,17(3):188-191.
[4]史紹杏,馬偉,朱傳紅.Y-STR家系分型及ITO分析法偵破強奸殺人案1例[J].刑事技術(shù),2005,(4):58-59.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.026
1004-5619(2015)06-0496-01
2015-08-25)
(本文編輯:李成濤)
國家自然科學基金資助項目(81302620);國家“十二五”科技支撐計劃項目(2012BAK16B01)
林源(1967—),男,主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學研究;E-mail:liny@ssfjd.cn