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空間生命科學(xué)共焦顯微圖像采集系統(tǒng)*

2014-12-31 12:18:36鞠洪偉鄭偉波劉方武
傳感器與微系統(tǒng) 2014年2期
關(guān)鍵詞:增益器件驅(qū)動(dòng)

鞠洪偉,張 濤,鄭偉波,蔡 萍,劉方武

(1.中國科學(xué)院 上海技術(shù)物理研究所,上海 200083;2.中國科學(xué)院大學(xué),北京 100049)

0 引言

空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中在軌實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的獲取、樣品的實(shí)時(shí)監(jiān)測與分析主要依靠生命科學(xué)儀器完成,而空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)用顯微鏡作為實(shí)驗(yàn)過程記錄和結(jié)果分析的可視化工具,是空間生命科學(xué)儀器的重要組成部分。目前,對(duì)生物樣品的顯微觀測手段主要包括普通光學(xué)顯微、熒光顯微以及共焦顯微等。共焦顯微技術(shù)作為現(xiàn)代生命科學(xué)研究重要的檢測手段,通過共焦光路和掃描技術(shù)實(shí)現(xiàn)對(duì)探測點(diǎn)的高分辨率掃描成像[1,2],配合軸向步進(jìn),可以完成樣品的光切,得到三維圖像。近年來,NASA成功研制共焦顯微模塊,并組合到光學(xué)顯微模塊(light microscopy module,LMM)中,用于在軌的微重力液體、物理和生物實(shí)驗(yàn)中的樣品顯微觀察。

隨著生命科學(xué)的飛速發(fā)展,生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)涉及的范圍越來越廣,而空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中需要顯微觀察的生物樣品可能具有活性和移動(dòng)性等特點(diǎn),所以,空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中針對(duì)活體目標(biāo)進(jìn)行觀察的需求日益緊迫,而傳統(tǒng)的點(diǎn)式掃描共焦顯微鏡基于逐點(diǎn)掃描探測成像原理,往往在512×512圖像分辨率下,掃描成像時(shí)間在s級(jí),很難在圖像幀頻上達(dá)到活體觀察要求。在逐點(diǎn)掃描方式中,每點(diǎn)的駐留時(shí)間很短,如要完成1 frame/s(512×512)的成像速度,激發(fā)光在每點(diǎn)的駐留時(shí)間只有4μs,要想在這么短的時(shí)間內(nèi)激發(fā)出探測器能夠探測到的熒光,就必須加大激發(fā)光的功率,這樣就會(huì)對(duì)樣品造成一定損傷。而應(yīng)用掃描盤進(jìn)行全視場同時(shí)掃描的共焦顯微系統(tǒng)同時(shí)激發(fā)約1000個(gè)針孔,掃描幀頻可以達(dá)到幾百赫茲,配合面陣弱光探測成像裝置,圖像幀頻可以達(dá)到活體觀察需求。由于掃描盤瞬間通過多個(gè)針孔激發(fā)樣品,所以,在每點(diǎn)的等效駐留時(shí)間要長得多,這就可以降低激發(fā)光的功率,繼而降低系統(tǒng)的光毒性和光漂白效應(yīng),所以,基于多針孔掃描盤的快速共焦顯微系統(tǒng)更適用于空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中長時(shí)間的活體目標(biāo)觀察。目前各種熒光共焦顯微鏡中應(yīng)用較為成熟弱光探測器包括:光電倍增管(PMT)、雪崩二極管(APD);多元面陣器件包括:高靈敏制冷CCD、微通道板或像增強(qiáng)CCD(ICCD)、電子倍增CCD(EMCCD)等。

1 共焦顯微原理與系統(tǒng)方案

基于針孔式掃描盤建立的快速共焦顯微系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)如圖1所示,激發(fā)光源發(fā)出的光經(jīng)過準(zhǔn)直、擴(kuò)束之后,透過分光鏡,依次經(jīng)過快速掃描盤和顯微物鏡。物鏡匯聚的激發(fā)光照射在樣品上,樣品受激發(fā)射的熒光按照原光路返回,當(dāng)發(fā)射熒光經(jīng)過快速掃描系統(tǒng)時(shí),被濾去物方非焦面發(fā)射的雜散光。分光鏡反射的熒光經(jīng)過透鏡匯聚后被CCD接收,獲取樣品共焦顯微圖像。通過控制樣品在Z軸上步進(jìn),進(jìn)而改變樣品的光切位置,可以獲得樣品不同切面的圖像,最終通過一定的圖像處理技術(shù)可以獲得樣品的三維圖像。

圖1 快速掃描共焦顯微系統(tǒng)結(jié)構(gòu)Fig 1 Structure of fast scanning confocal microscopy system

2 EMCCD相機(jī)結(jié)構(gòu)與組件內(nèi)容

圖1所建立的共焦顯微系統(tǒng)以針孔盤作為掃描部件,它以多點(diǎn)針孔同時(shí)對(duì)視場進(jìn)行掃描,因此,圖像采集器件宜采用面陣器件,綜合探測靈敏度、圖像輸出幀頻、空間應(yīng)用等角度考慮,系統(tǒng)采用EMCCD作為圖像采集器件。它與傳統(tǒng)CCD器件在感光、存儲(chǔ)等結(jié)構(gòu)上并無差異,之所以在探測靈敏度、信噪比上表現(xiàn)出色,是因?yàn)樵谄渥x出寄存器之后又多出了一串增益寄存器,增益寄存器的單個(gè)倍增單元如圖2所示。與普通的三相CCD轉(zhuǎn)移電極相比,EMCCD將Ф2分為Ф2和Фdc,一般Фdc接2 V左右的直流偏置,Ф2接高壓(40 V左右)轉(zhuǎn)移時(shí)鐘,由于Ф2與Фdc之間存在高壓差,當(dāng)信號(hào)電荷從Ф1向Ф2轉(zhuǎn)移時(shí),強(qiáng)電場會(huì)使電荷加速并與其他電荷碰撞產(chǎn)生新的電子,電子被Ф2勢井收集實(shí)現(xiàn)1次信號(hào)倍增。單個(gè)倍增單元的倍增率是隨機(jī)的,一般在1% ~1.5%范圍內(nèi),雖然單個(gè)倍增單元增益很低,但當(dāng)多個(gè)倍增單元級(jí)聯(lián)時(shí),總增益由式(1)確定

其中,g為單個(gè)倍增單元的倍增率,n為倍增單元數(shù),當(dāng)n取500時(shí),總增益可能達(dá)2000倍以上。

圖2 單個(gè)倍增單元結(jié)構(gòu)Fig 2 Structure of single multiplier unit

系統(tǒng)采用英國E2V公司的CCD97器件作為成像探測器[3],CCD97是減薄背照式幀轉(zhuǎn)移型 EMCCD,具有512×512有效像素,像素尺寸為16 μm×16 μm,它同時(shí)具有普通模式與倍增模式成像方式,相應(yīng)具有兩路讀出放大器。倍增模式下制冷到-40℃,可達(dá)30 photons/pixel/s(積分時(shí)間為0.1 s)的探測能力,滿足弱光探測需求,同時(shí)在11 MHz像素時(shí)鐘下,噪聲低于1電子/pixel,量子效率達(dá)90%以上,滿足高幀頻需求。

整套系統(tǒng)的電子學(xué)設(shè)計(jì)圍繞EMCCD的驅(qū)動(dòng)需求展開,按功能主要?jiǎng)澐譃?個(gè)模塊:邏輯驅(qū)動(dòng)模塊、功率驅(qū)動(dòng)模塊和上位機(jī)圖像采集模塊,系統(tǒng)功能框圖如圖3所示。

圖3 EMCCD相機(jī)功能結(jié)構(gòu)Fig 3 Functional structure of EMCCD camera

2.1 邏輯驅(qū)動(dòng)模塊

邏輯驅(qū)動(dòng)模塊主要完成EMCCD幀轉(zhuǎn)移、行轉(zhuǎn)移、行輸出等邏輯信號(hào)輸出、AD時(shí)序控制輸出、SRAM時(shí)序控制輸出以及圖像數(shù)據(jù)串行輸出等功能,邏輯模塊核心器件采用ACTEL公司的APA300器件,它基于Flash技術(shù),無需配置芯片,功耗低,對(duì)固件錯(cuò)誤有較好的免疫作用,可以抵御一些高能粒子的沖擊,最大優(yōu)勢在于在特殊環(huán)境下可以穩(wěn)定可靠地工作,適合航天領(lǐng)域的應(yīng)用。圖像信號(hào)采集部分用AD9824,它是ADI公司一種專用于CCD信號(hào)處理的AD器件,它包含14位精度最高采樣率為30MSPS的A/D轉(zhuǎn)換器,芯片內(nèi)部集成了相關(guān)雙采樣電路、像素增益放大器、可編程增益放大器。邏輯驅(qū)動(dòng)模塊的硬件程序各子模塊的調(diào)用關(guān)系如圖4所示。

圖4 硬件程序結(jié)構(gòu)Fig 4 Structure of hardware program

2.2 功率驅(qū)動(dòng)模塊

CCD97的驅(qū)動(dòng)除了對(duì)信號(hào)相位要求嚴(yán)格外,還要求信號(hào)電平和上升時(shí)間多樣化,針對(duì)不同信號(hào)的電平和上升時(shí)間需求,功率驅(qū)動(dòng)模塊采用4種電路方案,包括偏置電平電路、圖像轉(zhuǎn)移信號(hào)電路(ФIS,ФR)及高壓時(shí)鐘電路。

由于CCD97直流偏置所需電流不大,所以,偏置電平電路采用電阻分壓與運(yùn)放跟隨實(shí)現(xiàn)。圖像轉(zhuǎn)移信號(hào)上升時(shí)間較短,需要較大的驅(qū)動(dòng)電流,圖像幀轉(zhuǎn)移、行轉(zhuǎn)移、行輸出信號(hào)功率驅(qū)動(dòng)電路以EL7457作為核心器件。它是Elantec公司推出的四通道CMOS專用驅(qū)動(dòng)器,最高工作頻率可達(dá)40 MHz,最大驅(qū)動(dòng)電流2A,具有低輸出阻抗、外圍電路簡單、方便電源管理等優(yōu)點(diǎn),非常適用于多電平復(fù)雜時(shí)序的CCD器件驅(qū)動(dòng)設(shè)計(jì)。

圖像轉(zhuǎn)移信號(hào)功率驅(qū)動(dòng)電路如圖5所示[4],由于ФI,Φs,ФR信號(hào)的上升時(shí)間要求不同,實(shí)際調(diào)試電路時(shí)選擇合適的電阻器(R1~R5)使得信號(hào)上升時(shí)間盡量滿足器件需求,保證輸出的圖像質(zhì)量較高。

圖5 圖像轉(zhuǎn)移信號(hào)驅(qū)動(dòng)電路Fig 5 Image transfer signal driving circuit

高壓時(shí)鐘是實(shí)現(xiàn)倍增模式成像的關(guān)鍵信號(hào),它的電平?jīng)Q定了倍增增益,并最終影響器件在低照度下的成像效果。由于高壓時(shí)鐘的電平較高,一般在40 V左右,驅(qū)動(dòng)電流100 mA左右,使用集成元件很難實(shí)現(xiàn),所以,高壓時(shí)鐘電路采用分立元件實(shí)現(xiàn),電路如圖6所示[5]。

圖中電路的靜態(tài)偏置由二極管 D1,D2,D3,D4,D5,D6以及電阻器R1,R3,R4所組成的分壓網(wǎng)絡(luò)提供。Q1的柵源極靜態(tài)電壓約為-1 V,Q2的柵源極靜態(tài)電壓約為1 V。當(dāng)FPGA驅(qū)動(dòng)脈沖為低時(shí),U1和U2的輸出為5V,Q1的柵源極電壓為-1 V,Q2的柵源極電壓為6 V,此時(shí),Q1關(guān)斷,Q2導(dǎo)通,Φ2HV被拉低到0V;當(dāng)FPGA脈沖為高時(shí),U1和U2的輸出為0V,Q1的Vgs為-6 V,Q2的Vgs為1 V,此時(shí)Q2關(guān)斷,Q1導(dǎo)通,Ф2HV被拉高到電源電壓Vhigh。Ф2HV的輸出相位與FPGA輸出邏輯信號(hào)相同,高低電平與高壓電源一致。

圖6 高壓時(shí)鐘驅(qū)動(dòng)電路Fig 6 High-voltage clock driving circuit

2.3 上位機(jī)軟件

上位機(jī)控制軟件主要負(fù)責(zé)指令編碼、指令下傳以及圖像數(shù)據(jù)接收、圖像數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、圖像顯示等工作。

上位機(jī)軟件開發(fā)環(huán)境為VC++6.0,通過調(diào)用操作系統(tǒng)自帶的MScomm控件完成指令下傳與數(shù)據(jù)接收。通過點(diǎn)擊界面上的“打開串口”按鈕建立相機(jī)與上位機(jī)間的通信,點(diǎn)擊“打開相機(jī)”按鈕完成相機(jī)參數(shù)與開機(jī)指令下傳,開啟圖像數(shù)據(jù)接收線程,待正確接收數(shù)據(jù)包頭并完成一整幅圖像數(shù)據(jù)接收后,顯示接收?qǐng)D像并保存圖像數(shù)據(jù)。

3 圖像采集驗(yàn)證與分析

驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)鏡頭采用MV2514機(jī)器視覺鏡頭,該鏡頭放大倍率為0.23倍,焦距為25 mm,F(xiàn)數(shù)可小至1.4,可見光波段內(nèi)透過率約90%,機(jī)械接口為標(biāo)準(zhǔn)C接口,可兼容2/3 in CCD,最小工作距130mm。實(shí)驗(yàn)中采用6mm特寫環(huán)在0.01 lx微光、100 ms積分時(shí)間、2 dB增益條件下使用普通模式與倍增模式分別對(duì)同一目標(biāo)成像,圖像如圖7所示。

圖7 普通模式與倍增模式圖片F(xiàn)ig 7 Normal and multiplication mode image

從獲得的暗背景條件下的圖像數(shù)據(jù)可計(jì)算出噪聲平均灰度值與方差,分別選擇普通模式下與倍增模式下目標(biāo)圖像的最亮點(diǎn)作為信號(hào),取多幅圖像數(shù)據(jù)的亮點(diǎn)信號(hào)并計(jì)算平均值,可以獲得普通模式下與倍增模式下的信噪比,列于表1。

表1 實(shí)驗(yàn)對(duì)比數(shù)據(jù)Tab 1 Contrast data of experiment

從表中可以得出:相比普通模式,在44 V倍增時(shí)鐘電壓驅(qū)動(dòng)下,倍增模式輸出圖像的信號(hào)有7倍提升,信噪比也有8倍提升,證明CCD97在微弱光條件下,使用倍增模式可以獲得較高質(zhì)量的目標(biāo)圖像。

根據(jù)圖1搭建共焦顯微系統(tǒng),使用40倍物鏡對(duì)擬南芥進(jìn)行熒光顯微成像。普通顯微模式與共焦顯微模式分別對(duì)樣品所成圖像如圖8所示。

EMCCD相機(jī)倍增模式與普通模式使用相同AD增益,積分時(shí)間分別取100,50 ms。從圖8可以看出:EMCCD在倍增模式下可以獲得比較清晰的擬南芥葉肉共焦顯微熒光圖像。相比普通顯微模式,由于對(duì)樣品進(jìn)行光切的原因,使得系統(tǒng)在共焦顯微模式下可以清晰的分辨出擬南芥葉肉葉綠體。

圖8 擬南芥葉綠素?zé)晒鈭D像Fig 8 Fluorescence image of chlorophyll

4 結(jié)論

通過對(duì)空間生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中共焦顯微的原理分析,提出一套適用于活體目標(biāo)觀察、對(duì)樣品低損傷的共焦顯微方案。根據(jù)目標(biāo)的掃描方案和獲取目標(biāo)發(fā)射光的能量大小提出基于CCD97的弱光圖像采集系統(tǒng),將系統(tǒng)分成3個(gè)功能模塊分別實(shí)現(xiàn)并最終完成原理樣機(jī)研制。在普通模式與倍增模式下分別獲取目標(biāo)圖像,從圖像效果可以看出:該成像系統(tǒng)性能較高,對(duì)弱光目標(biāo)有很好的成像效果,且該系統(tǒng)具有體積小、可靠性高、適合空間應(yīng)用等特性。

[1]Gu Min.共焦顯微術(shù)的三維成像原理[M].王桂英,陳 偵,楊莉松,譯.北京:新時(shí)代出版社,2000:14-51.

[2]Colin J R Sheppard.Aberrations in high aperture conventional and confocal imaging systems[J].Applied Optics,1988,27(22):4782-4786.

[3]E2V Technologies inc.CCD97—00 back illuminated 2-phase IMO series electron multiplying CCD sensor[EB/OL].[2004—05—11].http://www.e2vtechnologies.com.

[4]孫 靜,張保平,曹睿學(xué).基于EMCCD的驅(qū)動(dòng)電路設(shè)計(jì)[J].現(xiàn)代電子技術(shù),2011,34(4):150-154.

[5]Texas Instruments.TC285SPD—B0 1004 ×1002 pixel impactron CCD image sensor[EB/OL].[2004—05—31].http://www.ti.com.

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