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2個不同來源真姬菇子實體同源性的分子鑒定*

2014-11-21 03:38:00黃龍花夏鳳娜邵滿超張一帆陳多揚胡惠萍
中國食用菌 2014年1期
關鍵詞:靈芝品系食用菌

黃龍花,夏鳳娜,邵滿超,張一帆,陳多揚,胡惠萍**

(1.廣東省微生物研究所,廣東省菌種保藏與應用重點實驗室,廣東省微生物應用新技術公共實驗室,

廣東省華南應用微生物重點實驗室,廣東 廣州 510070;2.廣東粵微食用菌技術有限公司,廣東 廣州 510070)

真姬菇Hypsizygus marmoreus(PK)Sing.屬于擔子菌亞門、傘菌目、白蘑科、玉蕈屬[1],又名斑玉蕈、蟹味菇、玉蕈、假松茸、靈芝菇等,是北溫帶一種品質優(yōu)良的食用菌[2]。真姬菇營養(yǎng)價值較高,是1種具有良好保健功能的食用菌,其子實體熱水和有機溶劑 (甲醇和乙醇等)提取物,具有清除體內自由基、降血壓、提高免疫力和延緩衰老等功效[3]。在日本有“香在松口蘑,味在玉蕈”之稱。由于我國真姬菇品種名稱使用不規(guī)范,造成同種異名、同名異種現(xiàn)象較多,給真姬菇品種交流和產(chǎn)品出口帶來不便[4]。因此建立一套準確可靠、穩(wěn)定性好的真姬菇菌株分類鑒定方法迫在眉睫。

本研究將ERIC-PCR指紋圖譜分析和ITS序列分析相結合,對2個不同企業(yè)提供的真姬菇子實體進行同源性研究,為快速準確鑒定真姬菇品種提供參考。其中利用ERIC-PCR技術對真姬菇進行同源性分析在國內外尚屬首次。

1 材料與方法

1.1 材料

2個供試真姬菇子實體樣品,由廣東省食用菌行業(yè)協(xié)會會員單位提供,具體見表1。

表1 供試菇品

1.2 子實體前處理

對獲得的子實體進行實地拍照記錄,并將新鮮子實體在恒溫鼓風干燥箱中50℃烘干,保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 子實體基因組DNA的提取

子實體總DNA的提取純化按黃龍花等[5]的方法進行。

1.4 PCR擴增

1.4.1 ERIC-PCR

采用ERIC-PCR通用引物ERIC2和ERICR(ERIC2:5'-ATG TAA GCT CCT GGG GAT TCA C-3';ERICR:5'-AAG TAA GTG ACT GGG GTG AGC G-3')進行PCR擴增,引物由上海生工合成,擴增在Biometra PCR儀上進行。反應體系為2 ×PCR Taqmix 12.5 μL,DNA 模板 (濃度適中)2.5 μL,ddH2O 6 μL,引物 (10 μmol·L-1)各 2 μL,總體積 25 μL。反應條件為95℃反應5 min;94℃反應1 min,40℃~60℃(溫度梯度)反應1 min,72℃反應2 min,30個循環(huán);72℃反應8 min。

1.4.2 ITS-PCR

采用真菌核糖體基因間隔區(qū)通用引物 ITS1和 ITS4[6](ITS1:TCC GTA GGT GAA CCT GCG G;ITS4:TCC TCC GCT TAT TGA TA TGC)進行PCR擴增,引物由Sangon公司合成,擴增在Biometra PCR儀上進行。反應體系為2×PCR Taqmix 25 μL,DNA 模板 (濃度適中)5 μL,ddH2O 12 μL,引物(10 μmol·L-1)各 4 μL,總體積 50 μL。反應條件為 94℃反應5 min;94℃反應1 min,55℃反應1 min,72℃反應1 min,30個循環(huán);72℃反應10 min。

1.5 電泳成像及測序

對ERIC-PCR及ITS-PCR產(chǎn)物進行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳,在UVP凝膠成像系統(tǒng) (GE公司)下成像保存。ITS-PCR產(chǎn)物回收純化后,以擴增引物為測序引物進行雙向測序拼接,由華大基因完成。

1.6 圖譜分析及序列比對分析

對電泳指紋圖譜進行分析 (樣品多的情況下,需要用UVIband等軟件構建系統(tǒng)進化樹,進行進化關系分析);對測得堿基序列,應用Clustal X進行序列完全比對分析 (樣品多的情況下,需要進一步用MEGA等軟件構建系統(tǒng)進化樹,進行進化關系分析)。

2 結果與分析

A公司靈芝菇子實體、B公司真姬菇子實體特征見圖1、圖2。

由圖1、圖2可以看出,2種鮮菇子實體外觀差異極小,難以區(qū)分 (色差由拍照引起)。觀察發(fā)現(xiàn),A公司靈芝菇整體較為矮胖,纖維感較強,因而提取DNA時,干燥子實體較難磨碎。對照1和對照2是由同一菌種分離出的不同菌株,結果見圖3。

從圖3可以看出,退火溫度為45℃和48℃時,條帶多態(tài)性更為豐富,說明這些菌種的ERIC-PCR最佳退火溫度為(45±5)℃,其中對照1和對照2的指紋圖譜極相近,為同一品系的菌種 (圖4進一步驗證);而A公司靈芝菇和B公司真姬菇的指紋圖譜則差異比較大,應該不是同一品系 (圖4進一步驗證)。為探索最適退火溫度,進一步進行40℃~55℃退火溫度的梯度PCR,結果見圖4。

由圖4可以看出,對照1和對照2在同一退火溫度下的ERIC-PCR指紋圖譜一致,應為同一品種,其子實體應栽培自同一品種的同一品系;而A公司靈芝菇和B公司真姬菇在同一退火溫度下的ERIC-PCR指紋圖譜差異明顯,可能為不同品種或者同一品種的不同品系。真姬菇ITS序列完全比對圖見圖5。

由圖5可以看出,測序所得的A公司靈芝菇和B公司真姬菇的ITS序列長度均為661 bp,對661個堿基進行完全比對,結果發(fā)現(xiàn)它們存在3個堿基差異,其中有1個落在ITS1上;2個在ITS2上。將序列在NCBI的GenBank上作Blast,發(fā)現(xiàn)2個序列和GenBank上的已知真姬菇 (Hypsizigus marmoreus)序列相似性均達99%,所以2個均為真姬菇,但應來自不同品系。

3 結論

ERIC-PCR指紋圖譜分析和ITS序列分析相結合,對A公司靈芝菇和B公司真姬菇2組外觀相近的菇品子實體進行同源性研究。結果發(fā)現(xiàn),A公司靈芝菇和B公司真姬菇的ERIC-PCR指紋圖譜存在較大的多態(tài)性差異,它們應屬于不同菌株 (品系),甚至不同品種;ITS序列測定結果顯示它們僅存在3個堿基差異,應屬于同一品種。因此2種分子方法結合分析表明,這兩個子實體樣品均屬于真姬菇 (Hypsizigus marmoreus)品種,來自同一個品種的不同亞種/菌株 (品系),它們擁有各自獨立知識產(chǎn)權。

[1]黃年來.中國大型真菌原色圖鑒[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,1998.

[2]楊新美.食用菌栽培學[M].北京:農(nóng)業(yè)出版社,1986.

[3]孫培龍,魏紅福,楊開,等.真姬菇研究進展 [J].食品科技,2005,26(9):54-57.

[4]王波.幾種食用菌品種名稱訂正 [J].中國食用菌,2006,25(5):27-28.

[5]黃龍花,吳清平,楊小兵,等.基于ITS序列分析探討我國栽培風尾菇的分類地位 [J].食用菌學報,2009,16(2):30-35.

[6]White TJ,Bruns T,Lee S.Analysis of phylogenetic relationships by amplification and direct sequencing of ribosomal RNA genes[C].//Innis MA.Ed.PCR Protocols:A guide to methods and applications.New York:Academic,1990:15-22.

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