劉曉莉LIU Xiao-li
(延安大學化學與化工學院,延安716000)
膠原蛋白是哺乳動物中含量十分豐富的一種蛋白,它的類型、質(zhì)量以及分布的改變直接影響著動物體正常的機能,具有非常重要的生物學機能,也是非常重要的蛋白質(zhì)。
膠原蛋白由于其良好的生物相容性和弱抗原性而可廣泛使用于醫(yī)藥、醫(yī)用材料及美容化妝品行業(yè)[1]。目前所用的動物源膠原蛋白具有病毒隱患及理化性能差的缺點。本文主要研究如何將人源性膠原蛋白的mRNA逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,再經(jīng)過酶切并修飾后進行特定序列重復,轉(zhuǎn)導于大腸桿菌內(nèi),經(jīng)過高密度發(fā)酵,使外源基因大量表達,從而得到水溶性的類人膠原蛋白(human-like collagen)。類人膠原蛋白不僅具有膠原蛋白原有的功效,而且經(jīng)修飾后的三重復螺旋結(jié)構(gòu)賦予其在分子量不變的條件下優(yōu)于天然膠原蛋白的獨特的化學結(jié)構(gòu)和更新的功能,如可逆成膠性、無病毒隱患、可加工性、低免疫排異性、水溶性等性質(zhì),消除了從動物身上提取的膠原蛋白的缺陷,大大拓展了其用途。
利用重組大腸桿菌E.coli his 3.1表達重組蛋白質(zhì),代謝副產(chǎn)物乙酸積累的量對菌體生長、目標產(chǎn)物的表達都有較大的影響。隨著乙酸積累達到一定程度,菌體的生長和產(chǎn)物合成會逐漸停止。乙酸對細胞生長代謝的抑制機理現(xiàn)在比較公認的為:乙酸在中性pH環(huán)境中以離子化(CH3COO-)和質(zhì)子化(CH3COOH)兩種形式存在,質(zhì)子化的乙酸具有弱的親脂性,可以穿過細胞質(zhì)膜進入胞內(nèi),在胞內(nèi)(pH 7.5)解離成CH3COO-和H+,這樣就降低了膜內(nèi)pH值,使膜內(nèi)外pH差減小,減弱了質(zhì)子推動力,產(chǎn)生的能量大大減少,擾亂了細胞的正常代謝和生理活性[5]。
乙酸的產(chǎn)生與細胞中的電子傳遞鏈和三羧酸循環(huán)有關(guān)。已知的大腸桿菌產(chǎn)生乙酸途徑有兩條,一是在丙酮酸氧化酶的作用下由丙酮酸直接生成乙酸。二是在乙酸激酶(ACK)和磷酸轉(zhuǎn)乙酰基酶(PTA)作用下由乙酰CoA生成乙酸。前者由于丙酮酸氧化酶在大腸桿菌中活性較低,不足以產(chǎn)生大量乙酸,因此后一條途徑就成為乙酸產(chǎn)生的主要途徑[4]。
當碳氮比過高時,就會造成碳代謝流在糖酵解途徑中的過量,細胞為了平衡碳代謝流,就要釋放出部分代謝副產(chǎn)物,而乙酸就是其中的主要副產(chǎn)物。
在低水平溶氧條件下,細胞由于攝氧量不足以滿足其好氧呼吸而轉(zhuǎn)向厭氧代謝,產(chǎn)生乙酸等小分子有機酸。
另外,在比生長速率過高條件下,大腸桿菌通過氧化代謝作用產(chǎn)生的能量不足以滿足合成和異化的需求,必須通過乙酸生成途徑獲得ATP和NADPH2。細胞在生成一分子乙酸同時,也會生成一分子ATP,這就成了乙酸產(chǎn)生的優(yōu)勢所在。
本實驗主要研究大腸桿菌生產(chǎn)類人膠原蛋白在補料—分批培養(yǎng)下乙酸的產(chǎn)生規(guī)律以及乙酸對類人膠原蛋白產(chǎn)量的影響,并對其進行優(yōu)化。
1.1 材料與方法
1.1.1 菌株與質(zhì)粒 基因工程菌E.coli his 3.1,卡那抗性,溫度誘導,質(zhì)粒pNWCP31。
1.1.2 種子培養(yǎng)基 種子培養(yǎng)基用固體LB培養(yǎng)基和液體LB培養(yǎng)基。從LB平板上分別刮取兩個單菌落,分別置于兩個盛有50mL種子培養(yǎng)基的300mL的搖瓶中,在溫度為32°C,轉(zhuǎn)速為200rpm的搖床中培養(yǎng)10~12h,然后將此種子轉(zhuǎn)接于八個盛有50mL種子培養(yǎng)基的300mL的搖瓶中,在相同的條件下培養(yǎng)10~12h。
1.1.3 分批-補料培養(yǎng) 將已經(jīng)培養(yǎng)好的種子接種到裝有6L發(fā)酵培養(yǎng)基的12.8L發(fā)酵罐中,控制溫度在34°C。在分批-補料培養(yǎng)階段,通過調(diào)節(jié)空氣流量、提高攪拌轉(zhuǎn)速和罐壓控制DO在20%空氣飽和度,用25%氨水(w/w)自動調(diào)節(jié)pH值為6.8。當發(fā)酵罐中的葡萄糖耗盡時,采用近指數(shù)補料法控制比生長速率[7]。當OD600達到90~100時,升溫至42°C開始誘導,兩小時后降溫至39°C,繼續(xù)誘導6~8h。
發(fā)酵培養(yǎng)基和補料培養(yǎng)基成分見表1。
表1 培養(yǎng)基的組成
1.1.4 主要試劑 酵母提取物為Oxoid公司生產(chǎn);卡納霉素為Siga公司生產(chǎn);其它為國產(chǎn)分析純試劑。
1.2 分析方法
1.2.1 乙酸含量(HPLC法)
1.2.1.1 HPLC系統(tǒng) 高效液相色譜儀Shim-pack VP-ODS,色譜柱(150mm×4.6mm),紫外檢測波長 210nm,流速1ml/min,進樣5μl,流動相,乙腈:磷酸鹽緩沖液(pH2.6)=3.5:96.5,A相為超純水,B相為色譜純的甲醇。
1.2.1.2 流動相的選擇依據(jù) 決定流動相的pH值的主要成分是被分離的有機酸pKa值乙酸的解離常數(shù)是4.76,柱子的pH值的最小下限是2,在流動相是酸性環(huán)境中,如果允許乙酸有1%的離子狀態(tài)存在,則可預測流動相的pH值:
即流動相的pH值應(yīng)該是pH2~2.76之間,我們選定pH值為2.6,用磷酸鹽作為緩沖液。
1.2.1.3 流動相的配制
①溶液A:用磷酸鹽緩沖液(H3PO4+KH2PO4)將超純水調(diào)節(jié)pH至2.6。
②流動相:乙腈:溶液A=3.5:96.5。
③將配好的流動相置于溶劑過濾器中過濾,然后在超聲波清洗器下進行超氣。
1.2.1.4 樣品預處理
①取1ml發(fā)酵液10,000r/min離心5min;
②取上清 0.5ml,加入 0.3gNaCl,0.10mL 2.3mol/L H2SO4,2.50mL 乙醚,在振蕩器上混合 1mim,5,000r/min 離心3min;
③取乙醚相1.00mL,加0.20mL 0.1mol/LNaCl混合1min,5,000r/min離心3min,吸去上層乙醚,用試紙測試pH>9(在酸性條件下,用乙醚萃取,將有機酸以分子形式萃取到乙醚相中,再在pH>9的條件下反萃取到水相中,可大大去除其他物質(zhì)的干擾),開蓋揮發(fā)乙醚相后,置干燥器內(nèi)干燥;
④加入0.40mL 0.05mol/L(NH4)H2PO4(pH2.6)溶解,10,000r/min 離心 10min;
⑤取5μl進樣分析。
1.2.1.5 保留時間的確定 選取發(fā)酵液中可能產(chǎn)生的有機酸如甲酸,琥珀酸,乙酸,檸檬酸,酒石酸,各取2%標準溶液進樣分析,測定各有機酸的保留時間分別為:甲酸1.99min,琥珀酸 2.215min,乙酸 2.880min,檸檬酸 3.011min,酒石酸 3.751min。
圖1 標準乙酸色譜圖
1.2.1.6 乙酸標準曲線的繪制 精確量取分析純的冰醋酸配制成含有 0g/L,0.2g/L,0.4g/L,0.6g/L,1.0g/Lm1.4g/L,2.0g/L不同濃度的標準乙酸溶液,分別取5μl進樣分析。
用乙酸濃度(X)對峰高(Y)做線性回歸分析,
得到線性方程 Y=463.8X
線性相關(guān)系數(shù) R2=0.9633
圖2 乙酸標準曲線
1.2.1.7 進樣分析 取 0、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22h時段的培養(yǎng)液,按樣品處理方法進行樣品處理后,進行HPLC測定,得到培養(yǎng)過程中乙酸隨發(fā)酵過程的變化曲線。
1.2.2 產(chǎn)物表達量的測定(雙縮脲法)
1.2.2.1 試劑 雙縮脲試劑:1.75g(CuSO4·5H2O)溶于150mL蒸餾水,加入300mL的濃氨水、300mL的冰蒸餾水及200mL的飽和NaOH搖勻,置于室溫1~2小時。用蒸餾水定容至1000mL。標準蛋白質(zhì)溶液:10mg·mL-1牛血清白蛋白溶液。
1.2.2.2 蛋白質(zhì)標準曲線的制定 取10支試管,按表2-3順序操作,在分光光度計(540nm)上測定吸收度。
其中,Y為標準曲線查得蛋白質(zhì)的濃度(mg·mL-1),N為稀釋倍數(shù),V為樣品所取的體積(mL)。
表2 雙縮脲標準曲線制作
2.1 乙酸對細胞生長的影響
2.1.1 乙酸隨發(fā)酵過程的曲線圖
圖3 樣品乙酸色譜圖
在發(fā)酵過程中乙酸的含量(HPLC測得的峰高表示)及糖含量如表3所示。
表3
由表3經(jīng)換算可得乙酸的含量,制得乙酸隨發(fā)酵由成圖(圖4)。
圖4 乙酸隨發(fā)酵由成圖
大腸桿菌在發(fā)酵過程中,碳源供給量高于細胞所同化的速度,因此當生長速率過大的時候,就會使得供氧不足,導致代謝副產(chǎn)物乙酸的形成。尤其發(fā)酵條件在高密度的時候,問題更加突出。在進行培養(yǎng)基中葡萄糖的濃度過于影響著細菌的代謝方式,隨著葡萄糖濃度的降低,大腸桿菌將乙酸作為碳源,發(fā)酵液中的乙酸濃度降低;隨著葡萄糖濃度的增加,發(fā)酵液中的乙酸濃度迅速增加,pH值迅速下降,從而導致對大腸桿菌繁殖和膠原蛋白表達的抑制。
2.1.2 乙酸對細胞生長的影響
由圖5可以發(fā)現(xiàn)在發(fā)酵初期,乙酸含量低,不會對細胞的生長產(chǎn)生抑制,比生長速率大;隨著細胞的生長,細胞利用葡萄糖作為碳源進行代謝,產(chǎn)生大量乙酸,比生長速率有下降的趨勢;隨著葡萄糖的消耗,此時補糖尚未開始,菌體利用乙酸作為碳源進行代謝,乙酸含量降低,比生長速率保持平穩(wěn);從第10小時開始補糖,隨著發(fā)酵地進行,乙酸逐漸積累,濃度升高,菌體的比生長速率降低;在發(fā)酵進行到第14個小時的時候,進行溫度誘導,比生長速率增加,乙酸積累,濃度增加;隨著發(fā)酵地進行,菌體已經(jīng)進入衰亡期,最后葡萄糖用盡,發(fā)酵停止。
圖5 乙酸與細胞生長的關(guān)系
2.2 乙酸對類人膠原蛋白合成的影響
由圖6、7可以看出,當乙酸含量低時,不會對類人膠原蛋白的產(chǎn)量有影響,隨著乙酸積累,會對產(chǎn)量產(chǎn)生影響,當乙酸含量達到一定程度,產(chǎn)物合成會逐漸停止。
圖6 乙酸對產(chǎn)量的影響1
圖7 乙酸對產(chǎn)量的影響2
所以應(yīng)該考察在不同碳氮比,不同細胞比生長速率,不同溶氧下條件下乙酸產(chǎn)生的量和其對目標蛋白表達量的影響,以確定生產(chǎn)類人膠原蛋白的優(yōu)化條件。
本文主要是對人類膠原蛋白基因工程菌E.coli his 3.1高密度發(fā)酵過程中乙酸的產(chǎn)生量和產(chǎn)物表達量之間的關(guān)系進行討論研究。我們可以看出,溶解氧控制在30~40%飽和度、比生長速率控制在0.1~0.2h-1、碳氮比控制在100:1到100:20左右的時候,有利于細胞生長和產(chǎn)物的表達,這樣能夠與降低乙酸等有害代謝副產(chǎn)物的積累有著直接的關(guān)系,可使最終表達量為9g/L,占總蛋白的30.5%。
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