故事發(fā)生在1910年，當(dāng)時(shí)巴黎正遭遇一場(chǎng)世紀(jì)洪水的侵襲，塞納河水淹沒(méi)了城市的大街小巷。

勞爾和埃米爾到一位生物學(xué)家的實(shí)驗(yàn)室送貨，生物學(xué)家不在，只有猩猩管家看門(mén)。兩個(gè)人忍不住亂動(dòng)實(shí)驗(yàn)室的藥品，引發(fā)混亂，令一只小跳蚤變異成一人多高的怪物。

怪物跳蚤受到驚嚇后逃出實(shí)驗(yàn)室，在巴黎引來(lái)了一陣恐慌。警察局長(zhǎng)梅諾特覺(jué)得這是個(gè)立功表現(xiàn)的大好時(shí)機(jī)，一心想消滅怪物，以樹(shù)立自己的威信。

露西在巴黎一家很有名的歌劇院擔(dān)當(dāng)主唱，是勞爾和埃米爾的好朋友。一個(gè)雨夜，露西偶遇變異的跳蚤怪物，覺(jué)得它可憐，于是“撿”它回家，并給它取名弗蘭卡。

弗蘭卡是只溫柔無(wú)辜的跳蚤，有著一顆純潔的心。更加神奇的是它具有令人驚嘆的音樂(lè)天賦，露西把它喬裝打扮成吉他手，藏在自己身邊。

警方的搜捕越來(lái)越頻繁，為了保護(hù)弗蘭卡，埃米爾、羅爾和露西聯(lián)合起來(lái)，用煙霧彈制造了弗蘭卡被炸死的假象。本以為這樣可以逃過(guò)搜捕，沒(méi)想到卻被梅諾特識(shí)破。

梅諾特對(duì)弗蘭卡的追殺更加不擇手段。他不顧同事的阻攔，乘坐熱氣球在空中追趕彈跳力超群的弗蘭卡，把它逼向積水的戰(zhàn)神廣場(chǎng)。弗蘭卡是跳蚤，無(wú)法在水中存活，積水的廣場(chǎng)對(duì)它來(lái)說(shuō)就是地獄。

體力不支的弗蘭卡踉蹌著爬上鐵塔，勞爾等人趕來(lái)營(yíng)救，卻被梅諾特扔下鐵塔。幸好腰帶掛在了鐵塔的螺絲上，才沒(méi)有掉下去。當(dāng)大家再次爬上鐵塔時(shí)，卻傳來(lái)槍響。

眾人沖上塔頂，不見(jiàn)了弗蘭卡，只有一頂弗蘭卡的寬檐帽。梅諾特被隨后到來(lái)的警長(zhǎng)帶走。他被控告在沒(méi)有獲得批準(zhǔn)的前提下擅自處死弗蘭卡，觸犯了國(guó)家法律，被關(guān)進(jìn)監(jiān)獄。

可是大家還是找不到弗蘭卡，露西傷心極了。忽然，從耳邊傳來(lái)微弱的歌聲，是弗蘭卡。它已經(jīng)變回原來(lái)的大小，正落在露西的肩頭，陪她一起唱歌呢。

猩猩管家得知此事，將弗蘭卡帶到生物學(xué)家的實(shí)驗(yàn)室，再次將它變大。從此，它正式和露西同臺(tái)演出，名震巴黎。

故事中最美的姑娘有著最美麗的心靈，而最丑的跳蚤有著最美的歌喉。是善良讓露西變得更美，也是善良讓人們接納了丑陋的弗蘭卡。而那位原本年輕英俊的警察局長(zhǎng)利欲熏心的樣貌卻反而變得丑陋，變得讓世人難以接受。