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應(yīng)用PCR檢測(cè)豬偽狂犬病毒野毒的研究

2014-05-30 17:24:15張婕李增奎
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年9期
關(guān)鍵詞:檢測(cè)

張婕 李增奎

摘要[目的]對(duì)豬偽狂犬病毒野毒進(jìn)行檢測(cè)。[方法]根據(jù)已發(fā)表的豬偽狂犬病病毒gE基因核苷酸序列,設(shè)計(jì)合成1對(duì)引物,擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為276 bp,優(yōu)化PCR反應(yīng)條件,建立檢測(cè)PRV野毒的PCR方法。[結(jié)果]利用建立的PCR方法檢測(cè)疑似PRV野毒感染的臨床送檢組織病料34份,陽(yáng)性樣品18份,陽(yáng)性率達(dá)52.94 %(18/34),選取6份陽(yáng)性病料PCR產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行序列鑒定,測(cè)序結(jié)果表明均為PRV gE基因特異性序列。[結(jié)論]該方法敏感、特異、可靠,可用于PRV野毒感染的快速診斷和流行病學(xué)調(diào)查。

關(guān)鍵詞豬偽狂犬病毒;gE基因;PCR;檢測(cè)

中圖分類號(hào)S852.65+1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)0517-6611(2014)09-02548-02

作者簡(jiǎn)介張婕(1982- ),女,土族,青海大通人,助理獸醫(yī)師,從事畜牧獸醫(yī)研究。

豬偽狂犬?。╬seudorabies,PR)是由豬偽狂犬病毒(pseudorabies virus,PRV)引起的豬的一種急性、熱性、敗血性傳染病[1-2]。PRV屬皰疹病毒科(Herpesvifidae)a皰疹病毒亞科(Alphaherpesvirinae),具有皰疹病毒的典型特征,可引起豬的潛伏感染[3-4]。PRV的潛伏感染并不使感染豬表現(xiàn)臨床癥狀,但可使感染豬終身帶毒并排毒,增加了PR預(yù)防控制的難度,故對(duì)PRV潛伏感染豬的篩查至關(guān)重要[5]。目前,世界各國(guó)廣泛應(yīng)用PRV gE基因缺失疫苗進(jìn)行PR的防控,且歐美等發(fā)達(dá)國(guó)家應(yīng)用PRV gE基因缺失弱毒疫苗與其配套的鑒別診斷方法已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了PRV的凈化[6]。我國(guó)自20世紀(jì)70年代中期以來(lái),廣泛使用gE基因缺失弱毒疫苗,其對(duì)PR的防控起到了重要的作用,但同時(shí)也給PRV野毒感染和疫苗接種的鑒別診斷帶來(lái)了較大困難,尤其是2011年以來(lái)我國(guó)多個(gè)使用gE基因缺失弱毒疫苗免疫的規(guī)模化豬場(chǎng)出現(xiàn)了PRV野毒的感染與流行[7],亟待建立可以準(zhǔn)確診斷PRV強(qiáng)毒和疫苗毒敏感、特異的鑒別檢測(cè)方法。鑒于此,筆者根據(jù)PRV gE基因序列設(shè)計(jì)特異性檢測(cè)引物,經(jīng)PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化,建立檢測(cè)PRV野毒的PCR方法,實(shí)現(xiàn)PRV野毒感染的快速鑒別診斷,以期為PR的綜合防治提供準(zhǔn)確、可靠的依據(jù)。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1研究對(duì)象。PRV野毒,由青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院第一實(shí)驗(yàn)室分離鑒定并保存。

1.1.2供試病毒。偽狂犬病病毒活疫苗(Bartha-K61株)和豬傳染性胃腸炎病毒(PEDV)豬流行性腹瀉病毒(TGEV)二聯(lián)活疫苗,均購(gòu)自哈爾濱維科生物技術(shù)開發(fā)公司;豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)弱毒疫苗(CH-1R株)和豬瘟病毒(CSFV)活疫苗(細(xì)胞源),均購(gòu)自普萊柯生物工程股份有限公司產(chǎn)品;疑似PRV野毒感染豬組織病料,由青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院第一實(shí)驗(yàn)室收集并保存。

1.1.3主要試劑。蛋白酶K、Taq酶和dNTP,均購(gòu)自TaKaRa公司;SDS、苯酚、氯仿和無(wú)水乙醇,均為國(guó)產(chǎn)分析純,市售。

1.2方法

1.2.1引物設(shè)計(jì)與合成。參照GenBank上的PRV gE基因序列,應(yīng)用Primer5.0軟件設(shè)計(jì)1對(duì)引物,擴(kuò)增產(chǎn)物大小為276 bp,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。引物序列如下:F1:5′ GAGATGGGCATCGGCGATTAC 3′;R1:5′ GGGCGAGAAGAGCTGCGAGTG 3′。

1.2.2病毒DNA的提取。采用SDS蛋白酶K法提取PRV病毒基因組DNA,取病毒液500 μl,加SDS溶液至終濃度為1%和蛋白酶K至終濃度為200 μg/ml,56 ℃水浴1 h,加入等體積的酚-氯仿混合溶液,離心,取上清加入2倍體積無(wú)水乙醇沉淀病毒DNA,用75%乙醇洗滌后,加滅菌水溶解,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.3影響PCR反應(yīng)的幾個(gè)重要參數(shù)的優(yōu)化。在保持相同的反應(yīng)體系和反應(yīng)條件下,引物F1、R1(20 μmol/L)分別加入0.1、0.5、1.0和1.5 μl;DNA分別加入2、4、6和8 μl;退火溫度分別選擇58、60、62、64和66 ℃;經(jīng)PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化分別確定PCR反應(yīng)的最佳DNA用量、引物用量、退火溫度。

1.2.4特異性試驗(yàn)。用優(yōu)化確定的PCR反應(yīng)條件分別檢測(cè)PRV野毒、PRV疫苗毒的DNA以及PEDV、TGEV、PRRSV、CSFV的cDNA,核酸電泳鑒定PCR反應(yīng)的特異性。

1.2.5靈敏性試驗(yàn)。將提取的PRV DNA定量,適當(dāng)稀釋,使其含量分別為1.0、0.1、1.0×10-5、1.0×10-6 和1.0×10-7 μg,用優(yōu)化確定的PCR反應(yīng)條件分別對(duì)其進(jìn)行檢測(cè),核酸電泳鑒定PCR反應(yīng)的敏感度。

1.2.6重復(fù)性試驗(yàn)。分別選取PRV野毒、PRV疫苗毒、3份PRV野毒感染陽(yáng)性病料、3份陰性病料,重復(fù)檢測(cè)3次,核酸電泳鑒定PCR反應(yīng)的重復(fù)性。

1.2.7初步應(yīng)用-臨床病料的檢測(cè)。利用建立的PCR方法檢測(cè)疑似PRV野毒感染的臨床送檢組織病料34份,核酸電泳鑒定檢測(cè)方法的臨床適用性。

2結(jié)果與分析

3討論

目前,豬偽狂犬病在我國(guó)流行廣泛,要想逐步控制和消滅該病,在使用弱毒疫苗免疫的同時(shí),還要逐步排查與及時(shí)淘汰野毒感染豬,逐步實(shí)現(xiàn)PRV的凈化。近年來(lái),隨著對(duì)PRV研究的不斷深入,研究學(xué)者已建立了多種鑒別PRV強(qiáng)毒感染與弱毒疫苗的方法,如唐勇等[8]、陽(yáng)愛國(guó)等[9]、白靜等[10]分別建立了鑒別診斷PRV野毒抗體的gELAT、gEELISA、gEGICA血清學(xué)方法,這些針對(duì)gE抗體的血清學(xué)方法雖然能有效區(qū)分野毒感染抗體和疫苗免疫抗體,但病毒感染的早期和潛伏感染期并不產(chǎn)生抗體,故無(wú)法做到早發(fā)現(xiàn)、早淘汰。田云等[11]建立了鑒別PRV野毒株的熒光定量PCR檢測(cè)方法,但需熒光定量PCR儀等昂貴儀器,且檢測(cè)成本較高,操作較復(fù)雜,目前只應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。有待于尋找一種更廉價(jià)的、操作簡(jiǎn)單、且能夠檢測(cè)出病毒早期感染和潛伏感染,適合基層應(yīng)用的臨床診斷方法。PCR方法作為簡(jiǎn)單、常用的分子生物學(xué)診斷技術(shù),具有操作簡(jiǎn)單、特異性強(qiáng)、敏感性高和快速高效等優(yōu)點(diǎn)。故研究將PCR技術(shù)引入到PRV野毒感染的檢測(cè)中,建立了檢測(cè)PRV野毒的PCR方法。該方法可有效區(qū)分PRV野毒和疫苗毒,檢測(cè)PRV疫苗毒、PEDV、TGEV、PRRSV和CSFV均為陰性,可以檢測(cè)到10 pg PRV野毒DNA,具有靈敏、特異、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),可望用于臨床上PRV野毒感染的快速檢測(cè),以及PRV野毒和疫苗毒的鑒別診斷,對(duì)我國(guó)PR的凈化將起到一定的促進(jìn)作用。

參考文獻(xiàn)

[1] 魏春華,劉建奎,楊小燕,等.豬偽狂犬病病毒的分離鑒定及其gE基因序列分析[J].福建畜牧獸醫(yī),2012,34(4):1-3.

[2] MULLEL T,HAHN E C,TOTTEWITZ F,et al.Pseudorabies virus in wild swine:a global perspective[J].Arch Virol,2011,156(10):1691-1705.

[3] PASDELOUP D,LABETOULLE M,RIXON J F.Differing effects of herpes simplex virus 1 and pseudorabies virus infections on centrosomal function[J].J Virol,2013,87(12):7102-7112.

[4] 楊睿,翟少欽,王孝友,等.重慶地區(qū)豬偽狂犬野毒株感染的流行病學(xué)調(diào)查[J].黑龍江畜牧獸醫(yī),2013(1):96-97.

[5] MAHMOUD H Y,SUZUKI K,TSJI T,et al.Pseudorabies virus infection in wild boars in Japan[J].J Vet Med Sci,2011,73(11):1535-1537.

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