董 曦,孫桂波,邢小燕,孫曉波
(中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所,北京 100193)
Micro RNA(miRNA)是一類(lèi)內(nèi)源性小RNA分子,其長(zhǎng)度約為22nt,通過(guò)降解mRNA或抑制其翻譯來(lái)調(diào)控基因表達(dá)[1]。miRNA于1993年被發(fā)現(xiàn),并被證實(shí)參與了許多細(xì)胞通路的調(diào)節(jié),是重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)物。曾經(jīng)的研究認(rèn)為,絕大部分人類(lèi)miRNA基因都不成簇存在于基因組內(nèi)[1]。然而,Altuvia等[2]通過(guò)對(duì) miRNA基因進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),約37%的已知人類(lèi)基因是成簇存在的。另一篇關(guān)于黑腹果蠅(D.melanogaster)的研究也指出[3],黑腹果蠅的 miRNA也是高度成簇存在于基因組內(nèi)的。這種排列的方式使得功能上相關(guān)的miRNA可以多順?lè)醋拥男问奖晦D(zhuǎn)錄。miRNA的功能涉及眾多的生物學(xué)進(jìn)程,包括增殖、凋亡、發(fā)育以及分化等,其異常表達(dá)更是與許多疾病相關(guān)。在miRNA分子中,存在一段由6個(gè)堿基組成的序列,稱(chēng)為“種子序列”(seed sequences)。種子序列與miRNA與目標(biāo)mRNA的識(shí)別有關(guān),它可以與靶mRNA的3’UTR結(jié)合,繼而引起轉(zhuǎn)錄抑制或mRNA的降解,也因此成為預(yù)測(cè)miRNA目標(biāo)mRNA的理論基礎(chǔ)[4]。
miR-106b-25簇 micro RNA包括 miR-106b、miR-93和miR-25,位于人第七染色體 MCM-7基因的第13內(nèi)含子處[5]。雖然miR-106b-25簇以多順?lè)醋拥男问奖晦D(zhuǎn)錄,但由于其種子序列不同,miR-106b-25簇分屬于兩個(gè)不同家族:miR-17家族,種子序列為AAAGUG,包括miR-106b、miR-93;miR-25家族,種子序列為AUUGCA,包括miR-25。雖然關(guān)于miR-106b-25簇的研究還比較有限,但是miR-106b-25簇涉及腫瘤的凋亡、增殖等生物進(jìn)程。本文將對(duì)最近miR-106b-25簇與腫瘤的研究做一綜述。
miR-106b-25簇miRNA在許多腫瘤中表達(dá)上調(diào),包括胃癌、食道癌、結(jié)腸癌和慢性淋巴細(xì)胞白血病等[6-9]。而除了在腫瘤細(xì)胞中的異常表達(dá),循環(huán)miR-106b及其他一些miRNA在胃癌患者血漿中的濃度也明顯提高[10]。
miR-106b-25簇與腫瘤的關(guān)系,可首先被理解為抗凋亡。有研究表明[11],miR-25可以抑制Bcl-2家族中Bim的翻譯來(lái)降低其表達(dá),并最終產(chǎn)生抗凋亡作用。此外,caspase-7也被證實(shí)可被miR-106b直接調(diào)節(jié)[12]。miR-106b-25簇還能夠促進(jìn)腫瘤組織的血管生成。miR-93可以促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增長(zhǎng)并增加腫瘤組織內(nèi)的血管密度,而血管生成作用的增加反過(guò)來(lái)又促進(jìn)了腫瘤細(xì)胞的增長(zhǎng),這種作用可能是通過(guò)miR-93抑制 integrin-β8實(shí)現(xiàn)的[13]。
miR-106b-25簇還與腫瘤細(xì)胞的增殖有關(guān),這一功能主要涉及RB(retinoblastoma)通路。在RB通路中,CDK4/6及cyclin D可以磷酸化RB,使轉(zhuǎn)錄因子E2F從RB/E2F復(fù)合物中游離出來(lái),繼而啟動(dòng)細(xì)胞的G1-S期轉(zhuǎn)換。由于MCM-7的啟動(dòng)子部分存在E2F的結(jié)合位點(diǎn),RB可以通過(guò)E2F來(lái)控制MCM-7及miR-106b-25簇的表達(dá),并且p21及PTEN的mRNA都是miR-106b-25簇的下游靶標(biāo),因此,RB通路最終可通過(guò)miR-106b-25簇來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞周期,促進(jìn)細(xì)胞進(jìn)入 S期[14]。盡管還沒(méi)有研究界定miR-106b-25簇在G1-S期轉(zhuǎn)換中的貢獻(xiàn),但是 miR-106b-25簇至少部分地參與了該轉(zhuǎn)換[11]。而亦有研究指出,miR-106b可以直接調(diào)節(jié)RB來(lái)促進(jìn) G1-S期轉(zhuǎn)換[15]。
在調(diào)節(jié)G1-S期轉(zhuǎn)換的功能上,miR-106b與E2F轉(zhuǎn)錄因子的研究更為豐富。由于E2F在G1-S期轉(zhuǎn)換中起到關(guān)鍵作用,因此許多研究者都將目光投向了這里。Trompeter等[16]的研究表明,miR-106b及其他一些miRNA可以提高E2F轉(zhuǎn)錄因子的活性來(lái)促進(jìn)G1-S期轉(zhuǎn)換,并促進(jìn)細(xì)胞增殖。由于E2F可以控制 miR-106b-25簇的表達(dá)[14,17],因此 E2F與miR-106b-25簇之間可能存在負(fù)反饋機(jī)制。值得一提的是,抑癌基因 p53及 p21與miR-106b-25簇亦有關(guān)聯(lián)。Brosh等[17]發(fā)現(xiàn),p53可以通過(guò)E2F來(lái)抑制miR-106b的表達(dá),這樣可以阻止DNA損傷的細(xì)胞增殖。由于miR-106b或miR-93可以分解p21的mRNA來(lái)抑制其表達(dá),p21又是p53的下游靶基因,是p53細(xì)胞增殖抑制作用的執(zhí)行者,因此這可能是miR-106b-25簇致癌的機(jī)制之一。此外,miR-106b-25簇還可以調(diào)節(jié)由p21介導(dǎo)的細(xì)胞周期檢查點(diǎn),阻止細(xì)胞的G1期阻滯[18]。有意思的是,Bueno等[19]的研究表明,與前面提到的相反,miR-106b-25簇可與其他一些miRNA對(duì)細(xì)胞進(jìn)入S期產(chǎn)生消極作用,從而使細(xì)胞免受復(fù)制應(yīng)激(replicative stress)的影響。PTEN作為另一種抑制細(xì)胞增殖或腫瘤抑制蛋白,也受到miR-106b-25簇的抑制,這種抑制與miR-106b-25簇的成瘤性有關(guān)[14]。
miR-106b-25簇可以通過(guò)TGFβ信號(hào)通路實(shí)現(xiàn)其功能。TGFβ信號(hào)通路與細(xì)胞增殖、分化、凋亡等的調(diào)節(jié)有關(guān),TGFβ因子可以通過(guò)TGFβⅠ型受體(TβRⅠ)和TGFβⅡ型受體(TβRⅡ)以及各種Smad將信號(hào)傳導(dǎo)至細(xì)胞核,繼而調(diào)節(jié)基因表達(dá)。TGFβ因子可以介導(dǎo)TβRⅠ和TβRⅡ組裝成復(fù)合物,該復(fù)合物可以激活細(xì)胞內(nèi)的磷酸化級(jí)聯(lián)反應(yīng)。在此級(jí)聯(lián)反應(yīng)中,Smad2和Smad3被磷酸化并復(fù)合成為Smad4,然后轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核內(nèi),通過(guò)與轉(zhuǎn)錄因子的相互作用來(lái)調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。另一方面,Smad6和Smad7可以抑制Smad2/3的信號(hào)傳導(dǎo)[20-21]。TGFβ信號(hào)通路通常作為腫瘤抑制的途徑,因此在腫瘤中被抑制。miR-106b簇可以下調(diào)作為T(mén)GF-β通路效應(yīng)物的p21與Bim,繼而干擾TGFβ依賴(lài)的細(xì)胞周期阻滯,擾亂胃癌細(xì)胞細(xì)胞周期檢控點(diǎn)(cell cycle checkpoint),并對(duì)抗TGF-β依賴(lài)的凋亡[22]。在神經(jīng)細(xì)胞中,miR-106b可直接負(fù)向調(diào)節(jié)TβRⅡ表達(dá),其機(jī)制是通過(guò)與TβRⅡmRNA結(jié)合來(lái)抑制翻譯。此外,還發(fā)現(xiàn)在miR-106b穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的神經(jīng)細(xì)胞中,磷酸化 Smad2/3水平下降,而 Smad6/7水平增加[21]。這表明,除了負(fù)向調(diào)節(jié)TβRⅡ表達(dá)外,miR-106b簇可能通過(guò)與Smad的相互作用來(lái)抑制TGFβ通路。在TGFβ缺失的胃癌細(xì)胞中,miR-106b-25簇并不能明顯改變其增殖和存活,因此有人認(rèn)為miR-106b-25簇主要通過(guò)TGFβ通路發(fā)揮作用[20]。
然而,TGFβ信號(hào)通路的作用是多樣的。在腫瘤進(jìn)程中,腫瘤細(xì)胞會(huì)從其抑瘤的作用中逃逸,并將TGFβ的信號(hào)“轉(zhuǎn)換”成為一種促進(jìn)信號(hào),即通過(guò)該信號(hào)來(lái)增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)、運(yùn)動(dòng)、存活、入侵、血管形成和免疫抑制[23]。Six1可通過(guò)上調(diào)miR-106b-25簇來(lái)轉(zhuǎn)換TGFβ信號(hào),即活化作為促進(jìn)腫瘤進(jìn)程TGFβ信號(hào),而這一作用是通過(guò)抑制Smad7來(lái)實(shí)現(xiàn)的[24]。這一結(jié)果提示,miR-106b-25簇參與了TGFβ信號(hào)通路的抑瘤和促瘤功能。有意思的是,該研究并未發(fā)現(xiàn)miR-106b-25簇對(duì)TβRⅡ的抑制作用,這與剛才提到的神經(jīng)細(xì)胞[21]中的情況不同,這可能與TGFβ信號(hào)轉(zhuǎn)換有關(guān)。
除了TGFβ信號(hào)通路之外,miR-106b-25簇也是insulin/IGF通路的一部分。盡管相關(guān)研究還較少,但是miR-106族的表達(dá)可以下調(diào)PTEN,而PTEN是insulin/IGF通路中重要的抑制物,并且具有抑制腫瘤和細(xì)胞周期進(jìn)行的功能。除此之外,insulin/IGF通路中許多mRNA都是miR-25的潛在靶mRNA,并且FoxO轉(zhuǎn)錄因子—insulin/IGF通路下游的效應(yīng)物,可以與 miR-106b-25簇的調(diào)節(jié)區(qū)(regulatory region)結(jié)合[25-26]。
盡管micro RNA發(fā)現(xiàn)的時(shí)間并不長(zhǎng),但是由于其參與了細(xì)胞調(diào)控的諸多方面,尤其在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中有著重要作用,各國(guó)研究者都將目光投向了該領(lǐng)域。miR-106b-25簇與腫瘤存在著諸多聯(lián)系,其在腫瘤發(fā)展過(guò)程中的作用及相關(guān)靶點(diǎn)的關(guān)系見(jiàn)Tab 1。對(duì)miR-106b-25簇的研究,能夠更加清晰地描繪腫瘤的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程,從而對(duì)腫瘤的治療產(chǎn)生積極的影響,如促進(jìn)腫瘤凋亡,抑制腫瘤增殖等。此外,由于循環(huán)miR-106b胃癌患者血漿中的濃度明顯提高[10],也可將其作為預(yù)測(cè)腫瘤預(yù)后或發(fā)展的生物標(biāo)記。亦有研究[27]表明miR-106b-25簇與腫瘤干細(xì)胞的耐藥性有關(guān),該方向也可作為下一步的研究課題。伴隨生物信息學(xué)的不斷發(fā)展完善,我們或許能夠看清不同micro RNA的復(fù)雜聯(lián)系,以及micro RNA-蛋白質(zhì)間的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,從而啟發(fā)我們關(guān)于腫瘤治療的新思路。
Tab 1 Targets and functions ofm ir-106b-25 cluster
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