黃建新 黃建平 張 旸 張黎仙 楊坤榮 陳清泉▲
1.福建省立醫(yī)院檢驗科,福建福州 350001;2.福建醫(yī)科大學附屬協(xié)和醫(yī)院病理科,福建福州 350001;3.福建醫(yī)科大學附屬協(xié)和醫(yī)院檢驗科,福建福州 350001;4.福建醫(yī)科大學醫(yī)學技術與工程學院醫(yī)學檢驗系,福建福州 350004
rs2233678和rs2233679多態(tài)性與福建漢族人群肺癌易感性及臨床病理學特征的關系
黃建新1黃建平2張 旸3張黎仙4楊坤榮4陳清泉4▲
1.福建省立醫(yī)院檢驗科,福建福州 350001;2.福建醫(yī)科大學附屬協(xié)和醫(yī)院病理科,福建福州 350001;3.福建醫(yī)科大學附屬協(xié)和醫(yī)院檢驗科,福建福州 350001;4.福建醫(yī)科大學醫(yī)學技術與工程學院醫(yī)學檢驗系,福建福州 350004
目的 了解福建漢族人群肽酰脯氨酰基順反異構(gòu)酶1(Pin1)基因rs2233678(-842G/C)和rs2233679(-667T/ C)多態(tài)性分布規(guī)律及其與肺癌發(fā)生、發(fā)展的關系。 方法 采用聚合酶鏈反應(PCR)技術,對80例漢族肺癌患者和135例健康對照的Pin1基因啟動子進行擴增并對PCR產(chǎn)物直接測序,分析Pin1基因啟動子多態(tài)性與肺癌易感性及其臨床病理學特征的關系。 結(jié)果rs2233678位點只檢測到GG和GC兩種基因型,沒有檢測到CC基因型。rs2233678和rs2233679位點的等位基因和基因型分布在肺癌組和健康對照組中比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);其組成的單體型C-C、G-C和G-T均與肺癌發(fā)生風險無相關性(P>0.05),rs2233678的基因型分布與肺癌的臨床病理學特征無相關性 (P>0.05),rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型呈弱相關 (r=0.285,P=0.010)。結(jié)論rs2233678和rs2233679多態(tài)性可能與福建漢族人群肺癌易感性無關,rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關性。
肺癌;肽酰脯氨?;樂串悩?gòu)酶1;多態(tài)性;易感性
肽酰脯氨?;樂串悩?gòu)酶1(peptidyl-prolyl cistrans isomerase NIMA-interacting 1,Pin1)是一種高度保守、特異的肽脯氨?;樂串悩?gòu)酶,能特異性地催化磷酸化絲/蘇-脯氨酸基序發(fā)生順反異構(gòu),影響許多癌基因信號通路中β-catenin[1]、NF-кB[2]等關鍵蛋白的活性和穩(wěn)定性,在細胞增殖和腫瘤發(fā)生、發(fā)展中起重要作用[3],被認為是一種新的腫瘤預后因子和抗癌治療的靶標[3-6]。Pin1基因多態(tài)性的研究主要集中在啟動子區(qū)的-842G/C(rs2233678)和-667T/C(rs2233679)兩個多態(tài)性位點上。流行病學研究顯示,Pin1基因多態(tài)性與乳腺癌、肝癌、肺癌、食管癌、頭頸部鱗癌及喉部鱗癌等多種腫瘤易感性密切相關,但研究結(jié)果存在明顯的分歧:有些研究者認為,-842G/C的C基因變異是腫瘤發(fā)生的保護因子,可以降低亞洲人和白種人群頭頸部鱗癌、肺癌和乳腺癌的發(fā)病風險[7-11];有些研究顯示,-667T基因可以明顯降低亞洲人群的腫瘤易感性[8];還有研究認為-842G/C[12]和-667T/C[7,10-12]與腫瘤的易感性無關。至今仍未見Pin1基因多態(tài)性與福建地區(qū)漢族人群肺癌易感性的報道,因此,為明確Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性和臨床病理特征的關系,本研究對福建漢族肺癌患者Pin1基因的rs2233678 (-842G/C)和rs2233679(-667T/C)多態(tài)性位點進行分析。
1.1 一般資料
收集2013年7~12月在本院住院并手術確診的80例肺癌患者作為肺癌組,其中男性52例(65.0%),女性28例(35.0%);平均年齡為(59.1±11.8)歲;腺癌54例(67.5%),鱗癌17例(21.3%),其他類型肺癌9例(11.2%)。同時選取同期135例體檢正常者作為健康對照組,其中男性79例 (58.5%),女性56例(41.5%);平均年齡為(57.6±11.3)歲。兩組的年齡、性別比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),具有可比性。所有研究對象均為出生并長期生活在福建地區(qū)的漢族人。
1.2 檢測方法
1.2.1 基因組DNA抽提 知情同意后,取患者及健康對照外周靜脈血2 ml,EDTA抗凝。所有標本置入-20℃保存?zhèn)溆没蛄⒓窗丛噭┖胁僮鞑襟E進行DNA提取。全血基因組DNA抽提試劑盒由北京康為世紀生物科技有限公司提供。
1.2.2 PCR引物及PCR反應 應用Primer 5.0軟件自行設計引物,上游引物:5′-AGGGTTCTATGCTAGGTGAACTG-3′;下游引物:5′-TATTGGCTAGACGCGCTCTG-3′(生工生物工程上海股份有限公司合成),該引物擴增產(chǎn)物為919 bp,包含Pin1基因啟動子區(qū)-842G/C (rs2233678)和-667T/C(rs2233679)區(qū)域。根據(jù)文獻[13]配制PCR反應體系,在ABI 2720型PCR儀上95℃預變性5 min后,進行95℃30 s→55℃30 s→72℃1 min,循環(huán)35次,72℃再延伸10 min。1.5%的瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果。
1.2.3 PCR產(chǎn)物純化和回收 使用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(天根生化科技有限公司),按使用說明操作,進行PCR產(chǎn)物的純化和回收。
1.2.4 測序 純化后的PCR產(chǎn)物用全自動測序儀(ABI377型,Applied Biosystems公司)進行測序。
1.2.5 臨床病理資料收集 收集所有肺癌患者的病理組織類型及TNM分期等資料,并記錄所有研究對象的年齡、性別等一般資料。
1.3 統(tǒng)計學處理
采用SPSS 18.0統(tǒng)計軟件對數(shù)據(jù)進行分析和處理,計量資料以±s表示,采用t檢驗,計數(shù)資料采用χ2檢驗,相關性強度采用Spearman相關分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 Pin1基因rs2233678和rs2233679位點的各基因型
對80例肺癌組和135例健康對照組的Pin1基因 rs2233678和 rs2233679位點進行測序分析,rs2233678位點只檢測到GG和GC兩種基因型,未檢測到CC基因型;rs2233679位點TT、TC和TT三種基因型均可檢測到。rs2233678和rs2233679位點的各基因型見圖1。
圖1 Pin1基因rs2233678和rs2233679位點的各基因型
2.2 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型頻率、單體型頻率及其與肺癌易感性的關系
肺癌組和健康對照組中Pin1基因rs2233678和rs2233679位點基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律;rs2233678和rs2233679等位基因、基因型和單體型頻率在肺癌組和健康對照組中比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)(表1)。
表1 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型頻率、單體型頻率及其與肺癌易感性的關系
2.3 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型與肺癌臨床病理學特征的關系
Pin1基因rs2233678基因型頻率與病理類型、TNM分期無關(P>0.05);rs2233679基因型頻率與病理類型呈弱相關(r=0.285,P=0.010)(表2、表3)。
表2 Pin1基因rs2233678基因型與肺癌臨床病理學特征的相關性
表3 Pin1基因rs2233679基因型與肺癌臨床病理學特征的相關性
Pin1基因定位于19p13,編碼含163個氨基酸殘基的核蛋白Pin1,相對分子量為18,包含兩個功能結(jié)構(gòu)域:N端的WW區(qū)和C端的肽基脯氨酰異構(gòu)酶活性區(qū)[3]。Pin1在許多腫瘤中高表達[14-15],不僅可以引起多條腫瘤信號通路關鍵蛋白的構(gòu)象變化[2],而且影響DNA的損傷修復[16],在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。
本研究首次描述了福建漢族人群 Pin1基因rs2233678和rs2233679位點的多態(tài)性分布規(guī)律,發(fā)現(xiàn)rs2233678和rs2233679位點的等位基因、基因型分布及其單體型均與肺癌風險無關,rs2233679基因型分布與肺癌的病理類型僅呈弱相關,與Naidu等[12]對乳腺癌的研究基本一致。與本研究結(jié)果不一致的是Lu等[11]發(fā)現(xiàn)rs2233678的C基因變異明顯降低患肺癌的風險,進一步的功能研究發(fā)現(xiàn)C基因變異可以降低轉(zhuǎn)錄活性;Zhu等[8]發(fā)現(xiàn)rs2233679的T基因型明顯降低亞洲人的患癌易感性。相關研究發(fā)現(xiàn)rs2233679多態(tài)性與患癌風險無關[7,11]。研究結(jié)果不一致,一方面可能是樣本量的大小不同所致,另一方面可能是不同地區(qū)的患者可能有不同的種族或遺傳背景所致[11,17]。這些差異可能會改變多態(tài)性位點的等位基因和基因型頻率在病例組和對照組中的分布,進而影響多態(tài)性位點與患癌風險的統(tǒng)計效力,因此,有必要進行多地區(qū)、多種族的大樣本量研究來進一步證實Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性的關系。
綜上所述,Pin1基因rs2233678和rs2233679位點多態(tài)性可能與福建漢族肺癌風險無關,rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關性,這為Pin1多態(tài)性與腫瘤易感性的研究豐富了數(shù)據(jù),也為無法手術的肺癌患者的病理類型推測提供了思路。當然,由于本研究的樣本量有限,也沒有進行rs2233678 和rs2233679基因型與Pin1表達量及活性的研究,因此,有關Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性仍有待于進一步深入研究。
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The relationship between rs2233678 and rs2233679 polymorphism and susceptibility and clinical pathological characteristics of lung cancer in Fujian Han ethnic group
HUANG Jian-xin1HUANG Jian-ping2ZHANG Yang3ZHANG Li-xian4YANG Kun-rong4CHEN Qing-quan4▲1.Department of Laboratory Medicine,Fujian Provincial Hospital,Fuzhou 350001,China;2.Department of Pathology, Union Hospital Affiliated to Fujian Medical University,Fuzhou 350001,China;3.Department of Laboratory Medicine, Union Hospital Affiliated to Fujian Medical University,Fuzhou 350001,China;4.Department of Laboratory Medicine, Medical Technology and Engineering College of Fujian Medical University,Fuzhou 350004,China
ObjectiveTo explore the relationship between the peptidyl-propyl-cis/trans isomerase 1(Pin1)rs2233678(-842G/C)and rs2233679(-667T/C)polymorphic variants and occurrence and development of lung cancer in Fujian Han ethnic group.MethodsThe polymerase chain reaction(PCR)-directly sequencing was used to detect the genotypes of Pin1 gene in 80 patients with lung cancer and 135 healthy control people.The relation between Pin1 gene promoter polymorphism and susceptibility and clinical pathological characteristics of lung cancer were analysed.ResultsBoth GG and GC two genotypes,except CC genotype were detected in rs2233678.The allele and genotype distribution of rs2233678 and rs2233679 between lung cancer group and healthy control group showed lack of statistical difference(P>0.05).C-C, G-C,G-T of the rs2233679 genotypes had no correlation with lung cancer risk(P>0.05).The genotype distribution of rs2233678 had no correlation with clinical pathological characteristic of lung cancer(P>0.05).Genotype distribution of rs2233679 and pathological type of lung cancer showed a weak correlation(r=0.285,P=0.010).Conclusionrs2233678 and rs2233679 polymorphism may be not associated with the susceptibility to lung cancer in Fujian Han ethnic group. There is some correlation between the distribution of rs2233679 genotypes and pathological type of lung cancer.
Lung cancer;Pin1;Polymorphism;Susceptibility
R734.2
A
1674-4721(2014)10(c)-0004-04
2014-08-11本文編輯:李亞聰)
國家級大學生創(chuàng)新性實驗計劃項目(20131 0392025);福建省教育廳基金項目(JA12147);福建省自然科學基金項目(2014J01337)
黃建新(1982-),男,碩士研究生,福建南安人,主管技師,主要從事臨床檢驗工作
▲通訊作者:陳清泉(1981-),男,碩士,福建安溪人,講師,主要從事醫(yī)學檢驗教育和臨床分子生物學研究