秦曉紅
【摘要】目的總結生物測定分子遺傳標記技術在中藥材鑒定領域的應用。方法查閱、歸納、整理近年來國內外有關中藥生物測定的研究文獻。結果DNA分子遺傳標記技術具有微量、快速、特異性強、準確可靠、對樣本要求較低的特點。結論DNA分子鑒定對中藥種類與資源等方面的研究起到重要作用。
【關鍵詞】DNA分子遺傳標記;PCR;RAPD
doi:10.3969/j.issn.1004-7484(s).2014.01.574文章編號:1004-7484(2014)-01-0472-01
中藥治療疾病在中國已有幾千年歷史,特別是治療慢性、消耗性疾病具有獨特的、西藥不可替代的作用。中藥品種繁多,同一種中藥,由于物種及產地的不同,其質量差異較大,而質量(品質)與中醫(yī)臨床療效密切相關。因此,為了保證臨床用藥的安全及質量和療效的穩(wěn)定,準確、迅速、簡捷的中藥鑒定方法的建立已成為當務之急。中藥鑒別所依據的遺傳標記主要有形態(tài)標記、生化標記(包括免疫學標記)、組織細胞標記。這些標記都是基因表達的產物,易受生理狀態(tài)、生長環(huán)境、貯藏加工、生長期、品種等的影響,且標記數目有限,急需新的遺傳標記技術。自從Bostein和White等于1980年利用RFLP作為遺傳標記,開創(chuàng)了直接應用DNA多態(tài)性發(fā)展遺傳標記的新階段。近年來,隨著分子生物學技術的進步,DNA分子標記的新技術不斷涌現,DNA分子標記技術在中藥的應用報道逐漸增多。由于DNA分子標記技術具有快速、微量、特異性強、準確可靠等特點,且不受生育階段、供試部位、環(huán)境條件、貯藏等因素的影響,在中藥研究中展示了廣闊的應用前景。
1DNA遺傳標記的應用范圍
1.1鑒定植物種類隨著分子生物學技術的發(fā)展,DNA分子遺傳標記技術已廣泛應用于植物品種的整理研究。我國南方部分省區(qū)有多種菊科不同屬的植物如地膽草、一點紅、苦荬菜、毛大子草、山萵苣、苦苣菜以“土公英”混作蒲公英使用。曹暉等[1]利用Ap-PCR和RAPD分子標記技術對蒲公英及六種土公英混淆品進行了DNA指紋鑒別研究,結果顯示它們的DNA指紋圖譜存在明顯差異,利用這種差異可以從分子水平上鑒別蒲公英及其混淆品此外,淫洋藿屬八種植物、云南八種木藍屬植物、山冬麥屬四種植物等用RAPD技術也得到了準確地鑒定。
1.2鑒定藥材道地性道地藥材的優(yōu)良品質是道地藥材基因型與特定的環(huán)境條件長期作用的結果,特定的基因產生特定的酶,進而調控次生代謝產物等有效成分的產生,因而特定的基因是藥材道地性形成的關鍵。由于道地藥材與非道地藥材來源于相同或相近的物種種類,在形態(tài)、生藥性狀及化學成分等特征上也常表現出高度的相似性,因而采用傳統(tǒng)的方法進行道地藥材的鑒別是十分困難的,具有很大的主觀性。隨著分子生物學技術的快速發(fā)展,作為現代分子生物學技術重要手段的RAPD技術的應用,使從分子水平進行道地藥材的快速、準確鑒定成為可能。近年來應用RAPD技術進行道地藥材的鑒定已取得了一些有價值的研究成果,例如枸杞、姜黃、溪黃草、當歸、金銀花等藥用植物道地性的研究。枸杞主產于寧夏、甘肅、青海、內蒙等地,以寧夏產為最佳道地藥材。李軍等[2]比較了來自寧夏和內蒙兩地的枸杞的RAPD指紋,結果表明,RAPD方法可以很好地鑒定不同來源的枸杞材料。王朝暉[3]等研究了4個來源的穿心蓮RAPD圖譜。結果各穿心蓮RAPD圖譜之間可見差異條帶,表明不同產地的穿心蓮基因確已發(fā)生了微小的變異,這種變異可能是導致不同產地穿心蓮質量差異的基礎之一。
2DNA遺傳標記的類別
根據目的基因所在細胞器的不同可分為核DNA標記、線粒體DNA標記和葉綠體DNA標記。線粒體DNA標記主要用于動物的起源進化、親緣關系、遺傳變異、物種鑒別等研究;核DNA和葉綠體DNA分子標記主要存在于高等植物中,尤以核DNA分子標記的應用最多。
DNA分子標記是近年來隨著核酸分子技術的發(fā)展而研發(fā)的,在基因定位、品種鑒定、遺傳圖譜構建等方面得到了廣泛的應用。根據DNA分子標記所采用的核心技術大體上可分為兩大類。一是以PCR為基礎的DNA分子標記技術,另一類是以分子雜交(southern雜交)為基礎的DNA分子標記技術。
基于PCR技術的DNA分子標記鑒別的研究方法依據分析對象可分為兩類:其一是采用檢測基因組DNA的多態(tài),如隨機擴增多態(tài)性DNA、AP-PCR、擴增內切酶片斷多態(tài)性等方法,又稱為PCR-DNA指紋法;其二是檢測特定片斷DNA的多態(tài),即以特定的基因(或短片斷的DNA)為研究對象,如PCR產物的限制性片斷長度多態(tài)性、等位基因特異PCR、DNA直接測序等方法。
3對PCR的影響因素
3.1植物核DNA的提取目前多采用CTAB法。CTAB是一種去污劑。它能跟核酸形成復合物,這些復合物在高鹽溶液(0.7mol/lNacl)中可溶并且穩(wěn)定存在,但如果降低鹽的濃度(0.3mol/INacl),CTAB與核酸的復合物就會因溶解度降低而沉淀出來,但大部分蛋白及多糖仍溶于液中。
3.2模板純度各濃度等對PCR的影響王培訓等[4]以各地產西洋參為研究對象,對影響中藥材隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)的若干問題進行了探討。研究發(fā)現,中藥材DNA模板的降解程度、純度、濃度,酶的濃度,M92+濃度以及循環(huán)參數等諸多因素皆會不同程度的影響擴增結果,同時推薦一個較為適用的循環(huán)參數。模板純度對PCR的影響:分子生物學的各類研究,通常需獲得高純度的DNA,然而在中藥飄揚的RAPD研究中,當模板中含有一定量的雜質時,并不影響擴增結果。模板濃度對PCR的影響:對PCR有一定影響,但在一定范圍內其擴增結果基本相同。反應介質:BSA能影響PCR擴增結果,不加BSA雖能進行的增,但其條帶數少于加少BSA的反應。BSA濃度在0.5-2.0g/l其條帶基本一致。此外根據經驗,中藥材的RAPD擴增Tap酶通常須1.5U/25uL以上方能進行較好擴增,這可能與各廠家Tap酶活性和我們提取的模板中帶有某些抑制成分有關。Mg2+、dNTP對擴增結果影響不大,主要是對弱帶的影響。
3.3引物的篩選問題商品中藥材基因組DNA降解程度差別較大,但合適的引物可得到基本一致的DNA指紋圖譜。通常RAPD的產物在200.3000bp形成指紋圖,但能使中藥材擴增出200.1500bp條帶的引物較為合適,因為在此范圍內,不同時間樣品易出現相同條帶即重現性好。
3.4擴增條件在其他參數條件相同時,樣品DNA降解相對較為重的模板,在用某些引物擴增時,反應循環(huán)數要適應增加,才能得到有效擴增。
3.5污染由于PCR的強大功能與檢測的靈敏性,極微量的污染便可導致假陽性結果。故每次PCR反應一定要設立陰性對照孔,檢測污染情況。
4小結與展望
中藥走向世界,質量保證是一個重要的方面。DNA分子遺傳標記技術在中藥鑒定及其相關研究方面具有獨到的優(yōu)勢和廣闊的應用前景,但目前尚處于探索階段。各種DNA分子遺傳技術存在一定的局限性,有待進一步規(guī)范和完善。利用DNA分子遺傳標記技術,開發(fā)有關藥用動物遺傳背景與化學成分相關性的研究,實現中藥品種——質量標準化、基因工程生產天然活性成分尋找和擴大新藥源;開發(fā)中藥重要性狀包括品質、產量和抗性的分子標記,實現中藥材分子育種及品質人工調控,將是中藥分子鑒定學的挑戰(zhàn)又是現實意義的大課題。
參考文獻
[1]曹暉,畢培曦,邵鵬柱.香港市售蒲公英及其混淆品蒲公英的DNA指紋鑒別研究[J].中國中藥雜志,1997,22(4):197.
[2]李軍,郭晏海,秦雪梅.DNA隨機擴增多態(tài)性分析技術在枸杞道地藥材鑒定中的應用[J].中醫(yī)藥研究,2002,18(3):48-49.
[3]王朝暉,李勁平,王培訓.不同產地穿心蓮藥材的RAPD鑒別初步研究[J].中醫(yī)藥導報,2006,12(5):4-5,8.
[4]王培訓,黃豐,等.商品西洋參DNA指紋圖譜鑒別[J].中藥新藥與臨床藥理,1999,10(6):367.