陳申秒等
摘 要:對(duì)東營(yíng)地區(qū)規(guī)?;怆u養(yǎng)殖場(chǎng)近兩年送檢的病死雞進(jìn)行分子檢測(cè),確定NDV和IBV的發(fā)生率很高,針對(duì)具有典型特征的NDV和IBV分離株分別進(jìn)行了F基因和S1基因的測(cè)定和分析,確定為腎型傳支和基因7型新城疫,通過與流行毒株和疫苗毒株的分析為以后該地區(qū)的防疫提供幫助。
關(guān)鍵字:NDV;IBV;進(jìn)化分析
2012年初至2013年7月,本單位收到東營(yíng)多個(gè)規(guī)模化肉雞場(chǎng)送檢的病死肉雞近1000例,經(jīng)剖檢、分子生物學(xué)檢測(cè)﹑分離鑒定及測(cè)序分析,確診為腎性傳支IBV和基因7型NDV病毒的流行。將具有代表性的IBV分離株命名為DY717-IBV;NDV分離株命名為DY717-NDV,從分子學(xué)上對(duì)其進(jìn)行了遺傳分析,希望為該地區(qū)傳染性支氣管炎和雞新城疫的防治提供幫助。
1 剖檢病變
腎臟腫大,尿酸鹽大量沉積,“花斑腎”十分典型,沿腎臟出現(xiàn)明顯的尿酸鹽沉積線,干酪物,氣管出血和支氣管出血(圖1、2、3)。
2 分子生物學(xué)檢測(cè)診斷
3 分離毒株DY717-IBV、DY717-NDV測(cè)序分析結(jié)果
將分離得到的DY717-IBV、DY717-NDV經(jīng)分子生物學(xué)方法分別對(duì)IBV的S基因進(jìn)行基因克隆,送至北京華大基因測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序,將獲得的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行了比對(duì)分析。
3.1 DY717-IBV的S基因分析
DY717-IBV與本實(shí)驗(yàn)室自行分離的IBV野毒株及保存的相關(guān)疫苗毒株,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增其S1基因,測(cè)序后與傳統(tǒng)的經(jīng)典毒株共同進(jìn)行基因和推導(dǎo)的氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析,其中H120,IBV-H52株,W491株,W93株均為疫苗毒株;LC株,IBX株,SC0901株(四川),zhejianghuzhou8株(浙江),Taiwan株(臺(tái)灣),SD10株,RZ株(日照)CAL99-07株,LNX株均為近些年國(guó)內(nèi)流行毒株。DY717-IBV為東營(yíng)分離株;以上毒株的S1基因序列均被本實(shí)驗(yàn)室送往北京華大基因測(cè)序結(jié)果。
由圖5可知,DY717-IBV分離株與H120株,CH-LNX株,RZ株,浙江株,四川株等國(guó)內(nèi)毒株的核苷酸序列同源性較高,都在96%~98.6%之間。江蘇分離株與M41株的同源性為77.8%,與491株的同源性為78.4%。
由圖6可知,S基因的裂解氨基酸序列分別為HRRRR、RRFRR、RRLRR;根據(jù)S1基因的序列和分子遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn):HRRRR是中國(guó)IBV腎型毒株近年新出現(xiàn)的裂解位點(diǎn)。疫苗株M1與491株,CAL99株,臺(tái)灣株的裂解位點(diǎn)為RRF/LRR;H120株,LNX株,SD10株,浙江株的裂解位點(diǎn)均為HRRRR。東營(yíng)肉雞DY717-IBV分離株的裂解位點(diǎn)同樣也為HRRRR,DY717-IBV分離株為典型的腎型毒株。
3.2 DY717-NDV的測(cè)序分析結(jié)果
新城疫是由雞副黏病毒引起的一種急性,高度接觸性傳染和致死性的傳染病,是嚴(yán)重危害養(yǎng)雞業(yè)發(fā)展的重要疫病之一。新城疫病毒囊膜上的融合蛋白基因(F基因)是決定毒力和免疫應(yīng)答的主要因素,F(xiàn)基因裂解位點(diǎn)區(qū)的氨基酸組成是NDV致病力的分子基礎(chǔ)。NDV強(qiáng)毒株裂解區(qū)域氨基酸序列為112R-R-Q-K/R-R-F117,弱毒株的裂解區(qū)域氨基酸序列組成為112G-K/R-Q-G-R-L117。
基因2型參考毒株:LaSota,Clone 30,HB92 V4,XD-Shandong08均來(lái)自Genbank中已經(jīng)證實(shí)的基因2型NDV弱毒株;基因7型參考毒株:SD09,SDWF02,SG-Liaoning2009,TianJin08均來(lái)自Genbank中已經(jīng)證實(shí)的基因7型NDV強(qiáng)毒株;東營(yíng)肉雞分離株:DY717-NDV。
圖7中,DY717-NDV與基因7型NDV強(qiáng)毒參考毒株的同源性在96.2%~99.8%之間,同源性較高。DY717-NDV分離株與LaSota,Clone 30,HB92 V4,XD-Shandong08等基因2型NDV弱毒參考毒株的核苷酸同源性在82.1%~82.7%之間,同源性相對(duì)較低。DY717毒株與LaSota,Clone 30等的疫苗毒株的同源性分別為82.5%和82.7%,也預(yù)示著二者與DY717毒株具有一定程度的交叉保護(hù),免疫LaSota和Clone 30的雞群不能夠完全抵御DY717毒株的攻擊。
由圖8可知,分離株DY717-NDV和基因7型NDV強(qiáng)毒參考毒株SD09,SDWF02,SG-Liaoning2009,TianJin08等全部位于一個(gè)較大的共同的分支之上(圖8內(nèi)上方黑框位置),這表明DY717-NDV為基因7型的毒株,毒力相對(duì)較強(qiáng)。
LaSota,Clone 30,HB92 V4,TYQ-Shanxi07,XD-
Shandong08等基因2型NDV弱毒參考毒株共同處于一個(gè)進(jìn)化分支之上(圖8內(nèi)下方黑框位置),與DY717-NDV以及基因7型NDV強(qiáng)毒參考毒株有著明顯的區(qū)別和界限。
由圖9可知,綜上所述,DY717-NDV與分離株SD09,SDWF02,SG-Liaoning2009,TianJin08均為基因7型NDV強(qiáng)毒毒株。這也表明當(dāng)前ND的流行仍以基因7型為主。對(duì)不同基因型的NDV毒株進(jìn)行同源性分析發(fā)現(xiàn),不同基因型之間,其核苷酸同源性較低,這也表明我國(guó)當(dāng)前許多雞群的免疫效果不佳或僅能部分保護(hù),與NDV的基因7型流行有關(guān)。
4 小結(jié)
通過對(duì)IBV東營(yíng)分離株S基因的分析,該地區(qū)分離株與國(guó)內(nèi)毒株的核苷酸序列同源性較高,與M41株、491株的同源性相對(duì)較低;其S基因的裂解氨基酸序列為近年來(lái)新出現(xiàn)的腎型毒株的裂解位點(diǎn),流行于該地區(qū)的毒株多為腎型傳支,且與部分疫苗毒株的同源性較低,正確篩選疫苗毒株具有很重要的臨床意義。
分離株DY717-NDV和基因7型NDV強(qiáng)毒參考毒株全部位于一個(gè)較大的共同的分支之上,確定DY717-NDV為基因7型的毒株,且毒力相對(duì)較強(qiáng)。對(duì)不同基因型的NDV毒株進(jìn)行同源性分析發(fā)現(xiàn),不同基因型之間,其核苷酸同源性較低,這也表明我國(guó)當(dāng)前許多雞群的免疫效果不佳或僅能部分保護(hù),可見基因7型新城疫在雞群特別是肉雞群規(guī)?;B(yǎng)殖中的危害較大,對(duì)此類毒株開展深層次的研究乃至疫苗的研發(fā)亟待進(jìn)行。(編輯:郭遠(yuǎn))