盧乃會 嚴玉寧 何紅 黃勤知
摘 要 以熒光顯微計數(shù)法和平板分離法分別對桐花樹根莖葉內(nèi)生細菌總量和可培養(yǎng)細菌數(shù)量進行周年動態(tài)初步測定,并對拮抗植物病原菌的可培養(yǎng)細菌菌株進行篩選鑒定。結(jié)果表明:桐花樹根莖葉內(nèi)均含有大量的內(nèi)生細菌,其中根部內(nèi)生細菌總量為0.88×107~49.67×107 ind./g FW,7月份最大,葉部細菌總量為1.07×107~65.07×107 ind./g FW,也以7月份最大,莖部細菌總量為1.1×107~19.73×107 ind./g FW,以5月份最大;而根莖葉可培養(yǎng)細菌含量分別為1.02×103~13.18×103、0.13×103~11.24×103、0.31×103~10.36×103 CFU/g FW,均以3月份數(shù)量最大,周年不同月份之間細菌總量和可培養(yǎng)細菌數(shù)量均差異顯著。用平板對峙生長法,從86株可培養(yǎng)內(nèi)生細菌中篩選獲得1株對香蕉葉鞘腐敗病菌、香蕉枯萎病菌、馬拉巴栗莖腐病等植物病原菌均有較強拮抗作用的Aec23菌株,經(jīng)形態(tài)、生理生化測試及16S rDNA序列比較分析,Aec23菌株初步鑒定為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。
關(guān)鍵詞 桐花樹;內(nèi)生細菌;時空動態(tài);植物病原菌;拮抗細菌
中圖分類號 S476 文獻標(biāo)識碼 A
紅樹林由于生長于海岸潮間帶的特殊生境,導(dǎo)致其共附(內(nèi))生微生物類群的復(fù)雜性和獨特性[1-3],因此有關(guān)紅樹林微生物的研究近年來已越來越多,成為研究的熱點之一。國內(nèi)外學(xué)者Ravikumar[4]、Hong[5]等分別對紅樹林放線菌種群多樣性和相關(guān)活性物質(zhì)進行了研究報道,鄧祖軍[6]、Peng[7]等對紅樹內(nèi)生真菌種群多樣性及其活性物質(zhì)進行了研究,并從中獲得功能特殊、結(jié)構(gòu)新穎的抗菌活性物質(zhì)。但有關(guān)紅樹內(nèi)生細菌周年數(shù)量時空動態(tài)變化,目前尚未見報道。本實驗室近年來對紅樹內(nèi)生細菌及其在生防植物病害中的作用開展了一系列研究,不僅獲得了多株對不同植物病原具有良好防病效果的內(nèi)生細菌菌株及其抗菌活性物質(zhì),同時也證明了紅樹內(nèi)生細菌是植物病害生物防治不可多得的資源菌來源。為此,筆者以廣東湛江灣分布廣、面積大的桐花樹為研究對象,在調(diào)查其內(nèi)生細菌周年時空變化動態(tài)的同時,以香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp. cubense)、香蕉葉鞘腐敗病菌(Pantoea agglomerans)、馬拉巴栗莖腐病菌(Phytophthora palmivora)和芒果炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)等為供試病原菌,從桐花樹可培養(yǎng)內(nèi)生細菌中篩選對植物病原真菌、細菌和卵菌均有拮抗作用的菌株,并對其進行了鑒定。為紅樹內(nèi)生細菌資源調(diào)查研究以及廣譜型植物病害生防菌株的篩選利用等提供依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 供試植物 紅樹植物桐花樹(Aegiceras corniculatum),于2010年1~11月(奇數(shù)月份)采自廣東湛江紅樹林自然保護區(qū)(21°20′N~21°25′N,109°50′E~109°53′E),編號封存帶回實驗室進行內(nèi)生細菌分離。
1.1.2 供試培養(yǎng)基 海水NA培養(yǎng)基用于內(nèi)生細菌平板計數(shù)測定(蛋白胨10.0 g,牛肉浸膏5.0 g,瓊脂20.0 g,過濾海水1 000 mL,pH7.2~7.4);LB培養(yǎng)基用于拮抗菌株基因組DNA的提?。ㄒ鹊鞍纂?0.0 g,酵母浸出粉5.0 g,氯化鈉10.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH7.2~7.4);PDA培養(yǎng)基用于菌株拮抗效果測定(馬鈴薯200.0 g,葡萄糖20.0 g,蒸餾水1 000 mL,瓊脂20.0 g);NB培養(yǎng)基用于菌株發(fā)酵(蛋白胨10.0 g,牛肉浸膏5.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH7.2~7.4)。
1.1.3 供試病原菌菌株 香蕉葉鞘腐敗病原菌(Pantoea agglomerans)[8];芒果炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides);香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp. cubense);馬拉巴栗疫霉病菌(Phytophthora palmivora)[9],均為本實驗室分離鑒定和保存。
1.2 方法
1.2.1 桐花樹可培養(yǎng)內(nèi)生細菌數(shù)量測定 樣品用自來水沖洗干凈,晾干后分別稱取根、莖、成熟葉片各5.0 g,75%酒精表面消毒30 s后,再用0.1%升汞表面消毒(對應(yīng)40 s、1 min、2 min),用無菌海水沖洗3次,陰干后加20 mL無菌海水于滅菌研缽中剪碎研磨,浸泡15 min后,吸取樣品浸泡液100 μL涂布于海水NA培養(yǎng)基平板上,25 ℃黑暗培養(yǎng)箱中培養(yǎng),4~7 d后觀察計數(shù),每樣品3次重復(fù)。根據(jù)菌落形態(tài)、顏色等挑取單菌落,純化保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 桐花樹內(nèi)生細菌總數(shù)測定 參考趙海萍[10]等海洋細菌熒光顯微計數(shù)法(略有改進):取1.2.1中浸泡液,加入40%甲醛溶液(終濃度1%)固定,吸取100 μL固定液至帶有黑色微孔濾膜的抽濾裝置管中,并滴加1~2滴吖啶橙(終濃度為0.1%)染色3 min,真空抽濾。將濾膜置于載玻片上,Olympus BH22熒光顯微鏡下100倍觀察,計算樣品內(nèi)生細菌總數(shù)。計算公式為:E=(×S1×V0)/(m×S2×V1)。其中:E:樣品中的細菌含量(個/g);:計數(shù)視野細菌數(shù)量的平均值(個);S1:濾膜面積(mm2);S2:顯微鏡的視野面積(mm2);V0:浸泡樣液體積,即20 mL;V1:過濾樣液體積,即0.1 mL;m:植物樣品質(zhì)量g。
1.2.3 拮抗菌株的篩選 病原細菌拮抗菌株篩選參照陳振明[11]等的方法稍加改進:取NB、37 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)24 h的香蕉葉鞘腐敗病菌于NA培養(yǎng)基上制成含菌平板,然后接種1.2.1中活化的細菌菌株,于28 ℃下黑暗培養(yǎng)24~48 h,觀測其抑菌圈大小,每處理重復(fù)3次。
病原真菌拮抗菌株篩選采用對峙生長法,在PDA平板中央接種供試病原菌菌塊,離平板邊緣1.5 cm處對角線接種1.2.1中活化的細菌菌株,28 ℃下黑暗培養(yǎng)72~96 h,觀測其抑菌圈大小,每處理重復(fù)3次。
1.2.4 拮抗菌株形態(tài)學(xué)觀察和生理生化試驗 參照《伯杰氏細菌鑒定手冊》[12]和《植病研究方法》[13]進行。
1.2.5 菌株16S rDNA序列分析 取LB培養(yǎng)基,37 ℃、120 r/min恒溫振蕩箱中黑暗培養(yǎng)24 h的Aec23菌株,以CTAB法[14]提取細菌基因組DNA為模板,以27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1504R(5′-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3′)為上、下游引物擴增其16S rDNA序列。PCR體系為25 μL:10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTPs(2.5 mmol/L) 2.0 μL,引物27F/1504R(10 μmol/L)2.0 μL,模板DNA(約50.0 mg/mL)1.0 μL,Taq酶0.2 μL,ddH2O補充至25 μL。PCR擴增條件:95 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min、53 ℃ 1 min、72 ℃ 1 min 40 s,30循環(huán),72 ℃ 10 min。瓊脂糖凝膠電泳并回收目標(biāo)片段,送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序,測序結(jié)果用BLAST軟件在GenBank進行同源性比較,以Clustal X[15]進行多序列比對后,用MEGA 5.0的Neighbor-Joining法[16]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并進行1 000次Bootstraps檢驗。
1.2.6 數(shù)據(jù)分析與處理方法 所測數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 桐花樹內(nèi)生細菌總量及動態(tài)變化
用吖啶橙染色熒光顯微計數(shù)法測定桐花樹內(nèi)生細菌總量結(jié)果表明(表1),桐花樹根莖葉內(nèi)含有大量的內(nèi)生細菌,不同時間、不同部位其內(nèi)生細菌的數(shù)量有所不同。根部和葉部不同月份數(shù)量變化趨勢基本相同,內(nèi)生細菌總量分別為0.88×107~49.67×107、1.07×107~65.07×107 ind./g FW,均在7月份數(shù)量最大,其不同時間數(shù)量變化趨勢為7月>3月>5月>9月>11月>1月;莖部內(nèi)生細菌總量為1.1×107~19.73×107 ind./g FW,5月份達到最大值,各時期數(shù)量變化趨勢為5月>7月>11月>9月>3月>1月。葉部內(nèi)生細菌的數(shù)量顯著高于莖部和根部。
2.2 桐花樹可培養(yǎng)內(nèi)生細菌數(shù)量及動態(tài)變化
可培養(yǎng)內(nèi)生細菌測定結(jié)果表明(表2),桐花樹根莖葉中可培養(yǎng)內(nèi)生細菌數(shù)量隨部位和時間變化不同。各部位可培養(yǎng)內(nèi)生細菌數(shù)量均在3月份數(shù)量達到最大值,根部和莖部可培養(yǎng)內(nèi)生細菌含量周年變化趨勢相似,分別為1.02×103~13.18×103、0.13×103~11.24×103 CFU/g FW,各時期變化動態(tài)為3月>11月>7月>5月>1月>9月;葉部可培養(yǎng)內(nèi)生細菌含量為0.31×103~10.36×103 CFU/g FW,其不同時間數(shù)量變化趨勢為3月>7月>9月>5月>11月>1月。通過比較發(fā)現(xiàn),根部的可培養(yǎng)細菌含量較之莖部和葉部含量豐富。
2.3 植物病原拮抗菌株的篩選
本研究從桐花樹體內(nèi)共分離獲得86株可培養(yǎng)內(nèi)生細菌,以香蕉葉鞘腐敗病菌、芒果炭疽病菌、香蕉枯萎病菌及馬拉巴栗疫霉病菌等植物病原細菌、真菌和卵菌等為供試菌,平板對峙測定發(fā)現(xiàn),以來自桐花樹根部Aec23菌株對上述供試病原菌的抑菌效果最強且穩(wěn)定(圖1),其抑菌圈直徑分別達(10.0±0.03)、(14.0±0.05)、(12.8±0.02)、(11.5±0.05)mm;進一步提取該菌株發(fā)酵上清液測定其抑菌圈直徑分別達(12.7±0.05)、(17.2±0.07)、(15.9±0.02)、(16.8±0.03)mm(圖2)。說明Aec23菌株對植物病原真菌、細菌和卵菌均有較強的拮抗作用。
2.4 拮抗菌株Aec23的鑒定
2.4.1 菌落形態(tài)特征觀察及生理生化測試結(jié)果 Aec23菌株在NA平板上菌落規(guī)則,圓形,邊緣加厚,乳白色,蠟質(zhì)。生物顯微鏡下觀察菌體呈桿狀,革蘭氏染色陽性。生理生化測定(表3):該菌株為好氧菌,厭氧條件不生長;可以使明膠液化,能水解淀粉和還原硝酸鹽,不能分解纖維素,不產(chǎn)生H2S;在pH5.7的培養(yǎng)基中可以生長,具有耐鹽性,可以在7%的NaCl培養(yǎng)基中生長;生長溫度為15~40 ℃,最適生長溫度為25~30 ℃;接觸酶試驗呈陽性,氧化酶、色氨酸脫氨酶及苯丙氨酸脫氨酶試驗均呈陰性;不產(chǎn)生吲哚;葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)酸不產(chǎn)氣;甲基紅試驗呈陰性,乙酰甲基甲醇試驗呈陽性;不利用丙二酸,檸檬酸鹽生長試驗為陽性(指示劑藍色)。
2.4.2 菌株分子生物學(xué)鑒定 生防菌株Aec23的16S rDNA測序片段大小為1 515 bp(GenBank登錄號為KF181458),用BLAST軟件進行同源性比較,通過與GenBank中的核酸數(shù)據(jù)進行對比分析,菌株Aec23與解淀粉芽孢桿菌(登錄號:AY651023)同源性高達99.8%。以16S rDNA為基礎(chǔ),利用MEGA 5.0軟件按Neighbor-Joining法構(gòu)建了包括解淀粉芽孢桿菌及同屬的臨近種細菌在內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)。生防芽孢桿菌Aec23與解淀粉芽孢桿菌同處一支,遺傳進化距離最近。結(jié)合菌株的生化試驗及16S rDNA序列分析,生防芽孢桿菌Aec23初步鑒定為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)。
3 討論
目前,細菌計數(shù)方法主要有平板直接計數(shù)法、熒光顯微計數(shù)法和流式細胞儀計數(shù)法等。較只分離可培養(yǎng)細菌的平板直接計數(shù)法[17]和前處理較復(fù)雜的流式細胞儀計數(shù)法[18],熒光顯微計數(shù)法由于簡捷、快速、方便、可靠,且樣品易于保存,能較好反映樣品中細菌的實際數(shù)量,現(xiàn)已在多個領(lǐng)域應(yīng)用[10],但用于內(nèi)生細菌含量測定卻鮮見報道。本研究采用吖啶橙熒光染色計數(shù)法對桐花樹內(nèi)生細菌進行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在顯微鏡下可觀察到大小、顏色和形狀各異的內(nèi)生細菌,說明該法用于植物內(nèi)生細菌含量測定是可行的,結(jié)果對植物內(nèi)生細菌的相關(guān)研究具有一定的參考價值。
關(guān)于紅樹林內(nèi)生菌的研究,目前以內(nèi)生真菌和放線菌報道較多,鄧祖軍等[19]對桐花樹內(nèi)生真菌類群進行了研究,發(fā)現(xiàn)不同部位、不同季節(jié)環(huán)境因素可直接影響內(nèi)生真菌的定居和分布;唐依莉[20]等的研究結(jié)果表明,紅樹內(nèi)生放線菌的定殖因宿主植物部位、年齡及季節(jié)和環(huán)境的變化明顯不同;相關(guān)性研究說明紅樹微生物數(shù)量動態(tài)變化受季節(jié)和分離部位的影響。本研究對桐花樹總內(nèi)生細菌和可培養(yǎng)內(nèi)生細菌數(shù)量測定結(jié)果表明,其細菌總量以5~7月份較高,而可培養(yǎng)細菌數(shù)最大值出現(xiàn)在3月份,說明桐花樹內(nèi)生細菌總量及可培養(yǎng)細菌數(shù)量均隨采樣時期不同而顯示出明顯的波動。本研究結(jié)果還表明,桐花樹內(nèi)生細菌總量與可培養(yǎng)細菌總量之間存在明顯差異,可培養(yǎng)細菌量僅占其總量的0.126‰ (0.005‰~0.768‰),說明桐花樹體內(nèi)存在有大量的不能培養(yǎng)或難培養(yǎng)的細菌類群,這與相關(guān)研究報道結(jié)果相似。關(guān)于桐花樹內(nèi)生細菌種群多樣性尚有待進一步研究。
近年來本實驗室利用紅樹內(nèi)生細菌生防植物病害進行了較為系統(tǒng)的研究,已從紅樹植物老鼠簕、木欖和紅海欖體內(nèi)分離獲得多株對香蕉枯萎病、芒果炭疽病、辣椒青枯病、辣椒疫病等植物病害具有較好防病作用的內(nèi)生細菌菌株[21-24]。本研究又從桐花樹中篩選獲得1株對香蕉葉鞘腐敗病菌等植物病原細菌和真菌均有明顯抑制效果的Aec23菌株,進一步說明紅樹植物內(nèi)生細菌是植物病害生物防治不可多得的資源[23]。有關(guān)Aec23菌株防病效果及防病機理等尚有待進一步研究。
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