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杜氏鹽藻糖原合成酶激酶3 cDNA片段的克隆及其在鞭毛再生中的功能*

2013-11-21 01:36:06毛麗紅李慶華王瑞莉龔方華薛樂勛1
關(guān)鍵詞:鞭毛杜氏雙酶

毛麗紅,李慶華,韓 康,王瑞莉,龔方華,薛樂勛1,#

1)鄭州大學(xué)生物工程系細胞生物學(xué)研究室 鄭州 450001 2)鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院細胞生物學(xué)研究室 鄭州 450052

糖原合成酶激酶3(glycogen synthase kinase 3,GSK3)是一種多功能的絲/蘇氨酸蛋白激酶,它可以抑制糖原合成酶的活性,導(dǎo)致胰島素抵抗,從而調(diào)節(jié)體內(nèi)糖代謝水平[1]。GSK3還在Wnt信號通路中發(fā)揮重要作用,它通過與APC、Axin、CK1和β-catenin形成復(fù)合體,使β-catenin發(fā)生磷酸化,從而影響下游轉(zhuǎn)錄因子[2]。它還參與Hedgehog、Notch、mTOR等其他信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,并對各種細胞過程進行調(diào)控,包括細胞增殖、細胞凋亡、神經(jīng)元功能及胚胎發(fā)育等[3-4]。鞭毛是廣泛存在于多種細胞表面、結(jié)構(gòu)保守的細胞器,它在介導(dǎo)細胞運動、感知外界環(huán)境及胞內(nèi)信號傳遞的過程中發(fā)揮重要作用。鞭毛的組裝是一個雙向的、動態(tài)的組裝過程,非常有利于鞭毛維持在合適的長度[5]。然而一旦這個過程發(fā)生異常,鞭毛出現(xiàn)缺陷或丟失,就有可能引發(fā)多種疾病,如多囊腎、癌癥等。因此研究鞭毛長度調(diào)控機制對了解這些疾病的發(fā)生具有重要的意義。目前已有研究[6]證明,采用GSK3的抑制劑LiCl能夠使衣藻鞭毛延長,表明衣藻中GSK3對鞭毛組裝和維持鞭毛長度具有一定的調(diào)控作用。杜氏鹽藻作為一種高度耐鹽的單細胞綠藻,具有一對等長的鞭毛,且易于觀察研究。該研究克隆杜氏鹽藻GSK3 cDNA序列,并通過實時熒光定量的方法初步探討杜氏鹽藻GSK3與鞭毛的關(guān)系。

1 材料與方法

1.1藻株與培養(yǎng)杜氏鹽藻UTEX LB-1644購自美國德克薩斯州大學(xué),采用改良型液體培養(yǎng)基于26 ℃、4 500 Lux光照強度下在HPG光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng),光暗周期各為12 h。

1.2主要試劑限制性內(nèi)切酶、3’RACE試劑盒、T4 DNA連接酶和pMD18-T載體均購自TaKaRa公司,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒為Fermentas公司產(chǎn)品,實時熒光定量染料購自全式金公司。

1.3杜氏鹽藻GSK3cDNA片段的克隆與鑒定

1.3.1 總cDNA模板的制備 取對數(shù)生長期鹽藻細胞10 mL,1 000 r/min離心10 min收集細胞,培養(yǎng)基洗滌2遍后離心收集細胞于無RNase離心管中。Trizol裂解法提取鹽藻總RNA,用瓊脂糖凝膠電泳和分光光度計檢測所提RNA的質(zhì)量和濃度。最后按逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA模板。

1.3.2 GSK3基因片段的擴增 根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測序得到的2個短片段分別設(shè)計上下游引物:上游 5’-TGG TGGATGGGGACCTCA-3’(18 bp),下游 5’-GCCGCC GAAGATGAGCTC-3’(18 bp)。PCR擴增兩片段間的序列,反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,50~60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min;反應(yīng)30個循環(huán)后72 ℃延伸10 min,4 ℃終止反應(yīng)。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離后膠回收,回收片段與pMD18-T載體16 ℃過夜連接。然后轉(zhuǎn)化E.coliDH5α進行藍白斑篩選,挑取陽性單克隆擴大培養(yǎng)并提取質(zhì)粒,EcoRⅠ、HindⅢ雙酶切鑒定,取插入片段大小正確的單克隆菌液送測序,進一步進行鑒定。

1.3.3 3’RACE法擴增GSK3 3’端序列 根據(jù)已擴增的GSK3片段設(shè)計3’RACE上游引物:外側(cè)5’-CCTGGTGCTGGAGTTCGT-3’(18 bp),內(nèi)側(cè)5’-ACTA

CACTGCTGCCATTGAT-3’(20 bp)。下游引物為3’RACE試劑盒自帶的引物:外側(cè) 5’-TACCGTCGTTC

CACTAGTGATTT-3’(23 bp)和內(nèi)側(cè) 5’-CGCGGATCC TCCACTAGTGATTTCACTATAGG-3’(32 bp)。提取鹽藻總RNA,使用3’RACE 接頭引物進行逆轉(zhuǎn)錄制備模板,按試劑盒說明上的程序進行巢式PCR反應(yīng)。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳、膠回收、連接及轉(zhuǎn)化后,提取質(zhì)粒,EcoRⅠ、HindⅢ雙酶切鑒定正確的單克隆菌樣送測序。

1.3.4 利用抑制消減雜交模板擴增5’端序列 將Tester cDNA模板PCR 引物5’-AAGCAGTGGTATCA ACGCAGAGTAC-3’(25 bp)作為上游引物。根據(jù)已知片段設(shè)計的特異性引物:外側(cè)5’-ACTCTGCCACC ACGCAGC-3’(18 bp),內(nèi)側(cè)5’-AGGAGCACGGTAG TAACG-3’(18 bp),作為下游引物。以Tester cDNA為模板,按常規(guī)反應(yīng)體系和程序進行巢式PCR,所得片段連入載體后,經(jīng)藍白斑篩選,質(zhì)粒提取,EcoRⅠ、HindⅢ雙酶切鑒定,最后送測序。

1.3.5 GSK3 cDNA總長的驗證 根據(jù)拼接后cDNA片段兩端序列設(shè)計引物,PCR擴增得到GSK3 cDNA總長,回收后連入pMD18-T載體,質(zhì)粒用BamHⅠ、HindⅢ酶切鑒定后送測序。

1.4實時熒光定量PCR法檢測GSK3在鞭毛再生中的變化采用pH休克法脫去杜氏鹽藻鞭毛[7],在去鞭毛后的300 min內(nèi),每隔30 min取一次鹽藻,將其收集于無RNase離心管中,加Trizol裂解提取RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。設(shè)計引物:上游5’-GGGGCAAACAAGCAGACG-3’(18 bp),下游5’-CG GATGGTCCACCATCTT-3’(18 bp),以GAPDH作為內(nèi)參,未脫鞭毛鹽藻作為對照,進行實時熒光定量PCR,導(dǎo)出數(shù)據(jù)計算2-ΔΔCt值進行定量分析,其中Ct為擴增產(chǎn)物達到設(shè)定閾值所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。

2 結(jié)果

2.1杜氏鹽藻GSK3cDNA片段結(jié)果分析

2.1.1 GSK3片段的擴增及鑒定 PCR擴增得到一段長為605 bp的序列(圖1A),大小與推測值相符。膠回收后與pMD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化后提取的質(zhì)粒進行雙酶切鑒定,結(jié)果見圖1B。

圖1 GSK3片段的擴增和鑒定結(jié)果

A:PCR結(jié)果;B:雙酶切鑒定結(jié)果;M:Marker;1:GSK3;2:pMD18-T-GSK3;3:pMD18-T和GSK3。

2.1.2 3’RACE和5’端cDNA序列擴增結(jié)果 3’RACE PCR擴增得到長為1 195 bp片段(圖2A),測序結(jié)果顯示含完整的polyA尾,回收片段與pMD18-T載體連接,質(zhì)粒經(jīng)雙酶切鑒定,結(jié)果見圖2B。5’端PCR擴增得到899 bp片段(圖3A),酶切鑒定結(jié)果見圖3B。

圖2 3’RACE擴增和鑒定結(jié)果

A:PCR結(jié)果;B:雙酶切鑒定結(jié)果;M:Marker;1:3’RACE PCR產(chǎn)物;2:pMD18-T-3’GSK3;3:pMD18-T和3’GSK3。

圖3 5’端cDNA擴增和鑒定結(jié)果

A:PCR結(jié)果;B:雙酶切鑒定結(jié)果;M:Marker;1:5’端PCR產(chǎn)物;2:pMD18-T-5’GSK3;3:pMD18-T和5’GSK3。

2.1.3 GSK3 cDNA總長序列分析結(jié)果 拼接后得到GSK3 cDNA總長為2 116 bp(圖4),其中包括737 bp的3’UTR和1 158 bp的開放閱讀框,編碼386個氨基酸。氨基酸序列經(jīng)比對后與萊茵衣藻的同源性為86%。

圖4 GSK3 cDNA總長的擴增結(jié)果

2.2實時熒光定量PCR結(jié)果與未脫鞭毛組相比,在去鞭毛后的300 min內(nèi)GSK3基因轉(zhuǎn)錄量明顯升高,并在120 min時達到最高水平(圖5)。

圖5 GSK3實時熒光定量PCR結(jié)果

3 討論

杜氏鹽藻是一種無細胞壁的單細胞真核綠藻,具有一對等長的鞭毛[8],長度約為13 μm,鞭毛具有典型的“9+2”結(jié)構(gòu)。因其結(jié)構(gòu)簡單,生長周期短,鞭毛形態(tài)易于觀察,所以非常適合作為研究鞭毛/纖毛長度調(diào)控機制的模型生物。然而,由于杜氏鹽藻的基因組序列尚未公布,且已得到全序列的鞭毛相關(guān)基因較少,因此給鞭毛調(diào)控機制和功能的研究帶來了諸多不便。該研究通過擴增GSK3 cDNA序列,得到了完整的開放閱讀框,編碼386個氨基酸,經(jīng)在NCBI上比對發(fā)現(xiàn)其氨基酸序列與衣藻、團藻等具有較高的同源性,說明GSK3在不同物種中高度保守,而這種高保守性也正是GSK3維持自身激酶活性所必需的。

一直以來,關(guān)于GSK3的研究層出不窮,作為一個多功能基因,它不僅是維持體內(nèi)糖代謝的關(guān)鍵酶,而且還是多種細胞信號通路的關(guān)鍵因子。GSK3還可以通過使微管相關(guān)蛋白Tau、MAP-1B和APC發(fā)生磷酸化來調(diào)控微管的動力學(xué)作用,從而影響軸索的生長[9]。另外,GSK3可以通過分解驅(qū)動蛋白1,進而選擇性地抑制順向軸絲運輸及其與貨物蛋白間的相互作用[10]。雖然這些研究已經(jīng)證明GSK3對維持微管的穩(wěn)定性及鞭毛內(nèi)運輸具有一定的調(diào)控作用,但對于它在鞭毛生長中的作用以及長度調(diào)控的機制目前尚不清楚。所以,作者通過實時熒光定量PCR方法研究了GSK3在轉(zhuǎn)錄水平上與鞭毛再生的關(guān)系,結(jié)果顯示GSK3的轉(zhuǎn)錄量明顯升高,甚至比對照組高20多倍,表明GSK3在鞭毛再生中發(fā)揮重要作用。雖然已有研究[6]表明,GSK3的活性形式在鞭毛內(nèi)大量存在且其活性抑制劑LiCl能夠使衣藻鞭毛延長。但是,在杜氏鹽藻中,鋰處理后鞭毛長度并未出現(xiàn)明顯的延伸,因此,作者推測杜氏鹽藻GSK3可能不參與鞭毛長度的維持,只是在鞭毛生長過程中發(fā)揮調(diào)控作用。另外,GSK3是否通過參與鞭毛內(nèi)某種信號通路實現(xiàn)對鞭毛生長的調(diào)控以及它在鞭毛再生中是否還發(fā)揮其他未知的功能,這還需要進一步的研究才能證實。

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