韻雪雪,楊永長,姜 偉,肖代雯,閆 慧,黃文芳*
(1.四川省醫(yī)學科學院 四川省人民醫(yī)院,四川 成都610072;2.重慶醫(yī)科大學醫(yī)學檢驗系 臨床檢驗診斷學教育部重點實驗室,重慶400016)
乳腺癌是一種嚴重危害育齡婦女健康的惡性腫瘤,占全身惡性腫瘤的7-10%,據(jù)統(tǒng)計,全球每年發(fā)病約250萬人,50萬人死亡。2004年Jemal等統(tǒng)計,早期診斷乳腺癌五年生存率可達97%,而擴散后的五年生存率僅為23%[1]。影像學檢查和CA-153標志物是目前乳腺癌檢查常用的技術(shù)指標,但由于乳腺炎癥,射線過敏和敏感性方面的問題[2,3],不足以滿足臨床和大規(guī)模篩查的需要,細胞膜在細胞生命活動中發(fā)揮重要作用,已有研究發(fā)現(xiàn)膜蛋白腫瘤過程中發(fā)生特異性變化[4],SELDI-TOF-MS是目前蛋白研究的先進技術(shù),具有高通量,檢測快速,敏感度和特異性高,分析全面精確的特點,在蛋白質(zhì)組學研究中應(yīng)用廣泛,本實驗擬通過SELDI-TOF-MS分析乳腺癌及正常乳腺細胞株膜,尋找差異蛋白,為乳腺癌亞細胞蛋白水平標志物的研究奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 細胞 人類乳腺正常細胞株HBL-100購自上海中科院細胞庫,人類乳腺癌細胞株MDA-MB-231及MCF-7均由重慶醫(yī)科大學惠贈。
1.1.2 主要試劑及來源 細胞膜蛋白提取試劑盒購自Sigma公司,小牛血清,1640培養(yǎng)基,0.25%胰酶均購自GIBCO公司,TritonX-114購自Amresco公司,芥子酸(SPA)、乙腈(ACN)、三氟乙酸(TFA)、細胞色素C和肌紅蛋白均購自Sigma公司。
1.1.3 主要儀器 CO2培養(yǎng)箱由德國Heraeus生產(chǎn);表面增強激光解吸蛋白飛行時間質(zhì)譜(SELDITOF-MS)儀、Au蛋白質(zhì)芯片為Ciphergen公司產(chǎn)品;Vortex-Genie 2渦旋振蕩器為美國Scientific Industries公司產(chǎn)品。
1.2.1 細胞培養(yǎng)與收集細胞MDA-MB-231,MCF-7,HBL-100培養(yǎng)于含有10%的小牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)基中,細胞貼壁70-90%時傳代,加入PBS洗2次,2×107每管凍于-80℃冰箱保存。
1.2.2 膜蛋白蛋白的分離純化 膜蛋白的分離純化按照試劑盒說明進行,步驟為:①每管細胞中加入600μl的裂解液,冰浴10min,②4℃×10 000g離心細胞5min,轉(zhuǎn)移上清至以新的管中,③37℃孵育5min,可以觀察到液體變?yōu)樵旗F狀渾濁。④37℃×3 000g離心3min,棄上清下部沉淀為細胞膜脂筏蛋白和疏水性蛋白。
1.2.3 丙酮沉淀 加預冷丙酮至膜蛋白提取物,-20℃冰箱沉淀過夜,4℃×12 000g離心10min,棄上清重復丙酮沉淀即為膜蛋白,加4‰Tritonx-114充分溶解。
1.2.4 蛋白定量 Olympus AU 2700生化分析儀檢測各管中蛋白量,用4‰TritonX-114調(diào)節(jié)樣品濃度為100μg/μl。
1.2.5 質(zhì)量校準 SELDI-TOF-MS儀每次使用前,采用蛋白標準品胰島素、細胞色素C和肌紅蛋白對SELDI-TOF-MS進行相對分子質(zhì)量校準,確保系統(tǒng)的質(zhì)量偏差范圍控制在0.1%以內(nèi)。
1.2.6 SELDI-TOF-MS分析蛋白指紋圖譜 10 μl 50%飽和SPA(能量分子,含50%ACN和0.5%TFA)與經(jīng)過處理的等體積膜蛋白樣品混合,上樣Au蛋白芯片,每孔4μl,每個標本重復2條芯片,每條2個點,待干后每孔重復加入1μl SPA2次,完全干燥后,選擇激光強度為190,靈敏度為8,SELDITOF-MS分析蛋白指紋圖譜,Protein-chip Software Bio-maker自動采集數(shù)據(jù)。
1.2.7 數(shù)據(jù)收集處理 采用Biomarker Wizard 3.1軟件對乳腺癌和正常乳腺細胞線粒體蛋白質(zhì)分別進行指紋圖譜分析,設(shè)定有意義的蛋白質(zhì)峰出現(xiàn)頻率閾值為10%,分別設(shè)定5,2兩次信噪比(S/N)過濾。確定兩組間蛋白質(zhì)峰值比較時,對初步篩選的蛋白質(zhì)峰進行t檢驗,以P<0.05篩選差異蛋白。
1.2.8 溶劑影響 4‰TritonX-114與SPA等量混合,按照1.2.6條件點樣分析蛋白指紋圖。
1.2.9 長期凍存對結(jié)果影響 選擇-80℃凍存達3-6個月的細胞,提取膜蛋白分析指紋圖譜,與新收集細胞膜蛋白指紋圖譜比較,觀察兩者蛋白峰數(shù)目及豐度有無統(tǒng)計學差異。
經(jīng)蛋白指紋圖譜標準化后,MDA-MB-231和MCF-7與HBL-100相比,膜蛋白差異點分別為32個和34個(P<0.05),其中7.8kD,8.3kD和8.8 kD的蛋白在兩株癌細胞中表達均降低,9.6kD的蛋白在兩株癌細胞中表達均增高,見表1和圖1、2。
表1 乳腺正常細胞膜與乳腺癌細胞膜差異蛋白(kD)
圖1 分子量7.8kD和8.3kD的差異蛋白指紋圖
圖2 分子量8.8kD和9.6kD的差異蛋白指紋圖
蛋白指紋圖譜分析4‰TritonX-114點樣Au蛋白芯片后除基質(zhì)峰外無任何蛋白峰,證明該濃度TritonX-114對結(jié)果分析無影響,見圖3。
圖3 芯片洗滌后點樣4‰TritonX-114分析圖譜
新鮮提取細胞與凍存3-6個月的細胞線粒體蛋白指紋圖譜比較,兩者在蛋白峰的數(shù)量和豐度上均無統(tǒng)計學差異(P>0.05),表明在此時間范圍內(nèi)保存不影響結(jié)果分析,見圖4。
圖4 新鮮細胞與凍存細胞膜蛋白指紋圖譜
細胞膜蛋白約占蛋白總量的1/3,在信號傳遞,物質(zhì)轉(zhuǎn)運方面發(fā)揮重要的作用,腫瘤細胞膜蛋白連接數(shù)量少而且發(fā)育差,微絨毛數(shù)量增多,一些質(zhì)膜蛋白如受體蛋白、轉(zhuǎn)運蛋白、黏附蛋白、抗原蛋白等過量表達、缺失或發(fā)生修飾,使細胞的信號轉(zhuǎn)導、物質(zhì)運輸、黏附作用、免疫原性等發(fā)生改變,與腫瘤細胞的惡性行為如侵襲和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。同時膜蛋白是藥物作用靶點之一,目前80%臨床使用藥物的靶點都集中在膜蛋白上,細胞膜蛋白改變時,會引起細胞對藥物的反應(yīng)改變,導致化療失敗。在乳腺癌中,Jensen等[5]研究發(fā)現(xiàn)一種以γ-氨基丁酸A型受體為配體的氯離子通道蛋白異常表達。Garcia Pedrero JM[6]等發(fā)現(xiàn)AnnexinA1在乳腺癌中表達下調(diào),其下調(diào)程度與其上皮分化狀態(tài)、局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移程度、組織病理學分級密切相關(guān),惡性程度越高,表達下調(diào)程度越明顯。Adam P J等[7]通過對乳腺癌細胞質(zhì)膜大規(guī)模蛋白質(zhì)組學分析,建立了500多個的蛋白的乳腺癌細胞質(zhì)膜蛋白數(shù)據(jù)集,其中27%功能未知,進一步的定位實驗、相互作用分析和免疫組化發(fā)現(xiàn)了3個以前未鑒定的蛋白質(zhì)BCMP11、BCMP84和BCMP101可能在癌變過程中起作用。
SELDI-TOF-MS問世以來,因其分析速度快,相對分子質(zhì)量范圍大,可以有效捕獲低分子量、低豐度的蛋白的特點,在亞細胞蛋白研究中得到極大的應(yīng)用,已通過SELDI-TOF-MS在乳腺癌全細胞蛋白研究中捕獲標志物[8]。本實驗利用SELDI-TOFMS檢測兩株乳腺癌及一株乳腺正常上皮細胞株膜蛋白,發(fā)現(xiàn)分子量7.8kD,8.3kD和8.8kD的蛋白在兩株癌細胞中表達均降低,分子量9.6kD的蛋白在兩株癌細胞中表達均增高。同時本實驗選擇的Au芯片,與以往CM10,WCX等相比,可以重復利用,成本極低,適合大面積篩查。在標本保存時間上,比較-80℃凍存3-6月的細胞膜蛋白與新鮮細胞膜蛋白指紋圖譜,發(fā)現(xiàn)兩者在蛋白峰數(shù)目及豐度均無統(tǒng)計學差異,表明在此范圍內(nèi)保存不影響指紋圖譜分析,與既往研究一致[9]。提示本實驗可用于長期保存標本的研究。
本實驗在亞細胞水平初步篩選出了乳腺癌特異性蛋白,但能否將篩選的蛋白用于乳腺癌的診斷,還有很長的路要走。在下一步實驗中,我們對差異蛋白分離、純化和鑒定,同時收集各種類型的臨床標本進行驗證,以期為乳腺癌標志物研究鑒定更多依據(jù)。
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