姜 玲,謝青軒,虢婷婷,阮 穎
(湖南農(nóng)業(yè)大學生物科學技術學院,湖南 長沙 410128)
組蛋白甲基化作為一個重要的表觀遺傳學標記[1],對植物開花起調控作用[2]。擬南芥SDG8(SET DOMAIN GROUP 8)編碼的是一種組蛋白甲基轉移酶[3],約含有1 806個氨基酸序列,能特異催化組蛋白H3K36的雙、三甲基化,是FLC表達所需的表觀遺傳記憶密碼之一,在抑制植物早花過程中起重要作用[4]。功能缺失的擬南芥sdg8突變體[5-6]36的雙、三甲基化水平顯著降低,開花調控的關鍵轉錄因子FLC的轉錄激活受到抑制[7],進而植株表現(xiàn)為早花表型[8]。
BraSDG8是湖南農(nóng)業(yè)大學植物發(fā)育與表觀遺傳調控研究室在白菜型油菜中克隆的擬南芥SDG8的同源基因,cDNA全長4 963 bp,編碼1 654個氨基酸,結構域的組成與擬南芥SDG8完全一致,包含 AWS(associated with SET)domain、SET domain和Post SET domain 3個結構域,同屬于ASH1家族,推測BraSDG8與SDG8具有相似的生物學功能[9]。筆者通過構建pFGC5941-BraSDG8 RNA干擾載體及農(nóng)桿菌介導的擬南芥遺傳轉化,旨在為進一步研究白菜型油菜BraSDGG8的功能奠定基礎。
擬南芥(Arabidopsis thaliana)哥倫比亞生態(tài)型Col,大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α,農(nóng)桿菌(A-grobacterium tumefaciens)GV3101 和 pFGC5941 表達載體由湖南農(nóng)業(yè)大學植物發(fā)育與表觀遺傳調控實驗室保存;pMD-19 T Vector購自TAKARA公司。
1.2.1 BraSDG8-1片段的擴增 比對擬南芥SDG8和BraSDG8 cDNA序列,根據(jù)保守區(qū)域設計引物,分別在5′端導入2個酶切位點(AscⅠ/BamHⅠ),預計擴增產(chǎn)物大小為443 bp,引物序列如下。
BraSDG8-1 F:5′-GGCGCGCCGGATCCCCAAG CATCAAGTGGCTCT-3′(NcoⅠ/XbaⅠ)
BraSDG8-1 R:5′-CCATGGTCTAGAGCACAGA GTTGATAACTTCTGAATCTGGT-3′
PCR擴增(Tm=57℃),回收片段,連接至pMD19-T載體構建成pMD19-T-BraSDG8-1,熱激法轉化大腸桿菌DH5α,將陽性菌落經(jīng)PCR驗證后送博尚生物公司測序,所得結果在The Brassica database(BRAD)上進行序列比對分析。
1.2.2 BraSDG8 RNA干擾載體的構建 如圖1所示,BamHⅠ和XbaⅠ雙酶切載體pMD19-TBraSDG8-1和pFGC5941,將目的片段反向插入至查爾酮內(nèi)含子與Ocs終止子之間,構建表達載體p-BraSDG8-1;然后AscⅠ和NcoⅠ雙酶切載體pMD19-T-BraSDG8-1和p-BraSDG8-1,將目的片段正向插入至35 S啟動子與查爾酮內(nèi)含子之間,構建BraSDG8 RNA干擾載體,記為p-BraSDG8。
將構建好的RNA干擾載體分別導入大腸桿菌DH5α和農(nóng)桿菌GV3101中,測序驗證。
1.2.3 擬南芥的遺傳轉化 采用浸花法將p-BraSDG8載體轉化野生型擬南芥Col生態(tài)型。通過卡那霉素(濃度為40 mg/L)篩選獲得抗性苗,改良的CTAB法提取葉片總DNA,PCR檢測。引物序列如下。
35s825F:5′-ATCCCACTATCCTTCGCAAGACC CTT-3′
Intron825R:5′-TGACTCCATCTTATTCCCTCCG TTTC-3′
克隆得到440 bp左右的目的片段,將目的片段連接至pMD19-T載體上,通過熱激法轉至大腸桿菌DH5α中,獲得陽性菌落,PCR檢測片段為440 bp左右,符合預期片段大?。▓D2)。
將目的片段測序,測序結果與RNA干擾片段進行序列比對,同源性達100%,MegAlign比對(圖3),BraSDG8-1基因片段序列完整正確,可用于后
用BamHⅠ和XbaⅠ分別單酶切p-BraSDG8驗證(圖4),最終分別得到了1 300 bp和2 500 bp左右的條帶,符合預期片段大小,表明BraSDG8 RNA干擾載體p-BraSDG8構建成功。
通過凍融法將干擾載體轉至根癌農(nóng)桿菌GV3101,提取陽性菌落質粒,進行質粒PCR檢測,擴增得到的條帶大小為400 bp左右(圖5),與設計的目的片段大小443 bp相符,說明干擾載體已轉化至根癌農(nóng)桿菌中。
通過改良的CTAB法提取抗性苗總DNA,擴增結果如圖6,檢測得到1株陽性植株。片段大小與預期片段大小一致,為1 200 bp左右。
在含有卡那霉素(濃度為40 mg/L)的MS培養(yǎng)基上,抗性苗生長健壯,子葉飽滿而呈綠色,根系發(fā)育正常,而非抗性苗子葉呈黃色,個體較小,根長相對短?。▓D7)。與野生型擬南芥Col生態(tài)型相比,在營養(yǎng)生長期,轉基因植株的蓮座葉數(shù)目以及生長狀態(tài)都沒有明顯區(qū)別;在生殖生長期,轉基因植株的花期并未縮短,只是花苔數(shù)目和果莢數(shù)目變少,每個果莢的結實率降低。
組蛋白甲基化作為一個重要的表觀遺傳學標記[10-11],是植物發(fā)育過程中的重要調節(jié)方式,其主要是由組蛋白甲基轉移酶(histone methyltransferases,HMTs)來調控的[12-13]。其中,組蛋白賴氨酸甲基轉移酶(histone lysine methyltransferase,HLMT)是一類含有 SET(Su(var),Enhancer of zeste,Trithorax)結構域的家族[14]。進化上保守的SET結構域包含約130個氨基酸序列,形成一個結狀結構的酶催化中心[15],通過催化組蛋白甲基化來影響染色體的結構進而調控基因的表達[16]。早前的研究顯示,在擬南芥中發(fā)現(xiàn)了約47個SET DOMAIN GROUP(SDG)基因[17],分別命名為 SDG1~SDG47,其中 SDG8,SDG25,SDG27和SDG30編碼的SET結構域蛋白涉及植物開花時間的調控[18]。RNAi是研究基因功能的重要方法[19-20]。BraSDG8是擬南芥SDG8的同源基因,二者的相似性非常高,筆者通過構建干擾載體轉化擬南芥,在克隆得到BraSDG8全長cDNA序列的基礎上,選取其中一段保守片段構建RNA干擾載體pFGC5941-BraSDG8,并通過農(nóng)桿菌GV3101介導,浸花法轉化野生型擬南芥Col,獲得了穩(wěn)定遺傳的轉基因植株。但是與野生型擬南芥(Col)相比,該轉基因植株開花時間、植株大小、蓮座葉數(shù)目等表型并未有明顯差異,其具體的原因有待進一步研究。
[1]杜婷婷,黃秋花.組蛋白賴氨酸甲基化在表觀遺傳調控中的作用[J].遺傳,2007,29(4):387-392.
[2]夏志強,何奕昆,鮑時來,等.植物開花的組蛋白甲基化調控分子機理[J].植物學通報,2007,24(3):275-283.
[3]謝 萍,田春艷,張令強,等.組蛋白甲基轉移酶的研究進展[J].遺傳,2007,29(9):1035-1041.
[4]Zhao Z,Yu Y,Meyer D,et al.Prevention of early?owering by expression of FLOWERING LOCUS C requires methylation of histone H3K36[J].Nat.Cell Biol,2005,(7):1256-1260.
[5]孫萬剛.擬南芥突變體構建方法及目的基因分離鑒定技術[J].安徽農(nóng)業(yè)科學,2010,38(18):9433-9434.
[6]Xu P L,Zhan J P,Meng J J,et al.A rapid DNA extraction method for PCR detection of Arabidopsis thaliana[J].Agricultural Science&Technology,2010,11(3):41-42,155.
[7]李紅梅,任 艷,魏艷麗,等.擬南芥開花時間的分子遺傳調控[J].山東科學,2007,20(1):48-53.
[8]Xu L,Zhao Z,DongA,et al.Di-and Tri-but Not Monomethylation on Histone H3 Lysine 36 Marks Active Transcription of Genes Involved in Flowering Time Regulation and Other Processes in Arabidopsis thaliana[J].Mol.Cell.Biol,2008,20(4):1348-1360.
[9]謝青軒,彭 琦,劉春林,等.白菜型油菜BraSDG8基因的克隆與序列分析 [J].湖南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版),2011,37(4):372-375.
[10]李 想,張飛雄.組蛋白甲基化的研究進展[J].遺傳,2004,26(2):244-248.
[11]田筱青,房靜遠.組蛋白甲基化研究進展[J].生物化學與生物物理進展,2006,33(6):511-516.
[12]He Y H.Control of the transition to flowering by chromatin modifications[J].Mol.Plant,2009,2(4):554-564.
[13]Martin C,Zhang Y.The diverse functions of histone lysine methylation[J].Nat.Rev,2000,6(11):838-849.
[14]Ng D W,Wang T,Chandrasekharan M B,et al.Plant SET domain-containing proteins:structure,function and regulation[J].Biochim.Biophys.Acta,2007,1769:316-329.
[15]Qian C,Zhou M M.SET domain protein lysine methyltransferases:Structure,specificity and catalysis[J].Cell Mol.Life Sci,2006,63(23):2755-2763.
[16]Sims RJ III,Nishioka K,Reinberg D.Histone lysine methylation:a signature for chromatin function [J].Trends Genet,2003,19:629-639.
[17]宋江華,曹家樹.植物SET蛋白 [J].細胞生物學雜志,2007,(29):384-388.
[18]Baumbusch L O,Thorstensen T,Krauss V,et al.The Arabidopsis thaliana genome contains at least 29 active genes encoding SET domain proteins that can be assigned to four evolutionarily conserved classes[J].Nucl.Acids Res,2001,29:4319-4333.
[19]李蘭嵐,饒力群,范 適,等.RNAi技術及其在植物中的應用研究進展 [J].湖南環(huán)境生物職業(yè)技術學院學報,2005,11(4):313-318.
[20]左 剛,毛建平.轉錄水平siRNA介導的基因沉默[J].中國生物工程雜志,2005,25(12):78-81.