王新朵, 李 莉, 王錫鋒
(植物病蟲害生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,北京 100193)
近年來我國(guó)主要農(nóng)作物病毒病發(fā)生的種類和面積不斷增加,給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了巨大損失。植物病毒是植物的活體寄生物,病毒病害素有“植物癌癥”之稱。對(duì)多數(shù)病毒病而言,以農(nóng)藥為基礎(chǔ)的常規(guī)防治方法無法從根本上解決問題[1]。因此,控制病毒病最為經(jīng)濟(jì)有效的途徑是利用品種自身抗性達(dá)到主動(dòng)防治的目的。然而傳統(tǒng)的育種方法由于缺乏理想的抗源,抗病基因又多與劣質(zhì)基因相伴隨,獲得抗病、高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)雙重特性品種的難度很大,很難在短時(shí)間內(nèi)取得突破,尋找有效的方法培育抗病、優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的作物新品系是當(dāng)務(wù)之急。
自從1983年轉(zhuǎn)基因植物誕生以來,植物轉(zhuǎn)基因工程發(fā)展勢(shì)頭始終不減,現(xiàn)已躍入大規(guī)模商業(yè)化生產(chǎn)階段,并成為發(fā)展最快、應(yīng)用潛力最大的生物技術(shù)領(lǐng)域之一。因此利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)創(chuàng)制免疫或高抗作物病毒病的新品系(品種)是解決嚴(yán)重威脅我國(guó)農(nóng)作物病毒病害的有效策略之一。
RNA干擾(RNA interference,RNAi)則是近年來發(fā)現(xiàn)的一種重要基因沉默現(xiàn)象,它是通過雙鏈RNA介導(dǎo)的特異性降解對(duì)應(yīng)序列的mRNA,從而抑制相應(yīng)基因的表達(dá),是植物在長(zhǎng)期進(jìn)化過程中形成的對(duì)外來入侵者的一種重要的防御機(jī)制。RNAi普遍存在于各種生物,且在動(dòng)物、植物和真菌中都證實(shí)了其具有特異性、穩(wěn)定性、高效性、不改變?cè)谢蚪M遺傳組成及轉(zhuǎn)基因后不在植物體內(nèi)表達(dá)蛋白質(zhì)等優(yōu)點(diǎn),其在植物遺傳改良,尤其是抗病毒育種等方面有著廣闊的應(yīng)用前景。
RNAi現(xiàn)象是1990年Jor gensen[2]等在轉(zhuǎn)基因植株中首先發(fā)現(xiàn)的,當(dāng)時(shí)這種同時(shí)抑制自身和相應(yīng)內(nèi)源基因表達(dá)的基因沉默現(xiàn)象被稱為基因的共抑制(co-suppression)。隨后諸多的研究報(bào)告了共抑制現(xiàn)象都是由核基因轉(zhuǎn)錄后形成的mRNA降解引起的[3],確定為轉(zhuǎn)錄后基因沉默(posttranscriptional gene silencing,PTGS)。直到1998年,F(xiàn)ire等發(fā)現(xiàn)將雙鏈RNA(ds RNA)注入秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)可以引起特異性基因沉默,并將這一現(xiàn)象定義為RNA干擾。后來證明除了外源ds RNA引發(fā)RNAi外,內(nèi)源性ds RNA存在同樣的機(jī)制[4]。
在不同的生物體內(nèi),不同的ds RNA引發(fā)的RNAi的詳細(xì)過程不盡相同,但RNAi有共同的作用模式。RNAi對(duì)基因表達(dá)的調(diào)節(jié)效應(yīng)最終通過3種方式發(fā)生作用:1)靶mRNA的降解;2)阻止mRNA的翻譯過程;3)RNA指導(dǎo)的DNA甲基化(RNA-directed DNA met hylation,Rd DM)。前兩種屬于PTGS,最后一種屬于TGS(transcriptional gene silencing)。其中以mi RNA通路發(fā)生的PTGS是RNAi最核心的沉默機(jī)制。在植物體內(nèi),RNAi作用過程基本概括為:1)細(xì)胞核內(nèi)ds RNA的形成,包括由正義mRNA和反義mRNA結(jié)合成的ds RNA,由單條RNA回折互補(bǔ)形成的hp RNA(haipin-RNA)等;2)屬于RNaseⅢ類的Dicer或DCL(Dicer-like)識(shí)別 ds RNA 并進(jìn)行切割,產(chǎn)生5′-磷酸基團(tuán),3′-OH 并突出2 nt的si RNA(s mall-interfering RNA)的雙鏈體,此雙鏈體解離后轉(zhuǎn)出細(xì)胞核[5];3)si RNA或mi RNA與 AGO(Argonaute)等蛋白結(jié)合形 成 RISC(RNA-induced silencing co mplex),RISC尋找與自身復(fù)合體中的si RNA或mi RNA堿基配對(duì)的mRNA結(jié)合;4)RISC將mRNA切割成小片段,有時(shí)在不將mRNA切斷的情況下通過si RNA或Ar gonaute蛋白特異性阻止mRNA的翻譯[6];5)釋放的si RNA以自身為引物,以mRNA為模板,在 Rd Rp(RNA-dependent RNA pol y merase)的作用下合成新的ds RNA;6)si RNA分子可以通過胞間連絲或韌皮部運(yùn)輸實(shí)現(xiàn)細(xì)胞、組織間的傳遞[7]。
除了mi RNA通路,擬南芥體內(nèi)還存在tasi RNA通路,nat-si RNA通路,rasi RNA通路。其中rasi RNA通路可以引發(fā)Rd DM,屬于TGS。
已有研究表明,內(nèi)源性mi RNA也可以介導(dǎo)RNAi。在高等生物中,存在200種以上的miRNA,約占基因組的1%[8]。每個(gè)細(xì)胞中,可能存在幾百到上萬個(gè)這樣的分子[9]。在擬南芥中已發(fā)現(xiàn)了幾百種不同的siRNA[10]。細(xì)胞核中轉(zhuǎn)錄的原初mi RNA(pri mary-mi RNA)在ds RNA 結(jié)合蛋白(ds RBP)的參與下被DCL1切割成雙鏈體miRNA,雙鏈體miRNA被甲基轉(zhuǎn)移酶HEN1在3′甲基化修飾后在核輸出蛋白 HST(HASTY)的幫助下進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)[11-13]。在胞質(zhì)中,成熟的單鏈miRNA裝載AGO1后形成RISC,RISC靶向切割同源配對(duì)的mRNA。植物中mi RNA的RNAi途徑主要由靶mRNA的降解導(dǎo)致靶基因的低表達(dá),哺乳動(dòng)物或昆蟲卻主要依賴mi RNA靶向mRNA的3′的UTR區(qū)互補(bǔ)配對(duì)從而影響mRNA的正常翻譯[14]。
自然界廣泛存在的RNAi現(xiàn)象解決了人們對(duì)RNAi技術(shù)的倫理學(xué)疑惑,極大地鼓舞了siRNA藥物和RNAi轉(zhuǎn)基因作物的開發(fā)應(yīng)用。目前,國(guó)際上已有幾個(gè)siRNA治療藥物被批準(zhǔn)進(jìn)入臨床試驗(yàn)[15],RNAi技術(shù)在抗病毒轉(zhuǎn)基因作物中的應(yīng)用也已成為研究的熱點(diǎn)。
抗病品種的培育、推廣是控制作物病毒病最為經(jīng)濟(jì)有效的途徑。RNAi被認(rèn)為是一種古老的植物抗病毒機(jī)制[16-19],是用來防止外來遺傳物質(zhì)干擾自身基因組功能和穩(wěn)定性的重要機(jī)制,是生物體中一種不完全的原始生物免疫系統(tǒng)。病毒侵染植物時(shí),當(dāng)病毒核酸的復(fù)制數(shù)量達(dá)到強(qiáng)烈干擾植物基因組正常生理生化功能時(shí),植物會(huì)通過甲基化修飾或激活特異性RNA降解系統(tǒng)來專一性降解病毒RNA,從而抑制病毒復(fù) 制[20]。自 從 1986 年 Powell-Abel等[21]首次獲得抗煙草花葉病毒(T MV)侵染的轉(zhuǎn)基因煙草以來,很多研究人員開始將病毒的不同基因(如復(fù)制酶基因、運(yùn)轉(zhuǎn)蛋白基因、外殼蛋白基因等)序列導(dǎo)入植物,強(qiáng)化植物體天然的抗病毒機(jī)制,均獲得抗病毒植株。
1999年P(guān)into等[22]將南方菜豆花葉病毒屬的水稻黃斑駁病毒(Rice yellow mottle virus,RYMV)復(fù)制所需酶的部分基因通過構(gòu)建載體而轉(zhuǎn)化水稻,誘發(fā)基因沉默,從而使植物具有RY MV的抗性,且這種抗性能穩(wěn)定遺傳3代。2000年 Wang等[23]利用大麥黃矮病毒(Barley yellow d war f vir us,BYDV)PAV的復(fù)制酶基因片斷的反向重復(fù)序列載體(hp BYDVpol)轉(zhuǎn)化大麥,獲得對(duì)PAV免疫的植株。2001年Tenllado等[24-25]分別以直接注射和農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化兩種方式將病毒復(fù)制酶基因部分序列構(gòu)建ds RNA導(dǎo)入植物葉片細(xì)胞,結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩種方式都可成功阻止辣椒輕型斑駁病毒(Peppermild mottle virus,PMMo V)、煙草蝕斑病毒 (Tobacco etch vir us,TEV)和苜?;ㄈ~病毒(Alfalfa mosaicvirus,A MV)3種病毒的侵染過程。2002年Kalantids等[26]將黃瓜花葉病毒(Cucu mber mosaic virus,CMV)部分基因的c DNA反向重復(fù)序列導(dǎo)入煙草中,并且檢測(cè)到一個(gè)完全抗CMV的株系。2004年Ma等[27]根據(jù)抗水稻矮縮病毒(Ricedwar fvirus,RDV)序列,構(gòu)建了與其相關(guān)的RNA干擾序列,導(dǎo)入水稻中,發(fā)現(xiàn)對(duì)水稻矮縮病毒有很高的抗性。2005年Andika等[28]證實(shí)RNAi誘導(dǎo)的抗甜菜壞死黃脈病毒(Beet necrotic yellow vein virus,BNYVV)在葉中比根部有效。2006年Shuichiro Takahashi等[29]分別以馬鈴薯X病毒(Potato virus X,PVX)的外殼蛋白基因和編碼RNA沉默抑制因子的TGBp1基因?yàn)榘形稽c(diǎn)來設(shè)計(jì)si RNA,結(jié)果顯示這兩種si RNA都能干擾PVX的侵染。2007年代玉華等[30]對(duì)水稻條紋病毒(Rice stripe virus,RSV)的CP基因,設(shè)計(jì)了ds RNA,構(gòu)建干涉載體,遺傳轉(zhuǎn)化水稻,獲得了能穩(wěn)定遺傳、高抗或免疫的植株。2011年Taku mi等[31]將RSV編碼的7個(gè)基因都構(gòu)建成干涉載體,分別導(dǎo)入水稻受體,接種試驗(yàn)表明:轉(zhuǎn)CP、SP基因的水稻對(duì)接種免疫,轉(zhuǎn)p C1基因的水稻抗病性顯著提高,轉(zhuǎn)p C2和p C4基因的水稻抗病性沒有增加。
眾多成功的事例說明,利用RNAi技術(shù)以工程化的手段賦予植物體病毒抗性具有高度可行性,有可能成為植物抗病毒基因工程研究中的一種特異抗性手段[32]。20世紀(jì)80年代末,美國(guó) Monsanto、Cal gene、Du Pont等公司即開始進(jìn)行RNAi轉(zhuǎn)基因抗病毒作物的研究開發(fā),并在90年代末獲批釋放了第1批轉(zhuǎn)基因作物,如轉(zhuǎn)病毒CP基因抗馬鈴薯卷葉病毒(Potato leaf roll virus,PLRV)、馬鈴薯 Y病毒(Potato virus Y,PVY)的馬鈴薯等[33]。
3.1.1 過敏原
人們可能認(rèn)為基因改造食品潛在危險(xiǎn)來自于基因轉(zhuǎn)化過程本身,故認(rèn)為基因食品是有害的。然而,天然食品不等于安全食品,沒有零風(fēng)險(xiǎn)的食品,如小麥粉、谷子、花生、大豆、杏、板栗、腰果、魚、蝦、蟹、龍蝦、雞蛋、牛奶等對(duì)不同的人來說,都可能成為過敏原,一般的蔬果也可能含有致癌物,而特定的食品在經(jīng)過不同的搭配混合后,一樣會(huì)產(chǎn)生毒素。應(yīng)用RNAi策略對(duì)作物抗病毒特性的遺傳改造,導(dǎo)入的外源基因本身就是寄生于作物的病毒基因,且以雙鏈發(fā)夾結(jié)構(gòu)存在,通過特異性降解病毒基因而達(dá)到抗病毒的目的,在轉(zhuǎn)基因植株內(nèi)不會(huì)表達(dá)外源蛋白,對(duì)應(yīng)的抗病毒轉(zhuǎn)基因作物的營(yíng)養(yǎng)成分與原作物沒有差異,故轉(zhuǎn)基因植物不會(huì)增加過敏蛋白,不會(huì)引入新的過敏原。牛顏冰[34]對(duì)表達(dá) CMV2ΔRep或 To MV2 MP ds RNA的轉(zhuǎn)基因煙草植株進(jìn)行Northernblot分析已經(jīng)證明了這種結(jié)論。根據(jù)實(shí)質(zhì)等同原則如果一種新食品或食品成分與已存在的食品或食品成分實(shí)質(zhì)等同,能夠被認(rèn)為與傳統(tǒng)食品或食品成分一樣安全[35]。因此,通過該機(jī)制所產(chǎn)生的抗病毒轉(zhuǎn)基因植物可以符合人們對(duì)生物安全性的高要求。
3.1.2 殘留的ds RNA
RNAi轉(zhuǎn)基因作物通常通過dsRNA介導(dǎo)靶基因沉默,所以殘留dsRNA可能存在風(fēng)險(xiǎn)。目前,臨床研究表明口服ds RNA對(duì)哺乳動(dòng)物不會(huì)產(chǎn)生影響[36]。這是因?yàn)閐s RNA不會(huì)在哺乳動(dòng)物細(xì)胞間傳遞或者是很快地被降解。因?yàn)椴溉閯?dòng)物細(xì)胞間信號(hào)傳遞機(jī)制要比植物、線蟲、昆蟲復(fù)雜得多,而且ds RNA通過人的胃和腸道時(shí)會(huì)被其中的酶和菌群降解。哺乳動(dòng)物中缺乏依賴于RNA的RNA聚合酶(Rd Rp),不存在放大級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Irie[37]等人發(fā)現(xiàn),在低等生物中RNAi可持續(xù)存在,但RNAi在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中只能維持一段時(shí)間。一般注入ds RNA后的2~3 d,RNAi的作用最明顯,而后1~2 d內(nèi),靶mRNA的豐度就能恢復(fù)到注射RNAi之前的水平。
除了口服dsRNA不會(huì)對(duì)哺乳動(dòng)物產(chǎn)生影響外,Gil等[38]的研究表明,dsRNA大于30 bp在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中不會(huì)引起RNAi現(xiàn)象,因?yàn)檩^長(zhǎng)的ds RNA在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中能誘導(dǎo)干擾素生成,導(dǎo)致非特異性的蛋白質(zhì)合成障礙;另一方面,dsRNA又能誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生多種抗病毒蛋白的酶,發(fā)生非特異性的RNA降解效應(yīng)。而Sabine[39]研究表明引發(fā)有效RNAi的ds RNA最短不得短于21 nt,Dicer能與200~500 nt范圍內(nèi)的ds RNA結(jié)合,底物片段越短,Dicer酶的活性也就越弱。因此,如果既使ds RNA發(fā)揮作用又不使其對(duì)哺乳動(dòng)物造成危害,要控制好ds RNA的長(zhǎng)度。而目前在轉(zhuǎn)基因作物中應(yīng)用的ds RNA長(zhǎng)度一般大于30 bp。這些都表明攝食轉(zhuǎn)ds RNA的食物不會(huì)對(duì)哺乳動(dòng)物產(chǎn)生影響。
3.1.3 siRNA 水平
RNAi通過si RNA發(fā)揮作用。除了dsRNA策略的RNAi,在轉(zhuǎn)基因作物研究中有的直接導(dǎo)入si RNA。短于30 bp的si RNA,不會(huì)促發(fā)干擾素效應(yīng),能特異性地降解mRNA,引起哺乳動(dòng)物細(xì)胞的基因沉默。近來在藥物研究領(lǐng)域發(fā)現(xiàn),si RNA分子在哺乳動(dòng)物體內(nèi)會(huì)產(chǎn)生脫靶效應(yīng)[40],因此,對(duì)于siRNA在轉(zhuǎn)基因作物中的殘留是否對(duì)哺乳動(dòng)物產(chǎn)生影響是最值得關(guān)心的問題。
然而siRNA在環(huán)境中不穩(wěn)定,且RNAi機(jī)制本身就是植物自然存在的一種古老機(jī)制,多年來也未曾發(fā)現(xiàn)對(duì)哺乳動(dòng)物造成負(fù)面影響。siRNA的藥物研究表明,siRNA在體內(nèi)處于極不穩(wěn)定狀態(tài)。這主要是因?yàn)槠湎鄬?duì)分子質(zhì)量?。s為7 000),容易被腎透析并很快清除,也容易被內(nèi)源性的血漿RNA酶降解,在血漿內(nèi)半衰期為5~60 min[41]。
對(duì)于siRNA發(fā)揮沉默作用,其劑量問題是不容忽視的。唐省三等[42]在研究中發(fā)現(xiàn)si RNA對(duì)病毒性心肌炎療效的影響是劑量依賴性的,隨注射si RNA劑量增加,病理變化逐漸減輕。在轉(zhuǎn)基因食品烹飪和加工過程中si RNA易降解,在體內(nèi)易降解,因此殘留的si RNA劑量遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于藥物的劑量。因此,基于RNAi作用獲得的轉(zhuǎn)基因食品對(duì)哺乳動(dòng)物的影響應(yīng)該是微不足道的。但是為了進(jìn)一步確保安全,應(yīng)該對(duì)每一種RNAi轉(zhuǎn)基因作物產(chǎn)品進(jìn)行si RNA含量的測(cè)定。
抗病毒轉(zhuǎn)基因作物除了考慮到哺乳動(dòng)物(包括人)的安全性外,還要考慮到對(duì)其他非靶標(biāo)生物的影響,對(duì)生態(tài)環(huán)境的作用,及插入的外源基因是否會(huì)與病毒的核酸發(fā)生重組而產(chǎn)生新病毒等問題。
RNAi對(duì)靶基因的沉默是高度特異性的,一般來說,當(dāng)si RNA有4個(gè)或以上堿基不配對(duì)時(shí),RISC將無法識(shí)別該mRNA,一個(gè)堿基的突變甚至也會(huì)對(duì)干擾的效果產(chǎn)生巨大的影響[43]。所以RNAi的轉(zhuǎn)基因作物對(duì)非靶標(biāo)生物的影響很?。?4]。到目前為止,在獲得釋放的美國(guó)3個(gè)轉(zhuǎn)CP基因作物南瓜、番木瓜和李中,并沒有發(fā)現(xiàn)任何的過敏原[45]。表達(dá)李痘皰病毒(Plumpox virus,PPV)CP基因的李樹與非轉(zhuǎn)基因的相比,節(jié)肢動(dòng)物及傳毒蚜蟲的種類和數(shù)量沒有差異[46]。對(duì)抗番木瓜環(huán)斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)的番木瓜的研究表明,土壤各層的放線菌多樣性和總量沒有受到顯著影響[47]。雖然還沒有發(fā)現(xiàn)RNAi對(duì)非靶標(biāo)生物的影響,但基于非靶標(biāo)生物可能存在靶基因的同源序列,脫靶效應(yīng)將成為基于RNAi技術(shù)轉(zhuǎn)基因作物安全性評(píng)價(jià)的關(guān)鍵問題[48]。
3.2.1 RNAi介導(dǎo)的抗病毒作物不存在重組風(fēng)險(xiǎn)
在自然環(huán)境下,植物病毒間的重組已在苜蓿花葉病毒屬(Al famovirus)、雀麥花葉病毒屬(Bromovir us)和番茄叢矮病毒科(To mbusviridae)中發(fā)現(xiàn)[49]。某些野生的植物病毒通過重組從轉(zhuǎn)基因植物中截獲一定的病毒基因也已被證明。如Borja等[50]發(fā)現(xiàn),番茄叢矮病毒(Tomato bushy stunt virus,TBSV)CP突變體和轉(zhuǎn)基因CP之間由于發(fā)生了重組而導(dǎo)致野生型病毒的再生。Falk等[49]認(rèn)為,轉(zhuǎn)基因植株中的RNA與野生病毒RNA基因組之間重組率很低,即便是發(fā)生了重組,新的重組病毒在整個(gè)病毒侵染周期的一系列過程中,也不會(huì)有更高的生活力[51]。然而采用RNAi介導(dǎo)的抗性策略能夠有效地避免重組發(fā)生。因?yàn)镽NAi介導(dǎo)的抗病毒轉(zhuǎn)基因作物主要是通過將病毒基因組上的基因構(gòu)建成ds RNA,將導(dǎo)入的基因與其同源的入侵RNA都降解成21~26 nt的干擾型 RNA(si RNA)[52]。通過這種方法所獲得的抗病毒植株在轉(zhuǎn)化的細(xì)胞質(zhì)中有少量或者沒有轉(zhuǎn)基因mRNA積累[53],由于缺少重組所需的必要模板,所以不會(huì)發(fā)生重組。
3.2.2 脫靶效應(yīng)及對(duì)非靶標(biāo)生物的影響
脫靶效應(yīng)是指由siRNA引起的、通過RNAi機(jī)制作用于非靶mRNA導(dǎo)致非靶基因沉默的現(xiàn)象。當(dāng)siRNA分子的中間有一個(gè)堿基與mRNA不配對(duì)時(shí),RISC仍具有識(shí)別該mRNA的能力。這使得si RNA能夠介導(dǎo)序列相似的非靶mRNA的降解從而導(dǎo)致非靶基因的沉默[43]。目前已知脫靶效應(yīng)在mRNA水平和蛋白質(zhì)表達(dá)水平上都能夠檢測(cè)出來[54]。
Fedorov等發(fā)現(xiàn)一段隨機(jī)選擇的siRNA可以通過完整的RNAi通路實(shí)現(xiàn)細(xì)胞存活率的改變,但這一毒性不依賴于靶基因的沉默,si RNA誘導(dǎo)的脫靶效應(yīng)產(chǎn)生了可觀測(cè)到的表型[55]。Xing等在擬南芥中同樣發(fā)現(xiàn)RNAi可以產(chǎn)生非預(yù)期的花粉活力下降的表型[56]。所以在開發(fā)RNAi轉(zhuǎn)基因作物時(shí),最為關(guān)鍵的問題就是要進(jìn)行高效特異的si RNA序列設(shè)計(jì)和化學(xué)修飾,可以既保持或增強(qiáng)靶基因的特異性沉默效果,又避免si RNA誘導(dǎo)脫靶作用。傳統(tǒng)的BLAST來搜索脫靶基因會(huì)忽略很多候選的脫靶基因,而通過計(jì)算生物學(xué)方法能夠在精度和成本之間得到平衡,可以迅速找出候選的脫靶基因[57]。目前網(wǎng)上許多脫靶評(píng)估軟件,如ds Check不僅能對(duì)si RNA脫靶可能性進(jìn)行精確的軟件搜索驗(yàn)證,而且提供最小化脫靶效應(yīng)ds RNA的設(shè)計(jì)[58]。
3.2.3 siRNA殘留對(duì)非靶標(biāo)生物的影響
在考慮siRNA對(duì)非靶標(biāo)生物的影響時(shí),必須要強(qiáng)調(diào)的是siRNA的劑量是否足以引起脫靶效應(yīng)。由于si RNA的目的基因的沉默效率和脫靶效應(yīng)幾率都與siRNA的濃度呈正相關(guān),因此為了避免高劑量的siRNA引起的脫靶效應(yīng),在轉(zhuǎn)基因育種中可以優(yōu)化si RNA池(siRNA pool),即通過同時(shí)嚴(yán)格設(shè)計(jì)幾條特異位點(diǎn)的siRNA,挑選最有效的siRNA最佳混合比例。這樣靶向同一mRNA的不同siRNA的單獨(dú)濃度降低了,降低了脫靶效應(yīng)幾率,而混合的siRNA的沉默效率卻是幾條siRNA的加和甚至更高,因此沉默效率不會(huì)下降,實(shí)現(xiàn)了目的基因沉默的效率最大化和最小的脫靶效應(yīng)發(fā)生的可能性。
從本質(zhì)上講,轉(zhuǎn)基因作物和常規(guī)遺傳育種育成的品種都是在原有品種的基礎(chǔ)上對(duì)部分性狀進(jìn)行修飾。傳統(tǒng)的育種方法是以基因突變和有性雜交為基礎(chǔ),限于自然界中自發(fā)的基因重組和交換,而轉(zhuǎn)基因作物育種是人為地將某些生物的基因轉(zhuǎn)移到作物的遺傳物質(zhì)中去,使其在產(chǎn)量、抗性、營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)、消費(fèi)品質(zhì)等方面向人們所需要的方向轉(zhuǎn)變。基因重組技術(shù)縮短了新基因產(chǎn)生的時(shí)間,打破了生物種之間的基因交流界限。因此,人們擔(dān)心轉(zhuǎn)基因作物的應(yīng)用會(huì)產(chǎn)生一些食品和生態(tài)安全風(fēng)險(xiǎn)。但是,可能的風(fēng)險(xiǎn)不等于真實(shí)的風(fēng)險(xiǎn)。隨著轉(zhuǎn)基因作物的應(yīng)用,各國(guó)都將轉(zhuǎn)基因作物安全評(píng)估納入到轉(zhuǎn)基因作物的監(jiān)管中[59],分為食品營(yíng)養(yǎng)安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和生態(tài)安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估過程是一個(gè)從建立問題也稱危害性識(shí)別,到最后給出風(fēng)險(xiǎn)結(jié)論的過程,由危害性識(shí)別、暴露評(píng)估、效果測(cè)試、風(fēng)險(xiǎn)描述等幾部分組成[60]。因?yàn)椴淮嬖诮^對(duì)的安全性和零風(fēng)險(xiǎn),轉(zhuǎn)基因作物風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的第1步就是要求對(duì)轉(zhuǎn)基因作物的潛在危害做合理假定,在此過程中要毫不猶豫地忽略無關(guān)緊要的假定危害而保留重大的問題并做進(jìn)一步的細(xì)化考慮[61]。在轉(zhuǎn)基因作物的安全評(píng)價(jià)方面,國(guó)際上已經(jīng)廣泛接受和采用實(shí)質(zhì)等同原則和個(gè)案分析原則。
作為生物界普遍存在的機(jī)制之一,RNAi技術(shù)已在全球范圍迅速發(fā)展,其優(yōu)勢(shì)有目共睹。RNAi介導(dǎo)的抗病毒轉(zhuǎn)基因植株具有高效、特異性抗性,且不會(huì)翻譯成有功能的病毒蛋白質(zhì),不存在病毒RNA重組、異源包裝及協(xié)生作用的潛在生物風(fēng)險(xiǎn),具有較高的生物安全性。雖然RNAi介導(dǎo)的抗病毒轉(zhuǎn)基因作物也潛在一些風(fēng)險(xiǎn),如對(duì)非靶標(biāo)生物的影響,但是隨著對(duì)RNAi機(jī)制的不斷深入了解,通過RNAi技術(shù)的日臻完善,及構(gòu)建嚴(yán)密的、科學(xué)的、合理的生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估系統(tǒng),對(duì)轉(zhuǎn)基因植物的商業(yè)化大面積釋放所存在的潛在生態(tài)學(xué)影響進(jìn)行長(zhǎng)期的監(jiān)測(cè)監(jiān)控研究,將為RNAi更加安全有效地應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因作物開辟更廣闊的前景。
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