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距離矩陣的本征值用于硫醇/硫醚的QSPR研究

2010-10-26 03:49:20徐梅芳
關(guān)鍵詞:硫醚沸點(diǎn)氣態(tài)

徐梅芳

(天津師范大學(xué) 數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院,天津 300387)

結(jié)構(gòu)決定性質(zhì),性質(zhì)是分子內(nèi)在結(jié)構(gòu)的反映,結(jié)構(gòu)與性質(zhì)的關(guān)系是化學(xué)研究中非常重要的課題之一。拓?fù)渲笖?shù)是分子結(jié)構(gòu)的數(shù)學(xué)描述符,通過(guò)描述分子的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)——分子中所含原子種類(lèi)、數(shù)目及其連接關(guān)系,能夠揭示分子的基本拓?fù)湫?。用拓?fù)渲笖?shù)研究定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)關(guān)系(QSPR)是當(dāng)前非?;钴S的領(lǐng)域[1-6],人們相繼提出了100余種拓?fù)渲笖?shù),如 Weiner指數(shù) W[7],Hosoya指數(shù) Z[8],Balaban指數(shù) J[9],Randic的分子連接性指數(shù)(nχ)[10]等。我們?cè)岢鲞^(guò)一個(gè)拓?fù)渲笖?shù) X[5,13,14],并用其研究飽和烷烴、烯烴以及飽和脂肪醇的構(gòu)效關(guān)系,效果良好。目前對(duì)脂肪烴性質(zhì)的QSPR研究比較多[14-16],而雜原子體系的 QSPR研究則較少,對(duì)硫醇/硫醚體系的研究則更少[17,18]。本文針對(duì)硫醇/硫醚分子拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)特點(diǎn),根據(jù)距離矩陣定義了一種新的拓?fù)渲笖?shù)A,通過(guò)對(duì)硫醇/硫醚進(jìn)行的一些理化性質(zhì)的相關(guān)性回歸分析和預(yù)測(cè),得到了良好的結(jié)果。

1 拓?fù)渲笖?shù)A的計(jì)算

圖形G={V,E}表示一個(gè)隱氫圖,其中V為頂點(diǎn)集,E為邊集,則距離矩陣 D=[dij]n×n(n為頂點(diǎn)數(shù)),dij為沿頂點(diǎn) i與j之間的最短路徑所包含的邊的數(shù)目。以1-丁硫醇為例,其隱氫圖為:

相應(yīng)的距離矩陣D為

為了區(qū)別碳原子和硫原子,將硫原子進(jìn)行染色,定義C和S原子之間的距離為rC-S/rC-C=1.16。則此矩陣的本征值為:

λ1=-5.36,λ2=-1.85,λ3=-0.80,λ4=-0.57,λ5=8.57則將矩陣D的最大本征值定義為拓?fù)渲笖?shù)A:

A=λ5=8.57

按照同樣的方法,計(jì)算了47個(gè)硫醇/硫醚的拓?fù)渲笖?shù)A,見(jiàn)表1。

表1 硫醇/硫醚的拓?fù)渲笖?shù)A值

表2 硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成熱(ΔHf, 2980)的實(shí)驗(yàn)值[17]與計(jì)算值的比較

2 結(jié)果和討論

2.1 硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成熱(ΔHf,2980)與拓?fù)渲笖?shù)A的相關(guān)性

根據(jù)計(jì)算出的硫醇/硫醚的A值,將含有1~18個(gè)碳原子的28個(gè)硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成熱(ΔHf,2980)進(jìn)行回歸分析(如圖1所示),其回歸方程為:

其中N為參與回歸的硫醇/硫醚的數(shù)目,RR為復(fù)相關(guān)系數(shù),SD 為標(biāo)準(zhǔn)偏差(下同)。方程(1)的復(fù)相關(guān)系數(shù)為 0.9936,表明硫醇/硫醚的ΔHf,2980與A之間關(guān)系密切。表2列出了根據(jù)方程(1)計(jì)算的硫醇/硫醚的ΔHf,2980與其實(shí)驗(yàn)值。

圖1 硫醇/硫醚氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成熱ΔHf,2980的實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值間的關(guān)系

由圖1可以發(fā)現(xiàn),大多數(shù)硫醇/硫醚的ΔHf,2980計(jì)算值與實(shí)驗(yàn)值都比較接近,特別是不含支鏈的直鏈硫醇/硫醚,其ΔHf,2980實(shí)驗(yàn)值與回歸曲線更符合;含支鏈的硫醇/硫醚,其 ΔHf,2980與回歸曲線的符合程度則要差一些。

表3 硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成自由能(ΔGf, 2980)和氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)熵(S2980)的實(shí)驗(yàn)值[17]與計(jì)算值的比較

2.2 硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)熵(S2980)、氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成自由能(ΔGf,2980)與拓?fù)渲笖?shù)A的相關(guān)性

將含有1~18個(gè)碳原子的28個(gè)硫醇/硫醚的氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成自由能(ΔGf,2980)和氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)熵(S2980)分別進(jìn)行回歸分析(如圖2、圖3所示),其回歸方程分別為:

方程(2)和(3)的 RR 非常接近 1,說(shuō)明硫醇/硫醚的ΔGf,2980、S2980與A之間關(guān)系密切。表3列出了根據(jù)方程(2)和(3)計(jì)算的硫醇/硫醚的S2980和ΔGf,2980與其實(shí)驗(yàn)值。由圖2、圖3及表3可以發(fā)現(xiàn),大多數(shù)硫醇/硫醚的S2980以及ΔGf,2980的計(jì)算值與實(shí)驗(yàn)值都比較接近。倪彩華等[17]曾分別用拓?fù)渲笖?shù)S,Is對(duì)硫醚和硫醇的ΔHf,2980、ΔS2980、ΔGf,2980進(jìn)行過(guò) QSPR 研究,其回歸效果良好。

圖2 硫醇/硫醚氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)熵S2980的實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值間的關(guān)系

圖3 硫醇/硫醚氣態(tài)標(biāo)準(zhǔn)生成生成自由能ΔGf, 2980的實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值間的關(guān)系

圖4 硫醇/硫醚沸點(diǎn)BP的實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值間的關(guān)系

2.3 硫醇/硫醚的沸點(diǎn)(BP)與拓?fù)渲笖?shù)A的相關(guān)性

將含有1~10個(gè)碳原子的40個(gè)硫醇/硫醚的沸點(diǎn)回歸分析(如圖3所示),其回歸方程為:

方程(4)的復(fù)相關(guān)系數(shù)為 0.9923,說(shuō)明硫醇/硫醚的沸點(diǎn)與 A之間關(guān)系密切。王克強(qiáng)等[18]利用另外一組拓?fù)渲笖?shù)(Ws,Ps,S1,S2)對(duì)硫醇/硫醚的沸點(diǎn)關(guān)聯(lián),RR=0.9997,效果很好。需要指出的是,該研究同樣是對(duì)硫醇、硫醚分開(kāi)來(lái)計(jì)算的,因此不能將其結(jié)果與本論文結(jié)果做簡(jiǎn)單的比較。表4列出了根據(jù)方程(4)計(jì)算的硫醇/硫醚的沸點(diǎn)及其實(shí)驗(yàn)值。由圖4及表 4可以發(fā)現(xiàn),不含支鏈的直鏈硫醇/硫醚,其沸點(diǎn)實(shí)驗(yàn)值與回歸曲線更符合;而對(duì)含支鏈的硫醇/硫醚,其沸點(diǎn)實(shí)驗(yàn)值與回歸曲線的符合程度要差一些。

表4 硫醇/硫醚的沸點(diǎn)(BP)實(shí)驗(yàn)值[18]與計(jì)算值的比較

表5 硫醇/硫醚的Kováts保留指數(shù)(RI)實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值的比較

2.4 硫醇/硫醚的Kováts色譜保留指數(shù)(RI)與拓?fù)渲笖?shù)A的相關(guān)性

對(duì)含有2~12個(gè)碳原子的硫醇的Kováts保留指數(shù)(RI)進(jìn)行回歸分析(如圖5所示),回歸方程為:

方程(5)的RR非常接近1,說(shuō)明RI與A屬于顯著相關(guān)。表5為根據(jù)方程(5)計(jì)算的RI與其實(shí)驗(yàn)值的比較。由圖5及表5可見(jiàn)RI與A之間具有相當(dāng)好的相關(guān)性。劉利等[19]曾采用4個(gè)拓?fù)渲笖?shù)對(duì)硫醇的Kováts保留指數(shù)(RI)進(jìn)行拓?fù)浞治?,結(jié)果與本文相當(dāng)。所以拓?fù)渲笖?shù) A簡(jiǎn)化了計(jì)算,在使用上更為方便,并且性能良好。

圖5 硫醇/硫醚的Kováts保留指數(shù)(RI)的實(shí)驗(yàn)值與計(jì)算值之間的關(guān)系

3 結(jié)論

拓?fù)渲笖?shù)A對(duì)硫醇/硫醚的多種物理化學(xué)性質(zhì)的良好回歸分析結(jié)果表明,A是一個(gè)性能優(yōu)良的分子拓?fù)渲笖?shù)。硫醇/硫醚異構(gòu)體的數(shù)目隨著分子中碳原子數(shù)的增加而急劇增多,完全依靠實(shí)驗(yàn)方法測(cè)定其物理化學(xué)性質(zhì)是相當(dāng)困難的,因此采用拓?fù)渲笖?shù) A建立相應(yīng)的構(gòu)效關(guān)系模型,不僅能夠合理表征硫醇/硫醚的物理化學(xué)性質(zhì)與分子結(jié)構(gòu)的關(guān)系,而且能夠?qū)α虼?硫醚的物理化學(xué)性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè)。

但是也應(yīng)該看到,拓?fù)渲笖?shù)A在預(yù)測(cè)含支鏈硫醇/硫醚的物理化學(xué)性質(zhì)方面還不能令人十分滿(mǎn)意,其主要原因是由于拓?fù)渲笖?shù) A只是分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的表征,未能顧及其它因素如順?lè)串悩?gòu)、鍵長(zhǎng)與鍵角等等,尚不能?chē)?yán)格區(qū)分硫醇/硫醚的同分異構(gòu)體,而這些都是影響分子的物理化學(xué)性質(zhì)的因素。目前,越來(lái)越多的研究正在嘗試考慮諸如順?lè)串悩?gòu)、鍵長(zhǎng)與鍵角等分子三維結(jié)構(gòu)的拓?fù)湫再|(zhì),從而提出更好的拓?fù)渲笖?shù)。

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