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茶樹(shù)葉面真菌與內(nèi)生真菌群落結(jié)構(gòu)的比較

2010-06-27 08:46張宇玲李小容楊民和
生物災(zāi)害科學(xué) 2010年1期
關(guān)鍵詞:葉面內(nèi)生茶樹(shù)

張宇玲,李小容,楊民和

(福建師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,福州 350108)

植物葉片棲居有豐富的真菌群落。人們把附著于葉面并可以定居和增殖的真菌群體稱(chēng)為葉面真菌(fungal epiphytes)[1];而將寄生于正常生長(zhǎng)植物體內(nèi)的真菌稱(chēng)為內(nèi)生真菌(fungal endophytes)[2]。已有的絕大多數(shù)研究都將葉面真菌和內(nèi)生真菌獨(dú)立進(jìn)行。因此,葉面真菌與內(nèi)生真菌雖然生存的微環(huán)境相距不到1 mm,但人們對(duì)它們的種群結(jié)構(gòu)差異和相互關(guān)系知之甚少。近年來(lái),由于微生態(tài)學(xué)理論和技術(shù)的飛速發(fā)展,人們逐步認(rèn)識(shí)到植物葉圍(phyllosphere)微生物的種群和互作關(guān)系比人們預(yù)料的要更為復(fù)雜而多樣[3]。

20世紀(jì)70年代以來(lái),已有一些零星的報(bào)道對(duì)健康植物葉片上葉面真菌和內(nèi)生真菌作了比較研究。日本學(xué)者Osono實(shí)驗(yàn)室對(duì)山茱萸(Swida controversa)、偃伏梾木(Cornus stolonifera)和純齒山毛櫸(Fagus crenata)等植物的葉面真菌和內(nèi)生真菌進(jìn)行了分離和比較。研究結(jié)果表明,植物葉面和內(nèi)部組織生長(zhǎng)有明顯不同的真菌群落,真菌的定植和分布受生長(zhǎng)季節(jié)和葉片生育期的影響[4~7]。在咖啡(Coffea arabica)的健康葉片上,生長(zhǎng)有豐富的真菌群落,內(nèi)生真菌和葉片真菌的種群差異明顯,交叉分布的種類(lèi)很少;同時(shí)還發(fā)現(xiàn),內(nèi)生真菌的物種多樣性比葉面真菌更為豐富;不同取樣地點(diǎn)的同種植物的葉片中,真菌群落也有差異[3]。相對(duì)于種類(lèi)豐富、生態(tài)類(lèi)型復(fù)雜多樣的植物,這些研究結(jié)果顯然不足于概述植物葉圍真菌的全貌。

茶樹(shù)(Camellia sinensis)是一種重要的經(jīng)濟(jì)樹(shù)種,有關(guān)茶樹(shù)相關(guān)微生物的研究已經(jīng)積累了一些資料。在茶園土壤微生物、茶樹(shù)生長(zhǎng)繁殖與微生物、微生物與茶葉加工貯藏、微生物與茶樹(shù)保護(hù)、微生物與茶的綜合利用等多方面都有相關(guān)的報(bào)道[8]。盧東升等對(duì)茶樹(shù)內(nèi)生真菌的種類(lèi)及分布以及對(duì)豫南茶園樹(shù)棲真菌、芽及葉棲真菌群落及種群演替做了大量調(diào)查,并對(duì)茶園微生物及其應(yīng)用進(jìn)行了很好的總結(jié)[9]。謝麗華等[10]對(duì)茶樹(shù)品種、葉片生育期和茶葉化學(xué)成份對(duì)內(nèi)生真菌的影響做過(guò)報(bào)道。但是,同時(shí)分離茶樹(shù)葉面真菌與內(nèi)生真菌,比較、分析它們的種群結(jié)構(gòu)及其差異,還未見(jiàn)相關(guān)的報(bào)道。本研究對(duì)茶樹(shù)葉面真菌與內(nèi)生真菌進(jìn)行分離和鑒定,以期進(jìn)一步了解其種群結(jié)構(gòu)及微生態(tài)關(guān)系。

1 材料與方法

1.1 樣本采集

從福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院實(shí)驗(yàn)茶園(福州金山)采集健康成熟的葉片,茶樹(shù)品種為黃旦和鐵觀音,在茶園這兩品種相鄰種植。采用五點(diǎn)取樣法,每品種每點(diǎn)分別取健康成熟葉片10片,共50片。成熟葉片指得是當(dāng)年生長(zhǎng)季節(jié)發(fā)出的,葉色嫩綠、角質(zhì)化不明顯的展開(kāi)葉片。樣本編號(hào)后,裝入無(wú)菌紙袋,帶回實(shí)驗(yàn)室后立即進(jìn)行真菌的分離,或?qū)⒅参飿颖敬娣庞?℃冰箱中備用。

1.2 葉面真菌

采用兩種方法分離茶樹(shù)葉面真菌。分離方法1,葉片組織粘附法[3]:將采集的同一品種的茶樹(shù)葉片充分混合,然后隨機(jī)取20片,用直徑為0.5cm的無(wú)菌打孔器取葉片組織塊,從每一葉片隨機(jī)取6個(gè)組織塊,分別接入補(bǔ)加50mg/kg鏈霉素的PDA培養(yǎng)基中,每直徑為9cm的培養(yǎng)皿中放入6~8個(gè)組織塊(3~4塊近軸面朝下),置于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)1 h后,再在無(wú)菌條件下將葉片組織塊移出培養(yǎng)皿。將移走葉片組織塊的培養(yǎng)皿放入28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待出現(xiàn)菌落時(shí),按菌落形態(tài)的不同,挑取少量菌絲進(jìn)行分離純化。分離方法2,稀釋平板法:將采集來(lái)的同一品種的茶樹(shù)葉片混合,分別選取形狀大小相近的茶樹(shù)葉片10片,置于盛有100ml無(wú)菌水的三角瓶?jī)?nèi),強(qiáng)力、反復(fù)振蕩15min后,制得菌懸液,稀釋10、100、1000倍3個(gè)不同濃度,用無(wú)菌吸管吸取0.2ml接種到PDA平板中,每個(gè)濃度梯度設(shè)3個(gè)重復(fù),涂抹均勻后置于28℃恒溫箱中培養(yǎng);待菌落長(zhǎng)出后統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)并挑取單菌落于PDA平板上純化培養(yǎng),用于菌類(lèi)的鑒定。

1.3 內(nèi)生真菌分離

內(nèi)生真菌的分離參見(jiàn)謝麗華等[10]的方法。待葉片組織周?chē)霈F(xiàn)菌體時(shí),進(jìn)行分離純化。

1.4 真菌形態(tài)鑒定

由于分離獲得的部分真菌在常規(guī)培養(yǎng)條件下不產(chǎn)生繁殖體,按其在PDA培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)情況和菌落形態(tài)劃分為不同的形態(tài)型(morphospecies)。誘導(dǎo)產(chǎn)孢的方法如下:分離純化的真菌移接到PDA培養(yǎng)基或經(jīng)高壓滅菌的茶葉上,在28℃恒溫、黑暗條件下培養(yǎng)。至菌絲長(zhǎng)滿培養(yǎng)皿后,將培養(yǎng)皿取出,放置于室溫下繼續(xù)培養(yǎng);或在無(wú)菌條件下用接種環(huán)輕刮菌絲表面,誘導(dǎo)真菌產(chǎn)生孢子。培養(yǎng)期間注意觀察真菌生長(zhǎng)特征,隨時(shí)進(jìn)行照相記錄。對(duì)在人工培養(yǎng)條件能產(chǎn)孢的真菌,參照魏景超和陸家云等的相關(guān)專(zhuān)著,進(jìn)行真菌屬的初步鑒定;選擇優(yōu)勢(shì)種真菌(分離率≥30%)采用ITS序列分析鑒定。

1.5 優(yōu)勢(shì)真菌ITS序列分析

1.5.1 基因組DNA的提取 參照武漢琴等(2009)的方法進(jìn)行。

1.5.2 rDNA-ITS的擴(kuò)增與序列測(cè)定 nrDNA ITS區(qū)用引物ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′和ITS5:5′-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3′,按程序:95℃預(yù)變性5 min;接以95℃30s,56℃30s,72℃30s,30個(gè)循環(huán);最后72℃保溫7min進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物由上海生工生物工程有限公司合成。擴(kuò)增的反應(yīng)體系( 25μl):超純水16.75μl,10×Buffer2.5μl,2mmol/L dNTP2.5μl,10μmol/L ITS4 1μl,10μmol/L ITS5 1μl,Taq酶0.25μl,模板1μl。PCR產(chǎn)物經(jīng)凝膠回收、純化后送上海生工生物工程有限公司測(cè)序。

1.5.3 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 以每個(gè)菌株的ITS和5.8S序列作為靶序列,在GenBank中用BLAST程序搜索同源序列,挑選與菌株序列相近的參考序列用于系統(tǒng)發(fā)育分析。利用Bioedit軟件編輯,Clustalx軟件將序列匹配排列,phylip3.67構(gòu)建ITS系統(tǒng)樹(shù),選用鄰接法(Neighbor-joining)分析,每次搜索進(jìn)行隨機(jī)1 000次重復(fù),獲得的自展檢驗(yàn)(bootstrap)數(shù)值標(biāo)記在分支上。

1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

葉面真菌和內(nèi)生真菌的分離率按以下公式進(jìn)行:

數(shù)據(jù)的顯著性分析采用t-檢驗(yàn):雙樣本等方差假設(shè)。

2 結(jié)果與分析

2.1 茶樹(shù)葉面真菌與內(nèi)生真菌多樣性

采用常規(guī)葉部真菌分離方法,依據(jù)PDA培養(yǎng)基上菌落形態(tài)的差異,從茶樹(shù)品種黃旦葉片上分離得到葉面真菌共26種形態(tài)型,其中15種在PDA培養(yǎng)基上能產(chǎn)生或誘導(dǎo)產(chǎn)生繁殖體;內(nèi)生真菌18種形態(tài)型,其中6種在PDA培養(yǎng)基上能產(chǎn)生或誘導(dǎo)產(chǎn)生繁殖體,葉面真菌與內(nèi)生真菌檢出率分別為100%和87.52%,其中分離率大于3%的共18種形態(tài)型。從茶樹(shù)品種鐵觀音葉片分離到葉面真菌16種形態(tài)型,其中10種在PDA培養(yǎng)基上能產(chǎn)生或誘導(dǎo)產(chǎn)生繁殖體;內(nèi)生真菌15種形態(tài)型,其中7種在PDA培養(yǎng)基上能產(chǎn)生或誘導(dǎo)產(chǎn)生繁殖體,葉面真菌與內(nèi)生真菌檢出率分別為100%和94.27%,其中分離率大于3%的共12種形態(tài)型。人工培養(yǎng)條件下能產(chǎn)生繁殖體的真菌包括擬盤(pán)多毛孢屬(Pestalotiopsis spp.)、芽枝霉屬(Cladosporium sp.)、短梗霉屬(Aureobasidium sp.)、青霉屬(Penicillium spp.)、曲霉屬(Aspergillus sp.)、鐮刀菌屬(Fusarium sp.)、球座菌屬(Guignardia sp.)、刺盤(pán)孢屬(Colletotrichum spp.)的真菌。本研究中,同時(shí)分離獲得一些人工培養(yǎng)條件下不產(chǎn)孢或難于產(chǎn)孢的、未鑒定的真菌。

2.2 優(yōu)勢(shì)真菌鑒定

對(duì)分離率大于30%的6種茶樹(shù)葉圍真菌,在形態(tài)學(xué)觀察的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步分析其ITS序列,采用鄰接法(Neighbor-joining)構(gòu)建N-J樹(shù),進(jìn)行初步的鑒定。結(jié)果表明:菌株B1為Pestalotiopsis theae,菌株B2為Cladosporium cladosporioides(GenBank序列號(hào):FJ216453),菌株B4為Botryosphaeria rhodina(GenBank序列號(hào):FJ216454),菌株B8為Aureobasidium pullulans(GenBank序列號(hào):FJ216455),菌株nsy-12為Guignardia mangiferae(GenBank序列號(hào):EU671077),菌株N13確定為Colletotrichum sp.。

2.3 兩種方法分離葉面真菌比較

采用兩種分離方法均分離到4種相同的優(yōu)勢(shì)種葉面真菌。但從分離所得的真菌總數(shù)上,稀釋平板法所得葉面真菌種類(lèi)(形態(tài)型)少于葉片組織黏附法所獲得的真菌;在茶樹(shù)品種黃旦上,采用稀釋平板法分離到葉面真菌15種形態(tài)型,而采用葉片組織黏附法獲得26種形態(tài)型;在鐵觀音上,采用稀釋平板法分離到葉面真菌12種形態(tài)型,而采用葉片組織黏附法獲得16種形態(tài)型。采用葉片黏附法獲得的4種優(yōu)勢(shì)真菌在茶樹(shù)品種黃旦、鐵觀音中的分離率無(wú)顯著差異(p<0.01),但采用稀釋平板法分離獲得的Pestalotiopsis theae、Cladosporium cladosporioides、Aureobasidium pullulans在黃旦和鐵觀音中的相對(duì)分離率存在顯著差異(p<0.01),Botryosphaeria rhodina無(wú)顯著差異(p=0.33)(表1)。同時(shí),采用不同分離方法,真菌數(shù)量也大不相同,如采用葉片黏附法,Pestalotiopsis theae在黃旦和鐵觀音中的分離率分別為90.57%和96.74%;而采用稀釋平板法,相對(duì)分離率分別只有7.47%和31.11%;其它3種真菌的數(shù)量也存在明顯的差異(表1)。因此,采用不同的葉片表面真菌分離方法,檢出真菌的種類(lèi)和數(shù)量,均表現(xiàn)出明顯的差異。

表1 葉面真菌兩種不同分離方法結(jié)果比較Table 1 Comparison of fungal epiphytes with two isolation methods

2.4 茶樹(shù)葉面真菌與內(nèi)生真菌比較

由表2可知,Pestalotiopsis theae、Cladosporium cladosporioides、Botryosphaeria rhodina、Aureobasidium pullulans等4種真菌為葉面優(yōu)勢(shì)真菌,Guignardia mangiferae、Colletotrichum sp.等為內(nèi)生優(yōu)勢(shì)真菌,其中僅Pestalotiopsis theae為葉面優(yōu)勢(shì)真菌與內(nèi)生真菌所共有,其余葉面優(yōu)勢(shì)真菌均未在內(nèi)生真菌中分離得到,數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明兩群落的真菌組成存在顯著差異。

在葉面真菌中,Pestalotiopsis theae、Cladosporium cladosporioides、Botryosphaeria rhodina和Aureobasidium pullulans均能從同一茶葉組織塊中長(zhǎng)出,特別是Pestalotiopsis theae、Cladosporium cladosporioides和 Aureobasidium pullulans,表現(xiàn)出高度重疊(>64.10%);內(nèi)生真菌中,Guignardia mangiferae 和 Colletotrichum sp.可以部分重疊,有22.33%~35.67%的Colletotrichum sp.和Guignardia mangiferae從同一組織塊中同時(shí)長(zhǎng)出。而Pestalotiopsis theae 則一般單獨(dú)長(zhǎng)出(表2)。

表2 茶葉葉面真菌與內(nèi)生真菌優(yōu)勢(shì)種比較Table 2 Epiphytes vs endophytes in the six major fungal species isolated from tea leaves

3 討論

結(jié)果顯示,采用不同的分離方法用于分析真菌的種群數(shù)量和結(jié)構(gòu),能顯著地改變分離結(jié)果。葉片洗滌后稀釋平板分離法對(duì)那些以孢子粘附在葉面上的真菌計(jì)數(shù)較為準(zhǔn)確,但以菌絲粘附的真菌則難以洗下。而在培養(yǎng)基上黏附一定時(shí)間后移走葉片組織塊,卻能分離到更多種類(lèi)的葉面真菌。從葉片組織黏附法的分離結(jié)果看,移去茶葉組織塊,培養(yǎng)2d后即可見(jiàn)茶擬盤(pán)多毛孢的菌絲大量生長(zhǎng)。因此,在PDA培養(yǎng)基上,茶擬盤(pán)多毛孢具有更強(qiáng)的生長(zhǎng)能力。對(duì)照于稀釋平板法的結(jié)果(表1),可見(jiàn)茶擬盤(pán)多毛孢在茶葉表面的數(shù)量并不比芽枝狀枝孢霉和出芽短梗霉更多,但因生長(zhǎng)能力強(qiáng),加上組織黏附法對(duì)葉面的真菌沒(méi)有稀釋作用,因而生長(zhǎng)迅速的真菌易造成對(duì)生長(zhǎng)慢的真菌的抑制作用。除少數(shù)情況外[3],大多數(shù)研究者采用稀釋平板法分離葉面真菌。本研究的結(jié)果表明,采用兩種方法分離、分析植物葉面真菌,各有優(yōu)點(diǎn)。但由于這些方法均依賴(lài)于培養(yǎng)基的篩選作用,因而也存在明顯的缺陷。采用PCR擴(kuò)增和變性梯度膠電泳技術(shù)(DGGE),Yang 等[12]在植物葉片表面洗滌液中檢測(cè)到豐富的微生物群落,其中許多種類(lèi)在人工培養(yǎng)基上難于分離。因此,結(jié)合應(yīng)用人工分離和分子生物學(xué)技術(shù),能更為全面地反映自然條件下茶樹(shù)葉圍真菌群落結(jié)構(gòu)的真實(shí)情況。

研究結(jié)果表明,茶樹(shù)葉圍維持有豐富的真菌物種多樣性;茶葉表面和內(nèi)部組織中,生長(zhǎng)有完全不同的真菌群落。黃旦葉面真菌與內(nèi)生真菌的種類(lèi)(p<0.01)與數(shù)量(p<0.05)均存在顯著不同,在黃旦葉片中葉面真菌的物種多樣性(26種形態(tài)型)遠(yuǎn)大于內(nèi)生真菌物種多樣性(18種形態(tài)型);而在鐵觀音中,葉面真菌的物種多樣性(16種)與內(nèi)生真菌物種多樣性(15種)差異不大(p=0.55),但各種真菌的數(shù)量存在顯著差異(p<0.01)(表1,表2)。在茶樹(shù)葉圍占優(yōu)勢(shì)的6種真菌中,芽枝狀枝孢霉、出芽短梗霉和柑桔葡萄座腔菌只存在于茶葉的表面;而芒果球座菌和刺盤(pán)孢菌只生活與茶葉組織內(nèi)。茶擬盤(pán)多毛孢既可生活于茶葉組織內(nèi),也可生活于茶葉表面(表2);但茶擬盤(pán)多毛孢在茶葉表面占據(jù)優(yōu)勢(shì),在茶葉內(nèi)部組織中則分布很少(<3%)。Santamaria & Bayman[3]對(duì)咖啡葉面真菌與內(nèi)生真菌進(jìn)行了研究,共分離得到內(nèi)生真菌66種,葉面真菌63種,其中僅4種為葉面真菌與內(nèi)生真菌所共有;在葉面真菌中,Botryosphaeria sp.和Pestalotia sp.是優(yōu)勢(shì)種真菌;而在內(nèi)生真菌中,Xylaria sp.、Collerotrichum sp.和 Guignardia sp.是優(yōu)勢(shì)種真菌。在山茱萸(Swida controversa)、純齒山毛櫸(Fagus crenata)和偃伏梾木(Cornus stolonifera)的葉部真菌研究中,也得出相似的結(jié)果[4-7]。Osono[13]從山茶(Camellia japonica)葉片中分離得到真菌共79種,其中葉面真菌52種,內(nèi)生真菌44種,17種為葉面真菌與內(nèi)生真菌所共有;Pestalotiopsis sp.、Cladosporium cladosporioides.、Colletotrichum gloeosporioides、Aureobasidium pullulans等真菌作為優(yōu)勢(shì)種葉面真菌存在,而Geniculosprium sp.、Colletotrichum gloeosporioides 和 C.acutatum.則是內(nèi)生真菌中的優(yōu)勢(shì)種;在優(yōu)勢(shì)種中,只有Colletotrichum gloeosporioides 為葉面真菌和內(nèi)生真菌種群所共有。和本研究的結(jié)果相比較,雖然同為山茶屬植物,茶樹(shù)和山茶葉面真菌的種群組成較為相似,但內(nèi)生真菌的種群組成則很不同。以上分析表明,在植物葉圍,不同物種之間優(yōu)勢(shì)種葉面真菌和內(nèi)生真菌的種類(lèi)可能有不同;但在同一物種葉片上,葉面真菌與內(nèi)生真菌種群的組成均存在顯著的差異。前人研究還顯示,雖然植物葉圍真菌的物種多樣性非常豐富,但優(yōu)勢(shì)種真菌只是少數(shù)幾種[1-7,13]。本研究的結(jié)果支持這一結(jié)論。

研究結(jié)果還顯示,在茶樹(shù)葉圍的優(yōu)勢(shì)真菌中,除茶擬盤(pán)多毛孢可以明確為茶樹(shù)葉部的病原菌,在一定條件下可導(dǎo)致茶樹(shù)輪斑病外,本研究分離獲得的其它葉圍真菌,特別是優(yōu)勢(shì)種真菌,在茶樹(shù)中均未有作為病原菌的記錄[14]。這些真菌可能在維持茶樹(shù)葉圍微生態(tài)平衡和病蟲(chóng)害控制等方面發(fā)揮重要的作用。當(dāng)然,有些真菌也可能是茶樹(shù)的非寄主(non-host)寄生物,在一定條件下能導(dǎo)致其它植物的病害。如芒果球座菌,是熱帶和亞熱帶植物葉部的常見(jiàn)內(nèi)生真菌,寄主范圍非常廣泛,但偶爾也能導(dǎo)致植物的病害[15]。像人體和動(dòng)物腸道微生態(tài)系一樣,植物葉圍微生態(tài)系中微生物的種群結(jié)構(gòu)和數(shù)量平衡,可能也會(huì)對(duì)植物健康產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。

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