黃鳳珍
核酸分子雜交技術(shù)是利用DNA變性與復(fù)性的原理,在某種理化因素作用下DNA雙鏈分子解鏈變性后,在DNA復(fù)性重新形成雙螺旋結(jié)構(gòu)時,把不同的DNA單鏈分子或者DNA與RNA的混合物放在同一溶液中,只要在DNA或RNA單鏈分子之間存在一定的堿基互補配對關(guān)系,就可以在DNA之間或DNA與RNA之間形成雜化的雙鏈。蛋白質(zhì)分子雜交是一種借助特異性抗體鑒定抗原的有效方法。分子雜交技術(shù)有很多種,下面重點介紹三種常用的分子雜交技術(shù)的基本流程和應(yīng)用。
1Southern雜交——DNA和DNA分子之間的雜交
1.1基本流程
第一步,從組織或細胞中提取出DNA,經(jīng)過適當?shù)南拗泼盖泻筮M行瓊脂糖凝膠電泳,將不同大小的片段分開;
第二步,將凝膠上的DNA片段轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上;
第三步,用標記了放射性同位素(或生物素)的目的基因的DNA片段作為探針與硝酸纖維素膜上的DNA進行雜交;
第四步,將X光底片壓在硝酸纖維素膜上,在暗處使底片感光;
第五步,將X光底片沖洗,如果在底片上出現(xiàn)黑色條帶,則表明待測樣品中含有目的基因。
1.2具體應(yīng)用
Southern雜交主要用來研究DNA分子中某一基因位置、某一專一序列在待檢樣品中存在與否及兩種核酸分子之間的相似性。具體來說,此項分子雜交的應(yīng)用有以下幾點。
1.2.1用于對基因組中特定基因的定位及檢測
如基因工程中用于檢測目的基因是否整合到受體生物的染色體DNA中。這是目的基因能否在真核生物中穩(wěn)定遺傳的關(guān)鍵。
1.2.2用于從基因文庫中找到所需要的基因
將含有某種生物不同基因的許多DNA片段,導(dǎo)入受體菌的群體中儲存,構(gòu)建了該種生物的基因文庫,但如何從基因文庫中找到所需要的基因呢?具體做法如下。
第一步,通過PCR方法將目的基因已知的部分核苷酸序列擴增出來,制成探針。
第二步,將基因文庫中的所有菌落轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,然后通過處理,溶解消化掉細菌中的蛋白質(zhì),并使DNA固定在膜上。
第三步,按Southem雜交的方法進行雜交。
第四步,在X光底片上出現(xiàn)黑斑的菌落含有所需要的目的基因(若選用別的標記方法,有陽性信號的菌落則含有所需要的目的基因)。
第五步,從該菌落中再提取目的基因。
1.2.3用于基因診斷遺傳病、癌癥等
舉兩個常見的病例:
鐮刀型細胞貧血癥是β-珠蛋白基因第六個密碼子發(fā)生單個堿基突變(A-T),這一突變使該基因內(nèi)部一個MstⅡ限制酶位點丟失。因此,將正常人和帶有突變基因個體的基因組DNA用MstⅡ切割后,與β—珠蛋白基因探針雜交,即可將正常人、突變基因攜帶者及鐮刀型細胞癥患者區(qū)別開來,如圖1所示。
苯丙酮尿癥(PKU)是新生兒中發(fā)病率較高的一種遺傳病,如果用限制性內(nèi)切酶EcoRV酶解苯丙酮尿癥患兒及其父母的DNA,再與苯丙氨酸羥化酶基因探針雜交,分析雜交片段后就會發(fā)現(xiàn)其父母都具有30 kb/25 kb酶特異片段,患兒則具有30 kb/30 kb片段。這說明患兒的2條30 kb片段都與致病基因連鎖,分別從父母親處遺傳而來,而父母親另一條染色體的25 kb不與致病基因連鎖。在此基礎(chǔ)上,分析另一未知胎兒,如果雜交圖譜顯示30 kb/25 kb特異片段,就可診斷胎兒為雜合子,如果雜交圖譜顯示為30 kb/30 kb片段,即為患兒。
2Northern雜交——DNA和RNA分子之間的雜交
2.1基本流程
與Southern雜交相同,只是第一步從組織或細胞中提取的是mRNA而不是DNA,另外由于RNA分子較小,在轉(zhuǎn)移前無需進行限制酶切割。
2.2具體應(yīng)用
目前主要用于檢測某一組織或細胞中已知的特異性mRNA的表達水平或比較不同組織或細胞中同一基因的表達情況,如在基因工程中是檢測目的基因是否轉(zhuǎn)錄出mRNA的方法。
如果RNA分子在大小和含量上與正常情況不同,可以考慮是否有調(diào)控區(qū)的突變或剪接部分的突變。
3Western雜交——蛋白質(zhì)分子(抗原-抗體)之間的雜交。
3.1基本流程
以檢測目的基因在受體細胞中是否表達出相應(yīng)的蛋白質(zhì)為例,其具體做法是:
第一步,將目的基因在大腸桿菌中表達出蛋白質(zhì);
第二步,將表達出的蛋白質(zhì)注射給動物進行免疫,產(chǎn)生相應(yīng)的抗體,并提取出抗體(一抗);
第三步,從轉(zhuǎn)基因生物中提取蛋白質(zhì),進行凝膠電泳;
第四步,將凝膠中的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上;
第五步,將抗體(一抗)與硝酸纖維素膜上的蛋白質(zhì)雜交,這時抗體(一抗)與目的基因表達的蛋白(抗原)會特異結(jié)合。由于這種抗原-抗體的結(jié)合顯示不出條帶,所以加入一種稱為二抗的抗體,它可以與一抗結(jié)合,二抗抗體上帶有特殊的標記。如果目的基因表達出了蛋白質(zhì),則結(jié)果為陽性。
Western雜交與上述兩種雜交技術(shù)不同的是,蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)移只有靠電轉(zhuǎn)移方可完成。另外蛋白質(zhì)的檢測是以抗體而不是以核酸作探針。上述三種雜交技術(shù)都需要將存在于凝膠中的生物大分子轉(zhuǎn)移(印跡)于固定化介質(zhì)上并加以分析,稱為印跡技術(shù)?;玖鞒炭捎脠D2歸納。
3.2具體應(yīng)用
可用于檢測樣品中特異蛋白質(zhì)是否存在、細胞中特異蛋白質(zhì)的半定量分析以及蛋白質(zhì)分子的相互作用研究等。如檢測目的基因在受體細胞中有沒有翻譯出相應(yīng)的蛋白質(zhì),檢測病人血液中是否有某種抗體從而檢測是否感染過某種抗原,單克隆抗體技術(shù)中用于篩選出能產(chǎn)生特定抗體的雜交瘤細胞等。