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一種提供容錯性保障的藥物設(shè)計網(wǎng)格環(huán)境

2009-02-08 01:11王永劍任一楠黃遠強于坤千欒鐘治蔣華良錢德沛
西安交通大學(xué)學(xué)報 2009年12期
關(guān)鍵詞:計算資源高通量網(wǎng)格

王永劍 任一楠 陳 婷 黃遠強 于坤千 欒鐘治 蔣華良 錢德沛

摘要:針對藥物虛擬篩選操作運行時間長、易出錯等問題,設(shè)計并實現(xiàn)了藥物設(shè)計網(wǎng)格(DDG rid),有效聚合了中國國家網(wǎng)格環(huán)境中閑散的資源,形成了支持高通量藥物虛擬篩選的網(wǎng)格環(huán)境。所設(shè)計的DDGrid網(wǎng)格實現(xiàn)了基于復(fù)雜事件處理技術(shù)的有狀態(tài)故障檢測機制,通過持續(xù)分析節(jié)點間交互的事件流,定位可能的故障場景并觸發(fā)相應(yīng)的補償操作來減少故障導(dǎo)致的損失,為系統(tǒng)提供了容錯性保障。實驗結(jié)果表明,有故障檢測機制可以通過監(jiān)測篩選任務(wù)運行情況對超時閥值進行動態(tài)調(diào)整,使得任務(wù)實際完成時間和理論完成時間之間的差值保持在10%以內(nèi),同時提高了底層計算資源的利用率。

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